MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 1112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	AACT	2	8	21	28	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019691	CGAT	2	8	38	45	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019691	AAT	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019691	TAA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019691	T	6	6	141	146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	ATCG	2	8	153	160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019691	AGG	2	6	317	322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	AAGC	2	8	344	351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019691	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019691	TTTG	2	8	514	521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019691	GGAT	2	8	612	619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019691	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019691	GCA	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019691	ATTT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019691	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019691	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019691	TCA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019691	ATT	2	6	967	972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019691	GTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019691	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019691	ATT	2	6	1401	1406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223390
22	NC_019691	TTA	2	6	1529	1534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223390
23	NC_019691	ATT	2	6	1580	1585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223390
24	NC_019691	TCAT	2	8	1634	1641	25 %	50 %	0 %	25 %	428223390
25	NC_019691	TTC	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223391
26	NC_019691	TA	3	6	1745	1750	50 %	50 %	0 %	0 %	428223391
27	NC_019691	ACCAG	2	10	1761	1770	40 %	0 %	20 %	40 %	428223391
28	NC_019691	CAC	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223391
29	NC_019691	TTA	2	6	1818	1823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223391
30	NC_019691	AGGT	2	8	1987	1994	25 %	25 %	50 %	0 %	428223391
31	NC_019691	TTAA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	428223391
32	NC_019691	AACTA	2	10	2111	2120	60 %	20 %	0 %	20 %	428223391
33	NC_019691	TAG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223391
34	NC_019691	GTA	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223391
35	NC_019691	T	6	6	2295	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019691	T	7	7	2356	2362	0 %	100 %	0 %	0 %	428223392
37	NC_019691	T	6	6	2368	2373	0 %	100 %	0 %	0 %	428223392
38	NC_019691	CCG	2	6	2459	2464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223392
39	NC_019691	GAT	2	6	2517	2522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223392
40	NC_019691	GCG	2	6	2593	2598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223392
41	NC_019691	CTT	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223392
42	NC_019691	GCTA	2	8	2751	2758	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
43	NC_019691	TAG	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223393
44	NC_019691	GATC	2	8	2973	2980	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
45	NC_019691	TGG	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223393
46	NC_019691	G	7	7	3010	3016	0 %	0 %	100 %	0 %	428223393
47	NC_019691	TCT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223393
48	NC_019691	CGA	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223393
49	NC_019691	AATC	2	8	3096	3103	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
50	NC_019691	CAG	2	6	3104	3109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223393
51	NC_019691	TAGT	2	8	3110	3117	25 %	50 %	25 %	0 %	428223393
52	NC_019691	TCT	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223393
53	NC_019691	TAAA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
54	NC_019691	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223393
55	NC_019691	TCG	2	6	3530	3535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223393
56	NC_019691	TTG	2	6	3679	3684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223393
57	NC_019691	CTT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223393
58	NC_019691	TAA	2	6	3735	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223393
59	NC_019691	GAT	2	6	3780	3785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223393
60	NC_019691	AGA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223393
61	NC_019691	ATT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223393
62	NC_019691	ATT	2	6	3991	3996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223393
63	NC_019691	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	428223393
64	NC_019691	GAAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	25 %	0 %	428223393
65	NC_019691	AAC	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223393
66	NC_019691	TAA	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223393
67	NC_019691	TTGG	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	428223393
68	NC_019691	AAAT	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
69	NC_019691	ATC	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223393
70	NC_019691	TTG	2	6	4592	4597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223393
71	NC_019691	TCA	2	6	4640	4645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223393
72	NC_019691	ACTT	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	428223393
73	NC_019691	AAT	2	6	4909	4914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223393
74	NC_019691	TAGC	2	8	5018	5025	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
75	NC_019691	AG	3	6	5033	5038	50 %	0 %	50 %	0 %	428223393
76	NC_019691	ATC	2	6	5086	5091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223393
77	NC_019691	AAT	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223393
78	NC_019691	AGC	2	6	5145	5150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223393
79	NC_019691	CAG	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223393
80	NC_019691	AACAG	2	10	5237	5246	60 %	0 %	20 %	20 %	428223393
81	NC_019691	ATT	2	6	5293	5298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223393
82	NC_019691	TA	3	6	5347	5352	50 %	50 %	0 %	0 %	428223393
83	NC_019691	TTC	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223393
84	NC_019691	CCAC	2	8	5510	5517	25 %	0 %	0 %	75 %	428223393
85	NC_019691	TTGTCC	2	12	5518	5529	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428223393
86	NC_019691	AAT	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223393
87	NC_019691	TAAC	2	8	5741	5748	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
88	NC_019691	TGT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223393
89	NC_019691	A	6	6	5797	5802	100 %	0 %	0 %	0 %	428223393
90	NC_019691	TGT	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019691	T	8	8	6075	6082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019691	GGGGT	2	10	6120	6129	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019691	GGGGT	2	10	6153	6162	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019691	T	6	6	6177	6182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019691	GGGGT	2	10	6195	6204	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019691	GGGGT	2	10	6299	6308	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019691	GGGGT	2	10	6336	6345	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019691	AAT	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019691	TA	3	6	6380	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019691	GT	3	6	6432	6437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019691	TCAG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019691	AGC	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019691	TGA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019691	GGGGT	2	10	6529	6538	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019691	GT	3	6	6543	6548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019691	TAT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019691	GTT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223394
108	NC_019691	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	428223394
109	NC_019691	TTC	2	6	6676	6681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223394
110	NC_019691	CTGA	2	8	6733	6740	25 %	25 %	25 %	25 %	428223394
111	NC_019691	TTG	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223394
112	NC_019691	ATTT	2	8	6811	6818	25 %	75 %	0 %	0 %	428223394
113	NC_019691	TAA	2	6	6900	6905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223394
114	NC_019691	AAG	2	6	6913	6918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223394
115	NC_019691	AACT	2	8	7060	7067	50 %	25 %	0 %	25 %	428223394
116	NC_019691	ATT	2	6	7084	7089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223394
117	NC_019691	CAT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223394
118	NC_019691	TGC	2	6	7201	7206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223394
119	NC_019691	GTG	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223394
120	NC_019691	TCA	2	6	7230	7235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223394
121	NC_019691	CT	3	6	7238	7243	0 %	50 %	0 %	50 %	428223394
122	NC_019691	CTT	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223394
123	NC_019691	CTT	2	6	7428	7433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223394
124	NC_019691	GTA	2	6	7481	7486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223394
125	NC_019691	TTC	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223394
126	NC_019691	T	6	6	7556	7561	0 %	100 %	0 %	0 %	428223394
127	NC_019691	TAA	3	9	7593	7601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223394
128	NC_019691	GGC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223394
129	NC_019691	GGC	2	6	7663	7668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223394
130	NC_019691	TGAG	2	8	7838	7845	25 %	25 %	50 %	0 %	428223394
131	NC_019691	TCT	2	6	7893	7898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223394
132	NC_019691	GTT	2	6	7922	7927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223394
133	NC_019691	T	6	6	7982	7987	0 %	100 %	0 %	0 %	428223394
134	NC_019691	T	6	6	8014	8019	0 %	100 %	0 %	0 %	428223394
135	NC_019691	AT	3	6	8054	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	428223394
136	NC_019691	CTA	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019691	ATT	2	6	8200	8205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223395
138	NC_019691	TTC	2	6	8227	8232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223395
139	NC_019691	AGGT	2	8	8238	8245	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
140	NC_019691	GAT	2	6	8306	8311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223395
141	NC_019691	T	6	6	8318	8323	0 %	100 %	0 %	0 %	428223395
142	NC_019691	GA	3	6	8356	8361	50 %	0 %	50 %	0 %	428223395
143	NC_019691	AAT	2	6	8390	8395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223395
144	NC_019691	CAC	2	6	8396	8401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223395
145	NC_019691	TAG	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223395
146	NC_019691	CTAG	2	8	8442	8449	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
147	NC_019691	TAC	2	6	8623	8628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223395
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149	NC_019691	TTGA	2	8	8684	8691	25 %	50 %	25 %	0 %	428223395
150	NC_019691	CTG	2	6	8744	8749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223395
151	NC_019691	CTG	2	6	8815	8820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223395
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155	NC_019691	AGT	2	6	9048	9053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223395
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163	NC_019691	CGAT	2	8	9441	9448	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
164	NC_019691	GGTA	2	8	9699	9706	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
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169	NC_019691	GGCG	2	8	10321	10328	0 %	0 %	75 %	25 %	428223395
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184	NC_019691	TGG	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_019691	GTTAG	2	10	11328	11337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019691	GGC	2	6	11346	11351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_019691	AATT	2	8	11357	11364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_019691	CCTG	2	8	11394	11401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
189	NC_019691	T	6	6	11416	11421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_019691	GA	3	6	15108	15113	50 %	0 %	50 %	0 %	428223400
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260	NC_019691	AC	4	8	15202	15209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
261	NC_019691	AATT	2	8	15213	15220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019691	GCA	2	6	15225	15230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223401
263	NC_019691	CAAT	2	8	15403	15410	50 %	25 %	0 %	25 %	428223401
264	NC_019691	CCA	2	6	15414	15419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223401
265	NC_019691	GACT	2	8	15598	15605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
266	NC_019691	GAG	2	6	15715	15720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019691	TTC	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_019691	GGT	2	6	15812	15817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019691	TGA	2	6	15818	15823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019691	GCC	2	6	15896	15901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_019691	CCG	2	6	15978	15983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
272	NC_019691	AGA	2	6	16443	16448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_019691	TC	3	6	16570	16575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
274	NC_019691	CAGA	2	8	16659	16666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
275	NC_019691	CTGC	2	8	16674	16681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_019691	GTC	2	6	16757	16762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_019691	AAAG	2	8	16906	16913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_019691	ATG	2	6	17030	17035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019691	T	8	8	17056	17063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019691	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_019691	GTA	2	6	17135	17140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019691	TGG	2	6	17159	17164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019691	CAT	2	6	17347	17352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_019691	ATA	2	6	17364	17369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_019691	TA	3	6	17386	17391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019691	ATA	2	6	17449	17454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019691	TTAC	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
288	NC_019691	TATT	2	8	17553	17560	25 %	75 %	0 %	0 %	428223402
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298	NC_019691	GCAA	2	8	18357	18364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
299	NC_019691	A	6	6	18403	18408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_019691	TTC	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_019691	AAT	2	6	18577	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_019691	AT	3	6	20020	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_019691	AGT	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
323	NC_019691	TCA	2	6	20076	20081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_019691	TCA	2	6	20198	20203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_019691	ATTCC	2	10	24598	24607	20 %	40 %	0 %	40 %	428223407
407	NC_019691	A	6	6	24782	24787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_019691	AGCT	2	8	25143	25150	25 %	25 %	25 %	25 %	428223409
411	NC_019691	GAA	2	6	25153	25158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223409
412	NC_019691	TGA	2	6	25237	25242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223409
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431	NC_019691	A	8	8	26529	26536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_019691	ATC	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_019691	GAC	2	6	26830	26835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_019691	GA	3	6	27001	27006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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