MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_019680	CTGGGC	2	12	877389	877400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_019680	AAC	2	6	877434	877439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15504	NC_019680	TTA	2	6	877452	877457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_019680	TCT	2	6	877605	877610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15506	NC_019680	AAAT	2	8	877616	877623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_019680	TCT	2	6	877644	877649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_019680	AAC	2	6	877667	877672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_019680	TGCCCC	2	12	877695	877706	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
15510	NC_019680	CTT	2	6	877722	877727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15511	NC_019680	AAC	2	6	877821	877826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15512	NC_019680	CTT	2	6	877909	877914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_019680	AAT	2	6	877933	877938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_019680	CAC	2	6	878109	878114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712019
15515	NC_019680	ATG	2	6	878212	878217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712019
15516	NC_019680	AGA	2	6	878222	878227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712019
15517	NC_019680	GCG	2	6	878283	878288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712019
15518	NC_019680	ACAA	2	8	878455	878462	75 %	0 %	0 %	25 %	427712019
15519	NC_019680	GCT	2	6	878630	878635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712020
15520	NC_019680	GTT	2	6	878742	878747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712020
15521	NC_019680	AACT	2	8	878776	878783	50 %	25 %	0 %	25 %	427712020
15522	NC_019680	GAT	2	6	878787	878792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712020
15523	NC_019680	TTG	2	6	878803	878808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712020
15524	NC_019680	GCCTG	2	10	878850	878859	0 %	20 %	40 %	40 %	427712020
15525	NC_019680	ATC	2	6	878980	878985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712020
15526	NC_019680	CGC	2	6	879200	879205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712021
15527	NC_019680	GGCCA	2	10	879232	879241	20 %	0 %	40 %	40 %	427712021
15528	NC_019680	TCC	2	6	879294	879299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427712021
15529	NC_019680	AAT	2	6	879303	879308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712021
15530	NC_019680	ATCCTT	2	12	879319	879330	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	427712021
15531	NC_019680	TTC	2	6	879353	879358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712021
15532	NC_019680	TGC	2	6	879447	879452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712021
15533	NC_019680	CTGGC	2	10	879460	879469	0 %	20 %	40 %	40 %	427712021
15534	NC_019680	T	6	6	879645	879650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_019680	ATCT	2	8	879658	879665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15536	NC_019680	GGC	2	6	879832	879837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_019680	A	6	6	879899	879904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15538	NC_019680	CAAG	2	8	880007	880014	50 %	0 %	25 %	25 %	427712022
15539	NC_019680	T	6	6	880058	880063	0 %	100 %	0 %	0 %	427712022
15540	NC_019680	CTCA	2	8	880182	880189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15541	NC_019680	GGTCT	2	10	880230	880239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15542	NC_019680	AGC	2	6	880273	880278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_019680	GCA	2	6	880320	880325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712023
15544	NC_019680	GGCC	2	8	880388	880395	0 %	0 %	50 %	50 %	427712023
15545	NC_019680	A	6	6	880396	880401	100 %	0 %	0 %	0 %	427712023
15546	NC_019680	TGC	3	9	880478	880486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712023
15547	NC_019680	TGG	2	6	880523	880528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712023
15548	NC_019680	TGA	2	6	880562	880567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712023
15549	NC_019680	GCT	2	6	880608	880613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712023
15550	NC_019680	TGGC	2	8	880647	880654	0 %	25 %	50 %	25 %	427712023
15551	NC_019680	TC	3	6	880748	880753	0 %	50 %	0 %	50 %	427712023
15552	NC_019680	AAC	2	6	880791	880796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712023
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15555	NC_019680	AAG	2	6	880920	880925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712023
15556	NC_019680	GGA	2	6	880979	880984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712023
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15558	NC_019680	CAC	2	6	881096	881101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712023
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15560	NC_019680	GGC	2	6	881266	881271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712023
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15562	NC_019680	TGC	2	6	881281	881286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712023
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15564	NC_019680	CGG	2	6	881568	881573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712023
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15573	NC_019680	GCT	2	6	882246	882251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712023
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15577	NC_019680	CGTCA	2	10	882465	882474	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15578	NC_019680	GTT	2	6	882633	882638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15580	NC_019680	TTTG	2	8	882761	882768	0 %	75 %	25 %	0 %	427712024
15581	NC_019680	AG	3	6	882880	882885	50 %	0 %	50 %	0 %	427712024
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15587	NC_019680	GAA	2	6	883165	883170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_019680	CAG	2	6	883223	883228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712025
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15592	NC_019680	CGTGT	2	10	883400	883409	0 %	40 %	40 %	20 %	427712025
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15598	NC_019680	G	6	6	883553	883558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15599	NC_019680	CTT	2	6	883559	883564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15602	NC_019680	AGC	2	6	883769	883774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15604	NC_019680	GCT	2	6	883852	883857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_019680	A	6	6	883962	883967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_019680	CCT	2	6	883998	884003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15607	NC_019680	CCTGC	2	10	884020	884029	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15608	NC_019680	TCC	2	6	884063	884068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15609	NC_019680	TTTC	2	8	884172	884179	0 %	75 %	0 %	25 %	427712026
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15617	NC_019680	A	7	7	884582	884588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_019680	TGA	2	6	884596	884601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_019680	A	7	7	884606	884612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_019680	ACA	2	6	884653	884658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_019680	GA	3	6	884676	884681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_019680	TTC	2	6	884708	884713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_019680	ATC	2	6	884715	884720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15743	NC_019680	GCT	2	6	890718	890723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15744	NC_019680	ACA	2	6	890759	890764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712032
15745	NC_019680	AGGA	2	8	890773	890780	50 %	0 %	50 %	0 %	427712032
15746	NC_019680	GCG	2	6	890836	890841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
15747	NC_019680	GAT	2	6	890964	890969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
15748	NC_019680	TGG	2	6	890991	890996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712032
15749	NC_019680	G	6	6	891023	891028	0 %	0 %	100 %	0 %	427712032
15750	NC_019680	GAG	2	6	891067	891072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
15751	NC_019680	ACGA	2	8	891074	891081	50 %	0 %	25 %	25 %	427712032
15752	NC_019680	CTT	2	6	891120	891125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
15753	NC_019680	CTGG	2	8	891129	891136	0 %	25 %	50 %	25 %	427712032
15754	NC_019680	GT	3	6	891161	891166	0 %	50 %	50 %	0 %	427712032
15755	NC_019680	AGA	2	6	891209	891214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15756	NC_019680	CGG	3	9	891243	891251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
15757	NC_019680	TTC	2	6	891421	891426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
15758	NC_019680	ACA	2	6	891458	891463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712032
15759	NC_019680	CAC	2	6	891501	891506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712032
15760	NC_019680	CGC	2	6	891535	891540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712032
15761	NC_019680	GAAG	2	8	891558	891565	50 %	0 %	50 %	0 %	427712032
15762	NC_019680	AAT	2	6	891580	891585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712032
15763	NC_019680	AAGGA	2	10	891593	891602	60 %	0 %	40 %	0 %	427712032
15764	NC_019680	GAA	2	6	891616	891621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15765	NC_019680	GAA	2	6	891657	891662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15766	NC_019680	CTT	2	6	891711	891716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
15767	NC_019680	CCGACC	2	12	891764	891775	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	427712032
15768	NC_019680	GCCA	2	8	891883	891890	25 %	0 %	25 %	50 %	427712032
15769	NC_019680	GAA	2	6	891948	891953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15770	NC_019680	TTTG	2	8	891982	891989	0 %	75 %	25 %	0 %	427712032
15771	NC_019680	GGT	2	6	892065	892070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712032
15772	NC_019680	GTC	2	6	892075	892080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15773	NC_019680	GCT	2	6	892116	892121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15774	NC_019680	GAG	3	9	892129	892137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
15775	NC_019680	AAG	2	6	892162	892167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15776	NC_019680	AG	3	6	892177	892182	50 %	0 %	50 %	0 %	427712032
15777	NC_019680	GCCA	2	8	892208	892215	25 %	0 %	25 %	50 %	427712032
15778	NC_019680	CCCT	2	8	892267	892274	0 %	25 %	0 %	75 %	427712032
15779	NC_019680	TC	3	6	892281	892286	0 %	50 %	0 %	50 %	427712032
15780	NC_019680	TTC	2	6	892306	892311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
15781	NC_019680	CGG	2	6	892387	892392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
15782	NC_019680	TGA	2	6	892463	892468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
15783	NC_019680	CTG	2	6	892543	892548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15784	NC_019680	TTG	2	6	892556	892561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712032
15785	NC_019680	CCG	2	6	892619	892624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712032
15786	NC_019680	TTG	2	6	892778	892783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427712032
15787	NC_019680	GAG	2	6	892804	892809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
15788	NC_019680	GGC	2	6	892813	892818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
15789	NC_019680	CAGC	2	8	892841	892848	25 %	0 %	25 %	50 %	427712032
15790	NC_019680	TCA	2	6	892957	892962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712032
15791	NC_019680	TTC	2	6	893110	893115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712032
15792	NC_019680	CAA	2	6	893190	893195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712032
15793	NC_019680	CA	3	6	893203	893208	50 %	0 %	0 %	50 %	427712032
15794	NC_019680	GAG	2	6	893234	893239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712032
15795	NC_019680	GCTG	2	8	893262	893269	0 %	25 %	50 %	25 %	427712032
15796	NC_019680	AC	3	6	893281	893286	50 %	0 %	0 %	50 %	427712032
15797	NC_019680	TGA	2	6	893342	893347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
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15799	NC_019680	GAAA	2	8	893490	893497	75 %	0 %	25 %	0 %	427712032
15800	NC_019680	GAGAC	2	10	893510	893519	40 %	0 %	40 %	20 %	427712032
15801	NC_019680	TCG	2	6	893531	893536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15802	NC_019680	CGC	2	6	893537	893542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712032
15803	NC_019680	AGTC	2	8	893579	893586	25 %	25 %	25 %	25 %	427712032
15804	NC_019680	TCAA	2	8	893597	893604	50 %	25 %	0 %	25 %	427712032
15805	NC_019680	AGA	2	6	893649	893654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15806	NC_019680	GTA	2	6	893855	893860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712032
15807	NC_019680	TG	3	6	893964	893969	0 %	50 %	50 %	0 %	427712032
15808	NC_019680	GAC	2	6	893989	893994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15809	NC_019680	ACT	2	6	894116	894121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712032
15810	NC_019680	GAA	3	9	894219	894227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15811	NC_019680	CTA	2	6	894243	894248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712032
15812	NC_019680	CTG	2	6	894268	894273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15813	NC_019680	GCC	2	6	894323	894328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427712032
15814	NC_019680	AAG	2	6	894395	894400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15815	NC_019680	GCG	2	6	894460	894465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712032
15816	NC_019680	CGT	2	6	894498	894503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712032
15817	NC_019680	AAG	2	6	894542	894547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712032
15818	NC_019680	GGCA	2	8	894573	894580	25 %	0 %	50 %	25 %	427712032
15819	NC_019680	CATC	2	8	894593	894600	25 %	25 %	0 %	50 %	427712032
15820	NC_019680	GCAA	2	8	894602	894609	50 %	0 %	25 %	25 %	427712032
15821	NC_019680	GTT	2	6	894677	894682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15822	NC_019680	ACC	2	6	894741	894746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712033
15823	NC_019680	GCTG	2	8	894767	894774	0 %	25 %	50 %	25 %	427712033
15824	NC_019680	GAC	2	6	894778	894783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712033
15825	NC_019680	TTGAGA	2	12	894860	894871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712033
15826	NC_019680	GAT	2	6	894880	894885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712033
15827	NC_019680	TGC	2	6	895007	895012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712033
15828	NC_019680	GTG	2	6	895061	895066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712033
15829	NC_019680	GTG	2	6	895087	895092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712033
15830	NC_019680	TGG	2	6	895190	895195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712033
15831	NC_019680	TGC	2	6	895211	895216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712033
15832	NC_019680	TCG	2	6	895257	895262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712033
15833	NC_019680	AAC	2	6	895328	895333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712033
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15835	NC_019680	GTC	2	6	895536	895541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712033
15836	NC_019680	GGAT	2	8	895707	895714	25 %	25 %	50 %	0 %	427712033
15837	NC_019680	TTGG	2	8	895740	895747	0 %	50 %	50 %	0 %	427712033
15838	NC_019680	ATG	2	6	895830	895835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712033
15839	NC_019680	GCT	2	6	895862	895867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712034
15840	NC_019680	TTA	2	6	895906	895911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427712034
15841	NC_019680	TGG	2	6	896147	896152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712034
15842	NC_019680	ACTG	2	8	896180	896187	25 %	25 %	25 %	25 %	427712034
15843	NC_019680	TAC	2	6	896210	896215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712034
15844	NC_019680	GAT	2	6	896301	896306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712034
15845	NC_019680	AAC	2	6	896330	896335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712034
15846	NC_019680	ATG	2	6	896394	896399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712034
15847	NC_019680	GAC	2	6	896427	896432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712034
15848	NC_019680	GAG	2	6	896496	896501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427712034
15849	NC_019680	AAT	2	6	896541	896546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427712034
15850	NC_019680	TG	3	6	896677	896682	0 %	50 %	50 %	0 %	427712034
15851	NC_019680	TGG	2	6	896704	896709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712034
15852	NC_019680	TGG	2	6	896721	896726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427712035
15853	NC_019680	TGA	2	6	896770	896775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712035
15854	NC_019680	CT	3	6	896859	896864	0 %	50 %	0 %	50 %	427712035
15855	NC_019680	CTT	2	6	896875	896880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427712035
15856	NC_019680	CAT	2	6	896969	896974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712035
15857	NC_019680	ATTG	2	8	896977	896984	25 %	50 %	25 %	0 %	427712035
15858	NC_019680	ACA	2	6	897019	897024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712035
15859	NC_019680	CAT	2	6	897030	897035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712035
15860	NC_019680	GAT	2	6	897143	897148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427712035
15861	NC_019680	AAG	2	6	897225	897230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427712035
15862	NC_019680	GCT	2	6	897284	897289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712035
15863	NC_019680	ACA	2	6	897301	897306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427712035
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15874	NC_019680	CTTAT	2	10	897761	897770	20 %	60 %	0 %	20 %	427712035
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15982	NC_019680	A	6	6	903818	903823	100 %	0 %	0 %	0 %	427712037
15983	NC_019680	GGA	2	6	903935	903940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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