MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_019680	GGT	2	6	904959	904964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_019680	TTA	2	6	905053	905058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_019680	CAGG	2	8	905090	905097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_019680	AGTT	2	8	905348	905355	25 %	50 %	25 %	0 %	427712039
16005	NC_019680	CGG	2	6	905449	905454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712039
16006	NC_019680	TAA	2	6	905469	905474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712039
16007	NC_019680	GACT	2	8	905499	905506	25 %	25 %	25 %	25 %	427712039
16008	NC_019680	CAC	2	6	905507	905512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712039
16009	NC_019680	C	6	6	905609	905614	0 %	0 %	0 %	100 %	427712039
16010	NC_019680	ACC	2	6	905702	905707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_019680	ATT	2	6	905778	905783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712040
16012	NC_019680	ACCG	2	8	905787	905794	25 %	0 %	25 %	50 %	427712040
16013	NC_019680	GAA	2	6	905970	905975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712040
16014	NC_019680	GAA	2	6	905978	905983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712040
16015	NC_019680	AT	3	6	905987	905992	50 %	50 %	0 %	0 %	427712040
16016	NC_019680	GTG	2	6	906351	906356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_019680	ACAA	2	8	906417	906424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16018	NC_019680	AG	3	6	906453	906458	50 %	0 %	50 %	0 %	427712041
16019	NC_019680	GACT	2	8	906483	906490	25 %	25 %	25 %	25 %	427712041
16020	NC_019680	GCT	3	9	906537	906545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712041
16021	NC_019680	ATC	2	6	906549	906554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712041
16022	NC_019680	GCC	2	6	906618	906623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712041
16023	NC_019680	GCC	2	6	906753	906758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712041
16024	NC_019680	GAA	2	6	906892	906897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712041
16025	NC_019680	TCGA	2	8	906929	906936	25 %	25 %	25 %	25 %	427712041
16026	NC_019680	GC	3	6	906971	906976	0 %	0 %	50 %	50 %	427712041
16027	NC_019680	CTG	2	6	906997	907002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712041
16028	NC_019680	CAT	2	6	907003	907008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712041
16029	NC_019680	C	6	6	907070	907075	0 %	0 %	0 %	100 %	427712041
16030	NC_019680	AAG	2	6	907092	907097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712041
16031	NC_019680	AAG	2	6	907126	907131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712041
16032	NC_019680	GAT	2	6	907150	907155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712041
16033	NC_019680	CCA	2	6	907228	907233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712041
16034	NC_019680	GC	3	6	907240	907245	0 %	0 %	50 %	50 %	427712041
16035	NC_019680	CTT	2	6	907300	907305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712041
16036	NC_019680	GCT	2	6	907434	907439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712041
16037	NC_019680	TCA	2	6	907446	907451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712041
16038	NC_019680	AAT	2	6	907472	907477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712041
16039	NC_019680	GCT	2	6	907486	907491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_019680	ATTGA	2	10	907612	907621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_019680	CTG	2	6	907699	907704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712042
16042	NC_019680	ACC	2	6	907773	907778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712042
16043	NC_019680	GCA	2	6	907796	907801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712042
16044	NC_019680	TG	3	6	907828	907833	0 %	50 %	50 %	0 %	427712042
16045	NC_019680	AACT	2	8	908086	908093	50 %	25 %	0 %	25 %	427712042
16046	NC_019680	TTAC	2	8	908181	908188	25 %	50 %	0 %	25 %	427712043
16047	NC_019680	GCT	2	6	908214	908219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712043
16048	NC_019680	T	6	6	908338	908343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_019680	TTG	3	9	908400	908408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_019680	T	6	6	908436	908441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_019680	TCA	2	6	908552	908557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_019680	ATT	2	6	908562	908567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_019680	TA	3	6	908569	908574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_019680	A	6	6	908630	908635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_019680	ACCT	2	8	908671	908678	25 %	25 %	0 %	50 %	427712044
16056	NC_019680	ATTG	2	8	908681	908688	25 %	50 %	25 %	0 %	427712044
16057	NC_019680	ATT	2	6	908761	908766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712044
16058	NC_019680	AGTG	2	8	908850	908857	25 %	25 %	50 %	0 %	427712044
16059	NC_019680	GCA	2	6	908938	908943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_019680	A	7	7	908953	908959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_019680	ATT	2	6	909108	909113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_019680	GAATAA	2	12	909141	909152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_019680	CT	3	6	909153	909158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_019680	AGTC	2	8	909164	909171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16065	NC_019680	GATT	2	8	909241	909248	25 %	50 %	25 %	0 %	427712045
16066	NC_019680	GCCGGA	2	12	909303	909314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	427712045
16067	NC_019680	ATT	2	6	909342	909347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712045
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16070	NC_019680	CT	3	6	909394	909399	0 %	50 %	0 %	50 %	427712045
16071	NC_019680	T	6	6	909399	909404	0 %	100 %	0 %	0 %	427712045
16072	NC_019680	CTG	2	6	909432	909437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712045
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16074	NC_019680	GCTT	2	8	909615	909622	0 %	50 %	25 %	25 %	427712045
16075	NC_019680	CAAAG	2	10	909681	909690	60 %	0 %	20 %	20 %	427712045
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16081	NC_019680	CTA	2	6	910028	910033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712045
16082	NC_019680	CCTGGG	2	12	910137	910148	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427712045
16083	NC_019680	CTT	2	6	910188	910193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712045
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16087	NC_019680	TCTGG	2	10	910578	910587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16088	NC_019680	GAA	2	6	910630	910635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712046
16089	NC_019680	ACGGT	2	10	910661	910670	20 %	20 %	40 %	20 %	427712046
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16093	NC_019680	GGAC	2	8	910795	910802	25 %	0 %	50 %	25 %	427712046
16094	NC_019680	AT	3	6	910857	910862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_019680	AAC	2	6	910868	910873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_019680	TC	3	6	910874	910879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16097	NC_019680	CTAG	2	8	910904	910911	25 %	25 %	25 %	25 %	427712047
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16101	NC_019680	GTT	2	6	910981	910986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712047
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16103	NC_019680	CCG	2	6	911080	911085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712047
16104	NC_019680	ATAA	2	8	911096	911103	75 %	25 %	0 %	0 %	427712047
16105	NC_019680	G	6	6	911173	911178	0 %	0 %	100 %	0 %	427712047
16106	NC_019680	CGG	2	6	911212	911217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712047
16107	NC_019680	TGGATC	2	12	911306	911317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427712047
16108	NC_019680	GCC	2	6	911326	911331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712047
16109	NC_019680	AAT	3	9	911390	911398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712047
16110	NC_019680	CACC	2	8	911578	911585	25 %	0 %	0 %	75 %	427712048
16111	NC_019680	CGC	2	6	911612	911617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712048
16112	NC_019680	TATC	2	8	911809	911816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16113	NC_019680	CAC	2	6	911849	911854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712049
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16115	NC_019680	CGC	3	9	911952	911960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712049
16116	NC_019680	ACC	2	6	911979	911984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712049
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16118	NC_019680	TC	3	6	912014	912019	0 %	50 %	0 %	50 %	427712049
16119	NC_019680	G	6	6	912176	912181	0 %	0 %	100 %	0 %	427712049
16120	NC_019680	GGC	2	6	912218	912223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712049
16121	NC_019680	AG	3	6	912294	912299	50 %	0 %	50 %	0 %	427712049
16122	NC_019680	TCC	2	6	912355	912360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712049
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16124	NC_019680	CGG	2	6	912414	912419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712049
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16246	NC_019680	GGC	2	6	918983	918988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712054
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16249	NC_019680	A	6	6	919145	919150	100 %	0 %	0 %	0 %	427712054
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