MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_019680	CCG	2	6	820057	820062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711956
14502	NC_019680	CCA	2	6	820239	820244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711956
14503	NC_019680	CATGGC	2	12	820260	820271	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427711956
14504	NC_019680	AGA	2	6	820403	820408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711956
14505	NC_019680	CGC	2	6	820411	820416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711956
14506	NC_019680	GAT	2	6	820430	820435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711956
14507	NC_019680	GTT	2	6	820502	820507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711956
14508	NC_019680	CCA	2	6	820566	820571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711956
14509	NC_019680	GCC	2	6	820595	820600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711956
14510	NC_019680	CATCC	2	10	820620	820629	20 %	20 %	0 %	60 %	427711956
14511	NC_019680	GAG	2	6	820641	820646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711956
14512	NC_019680	G	6	6	820646	820651	0 %	0 %	100 %	0 %	427711956
14513	NC_019680	GCC	2	6	820679	820684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711956
14514	NC_019680	ATCA	2	8	820719	820726	50 %	25 %	0 %	25 %	427711956
14515	NC_019680	GCCAG	2	10	820783	820792	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14516	NC_019680	GAG	2	6	820918	820923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711957
14517	NC_019680	CGG	2	6	820948	820953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711957
14518	NC_019680	CCT	2	6	820989	820994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711957
14519	NC_019680	AAC	2	6	821054	821059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711957
14520	NC_019680	GCGAT	2	10	821138	821147	20 %	20 %	40 %	20 %	427711957
14521	NC_019680	TGA	2	6	821214	821219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711957
14522	NC_019680	TC	3	6	821225	821230	0 %	50 %	0 %	50 %	427711957
14523	NC_019680	A	7	7	821329	821335	100 %	0 %	0 %	0 %	427711958
14524	NC_019680	TGA	2	6	821427	821432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711958
14525	NC_019680	CAAT	2	8	821492	821499	50 %	25 %	0 %	25 %	427711958
14526	NC_019680	ATTT	2	8	821572	821579	25 %	75 %	0 %	0 %	427711958
14527	NC_019680	ATG	2	6	821588	821593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711958
14528	NC_019680	GGA	2	6	821665	821670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711958
14529	NC_019680	CAG	2	6	821752	821757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711958
14530	NC_019680	AAT	2	6	821785	821790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711958
14531	NC_019680	GAC	2	6	821914	821919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_019680	GA	3	6	821933	821938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_019680	ACCCA	2	10	822094	822103	40 %	0 %	0 %	60 %	427711959
14534	NC_019680	ATCTC	2	10	822257	822266	20 %	40 %	0 %	40 %	427711959
14535	NC_019680	CAT	2	6	822534	822539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711959
14536	NC_019680	T	6	6	822591	822596	0 %	100 %	0 %	0 %	427711959
14537	NC_019680	CGG	2	6	822625	822630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711959
14538	NC_019680	ACTC	2	8	822746	822753	25 %	25 %	0 %	50 %	427711959
14539	NC_019680	TCAA	2	8	822793	822800	50 %	25 %	0 %	25 %	427711959
14540	NC_019680	AGTCA	2	10	822852	822861	40 %	20 %	20 %	20 %	427711959
14541	NC_019680	CGC	2	6	822884	822889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711959
14542	NC_019680	T	6	6	823173	823178	0 %	100 %	0 %	0 %	427711959
14543	NC_019680	CAA	2	6	823191	823196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711959
14544	NC_019680	CCT	2	6	823385	823390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711959
14545	NC_019680	T	8	8	823531	823538	0 %	100 %	0 %	0 %	427711959
14546	NC_019680	TGA	2	6	823745	823750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711959
14547	NC_019680	GCT	2	6	823758	823763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711959
14548	NC_019680	TGT	2	6	823776	823781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711959
14549	NC_019680	TA	3	6	823824	823829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_019680	TAT	2	6	823848	823853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_019680	CAT	2	6	823857	823862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14552	NC_019680	CAA	2	6	823885	823890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_019680	AT	3	6	823941	823946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_019680	TAT	2	6	823980	823985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_019680	AGA	2	6	824004	824009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_019680	T	6	6	824022	824027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_019680	GAA	2	6	824041	824046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711960
14558	NC_019680	GTT	2	6	824047	824052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711960
14559	NC_019680	AGA	2	6	824070	824075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711960
14560	NC_019680	GCG	2	6	824132	824137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711960
14561	NC_019680	CCAG	2	8	824143	824150	25 %	0 %	25 %	50 %	427711960
14562	NC_019680	TGT	2	6	824184	824189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711960
14563	NC_019680	GAA	2	6	824221	824226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711960
14564	NC_019680	AGC	2	6	824231	824236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711960
14565	NC_019680	AGTT	2	8	824255	824262	25 %	50 %	25 %	0 %	427711960
14566	NC_019680	GAA	2	6	824301	824306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711960
14567	NC_019680	TGA	2	6	824319	824324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711960
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14569	NC_019680	GTAT	2	8	824397	824404	25 %	50 %	25 %	0 %	427711960
14570	NC_019680	TGA	2	6	824433	824438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711960
14571	NC_019680	TCAATT	2	12	824439	824450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	427711960
14572	NC_019680	CTT	2	6	824472	824477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711960
14573	NC_019680	AGA	2	6	824610	824615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711960
14574	NC_019680	CAA	2	6	824622	824627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711960
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14577	NC_019680	AAT	2	6	824737	824742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_019680	GAA	2	6	824764	824769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_019680	AGC	2	6	824788	824793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_019680	TGA	2	6	824820	824825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_019680	GGA	2	6	824848	824853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_019680	CTT	2	6	824933	824938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711961
14583	NC_019680	TTC	2	6	824955	824960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711961
14584	NC_019680	CAT	2	6	825012	825017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711961
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14586	NC_019680	GCT	2	6	825043	825048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711961
14587	NC_019680	AATG	2	8	825232	825239	50 %	25 %	25 %	0 %	427711961
14588	NC_019680	ACC	2	6	825247	825252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711961
14589	NC_019680	AACC	2	8	825306	825313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14590	NC_019680	ACT	2	6	825318	825323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_019680	CAT	2	6	825329	825334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_019680	A	6	6	825339	825344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_019680	GGCC	2	8	825381	825388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14594	NC_019680	GAT	2	6	825406	825411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_019680	GTT	2	6	825419	825424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_019680	AGGAA	2	10	825465	825474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_019680	GTG	2	6	825497	825502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711962
14598	NC_019680	T	6	6	825513	825518	0 %	100 %	0 %	0 %	427711962
14599	NC_019680	GTC	2	6	825553	825558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711962
14600	NC_019680	ATG	2	6	825563	825568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711962
14601	NC_019680	ATGC	2	8	825643	825650	25 %	25 %	25 %	25 %	427711962
14602	NC_019680	CAGGC	2	10	825707	825716	20 %	0 %	40 %	40 %	427711962
14603	NC_019680	ACC	2	6	825881	825886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711962
14604	NC_019680	AGT	2	6	825890	825895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711962
14605	NC_019680	AGGC	2	8	825932	825939	25 %	0 %	50 %	25 %	427711963
14606	NC_019680	TGAA	2	8	825951	825958	50 %	25 %	25 %	0 %	427711963
14607	NC_019680	CAT	2	6	825964	825969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711963
14608	NC_019680	GTA	2	6	826118	826123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711963
14609	NC_019680	A	7	7	826142	826148	100 %	0 %	0 %	0 %	427711963
14610	NC_019680	CGT	2	6	826235	826240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711963
14611	NC_019680	ATG	2	6	826319	826324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711963
14612	NC_019680	GCA	2	6	826348	826353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711964
14613	NC_019680	ATG	2	6	826392	826397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711964
14614	NC_019680	ATG	2	6	826404	826409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711964
14615	NC_019680	GCTG	2	8	826415	826422	0 %	25 %	50 %	25 %	427711964
14616	NC_019680	TCC	2	6	826441	826446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711964
14617	NC_019680	CGC	3	9	826467	826475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711964
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14619	NC_019680	CCA	2	6	826499	826504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711964
14620	NC_019680	TTCAG	2	10	826519	826528	20 %	40 %	20 %	20 %	427711964
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14622	NC_019680	AAC	2	6	826584	826589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711964
14623	NC_019680	ATC	2	6	826698	826703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711964
14624	NC_019680	CAC	2	6	826713	826718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711964
14625	NC_019680	CCG	2	6	826721	826726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711964
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14627	NC_019680	CAC	2	6	826949	826954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711964
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