MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019680	CAA	2	6	653664	653669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711792
11502	NC_019680	GCA	2	6	653763	653768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711792
11503	NC_019680	GC	3	6	653923	653928	0 %	0 %	50 %	50 %	427711792
11504	NC_019680	GTT	3	9	653959	653967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711792
11505	NC_019680	CGGG	2	8	654041	654048	0 %	0 %	75 %	25 %	427711792
11506	NC_019680	TAA	2	6	654108	654113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_019680	AAAT	2	8	654132	654139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_019680	GAA	2	6	654213	654218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711793
11509	NC_019680	AAG	2	6	654226	654231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711793
11510	NC_019680	ATT	2	6	654296	654301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711793
11511	NC_019680	TCT	2	6	654323	654328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711793
11512	NC_019680	TGA	2	6	654335	654340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711793
11513	NC_019680	TGAT	2	8	654355	654362	25 %	50 %	25 %	0 %	427711793
11514	NC_019680	GAA	3	9	654369	654377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711793
11515	NC_019680	CT	3	6	654381	654386	0 %	50 %	0 %	50 %	427711793
11516	NC_019680	CAG	2	6	654409	654414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_019680	TTA	2	6	654419	654424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_019680	TAAA	2	8	654584	654591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_019680	TGA	2	6	654699	654704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_019680	CGG	2	6	654715	654720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_019680	CTCAAG	2	12	654769	654780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_019680	TAA	2	6	654932	654937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_019680	CAT	2	6	654995	655000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711794
11524	NC_019680	TGG	2	6	655029	655034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711794
11525	NC_019680	ATG	2	6	655081	655086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711794
11526	NC_019680	ACC	2	6	655095	655100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711794
11527	NC_019680	ATC	2	6	655207	655212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711794
11528	NC_019680	CT	3	6	655247	655252	0 %	50 %	0 %	50 %	427711794
11529	NC_019680	GGCT	2	8	655301	655308	0 %	25 %	50 %	25 %	427711794
11530	NC_019680	GGC	2	6	655346	655351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711794
11531	NC_019680	GCA	2	6	655412	655417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711794
11532	NC_019680	TAT	2	6	655532	655537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711794
11533	NC_019680	CTCTG	2	10	655544	655553	0 %	40 %	20 %	40 %	427711794
11534	NC_019680	CGG	2	6	655614	655619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711794
11535	NC_019680	AAC	2	6	655672	655677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711794
11536	NC_019680	ATC	2	6	655696	655701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711794
11537	NC_019680	GCCA	2	8	655806	655813	25 %	0 %	25 %	50 %	427711794
11538	NC_019680	CCA	2	6	655840	655845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711794
11539	NC_019680	CCCG	2	8	655881	655888	0 %	0 %	25 %	75 %	427711794
11540	NC_019680	G	6	6	655922	655927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_019680	GCC	2	6	655943	655948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_019680	TGCC	2	8	655950	655957	0 %	25 %	25 %	50 %	427711795
11543	NC_019680	TCCCAG	2	12	655988	655999	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427711795
11544	NC_019680	CCG	2	6	656015	656020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711795
11545	NC_019680	ACC	2	6	656051	656056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711795
11546	NC_019680	CTA	2	6	656062	656067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711795
11547	NC_019680	CAA	2	6	656079	656084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711795
11548	NC_019680	GCC	2	6	656090	656095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711795
11549	NC_019680	TGGTG	2	10	656164	656173	0 %	40 %	60 %	0 %	427711795
11550	NC_019680	GGT	2	6	656174	656179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711795
11551	NC_019680	CA	3	6	656201	656206	50 %	0 %	0 %	50 %	427711795
11552	NC_019680	CAG	2	6	656294	656299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711795
11553	NC_019680	GCA	2	6	656318	656323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711795
11554	NC_019680	A	6	6	656346	656351	100 %	0 %	0 %	0 %	427711795
11555	NC_019680	GGA	2	6	656358	656363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711795
11556	NC_019680	GCG	2	6	656378	656383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711795
11557	NC_019680	C	6	6	656386	656391	0 %	0 %	0 %	100 %	427711795
11558	NC_019680	CTT	2	6	656412	656417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711795
11559	NC_019680	ATC	2	6	656444	656449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711795
11560	NC_019680	GACT	2	8	656469	656476	25 %	25 %	25 %	25 %	427711795
11561	NC_019680	AGTTA	2	10	656517	656526	40 %	40 %	20 %	0 %	427711795
11562	NC_019680	TCAA	2	8	656552	656559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_019680	A	7	7	656582	656588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_019680	AGT	2	6	656596	656601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11567	NC_019680	A	6	6	656766	656771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_019680	AC	3	6	656865	656870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_019680	ACA	2	6	656954	656959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_019680	TC	3	6	657019	657024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_019680	AAG	2	6	657139	657144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_019680	GTC	2	6	657285	657290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711796
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11587	NC_019680	GTC	2	6	657927	657932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711796
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11590	NC_019680	TTC	2	6	657983	657988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711796
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11593	NC_019680	TAC	2	6	658285	658290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711796
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11596	NC_019680	GCC	2	6	658392	658397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11597	NC_019680	AG	3	6	658504	658509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_019680	GAA	2	6	658511	658516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_019680	CAT	2	6	658571	658576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711797
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11601	NC_019680	GTT	2	6	658622	658627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711797
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11604	NC_019680	GCC	2	6	658725	658730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711797
11605	NC_019680	CA	3	6	658806	658811	50 %	0 %	0 %	50 %	427711797
11606	NC_019680	ATC	2	6	658942	658947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711797
11607	NC_019680	CCAG	2	8	658978	658985	25 %	0 %	25 %	50 %	427711797
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11613	NC_019680	CTTA	2	8	659280	659287	25 %	50 %	0 %	25 %	427711797
11614	NC_019680	CGGTTT	2	12	659351	659362	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711797
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11618	NC_019680	GAC	2	6	659625	659630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_019680	GCACT	2	10	659729	659738	20 %	20 %	20 %	40 %	427711798
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11741	NC_019680	AAC	2	6	665631	665636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11989	NC_019680	GCGGA	2	10	681149	681158	20 %	0 %	60 %	20 %	427711818
11990	NC_019680	GCATTG	2	12	681219	681230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427711818
11991	NC_019680	CCT	2	6	681265	681270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711818
11992	NC_019680	CCT	2	6	681364	681369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711818
11993	NC_019680	CGG	2	6	681389	681394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711818
11994	NC_019680	ACCA	2	8	681426	681433	50 %	0 %	0 %	50 %	427711818
11995	NC_019680	GCA	2	6	681487	681492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711818
11996	NC_019680	TGG	2	6	681569	681574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711818
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11998	NC_019680	ATCC	2	8	681805	681812	25 %	25 %	0 %	50 %	427711818
11999	NC_019680	CGGGA	2	10	681847	681856	20 %	0 %	60 %	20 %	427711818
12000	NC_019680	GCT	2	6	681912	681917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711818

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