MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_019680	GAT	2	6	1078308	1078313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712212
19002	NC_019680	TGAT	2	8	1078397	1078404	25 %	50 %	25 %	0 %	427712212
19003	NC_019680	AGA	2	6	1078422	1078427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712212
19004	NC_019680	GCCC	2	8	1078680	1078687	0 %	0 %	25 %	75 %	427712212
19005	NC_019680	CAT	2	6	1078701	1078706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712212
19006	NC_019680	CAA	2	6	1078710	1078715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712212
19007	NC_019680	CAA	2	6	1078747	1078752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712213
19008	NC_019680	TGGG	2	8	1078819	1078826	0 %	25 %	75 %	0 %	427712213
19009	NC_019680	CGG	2	6	1078843	1078848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712213
19010	NC_019680	CGC	2	6	1078900	1078905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712213
19011	NC_019680	CTG	2	6	1079062	1079067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712213
19012	NC_019680	TTC	2	6	1079210	1079215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712213
19013	NC_019680	CGT	2	6	1079221	1079226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712213
19014	NC_019680	G	6	6	1079233	1079238	0 %	0 %	100 %	0 %	427712213
19015	NC_019680	CATCCC	2	12	1079290	1079301	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	427712213
19016	NC_019680	CAGGC	2	10	1079346	1079355	20 %	0 %	40 %	40 %	427712213
19017	NC_019680	A	6	6	1079447	1079452	100 %	0 %	0 %	0 %	427712214
19018	NC_019680	TCA	2	6	1079510	1079515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712214
19019	NC_019680	GCT	2	6	1079828	1079833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712214
19020	NC_019680	CCAGGC	2	12	1079853	1079864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427712214
19021	NC_019680	TGGAA	2	10	1079866	1079875	40 %	20 %	40 %	0 %	427712214
19022	NC_019680	CAC	2	6	1080001	1080006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712214
19023	NC_019680	GCC	2	6	1080024	1080029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712214
19024	NC_019680	ACC	2	6	1080119	1080124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712214
19025	NC_019680	GA	3	6	1080146	1080151	50 %	0 %	50 %	0 %	427712214
19026	NC_019680	GCCT	2	8	1080186	1080193	0 %	25 %	25 %	50 %	427712214
19027	NC_019680	GTT	2	6	1080228	1080233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712214
19028	NC_019680	A	6	6	1080235	1080240	100 %	0 %	0 %	0 %	427712214
19029	NC_019680	GCT	2	6	1080246	1080251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712214
19030	NC_019680	AAT	2	6	1080261	1080266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712214
19031	NC_019680	GAT	2	6	1080271	1080276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712214
19032	NC_019680	CCG	2	6	1080277	1080282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712214
19033	NC_019680	TCA	2	6	1080381	1080386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712214
19034	NC_019680	TC	3	6	1080391	1080396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19035	NC_019680	TCA	2	6	1080524	1080529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_019680	TGG	2	6	1080570	1080575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_019680	ATT	2	6	1080578	1080583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_019680	AAAACT	2	12	1080677	1080688	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19039	NC_019680	A	6	6	1080734	1080739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_019680	TTA	2	6	1080787	1080792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712215
19041	NC_019680	ATA	2	6	1080814	1080819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712215
19042	NC_019680	CAA	2	6	1080878	1080883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712215
19043	NC_019680	AACC	2	8	1080917	1080924	50 %	0 %	0 %	50 %	427712215
19044	NC_019680	AT	3	6	1080977	1080982	50 %	50 %	0 %	0 %	427712215
19045	NC_019680	AGC	2	6	1081003	1081008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712215
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19048	NC_019680	TA	3	6	1081149	1081154	50 %	50 %	0 %	0 %	427712215
19049	NC_019680	GAA	2	6	1081230	1081235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712215
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19051	NC_019680	A	6	6	1081285	1081290	100 %	0 %	0 %	0 %	427712215
19052	NC_019680	A	7	7	1081330	1081336	100 %	0 %	0 %	0 %	427712215
19053	NC_019680	CAA	2	6	1081362	1081367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712215
19054	NC_019680	AG	3	6	1081401	1081406	50 %	0 %	50 %	0 %	427712215
19055	NC_019680	TAA	2	6	1081415	1081420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712215
19056	NC_019680	TGG	2	6	1081427	1081432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712215
19057	NC_019680	TAA	2	6	1081469	1081474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712215
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19062	NC_019680	CAG	2	6	1081702	1081707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712215
19063	NC_019680	AT	5	10	1081735	1081744	50 %	50 %	0 %	0 %	427712215
19064	NC_019680	TGACTT	2	12	1081745	1081756	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427712215
19065	NC_019680	TCC	2	6	1081877	1081882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712215
19066	NC_019680	ATTT	2	8	1081883	1081890	25 %	75 %	0 %	0 %	427712215
19067	NC_019680	ATT	2	6	1081912	1081917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_019680	AAGT	2	8	1081954	1081961	50 %	25 %	25 %	0 %	427712216
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19071	NC_019680	TAT	2	6	1082092	1082097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712216
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19073	NC_019680	TGA	2	6	1082148	1082153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712216
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19083	NC_019680	CAT	2	6	1082671	1082676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712216
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19085	NC_019680	TTG	2	6	1082836	1082841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19087	NC_019680	TCA	2	6	1082851	1082856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19088	NC_019680	GA	3	6	1082886	1082891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19101	NC_019680	T	6	6	1083809	1083814	0 %	100 %	0 %	0 %	427712217
19102	NC_019680	TGG	2	6	1083849	1083854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712217
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19115	NC_019680	ATT	2	6	1084750	1084755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712218
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19118	NC_019680	GAT	2	6	1084888	1084893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712218
19119	NC_019680	AAC	2	6	1084926	1084931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712218
19120	NC_019680	GCG	2	6	1084955	1084960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712218
19121	NC_019680	ATT	2	6	1084982	1084987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712218
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19235	NC_019680	GAAA	2	8	1091543	1091550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19474	NC_019680	TAT	2	6	1104502	1104507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19475	NC_019680	GAC	2	6	1104602	1104607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19476	NC_019680	GGA	2	6	1104649	1104654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19477	NC_019680	TTA	2	6	1104703	1104708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19478	NC_019680	TTGT	2	8	1104798	1104805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19479	NC_019680	TCT	2	6	1104825	1104830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19480	NC_019680	CAC	2	6	1104838	1104843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19481	NC_019680	TAA	2	6	1104942	1104947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19482	NC_019680	AG	3	6	1104991	1104996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19483	NC_019680	T	6	6	1105017	1105022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19484	NC_019680	CAA	2	6	1105076	1105081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19485	NC_019680	AGGAAC	2	12	1105258	1105269	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19486	NC_019680	T	6	6	1105426	1105431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19487	NC_019680	ATC	2	6	1105499	1105504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19488	NC_019680	T	6	6	1105505	1105510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19489	NC_019680	T	6	6	1105713	1105718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19490	NC_019680	ACT	2	6	1105974	1105979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19491	NC_019680	CAT	2	6	1106074	1106079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19492	NC_019680	CAT	2	6	1106146	1106151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19493	NC_019680	TAA	2	6	1106283	1106288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19497	NC_019680	AG	3	6	1107010	1107015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19498	NC_019680	AAT	2	6	1107138	1107143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19499	NC_019680	ATG	2	6	1107148	1107153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_019680	GCT	2	6	1107284	1107289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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