MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_019673	GCT	2	6	34092	34097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601869
1003	NC_019673	GCCG	2	8	34100	34107	0 %	0 %	50 %	50 %	433601869
1004	NC_019673	CCG	2	6	34112	34117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601869
1005	NC_019673	GC	3	6	34222	34227	0 %	0 %	50 %	50 %	433601870
1006	NC_019673	CGG	3	9	34271	34279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601870
1007	NC_019673	CGGC	2	8	34305	34312	0 %	0 %	50 %	50 %	433601870
1008	NC_019673	CGG	2	6	34319	34324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601870
1009	NC_019673	TCT	2	6	34331	34336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601870
1010	NC_019673	GTC	2	6	34431	34436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601870
1011	NC_019673	CTC	2	6	34527	34532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601870
1012	NC_019673	GTC	2	6	34599	34604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601870
1013	NC_019673	GTG	2	6	34657	34662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601870
1014	NC_019673	CTCGTA	2	12	34719	34730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433601870
1015	NC_019673	CGG	2	6	34735	34740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601870
1016	NC_019673	GCG	2	6	34756	34761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601870
1017	NC_019673	GTT	2	6	34776	34781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433601870
1018	NC_019673	CGT	2	6	34796	34801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601870
1019	NC_019673	TCC	2	6	34834	34839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601870
1020	NC_019673	GGT	2	6	34850	34855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601870
1021	NC_019673	GCCG	2	8	34880	34887	0 %	0 %	50 %	50 %	433601870
1022	NC_019673	GCA	2	6	34904	34909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601870
1023	NC_019673	CGCAG	2	10	34922	34931	20 %	0 %	40 %	40 %	433601870
1024	NC_019673	GC	3	6	34955	34960	0 %	0 %	50 %	50 %	433601870
1025	NC_019673	GCG	3	9	34975	34983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601870
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1028	NC_019673	CGGTGG	2	12	35102	35113	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433601870
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1030	NC_019673	GTG	2	6	35200	35205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601870
1031	NC_019673	CG	3	6	35318	35323	0 %	0 %	50 %	50 %	433601870
1032	NC_019673	GCC	2	6	35338	35343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601870
1033	NC_019673	GCC	2	6	35525	35530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601871
1034	NC_019673	CGA	2	6	35540	35545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601871
1035	NC_019673	GTC	2	6	35569	35574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601871
1036	NC_019673	CCG	2	6	35613	35618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601871
1037	NC_019673	CGG	2	6	35622	35627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601871
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1039	NC_019673	CCGG	2	8	35691	35698	0 %	0 %	50 %	50 %	433601871
1040	NC_019673	GTC	2	6	35745	35750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601871
1041	NC_019673	CCT	2	6	35769	35774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601871
1042	NC_019673	GC	3	6	35801	35806	0 %	0 %	50 %	50 %	433601871
1043	NC_019673	CG	3	6	35817	35822	0 %	0 %	50 %	50 %	433601871
1044	NC_019673	CGG	2	6	35839	35844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601871
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1047	NC_019673	CCG	2	6	35888	35893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601871
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1053	NC_019673	CGG	2	6	36158	36163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601871
1054	NC_019673	CGGCG	2	10	36178	36187	0 %	0 %	60 %	40 %	433601871
1055	NC_019673	GGC	2	6	36195	36200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601871
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1059	NC_019673	CCGG	2	8	36345	36352	0 %	0 %	50 %	50 %	433601871
1060	NC_019673	CGC	2	6	36357	36362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601871
1061	NC_019673	CGT	2	6	36378	36383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601871
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1069	NC_019673	CGT	2	6	36630	36635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601871
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1072	NC_019673	GCCGG	2	10	36722	36731	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1073	NC_019673	GCCGG	2	10	36740	36749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1074	NC_019673	AGTC	2	8	36753	36760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1083	NC_019673	GAA	2	6	37211	37216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601872
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1089	NC_019673	GGC	2	6	37499	37504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1091	NC_019673	GCG	2	6	37623	37628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601873
1092	NC_019673	ACC	2	6	37656	37661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601873
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1095	NC_019673	TGGCC	2	10	37722	37731	0 %	20 %	40 %	40 %	433601873
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1098	NC_019673	TCG	2	6	37899	37904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601873
1099	NC_019673	CTG	2	6	37910	37915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601873
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1101	NC_019673	ACG	2	6	38016	38021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601873
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1104	NC_019673	GCC	2	6	38081	38086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601873
1105	NC_019673	GC	3	6	38088	38093	0 %	0 %	50 %	50 %	433601873
1106	NC_019673	CAA	2	6	38110	38115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601873
1107	NC_019673	CGCC	2	8	38121	38128	0 %	0 %	25 %	75 %	433601873
1108	NC_019673	CCGGA	2	10	38136	38145	20 %	0 %	40 %	40 %	433601873
1109	NC_019673	GCC	4	12	38156	38167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601873
1110	NC_019673	CGG	2	6	38223	38228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601873
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1113	NC_019673	ACT	2	6	38304	38309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601873
1114	NC_019673	ACCCG	2	10	38313	38322	20 %	0 %	20 %	60 %	433601873
1115	NC_019673	GC	4	8	38326	38333	0 %	0 %	50 %	50 %	433601873
1116	NC_019673	TGG	2	6	38364	38369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601873
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1119	NC_019673	GCC	2	6	38467	38472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601873
1120	NC_019673	GAC	2	6	38513	38518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601873
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1122	NC_019673	GC	4	8	38571	38578	0 %	0 %	50 %	50 %	433601873
1123	NC_019673	TTC	2	6	38582	38587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601873
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1252	NC_019673	GC	3	6	42985	42990	0 %	0 %	50 %	50 %	433601878
1253	NC_019673	TTC	2	6	43039	43044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601878
1254	NC_019673	GAT	2	6	43065	43070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433601878
1255	NC_019673	GAA	2	6	43110	43115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433601878
1256	NC_019673	AGCCGC	2	12	43177	43188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433601878
1257	NC_019673	ACC	2	6	43217	43222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601878
1258	NC_019673	ATG	2	6	43315	43320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433601878
1259	NC_019673	CAA	2	6	43350	43355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433601878
1260	NC_019673	CCG	2	6	43465	43470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601879
1261	NC_019673	GCG	2	6	43486	43491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601879
1262	NC_019673	CCG	2	6	43558	43563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601879
1263	NC_019673	TCG	2	6	43582	43587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601879
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1265	NC_019673	GCC	2	6	43644	43649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601879
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1272	NC_019673	CGC	2	6	43834	43839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601879
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1275	NC_019673	GGA	2	6	43904	43909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601879
1276	NC_019673	GTG	2	6	43968	43973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601879
1277	NC_019673	GCCGG	2	10	44013	44022	0 %	0 %	60 %	40 %	433601879
1278	NC_019673	TCGAC	2	10	44035	44044	20 %	20 %	20 %	40 %	433601879
1279	NC_019673	CG	3	6	44056	44061	0 %	0 %	50 %	50 %	433601879
1280	NC_019673	TGC	2	6	44179	44184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601879
1281	NC_019673	ACC	2	6	44208	44213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601879
1282	NC_019673	TGC	2	6	44218	44223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601879
1283	NC_019673	CGA	2	6	44252	44257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601879
1284	NC_019673	GCGG	2	8	44263	44270	0 %	0 %	75 %	25 %	433601879
1285	NC_019673	GGC	2	6	44273	44278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601879
1286	NC_019673	GGT	2	6	44305	44310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601879
1287	NC_019673	CG	3	6	44328	44333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1288	NC_019673	GTGG	2	8	44429	44436	0 %	25 %	75 %	0 %	433601880
1289	NC_019673	GGCGCA	2	12	44443	44454	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433601880
1290	NC_019673	GC	4	8	44459	44466	0 %	0 %	50 %	50 %	433601880
1291	NC_019673	GGC	2	6	44471	44476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601880
1292	NC_019673	GCT	2	6	44513	44518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601880
1293	NC_019673	CGT	2	6	44521	44526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601880
1294	NC_019673	CGA	2	6	44528	44533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601880
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1297	NC_019673	GC	3	6	44675	44680	0 %	0 %	50 %	50 %	433601880
1298	NC_019673	GCCC	2	8	44711	44718	0 %	0 %	25 %	75 %	433601880
1299	NC_019673	CACCG	2	10	44728	44737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1300	NC_019673	GGT	3	9	44829	44837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601881
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1310	NC_019673	TCG	2	6	45163	45168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601881
1311	NC_019673	CG	3	6	45189	45194	0 %	0 %	50 %	50 %	433601881
1312	NC_019673	CGG	2	6	45236	45241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601881
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1319	NC_019673	CTG	2	6	45471	45476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601881
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1321	NC_019673	CGT	2	6	45496	45501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601881
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1324	NC_019673	TCG	2	6	45636	45641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601882
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1327	NC_019673	GCG	3	9	45706	45714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601882
1328	NC_019673	GCG	2	6	45719	45724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601882
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1334	NC_019673	GCG	2	6	46016	46021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601882
1335	NC_019673	CG	3	6	46032	46037	0 %	0 %	50 %	50 %	433601882
1336	NC_019673	GAG	2	6	46040	46045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601882
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1374	NC_019673	GGC	2	6	47446	47451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601882
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