MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019048	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019048	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019048	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019048	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019048	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593713
7	NC_019048	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593713
8	NC_019048	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	410593713
9	NC_019048	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593713
10	NC_019048	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593713
11	NC_019048	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	410593713
12	NC_019048	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410593713
13	NC_019048	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	410593713
14	NC_019048	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593713
15	NC_019048	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593713
16	NC_019048	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593713
17	NC_019048	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	410593713
18	NC_019048	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
19	NC_019048	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	410593713
20	NC_019048	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	410593713
21	NC_019048	G	6	6	782	787	0 %	0 %	100 %	0 %	410593713
22	NC_019048	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593713
23	NC_019048	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	410593713
24	NC_019048	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
25	NC_019048	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593713
26	NC_019048	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	410593713
27	NC_019048	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593713
28	NC_019048	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593713
29	NC_019048	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	410593713
30	NC_019048	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	410593713
31	NC_019048	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019048	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019048	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019048	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	410593714
35	NC_019048	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593714
36	NC_019048	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593714
37	NC_019048	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
38	NC_019048	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
39	NC_019048	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	410593714
40	NC_019048	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593714
41	NC_019048	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593714
42	NC_019048	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593714
43	NC_019048	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	410593714
44	NC_019048	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593714
45	NC_019048	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593714
46	NC_019048	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593714
47	NC_019048	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593714
48	NC_019048	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410593714
49	NC_019048	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	410593714
50	NC_019048	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593714
51	NC_019048	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	410593714
52	NC_019048	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019048	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019048	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019048	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019048	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019048	A	9	9	2950	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019048	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019048	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019048	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019048	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019048	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019048	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019048	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019048	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019048	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019048	GACAG	2	10	3372	3381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019048	T	6	6	3405	3410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019048	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019048	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019048	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019048	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019048	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019048	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593715
77	NC_019048	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	410593715
78	NC_019048	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593715
79	NC_019048	A	6	6	3891	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	410593715
80	NC_019048	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019048	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019048	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019048	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019048	A	7	7	4175	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	ATA	2	6	4199	4204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019048	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019048	CTA	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019048	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019048	TCT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019048	T	6	6	4390	4395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019048	ATA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019048	TTGA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019048	CAG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593716
94	NC_019048	TTTA	2	8	4488	4495	25 %	75 %	0 %	0 %	410593716
95	NC_019048	GCT	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
96	NC_019048	TGGTA	2	10	4560	4569	20 %	40 %	40 %	0 %	410593716
97	NC_019048	A	7	7	4618	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	410593716
98	NC_019048	TAA	2	6	4698	4703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593716
99	NC_019048	TGA	3	9	4758	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
100	NC_019048	TCAA	2	8	4864	4871	50 %	25 %	0 %	25 %	410593716
101	NC_019048	A	6	6	4892	4897	100 %	0 %	0 %	0 %	410593716
102	NC_019048	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
103	NC_019048	GTT	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593716
104	NC_019048	AAC	2	6	5043	5048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593716
105	NC_019048	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
106	NC_019048	TGA	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
107	NC_019048	AG	3	6	5145	5150	50 %	0 %	50 %	0 %	410593716
108	NC_019048	AGT	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
109	NC_019048	GAA	3	9	5182	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
110	NC_019048	TGA	3	9	5202	5210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
111	NC_019048	GCT	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
112	NC_019048	ATC	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593716
113	NC_019048	ACTT	2	8	5302	5309	25 %	50 %	0 %	25 %	410593716
114	NC_019048	CTG	2	6	5312	5317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593716
115	NC_019048	TAT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593716
116	NC_019048	ATG	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593716
117	NC_019048	AAG	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
118	NC_019048	GAA	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593716
119	NC_019048	TAA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019048	TTA	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019048	TTG	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593717
122	NC_019048	ATA	2	6	5695	5700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593717
123	NC_019048	AGA	2	6	5753	5758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593717
124	NC_019048	A	6	6	5803	5808	100 %	0 %	0 %	0 %	410593717
125	NC_019048	TTTAT	2	10	5809	5818	20 %	80 %	0 %	0 %	410593717
126	NC_019048	ACT	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593717
127	NC_019048	CTTA	2	8	5868	5875	25 %	50 %	0 %	25 %	410593717
128	NC_019048	ACA	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593717
129	NC_019048	AT	3	6	5907	5912	50 %	50 %	0 %	0 %	410593717
130	NC_019048	GAT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593717
131	NC_019048	CTG	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593717
132	NC_019048	TAT	2	6	5990	5995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
133	NC_019048	TTA	2	6	6067	6072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
134	NC_019048	ATG	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593717
135	NC_019048	ATT	3	9	6151	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593717
136	NC_019048	A	6	6	6178	6183	100 %	0 %	0 %	0 %	410593717
137	NC_019048	ATT	2	6	6223	6228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593718
138	NC_019048	GTG	2	6	6242	6247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593718
139	NC_019048	A	7	7	6353	6359	100 %	0 %	0 %	0 %	410593718
140	NC_019048	AT	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	410593718
141	NC_019048	T	6	6	6446	6451	0 %	100 %	0 %	0 %	410593718
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406	NC_019048	GGA	2	6	17531	17536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
407	NC_019048	ATC	2	6	17555	17560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_019048	AC	3	6	17582	17587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_019048	TGGT	2	8	17597	17604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
410	NC_019048	CGC	2	6	17721	17726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_019048	AC	3	6	17751	17756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
412	NC_019048	CAC	2	6	17766	17771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_019048	AGCC	2	8	17814	17821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
414	NC_019048	GAT	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
415	NC_019048	CCT	2	6	17893	17898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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417	NC_019048	AGG	2	6	17995	18000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_019048	GAA	2	6	18229	18234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
421	NC_019048	ACG	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_019048	GTAA	2	8	18269	18276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
423	NC_019048	GAAG	2	8	18351	18358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
424	NC_019048	TAG	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
425	NC_019048	GCGA	2	8	18425	18432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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428	NC_019048	AG	3	6	18532	18537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
429	NC_019048	TCG	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_019048	GGA	2	6	18621	18626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
431	NC_019048	CT	3	6	18647	18652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
432	NC_019048	GGGAG	2	10	18702	18711	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019048	ACA	2	6	18739	18744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_019048	ATG	2	6	18806	18811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019048	TGT	2	6	18876	18881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_019048	GGA	2	6	18939	18944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_019048	AT	3	6	19225	19230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_019048	AGC	2	6	19284	19289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_019048	TG	3	6	19415	19420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019048	AAG	2	6	19421	19426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_019048	GA	3	6	19566	19571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
446	NC_019048	ACA	2	6	19592	19597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
447	NC_019048	TA	3	6	19620	19625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_019048	CTAA	2	8	19647	19654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
449	NC_019048	GAG	2	6	19736	19741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
450	NC_019048	TAG	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_019048	GA	3	6	19861	19866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019048	CT	3	6	19977	19982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_019048	GAT	2	6	19995	20000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_019048	TGGT	2	8	23422	23429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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