MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_019680	GTT	2	6	3359623	3359628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714379
59003	NC_019680	C	6	6	3359731	3359736	0 %	0 %	0 %	100 %	427714379
59004	NC_019680	GCCA	2	8	3359761	3359768	25 %	0 %	25 %	50 %	427714379
59005	NC_019680	TGG	2	6	3359772	3359777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714379
59006	NC_019680	CAAC	2	8	3360048	3360055	50 %	0 %	0 %	50 %	427714380
59007	NC_019680	GAA	2	6	3360120	3360125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714380
59008	NC_019680	ATTT	2	8	3360214	3360221	25 %	75 %	0 %	0 %	427714380
59009	NC_019680	TAT	2	6	3360246	3360251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714380
59010	NC_019680	ACC	3	9	3360297	3360305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714380
59011	NC_019680	TAT	2	6	3360342	3360347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427714380
59012	NC_019680	GGC	2	6	3360405	3360410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427714380
59013	NC_019680	A	6	6	3360451	3360456	100 %	0 %	0 %	0 %	427714380
59014	NC_019680	CAG	2	6	3360522	3360527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714380
59015	NC_019680	TTTA	2	8	3360535	3360542	25 %	75 %	0 %	0 %	427714380
59016	NC_019680	C	6	6	3360757	3360762	0 %	0 %	0 %	100 %	427714380
59017	NC_019680	C	6	6	3360771	3360776	0 %	0 %	0 %	100 %	427714380
59018	NC_019680	AATG	2	8	3360785	3360792	50 %	25 %	25 %	0 %	427714380
59019	NC_019680	C	6	6	3360912	3360917	0 %	0 %	0 %	100 %	427714380
59020	NC_019680	ATC	2	6	3360969	3360974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714380
59021	NC_019680	AGG	2	6	3360996	3361001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59022	NC_019680	GGCC	2	8	3361077	3361084	0 %	0 %	50 %	50 %	427714381
59023	NC_019680	CAGGC	2	10	3361136	3361145	20 %	0 %	40 %	40 %	427714381
59024	NC_019680	GCT	2	6	3361181	3361186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714381
59025	NC_019680	GAT	2	6	3361197	3361202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427714381
59026	NC_019680	CCCA	2	8	3361385	3361392	25 %	0 %	0 %	75 %	427714381
59027	NC_019680	GTT	2	6	3361398	3361403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714381
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59030	NC_019680	CCAGTT	2	12	3361497	3361508	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	427714381
59031	NC_019680	TAA	2	6	3361510	3361515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714381
59032	NC_019680	TCA	2	6	3361571	3361576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714381
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59035	NC_019680	AAG	2	6	3361670	3361675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714381
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59037	NC_019680	A	7	7	3361766	3361772	100 %	0 %	0 %	0 %	427714381
59038	NC_019680	CTGGCT	2	12	3361834	3361845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714381
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59042	NC_019680	CGC	2	6	3362119	3362124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714381
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59044	NC_019680	ACA	2	6	3362162	3362167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427714381
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59051	NC_019680	GTC	2	6	3362612	3362617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714381
59052	NC_019680	GCT	2	6	3362751	3362756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714381
59053	NC_019680	ACC	2	6	3362834	3362839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714381
59054	NC_019680	CAG	2	6	3362997	3363002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714381
59055	NC_019680	TTC	2	6	3363032	3363037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427714381
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59057	NC_019680	GGA	2	6	3363150	3363155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427714381
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59061	NC_019680	C	6	6	3363401	3363406	0 %	0 %	0 %	100 %	427714382
59062	NC_019680	GCC	3	9	3363421	3363429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714382
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59066	NC_019680	GAGG	2	8	3363876	3363883	25 %	0 %	75 %	0 %	427714382
59067	NC_019680	ATC	2	6	3364019	3364024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714382
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59092	NC_019680	GTCAT	2	10	3365651	3365660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59093	NC_019680	TA	3	6	3365668	3365673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59094	NC_019680	CAGA	2	8	3365713	3365720	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59095	NC_019680	GAT	2	6	3365742	3365747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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59097	NC_019680	CA	3	6	3365838	3365843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59098	NC_019680	CAG	2	6	3365984	3365989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59102	NC_019680	CAG	2	6	3366110	3366115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714383
59103	NC_019680	AGCCC	2	10	3366150	3366159	20 %	0 %	20 %	60 %	427714383
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59105	NC_019680	AGCA	2	8	3366302	3366309	50 %	0 %	25 %	25 %	427714383
59106	NC_019680	C	8	8	3366339	3366346	0 %	0 %	0 %	100 %	427714383
59107	NC_019680	CCCT	2	8	3366354	3366361	0 %	25 %	0 %	75 %	427714383
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59113	NC_019680	GGA	2	6	3366924	3366929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427714383
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59117	NC_019680	A	6	6	3367046	3367051	100 %	0 %	0 %	0 %	427714383
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59474	NC_019680	CAC	2	6	3387469	3387474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427714404
59475	NC_019680	CAG	2	6	3387586	3387591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714404
59476	NC_019680	AAT	2	6	3387657	3387662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427714405
59477	NC_019680	ATC	2	6	3387711	3387716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714405
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59480	NC_019680	TGG	2	6	3387811	3387816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714405
59481	NC_019680	GGT	2	6	3387840	3387845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427714405
59482	NC_019680	TCA	2	6	3387937	3387942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427714405
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59485	NC_019680	CTG	2	6	3388164	3388169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427714405
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59489	NC_019680	GC	3	6	3388547	3388552	0 %	0 %	50 %	50 %	427714406
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59491	NC_019680	AGGG	2	8	3388679	3388686	25 %	0 %	75 %	0 %	427714406
59492	NC_019680	GCC	2	6	3388741	3388746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714406
59493	NC_019680	GTT	2	6	3388874	3388879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427714406
59494	NC_019680	ACTGGG	2	12	3388899	3388910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427714406
59495	NC_019680	AAG	3	9	3388955	3388963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427714406
59496	NC_019680	AG	3	6	3388962	3388967	50 %	0 %	50 %	0 %	427714406
59497	NC_019680	CGC	2	6	3389022	3389027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427714406
59498	NC_019680	CAG	2	6	3389058	3389063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427714406
59499	NC_019680	CATC	2	8	3389177	3389184	25 %	25 %	0 %	50 %	427714406
59500	NC_019680	GCA	2	6	3389198	3389203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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