MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_019673	TGC	2	6	498359	498364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602320
15003	NC_019673	GCT	2	6	498378	498383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602320
15004	NC_019673	GC	4	8	498408	498415	0 %	0 %	50 %	50 %	433602320
15005	NC_019673	CGTG	2	8	498433	498440	0 %	25 %	50 %	25 %	433602320
15006	NC_019673	CGCC	2	8	498457	498464	0 %	0 %	25 %	75 %	433602321
15007	NC_019673	CGC	2	6	498469	498474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602321
15008	NC_019673	CGTCGG	2	12	498484	498495	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433602321
15009	NC_019673	GGT	2	6	498499	498504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602321
15010	NC_019673	CGCCC	2	10	498522	498531	0 %	0 %	20 %	80 %	433602321
15011	NC_019673	CGGCG	2	10	498535	498544	0 %	0 %	60 %	40 %	433602321
15012	NC_019673	CGGC	2	8	498558	498565	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
15013	NC_019673	GGT	2	6	498568	498573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602321
15014	NC_019673	CGG	2	6	498586	498591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602321
15015	NC_019673	GGCG	2	8	498634	498641	0 %	0 %	75 %	25 %	433602321
15016	NC_019673	GCG	2	6	498655	498660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602321
15017	NC_019673	CGA	3	9	498673	498681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602321
15018	NC_019673	GCG	2	6	498705	498710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602321
15019	NC_019673	ATC	2	6	498713	498718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602321
15020	NC_019673	CGG	2	6	498741	498746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602321
15021	NC_019673	GGC	2	6	498775	498780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602321
15022	NC_019673	CG	4	8	498785	498792	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
15023	NC_019673	GTCGCC	2	12	498800	498811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433602321
15024	NC_019673	GTC	2	6	498815	498820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602321
15025	NC_019673	TGGG	2	8	498833	498840	0 %	25 %	75 %	0 %	433602321
15026	NC_019673	CCG	2	6	498841	498846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602321
15027	NC_019673	TGG	2	6	498849	498854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602321
15028	NC_019673	GGCG	2	8	498871	498878	0 %	0 %	75 %	25 %	433602321
15029	NC_019673	CG	3	6	498889	498894	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
15030	NC_019673	CGA	2	6	498913	498918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602321
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15032	NC_019673	CGGC	2	8	498936	498943	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
15033	NC_019673	GCC	3	9	499021	499029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602321
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15036	NC_019673	CG	3	6	499117	499122	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
15037	NC_019673	CGA	2	6	499134	499139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602321
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15039	NC_019673	CGA	2	6	499207	499212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602321
15040	NC_019673	GGT	2	6	499234	499239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602321
15041	NC_019673	GCT	2	6	499276	499281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602321
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15045	NC_019673	GC	4	8	499428	499435	0 %	0 %	50 %	50 %	433602321
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15050	NC_019673	GCGCT	2	10	499478	499487	0 %	20 %	40 %	40 %	433602321
15051	NC_019673	GCC	2	6	499503	499508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602321
15052	NC_019673	G	6	6	499543	499548	0 %	0 %	100 %	0 %	433602321
15053	NC_019673	TTGA	2	8	499549	499556	25 %	50 %	25 %	0 %	433602321
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15055	NC_019673	CAC	3	9	499593	499601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15056	NC_019673	TCACCG	2	12	499624	499635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	433602322
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15061	NC_019673	GCA	2	6	499874	499879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602322
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15065	NC_019673	GC	3	6	500042	500047	0 %	0 %	50 %	50 %	433602322
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15101	NC_019673	GCC	2	6	501335	501340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602323
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15110	NC_019673	GCG	2	6	501511	501516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
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15112	NC_019673	GC	3	6	501600	501605	0 %	0 %	50 %	50 %	433602323
15113	NC_019673	GCGG	2	8	501617	501624	0 %	0 %	75 %	25 %	433602323
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15120	NC_019673	CGG	2	6	501843	501848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
15121	NC_019673	GGC	2	6	501856	501861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
15122	NC_019673	CTG	2	6	501902	501907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602323
15123	NC_019673	CGA	2	6	501919	501924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602323
15124	NC_019673	CCG	2	6	501936	501941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602323
15125	NC_019673	CCA	2	6	501966	501971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602323
15126	NC_019673	GGT	3	9	501988	501996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602323
15127	NC_019673	GGACGC	2	12	502045	502056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433602323
15128	NC_019673	CGGG	2	8	502129	502136	0 %	0 %	75 %	25 %	433602323
15129	NC_019673	GAC	2	6	502163	502168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602323
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15131	NC_019673	TCG	2	6	502194	502199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602323
15132	NC_019673	CGG	2	6	502213	502218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
15133	NC_019673	GAG	2	6	502250	502255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602323
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15135	NC_019673	GGC	2	6	502271	502276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
15136	NC_019673	ACC	2	6	502283	502288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602323
15137	NC_019673	CGG	2	6	502317	502322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
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15140	NC_019673	GCCG	2	8	502423	502430	0 %	0 %	50 %	50 %	433602323
15141	NC_019673	GCG	2	6	502551	502556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602323
15142	NC_019673	TCGA	2	8	502565	502572	25 %	25 %	25 %	25 %	433602323
15143	NC_019673	CG	3	6	502573	502578	0 %	0 %	50 %	50 %	433602323
15144	NC_019673	GCG	2	6	502661	502666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15145	NC_019673	GGCG	2	8	502683	502690	0 %	0 %	75 %	25 %	433602324
15146	NC_019673	CTG	2	6	502699	502704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602324
15147	NC_019673	TGC	2	6	502709	502714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602324
15148	NC_019673	CGC	2	6	502725	502730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602324
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15152	NC_019673	TGC	2	6	502868	502873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602324
15153	NC_019673	GCG	2	6	502928	502933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15154	NC_019673	CGG	2	6	502952	502957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15155	NC_019673	CGG	2	6	503012	503017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15156	NC_019673	CGG	3	9	503033	503041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15157	NC_019673	TTC	2	6	503044	503049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433602324
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15161	NC_019673	GC	3	6	503126	503131	0 %	0 %	50 %	50 %	433602324
15162	NC_019673	TCG	2	6	503171	503176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602324
15163	NC_019673	GTCGCG	2	12	503179	503190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433602324
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15166	NC_019673	GCG	2	6	503218	503223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602324
15167	NC_019673	GC	3	6	503263	503268	0 %	0 %	50 %	50 %	433602324
15168	NC_019673	GGA	3	9	503274	503282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602324
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15171	NC_019673	GCC	3	9	503323	503331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602324
15172	NC_019673	GCC	2	6	503335	503340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602324
15173	NC_019673	ACGCCG	2	12	503369	503380	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602324
15174	NC_019673	CACC	2	8	503388	503395	25 %	0 %	0 %	75 %	433602324
15175	NC_019673	GC	4	8	503434	503441	0 %	0 %	50 %	50 %	433602324
15176	NC_019673	GGTG	3	12	503450	503461	0 %	25 %	75 %	0 %	433602325
15177	NC_019673	CCCCG	2	10	503485	503494	0 %	0 %	20 %	80 %	433602325
15178	NC_019673	CGG	2	6	503499	503504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602325
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15180	NC_019673	CTGC	2	8	503542	503549	0 %	25 %	25 %	50 %	433602325
15181	NC_019673	CGGG	2	8	503575	503582	0 %	0 %	75 %	25 %	433602325
15182	NC_019673	GTC	2	6	503618	503623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602325
15183	NC_019673	CGG	2	6	503652	503657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602325
15184	NC_019673	CGG	3	9	503721	503729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602325
15185	NC_019673	TGG	2	6	503748	503753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602325
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15194	NC_019673	TGC	2	6	504070	504075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602325
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15197	NC_019673	CTG	2	6	504347	504352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602325
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15199	NC_019673	GTGCTG	2	12	504410	504421	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433602325
15200	NC_019673	CTG	3	9	504419	504427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602325
15201	NC_019673	CGG	2	6	504440	504445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602325
15202	NC_019673	CGGG	2	8	504461	504468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15203	NC_019673	GGC	2	6	504474	504479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15204	NC_019673	GCCT	2	8	504493	504500	0 %	25 %	25 %	50 %	433602326
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15211	NC_019673	CCG	2	6	504577	504582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602326
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15217	NC_019673	GCT	2	6	504827	504832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602326
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15220	NC_019673	CG	4	8	504969	504976	0 %	0 %	50 %	50 %	433602326
15221	NC_019673	GCC	2	6	505078	505083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602326
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15223	NC_019673	GGC	2	6	505095	505100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602326
15224	NC_019673	GTG	2	6	505114	505119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602326
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15227	NC_019673	ATC	2	6	505216	505221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602326
15228	NC_019673	GCAC	2	8	505223	505230	25 %	0 %	25 %	50 %	433602326
15229	NC_019673	GTGG	2	8	505269	505276	0 %	25 %	75 %	0 %	433602326
15230	NC_019673	CG	3	6	505316	505321	0 %	0 %	50 %	50 %	433602326
15231	NC_019673	GAG	2	6	505330	505335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602326
15232	NC_019673	CCG	2	6	505426	505431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602326
15233	NC_019673	GGT	2	6	505437	505442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602326
15234	NC_019673	CAC	2	6	505461	505466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602326
15235	NC_019673	GAC	2	6	505498	505503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602326
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15237	NC_019673	GCA	2	6	505520	505525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602326
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15239	NC_019673	ATC	2	6	505587	505592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15355	NC_019673	CGG	2	6	509123	509128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
15356	NC_019673	CGAA	2	8	509138	509145	50 %	0 %	25 %	25 %	433602330
15357	NC_019673	TCA	2	6	509148	509153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
15358	NC_019673	CGCGCC	2	12	509164	509175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
15359	NC_019673	CCCGAA	2	12	509179	509190	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	433602330
15360	NC_019673	CCG	2	6	509195	509200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
15361	NC_019673	CGC	2	6	509205	509210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
15362	NC_019673	AGC	2	6	509211	509216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602330
15363	NC_019673	GCCGC	2	10	509225	509234	0 %	0 %	40 %	60 %	433602330
15364	NC_019673	GAA	4	12	509236	509247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602330
15365	NC_019673	GTG	2	6	509288	509293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602330
15366	NC_019673	ACT	2	6	509316	509321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
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15368	NC_019673	GGCG	2	8	509347	509354	0 %	0 %	75 %	25 %	433602330
15369	NC_019673	GCG	2	6	509409	509414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
15370	NC_019673	GCG	2	6	509469	509474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
15371	NC_019673	TAC	2	6	509480	509485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602330
15372	NC_019673	CTG	2	6	509534	509539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602330
15373	NC_019673	CGG	2	6	509598	509603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
15374	NC_019673	GGT	2	6	509641	509646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602330
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15376	NC_019673	GCG	2	6	509673	509678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602330
15377	NC_019673	GC	3	6	509682	509687	0 %	0 %	50 %	50 %	433602330
15378	NC_019673	GCC	2	6	509738	509743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602330
15379	NC_019673	CCG	2	6	509780	509785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15380	NC_019673	CGG	2	6	509804	509809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15381	NC_019673	CAC	2	6	509833	509838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15382	NC_019673	GAT	2	6	509916	509921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15383	NC_019673	CCG	2	6	509945	509950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
15384	NC_019673	GCCG	2	8	509964	509971	0 %	0 %	50 %	50 %	433602331
15385	NC_019673	CGG	2	6	510009	510014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
15386	NC_019673	CCG	2	6	510038	510043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
15387	NC_019673	CCG	2	6	510107	510112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602331
15388	NC_019673	GAG	2	6	510157	510162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
15389	NC_019673	GAG	2	6	510166	510171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
15390	NC_019673	CGG	3	9	510173	510181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
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15395	NC_019673	CGG	2	6	510293	510298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602331
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15400	NC_019673	GAG	2	6	510424	510429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602331
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15413	NC_019673	GCG	2	6	511169	511174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602332
15414	NC_019673	CCG	2	6	511260	511265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15415	NC_019673	GCCG	2	8	511330	511337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15416	NC_019673	CGG	2	6	511340	511345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15417	NC_019673	TCCGA	2	10	511359	511368	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15418	NC_019673	GCC	2	6	511401	511406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
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15422	NC_019673	CCGC	2	8	511486	511493	0 %	0 %	25 %	75 %	433602333
15423	NC_019673	GCA	3	9	511503	511511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602333
15424	NC_019673	CGC	2	6	511520	511525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
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15429	NC_019673	CGC	2	6	511646	511651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602333
15430	NC_019673	GAA	2	6	511656	511661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602333
15431	NC_019673	GTC	2	6	511690	511695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602333
15432	NC_019673	GTG	2	6	511696	511701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602333
15433	NC_019673	GTG	2	6	511723	511728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602333
15434	NC_019673	ATC	2	6	511735	511740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602333
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15436	NC_019673	CCGACG	2	12	511808	511819	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433602333
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15446	NC_019673	CAT	2	6	512218	512223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15447	NC_019673	GC	4	8	512234	512241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15448	NC_019673	GGT	2	6	512250	512255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15449	NC_019673	CGGC	2	8	512278	512285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15450	NC_019673	TCG	2	6	512307	512312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
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15453	NC_019673	CAT	2	6	512371	512376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602334
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15455	NC_019673	GTCGAC	2	12	512455	512466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433602334
15456	NC_019673	TCGT	2	8	512501	512508	0 %	50 %	25 %	25 %	433602334
15457	NC_019673	GCT	2	6	512514	512519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
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15459	NC_019673	CG	3	6	512648	512653	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
15460	NC_019673	TGA	2	6	512676	512681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602334
15461	NC_019673	CGC	2	6	512698	512703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602334
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15463	NC_019673	CGG	2	6	512784	512789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602334
15464	NC_019673	TGG	2	6	512805	512810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
15465	NC_019673	GC	3	6	512814	512819	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
15466	NC_019673	GGCGA	2	10	512852	512861	20 %	0 %	60 %	20 %	433602334
15467	NC_019673	CCGGG	2	10	512863	512872	0 %	0 %	60 %	40 %	433602334
15468	NC_019673	CGCC	2	8	512916	512923	0 %	0 %	25 %	75 %	433602334
15469	NC_019673	CTGGAG	2	12	512938	512949	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433602334
15470	NC_019673	GTG	2	6	513011	513016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
15471	NC_019673	GCT	2	6	513021	513026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
15472	NC_019673	GCT	2	6	513043	513048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602334
15473	NC_019673	GGCC	2	8	513072	513079	0 %	0 %	50 %	50 %	433602334
15474	NC_019673	TGG	2	6	513099	513104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602334
15475	NC_019673	ACC	2	6	513128	513133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602334
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15477	NC_019673	AAC	2	6	513236	513241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433602334
15478	NC_019673	GAA	2	6	513255	513260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602334
15479	NC_019673	CGC	2	6	513289	513294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15480	NC_019673	TGT	2	6	513343	513348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15481	NC_019673	ACC	2	6	513366	513371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15482	NC_019673	CCGA	2	8	513393	513400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15483	NC_019673	CCGG	2	8	513454	513461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15484	NC_019673	GTG	2	6	513478	513483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15485	NC_019673	GGGGT	2	10	513501	513510	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15486	NC_019673	TGC	2	6	513535	513540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15487	NC_019673	CTG	2	6	513596	513601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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