MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019680	GCC	2	6	847641	847646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711983
15002	NC_019680	TTC	2	6	847661	847666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711983
15003	NC_019680	CCA	2	6	847816	847821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711983
15004	NC_019680	GTT	2	6	847852	847857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711983
15005	NC_019680	T	6	6	847987	847992	0 %	100 %	0 %	0 %	427711983
15006	NC_019680	GGTTT	2	10	848088	848097	0 %	60 %	40 %	0 %	427711983
15007	NC_019680	GCC	2	6	848228	848233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711983
15008	NC_019680	AAT	2	6	848240	848245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711983
15009	NC_019680	CAC	2	6	848246	848251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711983
15010	NC_019680	CGC	2	6	848344	848349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711983
15011	NC_019680	GTG	2	6	848388	848393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711983
15012	NC_019680	AAT	2	6	848560	848565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711983
15013	NC_019680	CGA	2	6	848599	848604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711983
15014	NC_019680	ACC	2	6	848625	848630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711983
15015	NC_019680	CCA	2	6	848631	848636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711983
15016	NC_019680	GTT	2	6	848732	848737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_019680	GGC	2	6	848871	848876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_019680	TGG	2	6	848969	848974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_019680	GGCCTG	2	12	848985	848996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_019680	GAG	3	9	849075	849083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_019680	CCCGG	2	10	849087	849096	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15022	NC_019680	GATT	2	8	849128	849135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_019680	CTTTT	2	10	849157	849166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15024	NC_019680	CAT	2	6	849186	849191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711984
15025	NC_019680	AAT	2	6	849258	849263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711984
15026	NC_019680	G	6	6	849266	849271	0 %	0 %	100 %	0 %	427711984
15027	NC_019680	GGTGG	2	10	849381	849390	0 %	20 %	80 %	0 %	427711984
15028	NC_019680	GCT	2	6	849433	849438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711984
15029	NC_019680	TTC	2	6	849456	849461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711984
15030	NC_019680	GGT	2	6	849594	849599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711984
15031	NC_019680	ATT	2	6	849620	849625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711985
15032	NC_019680	ATT	2	6	849675	849680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711985
15033	NC_019680	CAG	2	6	849728	849733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711985
15034	NC_019680	TGGCC	2	10	849770	849779	0 %	20 %	40 %	40 %	427711985
15035	NC_019680	GTTT	2	8	849823	849830	0 %	75 %	25 %	0 %	427711985
15036	NC_019680	G	6	6	849917	849922	0 %	0 %	100 %	0 %	427711985
15037	NC_019680	GGTT	2	8	849943	849950	0 %	50 %	50 %	0 %	427711985
15038	NC_019680	GCC	2	6	849958	849963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711985
15039	NC_019680	TGG	2	6	850027	850032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711985
15040	NC_019680	TGC	2	6	850090	850095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711985
15041	NC_019680	GTT	2	6	850122	850127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711985
15042	NC_019680	GAG	2	6	850128	850133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711985
15043	NC_019680	GTT	2	6	850149	850154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711985
15044	NC_019680	G	6	6	850211	850216	0 %	0 %	100 %	0 %	427711985
15045	NC_019680	GGC	2	6	850314	850319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711985
15046	NC_019680	ATG	2	6	850332	850337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711985
15047	NC_019680	CAC	2	6	850383	850388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711985
15048	NC_019680	GTT	2	6	850445	850450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711985
15049	NC_019680	GAT	2	6	850505	850510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711985
15050	NC_019680	CAGTTG	2	12	850566	850577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427711985
15051	NC_019680	TTA	2	6	850627	850632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711985
15052	NC_019680	GGA	2	6	850696	850701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711985
15053	NC_019680	G	7	7	850708	850714	0 %	0 %	100 %	0 %	427711985
15054	NC_019680	ACT	2	6	850741	850746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711985
15055	NC_019680	TGG	2	6	850801	850806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711985
15056	NC_019680	CGGAT	2	10	850810	850819	20 %	20 %	40 %	20 %	427711985
15057	NC_019680	ACA	2	6	850915	850920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711985
15058	NC_019680	GGT	2	6	850942	850947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711985
15059	NC_019680	AC	3	6	851363	851368	50 %	0 %	0 %	50 %	427711985
15060	NC_019680	CCG	2	6	851385	851390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711985
15061	NC_019680	T	6	6	851471	851476	0 %	100 %	0 %	0 %	427711985
15062	NC_019680	CCA	2	6	851577	851582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711985
15063	NC_019680	CAC	2	6	851783	851788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711985
15064	NC_019680	TTG	2	6	851838	851843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711985
15065	NC_019680	T	6	6	851852	851857	0 %	100 %	0 %	0 %	427711985
15066	NC_019680	AAC	2	6	851872	851877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711985
15067	NC_019680	TC	3	6	851979	851984	0 %	50 %	0 %	50 %	427711985
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15070	NC_019680	CAA	2	6	852236	852241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711985
15071	NC_019680	AAAT	2	8	852393	852400	75 %	25 %	0 %	0 %	427711985
15072	NC_019680	CCA	2	6	852450	852455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711985
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15074	NC_019680	C	6	6	852546	852551	0 %	0 %	0 %	100 %	427711985
15075	NC_019680	T	7	7	852568	852574	0 %	100 %	0 %	0 %	427711985
15076	NC_019680	CTG	2	6	852675	852680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711985
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15078	NC_019680	C	6	6	852820	852825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15079	NC_019680	GTC	2	6	852865	852870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15080	NC_019680	AAT	2	6	852890	852895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_019680	CT	3	6	852916	852921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15082	NC_019680	ATCA	2	8	852945	852952	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15083	NC_019680	G	6	6	853001	853006	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_019680	TTG	2	6	853010	853015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_019680	AATC	2	8	853019	853026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15086	NC_019680	T	7	7	853029	853035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_019680	GAA	2	6	853261	853266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711986
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15090	NC_019680	TATCT	2	10	853344	853353	20 %	60 %	0 %	20 %	427711986
15091	NC_019680	CAT	2	6	853371	853376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711986
15092	NC_019680	GCC	2	6	853411	853416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711986
15093	NC_019680	CCG	2	6	853679	853684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711986
15094	NC_019680	GGA	2	6	853695	853700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711986
15095	NC_019680	ATTT	2	8	853715	853722	25 %	75 %	0 %	0 %	427711986
15096	NC_019680	CGC	2	6	853731	853736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711986
15097	NC_019680	TG	3	6	853752	853757	0 %	50 %	50 %	0 %	427711986
15098	NC_019680	AATA	2	8	853771	853778	75 %	25 %	0 %	0 %	427711987
15099	NC_019680	ATT	2	6	853794	853799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711987
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15101	NC_019680	TCCTC	2	10	853868	853877	0 %	40 %	0 %	60 %	427711987
15102	NC_019680	ACA	2	6	853881	853886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711987
15103	NC_019680	AAC	2	6	853902	853907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711987
15104	NC_019680	CCTGG	2	10	853927	853936	0 %	20 %	40 %	40 %	427711987
15105	NC_019680	AGTT	2	8	853956	853963	25 %	50 %	25 %	0 %	427711987
15106	NC_019680	ATT	2	6	854093	854098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711987
15107	NC_019680	A	7	7	854249	854255	100 %	0 %	0 %	0 %	427711987
15108	NC_019680	TCAAA	2	10	854355	854364	60 %	20 %	0 %	20 %	427711987
15109	NC_019680	A	6	6	854373	854378	100 %	0 %	0 %	0 %	427711987
15110	NC_019680	TG	3	6	854420	854425	0 %	50 %	50 %	0 %	427711987
15111	NC_019680	GGTT	2	8	854473	854480	0 %	50 %	50 %	0 %	427711987
15112	NC_019680	GAT	2	6	854518	854523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711987
15113	NC_019680	TCA	2	6	854620	854625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711987
15114	NC_019680	GGATT	2	10	854956	854965	20 %	40 %	40 %	0 %	427711988
15115	NC_019680	TAA	2	6	855019	855024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711988
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15117	NC_019680	GAT	2	6	855278	855283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711988
15118	NC_019680	GGC	2	6	855378	855383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711988
15119	NC_019680	TTA	3	9	855435	855443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711988
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15121	NC_019680	TCC	2	6	855487	855492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711988
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15123	NC_019680	GA	3	6	855567	855572	50 %	0 %	50 %	0 %	427711988
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15251	NC_019680	GCCCC	2	10	863061	863070	0 %	0 %	20 %	80 %	427711998
15252	NC_019680	TGT	2	6	863089	863094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711998
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15254	NC_019680	GCT	2	6	863165	863170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711998
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15486	NC_019680	AATC	2	8	876537	876544	50 %	25 %	0 %	25 %	427712018
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15489	NC_019680	GCA	2	6	876717	876722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712018
15490	NC_019680	CCA	2	6	876726	876731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712018
15491	NC_019680	CAC	2	6	876739	876744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427712018
15492	NC_019680	G	6	6	876750	876755	0 %	0 %	100 %	0 %	427712018
15493	NC_019680	CTGGC	2	10	876915	876924	0 %	20 %	40 %	40 %	427712018
15494	NC_019680	TCA	2	6	876986	876991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712018
15495	NC_019680	GTTG	2	8	877007	877014	0 %	50 %	50 %	0 %	427712018
15496	NC_019680	CGG	2	6	877074	877079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427712018
15497	NC_019680	ATC	2	6	877111	877116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427712018
15498	NC_019680	CTG	2	6	877138	877143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712018
15499	NC_019680	GCT	2	6	877241	877246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427712018
15500	NC_019680	CAG	2	6	877281	877286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427712018

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