MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_019673	CAC	2	6	401494	401499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602233
12002	NC_019673	CTGG	2	8	401501	401508	0 %	25 %	50 %	25 %	433602233
12003	NC_019673	CG	3	6	401523	401528	0 %	0 %	50 %	50 %	433602233
12004	NC_019673	GC	3	6	401582	401587	0 %	0 %	50 %	50 %	433602233
12005	NC_019673	CAG	2	6	401624	401629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602233
12006	NC_019673	CAGGT	2	10	401640	401649	20 %	20 %	40 %	20 %	433602233
12007	NC_019673	GCC	2	6	401772	401777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12008	NC_019673	GCC	2	6	401826	401831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12009	NC_019673	TGCC	2	8	401866	401873	0 %	25 %	25 %	50 %	433602233
12010	NC_019673	AG	3	6	401892	401897	50 %	0 %	50 %	0 %	433602233
12011	NC_019673	GCCGA	2	10	401961	401970	20 %	0 %	40 %	40 %	433602233
12012	NC_019673	GCC	2	6	401979	401984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12013	NC_019673	CGC	2	6	402035	402040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12014	NC_019673	CGC	2	6	402089	402094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12015	NC_019673	CGT	3	9	402148	402156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602233
12016	NC_019673	GCA	2	6	402169	402174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602233
12017	NC_019673	CCT	2	6	402190	402195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602233
12018	NC_019673	GCC	2	6	402198	402203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12019	NC_019673	AGG	2	6	402237	402242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602233
12020	NC_019673	GACC	2	8	402283	402290	25 %	0 %	25 %	50 %	433602233
12021	NC_019673	GGC	2	6	402293	402298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602233
12022	NC_019673	GCA	2	6	402311	402316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602233
12023	NC_019673	AGCC	2	8	402351	402358	25 %	0 %	25 %	50 %	433602233
12024	NC_019673	AGC	2	6	402387	402392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602233
12025	NC_019673	CCG	2	6	402463	402468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602233
12026	NC_019673	GC	3	6	402538	402543	0 %	0 %	50 %	50 %	433602233
12027	NC_019673	C	6	6	402551	402556	0 %	0 %	0 %	100 %	433602233
12028	NC_019673	CTC	2	6	402568	402573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12029	NC_019673	TCG	2	6	402579	402584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12030	NC_019673	TGAG	2	8	402592	402599	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_019673	GCT	2	6	402650	402655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12032	NC_019673	GTT	2	6	402657	402662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_019673	CT	3	6	402665	402670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12034	NC_019673	GT	3	6	402682	402687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_019673	AGT	2	6	402716	402721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602234
12036	NC_019673	CCG	2	6	402773	402778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602234
12037	NC_019673	GTC	2	6	402821	402826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602234
12038	NC_019673	GTGG	2	8	402872	402879	0 %	25 %	75 %	0 %	433602234
12039	NC_019673	TTG	2	6	402899	402904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433602234
12040	NC_019673	ATC	2	6	402922	402927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602234
12041	NC_019673	GTA	2	6	402935	402940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602235
12042	NC_019673	CGC	2	6	402977	402982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12043	NC_019673	TCA	2	6	403000	403005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602235
12044	NC_019673	CCA	2	6	403102	403107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602235
12045	NC_019673	GCA	2	6	403108	403113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12046	NC_019673	TCG	2	6	403126	403131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12047	NC_019673	CCG	3	9	403132	403140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12048	NC_019673	CCG	2	6	403158	403163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12049	NC_019673	GAT	2	6	403187	403192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433602235
12050	NC_019673	GAA	2	6	403223	403228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602235
12051	NC_019673	GTG	2	6	403254	403259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602235
12052	NC_019673	CCG	2	6	403265	403270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12053	NC_019673	GC	3	6	403281	403286	0 %	0 %	50 %	50 %	433602235
12054	NC_019673	CAG	2	6	403331	403336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12055	NC_019673	GCA	2	6	403432	403437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12056	NC_019673	CCGGT	2	10	403440	403449	0 %	20 %	40 %	40 %	433602235
12057	NC_019673	GCGACA	2	12	403489	403500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12058	NC_019673	GCC	2	6	403510	403515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12059	NC_019673	GAG	2	6	403536	403541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433602235
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12061	NC_019673	GAC	2	6	403739	403744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12062	NC_019673	CTT	2	6	403745	403750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433602235
12063	NC_019673	CGC	2	6	403781	403786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602235
12064	NC_019673	GTC	2	6	403790	403795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602235
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12067	NC_019673	CCA	2	6	403942	403947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602235
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12072	NC_019673	GCT	2	6	404047	404052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602235
12073	NC_019673	CAG	2	6	404081	404086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602235
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12080	NC_019673	AGA	2	6	404230	404235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433602235
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12084	NC_019673	TCG	2	6	404370	404375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12085	NC_019673	GAC	2	6	404400	404405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12088	NC_019673	GCC	2	6	404470	404475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602236
12089	NC_019673	ACC	3	9	404581	404589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602236
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12091	NC_019673	ATC	2	6	404653	404658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602236
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12103	NC_019673	GGC	2	6	404941	404946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602236
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12105	NC_019673	CGG	2	6	405035	405040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602236
12106	NC_019673	GTC	2	6	405066	405071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602236
12107	NC_019673	GC	3	6	405118	405123	0 %	0 %	50 %	50 %	433602236
12108	NC_019673	CCA	2	6	405131	405136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602236
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12117	NC_019673	GGC	2	6	405552	405557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602237
12118	NC_019673	GGT	2	6	405568	405573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602237
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12235	NC_019673	GAC	2	6	409704	409709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602242
12236	NC_019673	TC	3	6	409712	409717	0 %	50 %	0 %	50 %	433602242
12237	NC_019673	G	6	6	409828	409833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12238	NC_019673	ACC	2	6	409841	409846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12239	NC_019673	CGG	2	6	409896	409901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12240	NC_019673	CAC	2	6	409910	409915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12241	NC_019673	GGTG	2	8	409920	409927	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12242	NC_019673	CGG	2	6	409930	409935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12243	NC_019673	TGG	2	6	409955	409960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12353	NC_019673	CTC	2	6	412944	412949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602245
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12355	NC_019673	GGTC	2	8	413024	413031	0 %	25 %	50 %	25 %	433602245
12356	NC_019673	C	6	6	413036	413041	0 %	0 %	0 %	100 %	433602245
12357	NC_019673	CTG	2	6	413100	413105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602245
12358	NC_019673	CCGG	2	8	413129	413136	0 %	0 %	50 %	50 %	433602245
12359	NC_019673	CCGGG	2	10	413222	413231	0 %	0 %	60 %	40 %	433602245
12360	NC_019673	CACC	2	8	413253	413260	25 %	0 %	0 %	75 %	433602245
12361	NC_019673	CGCCTC	2	12	413268	413279	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433602245
12362	NC_019673	CGAG	2	8	413282	413289	25 %	0 %	50 %	25 %	433602245
12363	NC_019673	CAGC	2	8	413331	413338	25 %	0 %	25 %	50 %	433602245
12364	NC_019673	GCC	2	6	413364	413369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602245
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12367	NC_019673	GTG	2	6	413421	413426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433602245
12368	NC_019673	CGGC	2	8	413477	413484	0 %	0 %	50 %	50 %	433602245
12369	NC_019673	AGCGTG	2	12	413485	413496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433602245
12370	NC_019673	GCC	2	6	413497	413502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602245
12371	NC_019673	CG	3	6	413523	413528	0 %	0 %	50 %	50 %	433602245
12372	NC_019673	CGC	2	6	413533	413538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433602245
12373	NC_019673	GTC	2	6	413568	413573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602245
12374	NC_019673	CCGCA	2	10	413578	413587	20 %	0 %	20 %	60 %	433602245
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12377	NC_019673	GCA	2	6	413687	413692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602245
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12382	NC_019673	GGTC	2	8	413825	413832	0 %	25 %	50 %	25 %	433602245
12383	NC_019673	AGC	2	6	413872	413877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433602245
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12391	NC_019673	CTC	2	6	414141	414146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433602245
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12395	NC_019673	TCG	2	6	414268	414273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602245
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12405	NC_019673	GC	4	8	414683	414690	0 %	0 %	50 %	50 %	433602245
12406	NC_019673	GCGG	2	8	414761	414768	0 %	0 %	75 %	25 %	433602245
12407	NC_019673	CGT	2	6	414806	414811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602245
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12410	NC_019673	CGG	2	6	414872	414877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433602245
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12412	NC_019673	CTC	2	6	414902	414907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12413	NC_019673	CGAG	2	8	415000	415007	25 %	0 %	50 %	25 %	433602246
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12452	NC_019673	ACGTC	2	10	416512	416521	20 %	20 %	20 %	40 %	433602247
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12479	NC_019673	ACC	2	6	417326	417331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433602247
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