MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_019680	GTT	2	6	625515	625520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711764
11003	NC_019680	ACCA	2	8	625529	625536	50 %	0 %	0 %	50 %	427711764
11004	NC_019680	CAT	2	6	625537	625542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711764
11005	NC_019680	GC	3	6	625573	625578	0 %	0 %	50 %	50 %	427711764
11006	NC_019680	GC	3	6	625648	625653	0 %	0 %	50 %	50 %	427711764
11007	NC_019680	T	6	6	625660	625665	0 %	100 %	0 %	0 %	427711764
11008	NC_019680	GCG	2	6	625745	625750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711764
11009	NC_019680	TTC	2	6	625754	625759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711764
11010	NC_019680	TGG	2	6	625800	625805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_019680	CCCGG	2	10	625937	625946	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11012	NC_019680	T	6	6	626033	626038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_019680	AGC	2	6	626041	626046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_019680	TGA	2	6	626141	626146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711765
11015	NC_019680	TAA	2	6	626185	626190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711765
11016	NC_019680	CCA	2	6	626223	626228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711765
11017	NC_019680	CCA	2	6	626277	626282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711765
11018	NC_019680	GCC	2	6	626297	626302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711765
11019	NC_019680	TTGA	2	8	626338	626345	25 %	50 %	25 %	0 %	427711765
11020	NC_019680	CAG	2	6	626347	626352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711765
11021	NC_019680	CAA	2	6	626353	626358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711765
11022	NC_019680	CCCG	2	8	626380	626387	0 %	0 %	25 %	75 %	427711765
11023	NC_019680	TGGTTC	2	12	626397	626408	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711765
11024	NC_019680	C	6	6	626462	626467	0 %	0 %	0 %	100 %	427711765
11025	NC_019680	AACC	2	8	626597	626604	50 %	0 %	0 %	50 %	427711765
11026	NC_019680	CGGA	2	8	626642	626649	25 %	0 %	50 %	25 %	427711765
11027	NC_019680	CCGG	2	8	626733	626740	0 %	0 %	50 %	50 %	427711765
11028	NC_019680	TGC	2	6	626744	626749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711765
11029	NC_019680	AAT	2	6	626831	626836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_019680	C	6	6	626845	626850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11031	NC_019680	T	6	6	626952	626957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_019680	C	6	6	626989	626994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11033	NC_019680	CTC	2	6	627057	627062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711766
11034	NC_019680	TGAA	2	8	627306	627313	50 %	25 %	25 %	0 %	427711766
11035	NC_019680	ACA	2	6	627320	627325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711766
11036	NC_019680	TGG	2	6	627384	627389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711766
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11038	NC_019680	CGC	2	6	627548	627553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711766
11039	NC_019680	TCCC	2	8	627622	627629	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11040	NC_019680	CT	4	8	627639	627646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11041	NC_019680	GAAG	2	8	627659	627666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_019680	GGA	2	6	627704	627709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_019680	T	7	7	627725	627731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_019680	GCC	2	6	627748	627753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11045	NC_019680	CTT	2	6	627806	627811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_019680	TGAT	2	8	627898	627905	25 %	50 %	25 %	0 %	427711767
11047	NC_019680	AGA	2	6	628100	628105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711767
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11050	NC_019680	CT	3	6	628384	628389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11051	NC_019680	GTT	2	6	628404	628409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_019680	GTT	3	9	628415	628423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_019680	GCCTG	2	10	628441	628450	0 %	20 %	40 %	40 %	427711768
11054	NC_019680	TCAA	2	8	628461	628468	50 %	25 %	0 %	25 %	427711768
11055	NC_019680	AAG	2	6	628506	628511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711768
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11058	NC_019680	TCG	2	6	628608	628613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711768
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11063	NC_019680	CT	3	6	628817	628822	0 %	50 %	0 %	50 %	427711768
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11071	NC_019680	CCCA	2	8	629417	629424	25 %	0 %	0 %	75 %	427711768
11072	NC_019680	ACC	2	6	629543	629548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711768
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11099	NC_019680	CTG	2	6	631194	631199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711771
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11102	NC_019680	T	6	6	631361	631366	0 %	100 %	0 %	0 %	427711771
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11106	NC_019680	GGCCCA	2	12	631543	631554	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711771
11107	NC_019680	TGA	2	6	631606	631611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711771
11108	NC_019680	AAT	2	6	631634	631639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711771
11109	NC_019680	GGCCT	2	10	631676	631685	0 %	20 %	40 %	40 %	427711771
11110	NC_019680	CAC	2	6	631714	631719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711771
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11246	NC_019680	CGC	2	6	639453	639458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11247	NC_019680	CTG	2	6	639499	639504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11248	NC_019680	GGC	2	6	639521	639526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11249	NC_019680	CAA	2	6	639647	639652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11250	NC_019680	GAT	2	6	639657	639662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11254	NC_019680	GAATT	2	10	639805	639814	40 %	40 %	20 %	0 %	427711778
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11264	NC_019680	TAGA	2	8	640366	640373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11363	NC_019680	AT	3	6	646587	646592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11365	NC_019680	CTCA	2	8	646725	646732	25 %	25 %	0 %	50 %	427711786
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11491	NC_019680	CCG	2	6	653095	653100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711792
11492	NC_019680	TGA	2	6	653112	653117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711792
11493	NC_019680	AGC	2	6	653145	653150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711792
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