MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_019680	TGT	2	6	567811	567816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_019680	G	6	6	567860	567865	0 %	0 %	100 %	0 %	427711708
10003	NC_019680	GCC	2	6	567933	567938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711708
10004	NC_019680	GCA	2	6	568197	568202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10005	NC_019680	GAT	2	6	568247	568252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711708
10006	NC_019680	AAT	2	6	568286	568291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711708
10007	NC_019680	CGG	2	6	568324	568329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711708
10008	NC_019680	GGCCTG	2	12	568355	568366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711708
10009	NC_019680	GCC	2	6	568401	568406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711708
10010	NC_019680	TGC	2	6	568412	568417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10011	NC_019680	ACA	2	6	568470	568475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711708
10012	NC_019680	CCG	2	6	568568	568573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711708
10013	NC_019680	GAC	2	6	568603	568608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10014	NC_019680	ATAA	2	8	568610	568617	75 %	25 %	0 %	0 %	427711708
10015	NC_019680	CTG	2	6	568666	568671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10016	NC_019680	CT	3	6	568787	568792	0 %	50 %	0 %	50 %	427711708
10017	NC_019680	GGGGT	2	10	568816	568825	0 %	20 %	80 %	0 %	427711708
10018	NC_019680	G	7	7	568837	568843	0 %	0 %	100 %	0 %	427711708
10019	NC_019680	GGGCGG	2	12	568983	568994	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	427711708
10020	NC_019680	GTC	2	6	569137	569142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10021	NC_019680	CGGC	3	12	569167	569178	0 %	0 %	50 %	50 %	427711708
10022	NC_019680	TGT	2	6	569227	569232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711708
10023	NC_019680	CCGG	2	8	569278	569285	0 %	0 %	50 %	50 %	427711708
10024	NC_019680	G	6	6	569305	569310	0 %	0 %	100 %	0 %	427711708
10025	NC_019680	CAC	2	6	569332	569337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711708
10026	NC_019680	ACG	2	6	569348	569353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711708
10027	NC_019680	GAG	2	6	569393	569398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_019680	GCT	2	6	569435	569440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_019680	TAA	2	6	569506	569511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_019680	GCA	2	6	569535	569540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10031	NC_019680	TGCC	2	8	569594	569601	0 %	25 %	25 %	50 %	427711709
10032	NC_019680	GCCTT	2	10	569668	569677	0 %	40 %	20 %	40 %	427711709
10033	NC_019680	TGC	2	6	569744	569749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10034	NC_019680	G	7	7	569824	569830	0 %	0 %	100 %	0 %	427711709
10035	NC_019680	TTG	2	6	569873	569878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711709
10036	NC_019680	G	6	6	569884	569889	0 %	0 %	100 %	0 %	427711709
10037	NC_019680	GCT	2	6	569950	569955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10038	NC_019680	AAG	2	6	569960	569965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711709
10039	NC_019680	GCG	2	6	569982	569987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711709
10040	NC_019680	GCT	2	6	570007	570012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10041	NC_019680	TCC	2	6	570020	570025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711709
10042	NC_019680	GTC	2	6	570056	570061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10043	NC_019680	CAGTCG	2	12	570141	570152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427711709
10044	NC_019680	GGCAAA	2	12	570279	570290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	427711710
10045	NC_019680	ACC	2	6	570373	570378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711710
10046	NC_019680	TCG	2	6	570387	570392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711710
10047	NC_019680	ACC	2	6	570397	570402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711710
10048	NC_019680	A	6	6	570418	570423	100 %	0 %	0 %	0 %	427711710
10049	NC_019680	CAA	2	6	570438	570443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711710
10050	NC_019680	AC	3	6	570444	570449	50 %	0 %	0 %	50 %	427711710
10051	NC_019680	AGT	3	9	570467	570475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711710
10052	NC_019680	TTA	2	6	570524	570529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_019680	CGG	2	6	570556	570561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711711
10054	NC_019680	GCG	2	6	570618	570623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711711
10055	NC_019680	TTA	2	6	570626	570631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711711
10056	NC_019680	ACA	2	6	570681	570686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711711
10057	NC_019680	TC	3	6	570785	570790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10058	NC_019680	CCAA	2	8	570887	570894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_019680	CTAT	2	8	570919	570926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10060	NC_019680	AAT	2	6	571063	571068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711712
10061	NC_019680	GCG	2	6	571071	571076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711712
10062	NC_019680	AGA	2	6	571281	571286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711712
10063	NC_019680	CGC	2	6	571356	571361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
10064	NC_019680	CAAA	2	8	571395	571402	75 %	0 %	0 %	25 %	427711712
10065	NC_019680	GCCC	2	8	571420	571427	0 %	0 %	25 %	75 %	427711712
10066	NC_019680	CAG	2	6	571550	571555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711712
10067	NC_019680	GCC	2	6	571588	571593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
10068	NC_019680	TGC	2	6	571626	571631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711712
10069	NC_019680	ACG	2	6	571663	571668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711712
10070	NC_019680	GCT	2	6	571675	571680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711712
10071	NC_019680	GGT	2	6	571770	571775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711712
10072	NC_019680	TGA	2	6	571866	571871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10073	NC_019680	TGA	2	6	571890	571895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10074	NC_019680	CCCT	2	8	571913	571920	0 %	25 %	0 %	75 %	427711712
10075	NC_019680	CGC	3	9	572002	572010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
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10077	NC_019680	C	6	6	572053	572058	0 %	0 %	0 %	100 %	427711712
10078	NC_019680	CAT	2	6	572121	572126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711712
10079	NC_019680	GTA	2	6	572141	572146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10080	NC_019680	ATG	2	6	572215	572220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10081	NC_019680	GTT	2	6	572250	572255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711712
10082	NC_019680	GCCTG	2	10	572282	572291	0 %	20 %	40 %	40 %	427711712
10083	NC_019680	ACA	3	9	572295	572303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711712
10084	NC_019680	TGA	3	9	572349	572357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10085	NC_019680	ATG	2	6	572410	572415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711712
10086	NC_019680	CGC	2	6	572433	572438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
10087	NC_019680	CCT	2	6	572500	572505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711712
10088	NC_019680	GAA	3	9	572506	572514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711712
10089	NC_019680	ACA	2	6	572517	572522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711712
10090	NC_019680	C	7	7	572526	572532	0 %	0 %	0 %	100 %	427711712
10091	NC_019680	CCG	2	6	572556	572561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
10092	NC_019680	CGC	2	6	572650	572655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711712
10093	NC_019680	GGT	2	6	572751	572756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711712
10094	NC_019680	TGG	2	6	572780	572785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711712
10095	NC_019680	AAC	2	6	572793	572798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711712
10096	NC_019680	CGG	2	6	572824	572829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711712
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10098	NC_019680	TTGC	2	8	572884	572891	0 %	50 %	25 %	25 %	427711712
10099	NC_019680	CTA	2	6	572899	572904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711712
10100	NC_019680	GAA	2	6	573016	573021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711712
10101	NC_019680	GAG	2	6	573156	573161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711713
10102	NC_019680	CCA	2	6	573384	573389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711713
10103	NC_019680	GTCA	2	8	573493	573500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_019680	CCAGG	2	10	573542	573551	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10105	NC_019680	AGTT	2	8	573588	573595	25 %	50 %	25 %	0 %	427711714
10106	NC_019680	T	7	7	573666	573672	0 %	100 %	0 %	0 %	427711714
10107	NC_019680	C	7	7	573740	573746	0 %	0 %	0 %	100 %	427711714
10108	NC_019680	ACC	2	6	573903	573908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711714
10109	NC_019680	GCC	2	6	573936	573941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711714
10110	NC_019680	GCAAT	2	10	574080	574089	40 %	20 %	20 %	20 %	427711714
10111	NC_019680	AAGA	2	8	574166	574173	75 %	0 %	25 %	0 %	427711714
10112	NC_019680	GAA	2	6	574175	574180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711714
10113	NC_019680	GAC	2	6	574225	574230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711714
10114	NC_019680	AG	3	6	574248	574253	50 %	0 %	50 %	0 %	427711714
10115	NC_019680	ACT	2	6	574325	574330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711714
10116	NC_019680	GCAA	2	8	574358	574365	50 %	0 %	25 %	25 %	427711714
10117	NC_019680	ACG	3	9	574475	574483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711714
10118	NC_019680	CAGT	2	8	574525	574532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_019680	CCGAT	2	10	574553	574562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10121	NC_019680	ATT	2	6	574668	574673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711715
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10237	NC_019680	GAAT	2	8	580855	580862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_019680	CAGG	2	8	580875	580882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10239	NC_019680	A	6	6	580886	580891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_019680	TGT	2	6	581020	581025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711723
10241	NC_019680	GCCAG	2	10	581039	581048	20 %	0 %	40 %	40 %	427711723
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10243	NC_019680	GTGG	3	12	581062	581073	0 %	25 %	75 %	0 %	427711723
10244	NC_019680	CCTGG	2	10	581151	581160	0 %	20 %	40 %	40 %	427711723
10245	NC_019680	AAT	2	6	581190	581195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711723
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10264	NC_019680	ATT	2	6	582489	582494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10488	NC_019680	GTT	2	6	594474	594479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711732
10489	NC_019680	GGTGG	2	10	594508	594517	0 %	20 %	80 %	0 %	427711732
10490	NC_019680	ATCA	2	8	594547	594554	50 %	25 %	0 %	25 %	427711732
10491	NC_019680	CAG	2	6	594747	594752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711732
10492	NC_019680	TGC	2	6	594815	594820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711732
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10500	NC_019680	GCC	2	6	595438	595443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711733

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