MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_019680	TGG	2	6	397311	397316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711547
7003	NC_019680	CGG	2	6	397365	397370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711547
7004	NC_019680	GC	3	6	397404	397409	0 %	0 %	50 %	50 %	427711547
7005	NC_019680	CTG	2	6	397460	397465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711547
7006	NC_019680	CGC	2	6	397479	397484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711547
7007	NC_019680	TTA	2	6	397590	397595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711547
7008	NC_019680	GAA	2	6	397613	397618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711547
7009	NC_019680	T	6	6	397637	397642	0 %	100 %	0 %	0 %	427711547
7010	NC_019680	TGC	2	6	397654	397659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711547
7011	NC_019680	T	6	6	397748	397753	0 %	100 %	0 %	0 %	427711547
7012	NC_019680	CTG	2	6	397754	397759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711547
7013	NC_019680	TTAC	2	8	397915	397922	25 %	50 %	0 %	25 %	427711547
7014	NC_019680	CAG	2	6	397931	397936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711547
7015	NC_019680	CTG	2	6	398004	398009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711547
7016	NC_019680	ACCC	2	8	398011	398018	25 %	0 %	0 %	75 %	427711547
7017	NC_019680	CCT	2	6	398053	398058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711547
7018	NC_019680	CGC	2	6	398061	398066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711547
7019	NC_019680	C	6	6	398090	398095	0 %	0 %	0 %	100 %	427711547
7020	NC_019680	C	7	7	398164	398170	0 %	0 %	0 %	100 %	427711547
7021	NC_019680	CCT	2	6	398266	398271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711547
7022	NC_019680	AGA	2	6	398284	398289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711547
7023	NC_019680	GAA	2	6	398468	398473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711547
7024	NC_019680	TATT	2	8	398474	398481	25 %	75 %	0 %	0 %	427711547
7025	NC_019680	CTT	2	6	398560	398565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711547
7026	NC_019680	GAA	2	6	398588	398593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711547
7027	NC_019680	A	6	6	398596	398601	100 %	0 %	0 %	0 %	427711547
7028	NC_019680	TTG	2	6	398631	398636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711547
7029	NC_019680	AATC	2	8	398672	398679	50 %	25 %	0 %	25 %	427711547
7030	NC_019680	G	6	6	398804	398809	0 %	0 %	100 %	0 %	427711547
7031	NC_019680	ATC	2	6	398913	398918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711547
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7033	NC_019680	GCCTGG	2	12	399036	399047	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711547
7034	NC_019680	TGC	2	6	399153	399158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_019680	TAAT	2	8	399202	399209	50 %	50 %	0 %	0 %	427711548
7036	NC_019680	GAGCA	2	10	399215	399224	40 %	0 %	40 %	20 %	427711548
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7038	NC_019680	GGGT	2	8	399405	399412	0 %	25 %	75 %	0 %	427711548
7039	NC_019680	CTC	2	6	399452	399457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711548
7040	NC_019680	ACC	3	9	399528	399536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711548
7041	NC_019680	TGG	2	6	399757	399762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711548
7042	NC_019680	TTCTGG	2	12	399767	399778	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711548
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7045	NC_019680	TCT	2	6	399868	399873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711548
7046	NC_019680	GGCCTG	2	12	400088	400099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711548
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7050	NC_019680	ACC	2	6	400207	400212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711548
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7053	NC_019680	C	6	6	400290	400295	0 %	0 %	0 %	100 %	427711548
7054	NC_019680	AGT	2	6	400302	400307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711548
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7057	NC_019680	TTG	2	6	400519	400524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711549
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7060	NC_019680	C	6	6	400630	400635	0 %	0 %	0 %	100 %	427711549
7061	NC_019680	GGCCA	2	10	400695	400704	20 %	0 %	40 %	40 %	427711549
7062	NC_019680	TAA	2	6	400770	400775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711549
7063	NC_019680	A	7	7	400774	400780	100 %	0 %	0 %	0 %	427711549
7064	NC_019680	ATC	2	6	400839	400844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711549
7065	NC_019680	G	8	8	400954	400961	0 %	0 %	100 %	0 %	427711549
7066	NC_019680	T	6	6	401090	401095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_019680	CCACTG	2	12	401197	401208	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427711550
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7070	NC_019680	C	6	6	401329	401334	0 %	0 %	0 %	100 %	427711550
7071	NC_019680	CAT	2	6	401397	401402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711550
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7081	NC_019680	TGA	2	6	402217	402222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711550
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7099	NC_019680	CTT	2	6	403305	403310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_019680	GAACT	2	10	403507	403516	40 %	20 %	20 %	20 %	427711552
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7104	NC_019680	GCG	2	6	403695	403700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711552
7105	NC_019680	C	8	8	403837	403844	0 %	0 %	0 %	100 %	427711552
7106	NC_019680	CCA	2	6	403900	403905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711552
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7111	NC_019680	CGCCA	2	10	404172	404181	20 %	0 %	20 %	60 %	427711552
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7113	NC_019680	T	6	6	404243	404248	0 %	100 %	0 %	0 %	427711552
7114	NC_019680	CCGG	2	8	404250	404257	0 %	0 %	50 %	50 %	427711552
7115	NC_019680	GC	3	6	404263	404268	0 %	0 %	50 %	50 %	427711552
7116	NC_019680	CGG	2	6	404339	404344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711552
7117	NC_019680	GC	3	6	404384	404389	0 %	0 %	50 %	50 %	427711552
7118	NC_019680	GCA	2	6	404425	404430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711552
7119	NC_019680	GGGT	2	8	404440	404447	0 %	25 %	75 %	0 %	427711552
7120	NC_019680	AT	3	6	404488	404493	50 %	50 %	0 %	0 %	427711552
7121	NC_019680	C	7	7	404553	404559	0 %	0 %	0 %	100 %	427711552
7122	NC_019680	GCA	3	9	404614	404622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711552
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7124	NC_019680	TATT	2	8	404781	404788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7248	NC_019680	TAA	2	6	411622	411627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7499	NC_019680	GTT	2	6	426126	426131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711570
7500	NC_019680	TGC	2	6	426152	426157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711570

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