MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_019680	CCTGA	2	10	3417380	3417389	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60002	NC_019680	AAG	2	6	3417446	3417451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60003	NC_019680	AAAT	2	8	3417504	3417511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60004	NC_019680	AT	3	6	3417523	3417528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60005	NC_019680	TAT	2	6	3417609	3417614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714435
60006	NC_019680	TGG	2	6	3417654	3417659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714435
60007	NC_019680	CGG	3	9	3417665	3417673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714435
60008	NC_019680	TTGA	2	8	3417760	3417767	25 %	50 %	25 %	0 %	427714435
60009	NC_019680	AGC	2	6	3417774	3417779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714435
60010	NC_019680	ACG	2	6	3417855	3417860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714435
60011	NC_019680	TC	4	8	3417870	3417877	0 %	50 %	0 %	50 %	427714435
60012	NC_019680	GCG	2	6	3417879	3417884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714435
60013	NC_019680	GCAA	2	8	3417929	3417936	50 %	0 %	25 %	25 %	427714435
60014	NC_019680	CGAG	2	8	3417977	3417984	25 %	0 %	50 %	25 %	427714435
60015	NC_019680	GAG	2	6	3418015	3418020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427714435
60016	NC_019680	CTG	2	6	3418069	3418074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714435
60017	NC_019680	AT	3	6	3418076	3418081	50 %	50 %	0 %	0 %	427714435
60018	NC_019680	G	6	6	3418120	3418125	0 %	0 %	100 %	0 %	427714436
60019	NC_019680	TGA	2	6	3418180	3418185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714436
60020	NC_019680	CTC	2	6	3418193	3418198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714436
60021	NC_019680	GTG	2	6	3418203	3418208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714436
60022	NC_019680	GA	3	6	3418232	3418237	50 %	0 %	50 %	0 %	427714436
60023	NC_019680	ATT	2	6	3418436	3418441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714436
60024	NC_019680	TGT	2	6	3418471	3418476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
60025	NC_019680	GTT	2	6	3418545	3418550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
60026	NC_019680	TGTT	2	8	3418556	3418563	0 %	75 %	25 %	0 %	427714436
60027	NC_019680	AAG	2	6	3418578	3418583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714436
60028	NC_019680	ACCTC	2	10	3418609	3418618	20 %	20 %	0 %	60 %	427714436
60029	NC_019680	GCA	2	6	3418622	3418627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714436
60030	NC_019680	TGG	2	6	3418630	3418635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714436
60031	NC_019680	TCT	2	6	3418651	3418656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714436
60032	NC_019680	GCT	2	6	3418727	3418732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714436
60033	NC_019680	CTG	2	6	3418773	3418778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714436
60034	NC_019680	GGT	2	6	3418862	3418867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714436
60035	NC_019680	GAT	2	6	3418868	3418873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714436
60036	NC_019680	AGC	2	6	3418879	3418884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714436
60037	NC_019680	ATGG	2	8	3418898	3418905	25 %	25 %	50 %	0 %	427714436
60038	NC_019680	GTT	2	6	3418910	3418915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714436
60039	NC_019680	TCC	2	6	3418926	3418931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427714436
60040	NC_019680	TGA	2	6	3418970	3418975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60041	NC_019680	ACT	2	6	3419070	3419075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60042	NC_019680	CAA	2	6	3419214	3419219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60043	NC_019680	CTG	2	6	3419244	3419249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60044	NC_019680	ATC	2	6	3419287	3419292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60045	NC_019680	ATA	2	6	3419297	3419302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60046	NC_019680	TATT	2	8	3419316	3419323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60047	NC_019680	GTT	2	6	3419353	3419358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60048	NC_019680	ACA	2	6	3419421	3419426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60049	NC_019680	ATT	2	6	3419430	3419435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60050	NC_019680	GTT	2	6	3419464	3419469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714437
60051	NC_019680	A	6	6	3419533	3419538	100 %	0 %	0 %	0 %	427714437
60052	NC_019680	AGCCGG	2	12	3419559	3419570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	427714437
60053	NC_019680	ATTG	2	8	3419695	3419702	25 %	50 %	25 %	0 %	427714437
60054	NC_019680	AATT	2	8	3419804	3419811	50 %	50 %	0 %	0 %	427714437
60055	NC_019680	AGT	2	6	3419818	3419823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714437
60056	NC_019680	TAT	2	6	3419964	3419969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714437
60057	NC_019680	GCG	2	6	3420009	3420014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714437
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60061	NC_019680	GCC	2	6	3420154	3420159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714437
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60063	NC_019680	TGC	2	6	3420183	3420188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714437
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60065	NC_019680	GCCA	2	8	3420421	3420428	25 %	0 %	25 %	50 %	427714437
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60068	NC_019680	CGG	2	6	3420534	3420539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714437
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60071	NC_019680	AGG	2	6	3420620	3420625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60072	NC_019680	CTT	2	6	3420655	3420660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60073	NC_019680	T	7	7	3420694	3420700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60074	NC_019680	ATGA	2	8	3420711	3420718	50 %	25 %	25 %	0 %	427714438
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60114	NC_019680	ACC	2	6	3422492	3422497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714440
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60116	NC_019680	T	6	6	3422690	3422695	0 %	100 %	0 %	0 %	427714440
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60226	NC_019680	AT	3	6	3427364	3427369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60472	NC_019680	TGC	2	6	3440216	3440221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714454
60473	NC_019680	ACC	2	6	3440253	3440258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714454
60474	NC_019680	T	6	6	3440371	3440376	0 %	100 %	0 %	0 %	427714454
60475	NC_019680	TCA	2	6	3440455	3440460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714454
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