MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_019048	CAT	2	6	1208133	1208138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594837
27003	NC_019048	AGC	3	9	1208143	1208151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594837
27004	NC_019048	ATTG	2	8	1208179	1208186	25 %	50 %	25 %	0 %	410594837
27005	NC_019048	TCT	2	6	1208210	1208215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594837
27006	NC_019048	CCA	2	6	1208286	1208291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410594837
27007	NC_019048	GTTC	2	8	1208345	1208352	0 %	50 %	25 %	25 %	410594837
27008	NC_019048	TTC	2	6	1208447	1208452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27009	NC_019048	A	6	6	1208467	1208472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27010	NC_019048	TACCA	2	10	1208566	1208575	40 %	20 %	0 %	40 %	410594838
27011	NC_019048	CAT	2	6	1208618	1208623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594838
27012	NC_019048	CTT	2	6	1208810	1208815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594838
27013	NC_019048	CT	3	6	1208849	1208854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27014	NC_019048	AAACT	2	10	1208907	1208916	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27015	NC_019048	CAAT	2	8	1208945	1208952	50 %	25 %	0 %	25 %	410594839
27016	NC_019048	TTGC	2	8	1208972	1208979	0 %	50 %	25 %	25 %	410594839
27017	NC_019048	GAA	2	6	1209112	1209117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594839
27018	NC_019048	GAA	2	6	1209169	1209174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594839
27019	NC_019048	GTA	2	6	1209183	1209188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594839
27020	NC_019048	ATC	2	6	1209242	1209247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594839
27021	NC_019048	GAA	2	6	1209376	1209381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594839
27022	NC_019048	GTT	2	6	1209388	1209393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594839
27023	NC_019048	TTA	2	6	1209405	1209410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594839
27024	NC_019048	CCA	2	6	1209488	1209493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410594839
27025	NC_019048	AAT	2	6	1209526	1209531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594839
27026	NC_019048	ACA	2	6	1209627	1209632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594839
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27029	NC_019048	AAC	2	6	1209731	1209736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594839
27030	NC_019048	TCA	2	6	1209804	1209809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594839
27031	NC_019048	TTC	2	6	1209815	1209820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594839
27032	NC_019048	TTG	2	6	1209847	1209852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594839
27033	NC_019048	CTT	2	6	1209862	1209867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594839
27034	NC_019048	ATC	2	6	1209911	1209916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594839
27035	NC_019048	TCA	3	9	1209966	1209974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594839
27036	NC_019048	T	6	6	1209989	1209994	0 %	100 %	0 %	0 %	410594839
27037	NC_019048	T	6	6	1210043	1210048	0 %	100 %	0 %	0 %	410594839
27038	NC_019048	T	6	6	1210079	1210084	0 %	100 %	0 %	0 %	410594840
27039	NC_019048	CTT	2	6	1210118	1210123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594840
27040	NC_019048	TC	3	6	1210220	1210225	0 %	50 %	0 %	50 %	410594840
27041	NC_019048	ATA	2	6	1210266	1210271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594840
27042	NC_019048	CAC	2	6	1210322	1210327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410594840
27043	NC_019048	TGT	2	6	1210362	1210367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594840
27044	NC_019048	GAT	2	6	1210415	1210420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594840
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27046	NC_019048	CTGT	2	8	1210475	1210482	0 %	50 %	25 %	25 %	410594840
27047	NC_019048	TTTG	2	8	1210501	1210508	0 %	75 %	25 %	0 %	410594840
27048	NC_019048	ATG	2	6	1210539	1210544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594840
27049	NC_019048	TCGT	2	8	1210548	1210555	0 %	50 %	25 %	25 %	410594840
27050	NC_019048	AAT	2	6	1210580	1210585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594840
27051	NC_019048	AT	3	6	1210618	1210623	50 %	50 %	0 %	0 %	410594840
27052	NC_019048	AATT	2	8	1210656	1210663	50 %	50 %	0 %	0 %	410594840
27053	NC_019048	T	6	6	1210670	1210675	0 %	100 %	0 %	0 %	410594840
27054	NC_019048	AGT	2	6	1210724	1210729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594840
27055	NC_019048	GTT	2	6	1210772	1210777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594840
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27063	NC_019048	TTA	2	6	1211116	1211121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594840
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27068	NC_019048	GAC	2	6	1211339	1211344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594840
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27070	NC_019048	CAT	2	6	1211447	1211452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594840
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27073	NC_019048	A	6	6	1211676	1211681	100 %	0 %	0 %	0 %	410594840
27074	NC_019048	T	6	6	1211714	1211719	0 %	100 %	0 %	0 %	410594840
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27078	NC_019048	T	6	6	1211899	1211904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27079	NC_019048	T	6	6	1211919	1211924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27083	NC_019048	TTTA	2	8	1212086	1212093	25 %	75 %	0 %	0 %	410594841
27084	NC_019048	TTGCTG	2	12	1212112	1212123	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410594841
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27087	NC_019048	GCT	2	6	1212210	1212215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594841
27088	NC_019048	TTA	2	6	1212280	1212285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594841
27089	NC_019048	TAC	2	6	1212302	1212307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594841
27090	NC_019048	TTC	2	6	1212312	1212317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594841
27091	NC_019048	GCT	2	6	1212327	1212332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594841
27092	NC_019048	CTG	2	6	1212355	1212360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594841
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27097	NC_019048	T	7	7	1212462	1212468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27098	NC_019048	AT	3	6	1212486	1212491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27099	NC_019048	A	6	6	1212493	1212498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27100	NC_019048	T	6	6	1212517	1212522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27101	NC_019048	TCTA	2	8	1212528	1212535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27102	NC_019048	T	6	6	1212543	1212548	0 %	100 %	0 %	0 %	410594842
27103	NC_019048	GCT	2	6	1212559	1212564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594842
27104	NC_019048	TTTACG	2	12	1212570	1212581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410594842
27105	NC_019048	ACG	2	6	1212660	1212665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594842
27106	NC_019048	TAC	2	6	1212696	1212701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594842
27107	NC_019048	CCT	2	6	1212722	1212727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27108	NC_019048	TTA	2	6	1212814	1212819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594843
27109	NC_019048	T	6	6	1212881	1212886	0 %	100 %	0 %	0 %	410594843
27110	NC_019048	TTA	2	6	1212896	1212901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594843
27111	NC_019048	CAT	2	6	1212960	1212965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594843
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27113	NC_019048	ATC	2	6	1212982	1212987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594843
27114	NC_019048	AAAT	2	8	1213048	1213055	75 %	25 %	0 %	0 %	410594843
27115	NC_019048	ACA	2	6	1213138	1213143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594843
27116	NC_019048	CAAT	2	8	1213160	1213167	50 %	25 %	0 %	25 %	410594843
27117	NC_019048	CTTT	2	8	1213224	1213231	0 %	75 %	0 %	25 %	410594843
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27119	NC_019048	AT	3	6	1213319	1213324	50 %	50 %	0 %	0 %	410594843
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27481	NC_019048	AGCT	2	8	1228353	1228360	25 %	25 %	25 %	25 %	410594854
27482	NC_019048	TAC	2	6	1228406	1228411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594854
27483	NC_019048	AGC	2	6	1228474	1228479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594854
27484	NC_019048	TGAT	2	8	1228545	1228552	25 %	50 %	25 %	0 %	410594854
27485	NC_019048	TGGA	2	8	1228646	1228653	25 %	25 %	50 %	0 %	410594854
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27488	NC_019048	TTA	2	6	1228779	1228784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594854
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27490	NC_019048	TAC	2	6	1228826	1228831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594854
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27499	NC_019048	ATCA	2	8	1229262	1229269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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