MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharothrix espanaensis DSM 44229 complete genome

Total Repeats: 280209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019673	GGCCG	2	10	148455	148464	0 %	0 %	60 %	40 %	433601986
4502	NC_019673	GCT	2	6	148482	148487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4503	NC_019673	GGC	2	6	148497	148502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4504	NC_019673	CGG	2	6	148512	148517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4505	NC_019673	CGA	2	6	148533	148538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4506	NC_019673	CG	3	6	148566	148571	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4507	NC_019673	GCT	2	6	148575	148580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4508	NC_019673	CG	3	6	148593	148598	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4509	NC_019673	CTCG	2	8	148617	148624	0 %	25 %	25 %	50 %	433601986
4510	NC_019673	CTT	2	6	148626	148631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433601986
4511	NC_019673	GCG	2	6	148635	148640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4512	NC_019673	CG	3	6	148697	148702	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4513	NC_019673	GCC	2	6	148719	148724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4514	NC_019673	GTG	2	6	148789	148794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601986
4515	NC_019673	GCC	2	6	148819	148824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4516	NC_019673	CCG	2	6	148826	148831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4517	NC_019673	TGG	2	6	148832	148837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601986
4518	NC_019673	CCG	2	6	148862	148867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4519	NC_019673	CGT	2	6	148872	148877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4520	NC_019673	CGA	2	6	148911	148916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4521	NC_019673	GCC	2	6	148939	148944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4522	NC_019673	GCG	2	6	148967	148972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4523	NC_019673	GCC	2	6	149007	149012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4524	NC_019673	CG	3	6	149016	149021	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4525	NC_019673	GCG	2	6	149077	149082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4526	NC_019673	TCC	2	6	149083	149088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601986
4527	NC_019673	AGC	2	6	149093	149098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4528	NC_019673	GTT	2	6	149172	149177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433601986
4529	NC_019673	CG	5	10	149208	149217	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4530	NC_019673	GCT	2	6	149229	149234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601986
4531	NC_019673	GGC	2	6	149247	149252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4532	NC_019673	GGC	2	6	149313	149318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601986
4533	NC_019673	GCC	3	9	149380	149388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601986
4534	NC_019673	CG	3	6	149396	149401	0 %	0 %	50 %	50 %	433601986
4535	NC_019673	TCGGC	2	10	149573	149582	0 %	20 %	40 %	40 %	433601986
4536	NC_019673	GGC	2	6	149726	149731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4537	NC_019673	CTCG	2	8	149749	149756	0 %	25 %	25 %	50 %	433601987
4538	NC_019673	CGG	2	6	149776	149781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4539	NC_019673	GCC	2	6	149799	149804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4540	NC_019673	GGC	2	6	149837	149842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4541	NC_019673	CGG	2	6	149845	149850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4542	NC_019673	GTC	2	6	149867	149872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601987
4543	NC_019673	GCG	2	6	149877	149882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4544	NC_019673	GGCC	2	8	149893	149900	0 %	0 %	50 %	50 %	433601987
4545	NC_019673	CGACCG	2	12	149920	149931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433601987
4546	NC_019673	ACC	2	6	149946	149951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601987
4547	NC_019673	TCG	2	6	149976	149981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601987
4548	NC_019673	CGA	2	6	149989	149994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601987
4549	NC_019673	CGG	2	6	150016	150021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4550	NC_019673	CGC	2	6	150050	150055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4551	NC_019673	GCC	2	6	150093	150098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4552	NC_019673	GGA	2	6	150100	150105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601987
4553	NC_019673	GGC	2	6	150172	150177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4554	NC_019673	GGC	2	6	150194	150199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
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4556	NC_019673	GTG	2	6	150209	150214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601987
4557	NC_019673	AGC	2	6	150231	150236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601987
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4559	NC_019673	GCC	2	6	150271	150276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4560	NC_019673	CCA	2	6	150298	150303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601987
4561	NC_019673	GCA	2	6	150352	150357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601987
4562	NC_019673	GCCGG	2	10	150371	150380	0 %	0 %	60 %	40 %	433601987
4563	NC_019673	GCC	2	6	150456	150461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4564	NC_019673	GGT	2	6	150473	150478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601987
4565	NC_019673	CCG	2	6	150483	150488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
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4569	NC_019673	GTC	2	6	150566	150571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601987
4570	NC_019673	CCG	2	6	150580	150585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
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4572	NC_019673	CGG	3	9	150624	150632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601987
4573	NC_019673	CCAG	2	8	150682	150689	25 %	0 %	25 %	50 %	433601987
4574	NC_019673	GCC	2	6	150765	150770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601987
4575	NC_019673	CCGCG	2	10	150778	150787	0 %	0 %	40 %	60 %	433601987
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4577	NC_019673	GTGGC	2	10	150862	150871	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4578	NC_019673	CGC	2	6	150941	150946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601988
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4580	NC_019673	CGG	2	6	151068	151073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601988
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4582	NC_019673	CGT	2	6	151226	151231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601988
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4584	NC_019673	GC	3	6	151244	151249	0 %	0 %	50 %	50 %	433601988
4585	NC_019673	AGC	2	6	151264	151269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601988
4586	NC_019673	TGG	2	6	151283	151288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601988
4587	NC_019673	CTC	2	6	151291	151296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_019673	CGC	2	6	151365	151370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_019673	CTTT	2	8	151376	151383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4590	NC_019673	CAG	2	6	151436	151441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601989
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4592	NC_019673	GTC	2	6	151489	151494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4593	NC_019673	GTC	2	6	151525	151530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4594	NC_019673	CGC	2	6	151551	151556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601989
4595	NC_019673	CAG	3	9	151567	151575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4596	NC_019673	GCACG	2	10	151624	151633	20 %	0 %	40 %	40 %	433601989
4597	NC_019673	GCC	2	6	151660	151665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601989
4598	NC_019673	TCG	3	9	151748	151756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4599	NC_019673	CGCT	2	8	151829	151836	0 %	25 %	25 %	50 %	433601989
4600	NC_019673	GCA	2	6	151845	151850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4601	NC_019673	CCGC	2	8	151875	151882	0 %	0 %	25 %	75 %	433601989
4602	NC_019673	CGG	2	6	151923	151928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601989
4603	NC_019673	TCGGC	2	10	151941	151950	0 %	20 %	40 %	40 %	433601989
4604	NC_019673	CCGCG	2	10	152004	152013	0 %	0 %	40 %	60 %	433601989
4605	NC_019673	CG	4	8	152010	152017	0 %	0 %	50 %	50 %	433601989
4606	NC_019673	CCT	2	6	152034	152039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601989
4607	NC_019673	CTC	2	6	152095	152100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601989
4608	NC_019673	GCG	2	6	152106	152111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601989
4609	NC_019673	GC	3	6	152184	152189	0 %	0 %	50 %	50 %	433601989
4610	NC_019673	GTG	2	6	152198	152203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601989
4611	NC_019673	GCG	2	6	152229	152234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601989
4612	NC_019673	GGC	2	6	152235	152240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601989
4613	NC_019673	CGT	3	9	152241	152249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4614	NC_019673	GC	3	6	152270	152275	0 %	0 %	50 %	50 %	433601989
4615	NC_019673	CGGC	2	8	152370	152377	0 %	0 %	50 %	50 %	433601989
4616	NC_019673	TGC	2	6	152423	152428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601989
4617	NC_019673	GGT	2	6	152506	152511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601989
4618	NC_019673	CGGC	2	8	152618	152625	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4619	NC_019673	GC	3	6	152657	152662	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4620	NC_019673	GTC	2	6	152676	152681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4621	NC_019673	GCA	2	6	152735	152740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4622	NC_019673	GTC	2	6	152742	152747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4623	NC_019673	GCA	2	6	152810	152815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4624	NC_019673	CCT	2	6	152816	152821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601990
4625	NC_019673	CG	3	6	152872	152877	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4626	NC_019673	GCG	2	6	153054	153059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601990
4627	NC_019673	CGC	2	6	153074	153079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601990
4628	NC_019673	GCG	2	6	153101	153106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601990
4629	NC_019673	GGCC	2	8	153110	153117	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4630	NC_019673	CG	3	6	153168	153173	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4631	NC_019673	CAC	2	6	153174	153179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601990
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4633	NC_019673	GC	3	6	153211	153216	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4634	NC_019673	GAT	2	6	153303	153308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433601990
4635	NC_019673	CCG	2	6	153371	153376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601990
4636	NC_019673	CTC	3	9	153444	153452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601990
4637	NC_019673	CGA	3	9	153461	153469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4638	NC_019673	TCG	2	6	153545	153550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601990
4639	NC_019673	GTA	2	6	153570	153575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433601990
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4641	NC_019673	TGT	2	6	153599	153604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433601990
4642	NC_019673	TGG	2	6	153613	153618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601990
4643	NC_019673	CCT	2	6	153632	153637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601990
4644	NC_019673	CG	3	6	153662	153667	0 %	0 %	50 %	50 %	433601990
4645	NC_019673	GTTC	2	8	153674	153681	0 %	50 %	25 %	25 %	433601990
4646	NC_019673	CGA	2	6	153695	153700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601990
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4649	NC_019673	GCA	2	6	153767	153772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601991
4650	NC_019673	CGG	2	6	153776	153781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601991
4651	NC_019673	CGT	2	6	153821	153826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601991
4652	NC_019673	CTC	2	6	153864	153869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601991
4653	NC_019673	GGCCC	2	10	153870	153879	0 %	0 %	40 %	60 %	433601991
4654	NC_019673	GTCGAG	2	12	153930	153941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	433601991
4655	NC_019673	CGG	2	6	153955	153960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601991
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4658	NC_019673	GGT	2	6	154047	154052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601991
4659	NC_019673	CCCTGC	2	12	154060	154071	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	433601991
4660	NC_019673	GCG	2	6	154075	154080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601991
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4662	NC_019673	GC	3	6	154148	154153	0 %	0 %	50 %	50 %	433601991
4663	NC_019673	CGG	2	6	154166	154171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601991
4664	NC_019673	GCA	2	6	154208	154213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601991
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4666	NC_019673	CGT	2	6	154295	154300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601991
4667	NC_019673	CGC	2	6	154307	154312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601991
4668	NC_019673	CGCCGA	2	12	154316	154327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	433601991
4669	NC_019673	CGT	2	6	154349	154354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601991
4670	NC_019673	AGC	2	6	154363	154368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601991
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4672	NC_019673	CGG	3	9	154448	154456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601991
4673	NC_019673	CCA	2	6	154490	154495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601991
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4676	NC_019673	CTC	2	6	154545	154550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433601991
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4678	NC_019673	ACC	2	6	154577	154582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433601991
4679	NC_019673	CCCG	2	8	154646	154653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4680	NC_019673	CAT	2	6	154667	154672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4681	NC_019673	G	6	6	154674	154679	0 %	0 %	100 %	0 %	433601992
4682	NC_019673	TGG	2	6	154695	154700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601992
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4685	NC_019673	CGGC	2	8	154782	154789	0 %	0 %	50 %	50 %	433601992
4686	NC_019673	CGC	2	6	154818	154823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601992
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4694	NC_019673	GGT	2	6	155131	155136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601992
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4703	NC_019673	GC	3	6	155497	155502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4705	NC_019673	CGGC	2	8	155512	155519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4706	NC_019673	GCG	2	6	155525	155530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4707	NC_019673	CG	3	6	155564	155569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4708	NC_019673	GTG	2	6	155584	155589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4709	NC_019673	GCT	2	6	155653	155658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4710	NC_019673	GGC	3	9	155687	155695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601993
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4712	NC_019673	GAG	3	9	155763	155771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433601993
4713	NC_019673	CGCGGT	2	12	155798	155809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433601993
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4722	NC_019673	GCT	2	6	156169	156174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601993
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4727	NC_019673	GAC	2	6	156234	156239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601993
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4733	NC_019673	CGA	2	6	156527	156532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601993
4734	NC_019673	CGC	2	6	156536	156541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601993
4735	NC_019673	CTA	2	6	156575	156580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433601993
4736	NC_019673	CGT	2	6	156626	156631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601993
4737	NC_019673	CGCC	2	8	156662	156669	0 %	0 %	25 %	75 %	433601993
4738	NC_019673	CGTGGG	2	12	156778	156789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	433601994
4739	NC_019673	AGCG	2	8	156827	156834	25 %	0 %	50 %	25 %	433601994
4740	NC_019673	TCG	2	6	156852	156857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601994
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4984	NC_019673	CGG	2	6	164444	164449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601999
4985	NC_019673	GTC	2	6	164499	164504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601999
4986	NC_019673	GCT	2	6	164549	164554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433601999
4987	NC_019673	GGCG	2	8	164618	164625	0 %	0 %	75 %	25 %	433601999
4988	NC_019673	GTG	2	6	164658	164663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601999
4989	NC_019673	TGG	2	6	164815	164820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601999
4990	NC_019673	GGT	2	6	164834	164839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433601999
4991	NC_019673	CGG	2	6	164887	164892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433601999
4992	NC_019673	CCG	2	6	164936	164941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433601999
4993	NC_019673	CGA	2	6	164951	164956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433601999
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4997	NC_019673	GCT	3	9	165092	165100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433602000
4998	NC_019673	CAT	2	6	165167	165172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433602000
4999	NC_019673	TTC	2	6	165195	165200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433602000
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