MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019048	A	6	6	136676	136681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019048	AGG	2	6	136687	136692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019048	AAT	2	6	136697	136702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593833
3004	NC_019048	CAG	2	6	136714	136719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593833
3005	NC_019048	AGC	2	6	136733	136738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410593833
3006	NC_019048	ACAA	2	8	136773	136780	75 %	0 %	0 %	25 %	410593833
3007	NC_019048	GC	3	6	136805	136810	0 %	0 %	50 %	50 %	410593833
3008	NC_019048	A	6	6	136821	136826	100 %	0 %	0 %	0 %	410593833
3009	NC_019048	GGT	2	6	136872	136877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593833
3010	NC_019048	AAC	2	6	136891	136896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593833
3011	NC_019048	GAT	2	6	136968	136973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593833
3012	NC_019048	GAA	2	6	137037	137042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3013	NC_019048	GTT	2	6	137064	137069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593833
3014	NC_019048	GGT	2	6	137121	137126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593833
3015	NC_019048	GAA	2	6	137127	137132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3016	NC_019048	CTT	2	6	137204	137209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593833
3017	NC_019048	GAA	2	6	137279	137284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3018	NC_019048	GGT	2	6	137325	137330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593833
3019	NC_019048	TGA	2	6	137342	137347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593833
3020	NC_019048	AAG	2	6	137356	137361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3021	NC_019048	GTTAAC	2	12	137385	137396	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	410593833
3022	NC_019048	GAA	2	6	137474	137479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3023	NC_019048	A	6	6	137478	137483	100 %	0 %	0 %	0 %	410593833
3024	NC_019048	GAA	2	6	137541	137546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593833
3025	NC_019048	CAAA	2	8	137569	137576	75 %	0 %	0 %	25 %	410593833
3026	NC_019048	ATA	2	6	137597	137602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_019048	T	7	7	137627	137633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019048	TTA	2	6	137649	137654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019048	TGC	2	6	137703	137708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019048	GTT	2	6	137720	137725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019048	CTT	2	6	137729	137734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_019048	TTCT	2	8	137756	137763	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3033	NC_019048	AAT	2	6	137781	137786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019048	GTA	2	6	137837	137842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_019048	T	6	6	137913	137918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019048	A	6	6	137922	137927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_019048	CTT	2	6	137954	137959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_019048	TTC	2	6	137973	137978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_019048	ACC	2	6	138069	138074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_019048	GAT	2	6	138250	138255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019048	CGT	2	6	138272	138277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_019048	CTT	2	6	138281	138286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_019048	CTT	2	6	138320	138325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_019048	ATCA	2	8	138447	138454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_019048	ATC	2	6	138498	138503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_019048	CCT	2	6	138591	138596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_019048	ATT	2	6	138600	138605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_019048	TAT	2	6	138612	138617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019048	GAAA	2	8	138626	138633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_019048	A	6	6	138643	138648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_019048	GAAG	2	8	138656	138663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_019048	TTA	2	6	138670	138675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_019048	A	6	6	138677	138682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019048	AGA	2	6	138738	138743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019048	AGG	2	6	138807	138812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_019048	CAAA	2	8	138892	138899	75 %	0 %	0 %	25 %	410593834
3058	NC_019048	AAACC	2	10	138910	138919	60 %	0 %	0 %	40 %	410593834
3059	NC_019048	A	7	7	138954	138960	100 %	0 %	0 %	0 %	410593834
3060	NC_019048	TAA	2	6	139009	139014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593834
3061	NC_019048	T	7	7	139034	139040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019048	T	7	7	139079	139085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019048	AAT	2	6	139088	139093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_019048	ATAGA	2	10	139105	139114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_019048	GTA	2	6	139134	139139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3069	NC_019048	A	6	6	139400	139405	100 %	0 %	0 %	0 %	410593835
3070	NC_019048	CTG	2	6	139453	139458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593835
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3073	NC_019048	ATT	2	6	139771	139776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593836
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3080	NC_019048	GTT	2	6	140051	140056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593836
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3082	NC_019048	TTTA	2	8	140081	140088	25 %	75 %	0 %	0 %	410593836
3083	NC_019048	ACTG	2	8	140107	140114	25 %	25 %	25 %	25 %	410593836
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3090	NC_019048	GAA	2	6	140297	140302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593836
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3097	NC_019048	GTTGAA	2	12	140486	140497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593836
3098	NC_019048	TAT	2	6	140527	140532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593836
3099	NC_019048	TGT	2	6	140536	140541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593836
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3102	NC_019048	TTA	2	6	140670	140675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593836
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3105	NC_019048	TGAT	2	8	141006	141013	25 %	50 %	25 %	0 %	410593836
3106	NC_019048	AAGC	2	8	141056	141063	50 %	0 %	25 %	25 %	410593836
3107	NC_019048	CCA	2	6	141124	141129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593836
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3109	NC_019048	ATAAA	2	10	141176	141185	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019048	A	6	6	141183	141188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019048	GA	3	6	141193	141198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019048	T	6	6	141208	141213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_019048	ATG	2	6	141317	141322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593837
3114	NC_019048	ATTA	2	8	141325	141332	50 %	50 %	0 %	0 %	410593837
3115	NC_019048	CTT	2	6	141375	141380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593837
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3122	NC_019048	TTA	2	6	141619	141624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593837
3123	NC_019048	TAA	2	6	141630	141635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593837
3124	NC_019048	TCA	2	6	141680	141685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593837
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3126	NC_019048	AGA	2	6	141760	141765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410593837
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3252	NC_019048	ATG	2	6	146852	146857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593841
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3373	NC_019048	GTTA	2	8	152151	152158	25 %	50 %	25 %	0 %	410593846
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3375	NC_019048	AAATT	2	10	152245	152254	60 %	40 %	0 %	0 %	410593846
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3377	NC_019048	GTC	2	6	152308	152313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
3378	NC_019048	CAA	2	6	152326	152331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593846
3379	NC_019048	TGA	2	6	152350	152355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
3380	NC_019048	TGT	2	6	152366	152371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593846
3381	NC_019048	AGT	2	6	152423	152428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
3382	NC_019048	TGC	2	6	152429	152434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410593846
3383	NC_019048	CAA	2	6	152595	152600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593846
3384	NC_019048	ATCCT	2	10	152647	152656	20 %	40 %	0 %	40 %	410593846
3385	NC_019048	TGAT	2	8	152659	152666	25 %	50 %	25 %	0 %	410593846
3386	NC_019048	ATG	2	6	152671	152676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
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3388	NC_019048	TGA	2	6	152734	152739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593846
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3402	NC_019048	GA	3	6	153280	153285	50 %	0 %	50 %	0 %	410593847
3403	NC_019048	TTTAGA	2	12	153327	153338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	410593847
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3405	NC_019048	GTT	2	6	153466	153471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410593847
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3407	NC_019048	GAAA	2	8	153588	153595	75 %	0 %	25 %	0 %	410593847
3408	NC_019048	TGG	2	6	153627	153632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410593847
3409	NC_019048	TGAT	2	8	153638	153645	25 %	50 %	25 %	0 %	410593847
3410	NC_019048	GGAA	2	8	153671	153678	50 %	0 %	50 %	0 %	410593847
3411	NC_019048	ATT	2	6	153746	153751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593847
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3429	NC_019048	AAC	2	6	154568	154573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3430	NC_019048	TAG	2	6	154595	154600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3431	NC_019048	TTAAAT	2	12	154610	154621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_019048	AAAG	2	8	154625	154632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_019048	AAAT	2	8	154647	154654	75 %	25 %	0 %	0 %	410593849
3434	NC_019048	TAA	2	6	154834	154839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593849
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3443	NC_019048	ATA	2	6	155166	155171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593849
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3455	NC_019048	ACA	2	6	155626	155631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410593849
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3459	NC_019048	GATG	2	8	155797	155804	25 %	25 %	50 %	0 %	410593849
3460	NC_019048	ATACC	2	10	155820	155829	40 %	20 %	0 %	40 %	410593849
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3463	NC_019048	CTGAAG	2	12	155931	155942	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410593849
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3465	NC_019048	ATA	2	6	156075	156080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3466	NC_019048	TGA	2	6	156098	156103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3467	NC_019048	TTA	2	6	156127	156132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593850
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3479	NC_019048	TAG	2	6	156720	156725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410593850
3480	NC_019048	ATA	2	6	156890	156895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593850
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3482	NC_019048	CTTA	2	8	156994	157001	25 %	50 %	0 %	25 %	410593850
3483	NC_019048	TCTGTT	2	12	157010	157021	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410593850
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3485	NC_019048	CAT	2	6	157200	157205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410593850
3486	NC_019048	ATA	2	6	157229	157234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593850
3487	NC_019048	TTC	2	6	157243	157248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593850
3488	NC_019048	ATA	2	6	157278	157283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593850
3489	NC_019048	TTA	2	6	157338	157343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_019048	A	6	6	157354	157359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_019048	TAA	2	6	157364	157369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3492	NC_019048	CTG	2	6	157429	157434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3493	NC_019048	CCA	2	6	157504	157509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410593851
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3495	NC_019048	TTA	2	6	157595	157600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410593851
3496	NC_019048	TAA	2	6	157610	157615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410593851
3497	NC_019048	T	7	7	157633	157639	0 %	100 %	0 %	0 %	410593851
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3499	NC_019048	TCT	2	6	157704	157709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410593851
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