MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_019673	GGCG	2	8	582533	582540	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17502	NC_019673	TGG	2	6	582558	582563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17503	NC_019673	TGG	2	6	582568	582573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17504	NC_019673	TGG	2	6	582584	582589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_019673	TGG	2	6	582594	582599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_019673	CG	3	6	582628	582633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17507	NC_019673	GCGG	2	8	582815	582822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17508	NC_019673	GCTGGG	3	18	582843	582860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17509	NC_019673	GT	3	6	582892	582897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_019673	GGT	2	6	582910	582915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_019673	GGA	2	6	582969	582974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602406
17512	NC_019673	GCC	2	6	582994	582999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17513	NC_019673	CGC	2	6	583012	583017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17514	NC_019673	ACC	2	6	583037	583042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17515	NC_019673	GCCACC	2	12	583043	583054	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	433602406
17516	NC_019673	G	6	6	583062	583067	0 %	0 %	100 %	0 %	433602406
17517	NC_019673	G	6	6	583112	583117	0 %	0 %	100 %	0 %	433602406
17518	NC_019673	ATC	2	6	583160	583165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602406
17519	NC_019673	TCC	2	6	583232	583237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602406
17520	NC_019673	CGC	4	12	583255	583266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17521	NC_019673	GAA	2	6	583285	583290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602406
17522	NC_019673	CCA	2	6	583350	583355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17523	NC_019673	CGA	2	6	583366	583371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17524	NC_019673	GAT	2	6	583393	583398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602406
17525	NC_019673	CAG	2	6	583399	583404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17526	NC_019673	GCA	2	6	583407	583412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17527	NC_019673	CAC	2	6	583432	583437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17528	NC_019673	CAG	3	9	583444	583452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17529	NC_019673	CCA	2	6	583485	583490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17530	NC_019673	TCC	2	6	583505	583510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602406
17531	NC_019673	CAG	2	6	583543	583548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17532	NC_019673	AGT	2	6	583551	583556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602406
17533	NC_019673	CAG	2	6	583558	583563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17534	NC_019673	CGC	2	6	583564	583569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17535	NC_019673	CCA	2	6	583626	583631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17536	NC_019673	CGC	2	6	583642	583647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17537	NC_019673	CTG	2	6	583711	583716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17538	NC_019673	TCGA	2	8	583730	583737	25 %	25 %	25 %	25 %	433602406
17539	NC_019673	CGT	2	6	583749	583754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17540	NC_019673	CAC	2	6	583768	583773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602406
17541	NC_019673	GC	3	6	583791	583796	0 %	0 %	50 %	50 %	433602406
17542	NC_019673	CGCC	2	8	583818	583825	0 %	0 %	25 %	75 %	433602406
17543	NC_019673	GCT	2	6	583833	583838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17544	NC_019673	GCC	3	9	583841	583849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602406
17545	NC_019673	GTCG	2	8	583852	583859	0 %	25 %	50 %	25 %	433602406
17546	NC_019673	CGG	2	6	583893	583898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602406
17547	NC_019673	CAG	2	6	583918	583923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17548	NC_019673	GCCTG	2	10	583928	583937	0 %	20 %	40 %	40 %	433602406
17549	NC_019673	GAT	2	6	584011	584016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602406
17550	NC_019673	ACGA	2	8	584033	584040	50 %	0 %	25 %	25 %	433602406
17551	NC_019673	GC	3	6	584045	584050	0 %	0 %	50 %	50 %	433602406
17552	NC_019673	CGG	2	6	584069	584074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602406
17553	NC_019673	CCGC	2	8	584088	584095	0 %	0 %	25 %	75 %	433602406
17554	NC_019673	GCT	2	6	584107	584112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602406
17555	NC_019673	CTC	2	6	584124	584129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602407
17556	NC_019673	CAC	2	6	584133	584138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602407
17557	NC_019673	GTC	2	6	584165	584170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
17558	NC_019673	CCGGT	2	10	584189	584198	0 %	20 %	40 %	40 %	433602407
17559	NC_019673	GCG	2	6	584206	584211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602407
17560	NC_019673	GCA	2	6	584213	584218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602407
17561	NC_019673	GTC	2	6	584226	584231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
17562	NC_019673	CTCGAC	2	12	584268	584279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433602407
17563	NC_019673	CGG	2	6	584300	584305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602407
17564	NC_019673	GCC	2	6	584320	584325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602407
17565	NC_019673	GC	3	6	584359	584364	0 %	0 %	50 %	50 %	433602407
17566	NC_019673	TCG	2	6	584368	584373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
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17569	NC_019673	CGCC	2	8	584474	584481	0 %	0 %	25 %	75 %	433602407
17570	NC_019673	GCA	2	6	584495	584500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602407
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17572	NC_019673	CCAGCA	2	12	584552	584563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433602407
17573	NC_019673	GCT	2	6	584603	584608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
17574	NC_019673	TCG	2	6	584635	584640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
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17580	NC_019673	GC	3	6	584822	584827	0 %	0 %	50 %	50 %	433602407
17581	NC_019673	TGC	2	6	584906	584911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602407
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17584	NC_019673	CGA	2	6	584966	584971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602407
17585	NC_019673	CCT	2	6	585032	585037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17586	NC_019673	CG	3	6	585049	585054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17587	NC_019673	CCG	3	9	585057	585065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17588	NC_019673	C	6	6	585185	585190	0 %	0 %	0 %	100 %	433602408
17589	NC_019673	GC	3	6	585197	585202	0 %	0 %	50 %	50 %	433602408
17590	NC_019673	GCA	2	6	585269	585274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602408
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17593	NC_019673	CGG	2	6	585389	585394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17594	NC_019673	CGT	2	6	585482	585487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17597	NC_019673	CTCG	2	8	585610	585617	0 %	25 %	25 %	50 %	433602409
17598	NC_019673	G	6	6	585717	585722	0 %	0 %	100 %	0 %	433602409
17599	NC_019673	GC	3	6	585775	585780	0 %	0 %	50 %	50 %	433602409
17600	NC_019673	CGGC	2	8	585783	585790	0 %	0 %	50 %	50 %	433602409
17601	NC_019673	TCG	2	6	585816	585821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602409
17602	NC_019673	TGG	2	6	585891	585896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602409
17603	NC_019673	CCGGAG	2	12	585899	585910	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433602409
17604	NC_019673	CGA	3	9	585934	585942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602409
17605	NC_019673	CCA	2	6	585956	585961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602409
17606	NC_019673	GGA	2	6	586020	586025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602410
17607	NC_019673	CCG	2	6	586088	586093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602410
17608	NC_019673	CGAC	2	8	586106	586113	25 %	0 %	25 %	50 %	433602410
17609	NC_019673	CGT	2	6	586130	586135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602410
17610	NC_019673	CCT	2	6	586142	586147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602410
17611	NC_019673	CCG	2	6	586160	586165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602410
17612	NC_019673	GGCCA	2	10	586186	586195	20 %	0 %	40 %	40 %	433602410
17613	NC_019673	AGG	2	6	586229	586234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602410
17614	NC_019673	GC	3	6	586291	586296	0 %	0 %	50 %	50 %	433602410
17615	NC_019673	TCCT	2	8	586335	586342	0 %	50 %	0 %	50 %	433602411
17616	NC_019673	CGG	2	6	586369	586374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602411
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17982	NC_019673	GC	3	6	597566	597571	0 %	0 %	50 %	50 %	433602421
17983	NC_019673	CGCC	2	8	597598	597605	0 %	0 %	25 %	75 %	433602421
17984	NC_019673	AGC	2	6	597705	597710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602421
17985	NC_019673	TGC	2	6	597775	597780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602421
17986	NC_019673	GCG	2	6	597815	597820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602421
17987	NC_019673	CGT	2	6	597955	597960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602421
17988	NC_019673	GC	3	6	597983	597988	0 %	0 %	50 %	50 %	433602421
17989	NC_019673	CTGG	2	8	598067	598074	0 %	25 %	50 %	25 %	433602421
17990	NC_019673	GCCGC	2	10	598103	598112	0 %	0 %	40 %	60 %	433602421
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18000	NC_019673	TCG	2	6	598293	598298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602421

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