MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_019680	GTC	2	6	368086	368091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711513
6502	NC_019680	AAC	2	6	368116	368121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711513
6503	NC_019680	GAG	2	6	368155	368160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711513
6504	NC_019680	TCT	2	6	368264	368269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711513
6505	NC_019680	AAT	3	9	368350	368358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711513
6506	NC_019680	ATT	2	6	368363	368368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711513
6507	NC_019680	GAT	2	6	368433	368438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_019680	ATG	2	6	368458	368463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_019680	CGG	2	6	368471	368476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_019680	TGG	2	6	368550	368555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711514
6511	NC_019680	GCTG	2	8	368583	368590	0 %	25 %	50 %	25 %	427711514
6512	NC_019680	TTG	2	6	368609	368614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711514
6513	NC_019680	GT	3	6	368699	368704	0 %	50 %	50 %	0 %	427711514
6514	NC_019680	CCG	2	6	368801	368806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711514
6515	NC_019680	AAAC	2	8	368859	368866	75 %	0 %	0 %	25 %	427711514
6516	NC_019680	TTG	2	6	368907	368912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711515
6517	NC_019680	TTA	2	6	368925	368930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711515
6518	NC_019680	TCT	2	6	368932	368937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711515
6519	NC_019680	CTGG	2	8	368943	368950	0 %	25 %	50 %	25 %	427711515
6520	NC_019680	ATG	2	6	369022	369027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711515
6521	NC_019680	ATT	2	6	369105	369110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711515
6522	NC_019680	CCAAAT	2	12	369119	369130	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427711515
6523	NC_019680	CCA	2	6	369188	369193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711515
6524	NC_019680	AAC	2	6	369228	369233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711515
6525	NC_019680	GCA	2	6	369288	369293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711515
6526	NC_019680	CTC	2	6	369340	369345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711515
6527	NC_019680	TC	3	6	369344	369349	0 %	50 %	0 %	50 %	427711515
6528	NC_019680	CTTG	2	8	369444	369451	0 %	50 %	25 %	25 %	427711516
6529	NC_019680	ACA	2	6	369531	369536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711516
6530	NC_019680	AGT	2	6	369558	369563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711516
6531	NC_019680	TAT	2	6	369606	369611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711516
6532	NC_019680	GCT	2	6	369655	369660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711516
6533	NC_019680	AGCCG	2	10	369662	369671	20 %	0 %	40 %	40 %	427711516
6534	NC_019680	C	6	6	369685	369690	0 %	0 %	0 %	100 %	427711516
6535	NC_019680	A	6	6	369741	369746	100 %	0 %	0 %	0 %	427711516
6536	NC_019680	AAC	2	6	369771	369776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711516
6537	NC_019680	CAA	2	6	369783	369788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711516
6538	NC_019680	ATG	2	6	369831	369836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711516
6539	NC_019680	TCC	2	6	369858	369863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6540	NC_019680	CAG	2	6	369909	369914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_019680	TTG	2	6	369996	370001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_019680	GAT	2	6	370002	370007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_019680	GTCTTG	2	12	370107	370118	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	427711517
6544	NC_019680	T	6	6	370138	370143	0 %	100 %	0 %	0 %	427711517
6545	NC_019680	TGG	2	6	370273	370278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711517
6546	NC_019680	AAT	2	6	370281	370286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711517
6547	NC_019680	AAT	2	6	370293	370298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711517
6548	NC_019680	CTC	2	6	370380	370385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711517
6549	NC_019680	GGT	2	6	370451	370456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711517
6550	NC_019680	CCA	2	6	370559	370564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711517
6551	NC_019680	TGA	2	6	370591	370596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711517
6552	NC_019680	GGCG	2	8	370608	370615	0 %	0 %	75 %	25 %	427711517
6553	NC_019680	GGT	2	6	370688	370693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711517
6554	NC_019680	AGCC	2	8	370730	370737	25 %	0 %	25 %	50 %	427711517
6555	NC_019680	AATC	2	8	370866	370873	50 %	25 %	0 %	25 %	427711517
6556	NC_019680	TGT	2	6	370874	370879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711517
6557	NC_019680	CAA	2	6	370953	370958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711517
6558	NC_019680	TTG	2	6	370972	370977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711517
6559	NC_019680	GGA	2	6	370989	370994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711517
6560	NC_019680	GGA	2	6	371027	371032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711517
6561	NC_019680	GTTG	2	8	371033	371040	0 %	50 %	50 %	0 %	427711517
6562	NC_019680	GAT	2	6	371096	371101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711517
6563	NC_019680	TGA	2	6	371138	371143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_019680	GTGGGT	2	12	371182	371193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711518
6565	NC_019680	TTGCC	2	10	371323	371332	0 %	40 %	20 %	40 %	427711518
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6567	NC_019680	TCT	2	6	371458	371463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711518
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6569	NC_019680	CCG	2	6	371625	371630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711518
6570	NC_019680	GGA	2	6	371636	371641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711518
6571	NC_019680	TGG	2	6	371644	371649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711518
6572	NC_019680	GGCCA	2	10	371739	371748	20 %	0 %	40 %	40 %	427711518
6573	NC_019680	CAT	2	6	371756	371761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711518
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6577	NC_019680	GCC	2	6	371967	371972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711518
6578	NC_019680	G	6	6	371978	371983	0 %	0 %	100 %	0 %	427711518
6579	NC_019680	CGG	2	6	372085	372090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_019680	G	6	6	372155	372160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_019680	ATG	2	6	372172	372177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711519
6582	NC_019680	TGG	2	6	372185	372190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711519
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6588	NC_019680	TCT	2	6	372702	372707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711519
6589	NC_019680	C	7	7	372715	372721	0 %	0 %	0 %	100 %	427711519
6590	NC_019680	TGG	2	6	372754	372759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711519
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6594	NC_019680	CA	3	6	373212	373217	50 %	0 %	0 %	50 %	427711521
6595	NC_019680	TGA	2	6	373236	373241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711521
6596	NC_019680	TGT	2	6	373303	373308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711521
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6605	NC_019680	GCCA	2	8	373811	373818	25 %	0 %	25 %	50 %	427711521
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6607	NC_019680	AAG	2	6	374090	374095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_019680	TGA	2	6	374234	374239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_019680	CAT	2	6	374283	374288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6611	NC_019680	G	6	6	374317	374322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_019680	TC	3	6	374339	374344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_019680	TC	3	6	374362	374367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_019680	TG	3	6	374462	374467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_019680	AAC	2	6	374537	374542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711522
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6619	NC_019680	GCG	2	6	374883	374888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711522
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6621	NC_019680	AAACC	2	10	374997	375006	60 %	0 %	0 %	40 %	427711522
6622	NC_019680	GCCA	2	8	375013	375020	25 %	0 %	25 %	50 %	427711522
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6996	NC_019680	CATC	2	8	396982	396989	25 %	25 %	0 %	50 %	427711547
6997	NC_019680	GCG	2	6	397015	397020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711547
6998	NC_019680	GCG	3	9	397106	397114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711547
6999	NC_019680	GGC	2	6	397170	397175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711547
7000	NC_019680	GAT	2	6	397207	397212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711547

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