MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_019048	TCA	2	6	1400932	1400937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595023
31502	NC_019048	TAC	2	6	1400946	1400951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595023
31503	NC_019048	TTC	2	6	1400991	1400996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595023
31504	NC_019048	CAT	2	6	1401083	1401088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595023
31505	NC_019048	CAT	2	6	1401134	1401139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595023
31506	NC_019048	T	6	6	1401162	1401167	0 %	100 %	0 %	0 %	410595023
31507	NC_019048	GTAC	2	8	1401229	1401236	25 %	25 %	25 %	25 %	410595023
31508	NC_019048	AAT	2	6	1401279	1401284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595023
31509	NC_019048	TGCT	2	8	1401393	1401400	0 %	50 %	25 %	25 %	410595023
31510	NC_019048	GCA	2	6	1401463	1401468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595023
31511	NC_019048	AT	3	6	1401471	1401476	50 %	50 %	0 %	0 %	410595023
31512	NC_019048	CAA	2	6	1401536	1401541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595023
31513	NC_019048	TAA	2	6	1401590	1401595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31514	NC_019048	CTG	2	6	1401597	1401602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31515	NC_019048	GCAA	2	8	1401613	1401620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31516	NC_019048	TAT	3	9	1401636	1401644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_019048	AATC	2	8	1401716	1401723	50 %	25 %	0 %	25 %	410595024
31518	NC_019048	CTA	2	6	1401727	1401732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595024
31519	NC_019048	TAA	2	6	1401800	1401805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595024
31520	NC_019048	TCC	2	6	1401865	1401870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595024
31521	NC_019048	TCC	2	6	1401882	1401887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595024
31522	NC_019048	ATT	2	6	1401891	1401896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595024
31523	NC_019048	GAAT	2	8	1401905	1401912	50 %	25 %	25 %	0 %	410595024
31524	NC_019048	CTT	2	6	1402046	1402051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595024
31525	NC_019048	ACTT	2	8	1402094	1402101	25 %	50 %	0 %	25 %	410595024
31526	NC_019048	AGC	2	6	1402179	1402184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595024
31527	NC_019048	AAT	2	6	1402191	1402196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595024
31528	NC_019048	TCA	2	6	1402267	1402272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595024
31529	NC_019048	CTT	2	6	1402301	1402306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595024
31530	NC_019048	TTC	2	6	1402335	1402340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595024
31531	NC_019048	ATA	2	6	1402363	1402368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595024
31532	NC_019048	TGG	2	6	1402428	1402433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595024
31533	NC_019048	CCT	3	9	1402513	1402521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595024
31534	NC_019048	AAT	2	6	1402556	1402561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595024
31535	NC_019048	ATG	2	6	1402647	1402652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595024
31536	NC_019048	TAA	2	6	1402678	1402683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595025
31537	NC_019048	T	6	6	1402706	1402711	0 %	100 %	0 %	0 %	410595025
31538	NC_019048	TTC	2	6	1402734	1402739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595025
31539	NC_019048	TTAT	2	8	1402747	1402754	25 %	75 %	0 %	0 %	410595025
31540	NC_019048	AG	3	6	1402776	1402781	50 %	0 %	50 %	0 %	410595025
31541	NC_019048	CTTT	2	8	1402813	1402820	0 %	75 %	0 %	25 %	410595025
31542	NC_019048	AGAA	2	8	1402848	1402855	75 %	0 %	25 %	0 %	410595025
31543	NC_019048	CTA	2	6	1402862	1402867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595025
31544	NC_019048	GAA	2	6	1402894	1402899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595025
31545	NC_019048	AAT	2	6	1402924	1402929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595025
31546	NC_019048	A	7	7	1402956	1402962	100 %	0 %	0 %	0 %	410595025
31547	NC_019048	CAA	2	6	1402965	1402970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595025
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31552	NC_019048	TCAC	2	8	1403122	1403129	25 %	25 %	0 %	50 %	410595025
31553	NC_019048	AAAT	2	8	1403153	1403160	75 %	25 %	0 %	0 %	410595025
31554	NC_019048	T	7	7	1403183	1403189	0 %	100 %	0 %	0 %	410595025
31555	NC_019048	TAA	2	6	1403195	1403200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595025
31556	NC_019048	GAA	2	6	1403203	1403208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410595025
31557	NC_019048	TTTAT	2	10	1403223	1403232	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31558	NC_019048	TGA	2	6	1403243	1403248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31559	NC_019048	TAT	2	6	1403251	1403256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31560	NC_019048	ATT	2	6	1403280	1403285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31561	NC_019048	ACAA	2	8	1403305	1403312	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31562	NC_019048	TAA	2	6	1403351	1403356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31563	NC_019048	A	7	7	1403390	1403396	100 %	0 %	0 %	0 %	410595026
31564	NC_019048	TCAA	2	8	1403400	1403407	50 %	25 %	0 %	25 %	410595026
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31568	NC_019048	TGA	2	6	1403665	1403670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595026
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31572	NC_019048	GTG	2	6	1403829	1403834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410595026
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31574	NC_019048	TGA	2	6	1403917	1403922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595026
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31579	NC_019048	AAAG	2	8	1404398	1404405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31580	NC_019048	A	6	6	1404457	1404462	100 %	0 %	0 %	0 %	410595027
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31587	NC_019048	A	7	7	1404817	1404823	100 %	0 %	0 %	0 %	410595027
31588	NC_019048	TAG	2	6	1404853	1404858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595027
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31591	NC_019048	TTC	2	6	1404944	1404949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595027
31592	NC_019048	ATT	3	9	1404953	1404961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595027
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31599	NC_019048	TAG	2	6	1405221	1405226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595028
31600	NC_019048	A	7	7	1405239	1405245	100 %	0 %	0 %	0 %	410595028
31601	NC_019048	TAT	2	6	1405246	1405251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595028
31602	NC_019048	AGT	2	6	1405267	1405272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595028
31603	NC_019048	GGAG	2	8	1405273	1405280	25 %	0 %	75 %	0 %	410595028
31604	NC_019048	GCT	3	9	1405289	1405297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595028
31605	NC_019048	CAGG	2	8	1405304	1405311	25 %	0 %	50 %	25 %	410595028
31606	NC_019048	AATA	2	8	1405358	1405365	75 %	25 %	0 %	0 %	410595028
31607	NC_019048	TAT	2	6	1405372	1405377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595029
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31611	NC_019048	ATT	2	6	1405543	1405548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410595029
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31614	NC_019048	GAAA	2	8	1405699	1405706	75 %	0 %	25 %	0 %	410595029
31615	NC_019048	GCA	2	6	1405844	1405849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595029
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31617	NC_019048	CAA	2	6	1405908	1405913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410595029
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31974	NC_019048	TTC	2	6	1421456	1421461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595047
31975	NC_019048	CTT	2	6	1421512	1421517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595047
31976	NC_019048	TCC	2	6	1421532	1421537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595047
31977	NC_019048	GAT	2	6	1421617	1421622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410595047
31978	NC_019048	TTAG	2	8	1421631	1421638	25 %	50 %	25 %	0 %	410595047
31979	NC_019048	AATC	2	8	1421656	1421663	50 %	25 %	0 %	25 %	410595047
31980	NC_019048	AGGAAC	2	12	1421678	1421689	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410595047
31981	NC_019048	TAA	2	6	1421710	1421715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595047
31982	NC_019048	TAA	2	6	1421779	1421784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595047
31983	NC_019048	TC	3	6	1421814	1421819	0 %	50 %	0 %	50 %	410595047
31984	NC_019048	CAT	3	9	1421821	1421829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595047
31985	NC_019048	AAT	2	6	1421866	1421871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595047
31986	NC_019048	CGT	2	6	1421883	1421888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410595047
31987	NC_019048	TAA	2	6	1421954	1421959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410595047
31988	NC_019048	AACTA	2	10	1422023	1422032	60 %	20 %	0 %	20 %	410595047
31989	NC_019048	CAT	2	6	1422035	1422040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595047
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31991	NC_019048	CTT	2	6	1422061	1422066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410595047
31992	NC_019048	ATC	2	6	1422125	1422130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595047
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31994	NC_019048	TCC	2	6	1422232	1422237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595048
31995	NC_019048	AAAC	2	8	1422258	1422265	75 %	0 %	0 %	25 %	410595048
31996	NC_019048	ACG	2	6	1422327	1422332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410595048
31997	NC_019048	TCA	2	6	1422431	1422436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595048
31998	NC_019048	TCC	2	6	1422465	1422470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410595048
31999	NC_019048	ATC	4	12	1422522	1422533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595048
32000	NC_019048	CAT	2	6	1422581	1422586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410595048

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