MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 40897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_019048	TCAT	2	8	519371	519378	25 %	50 %	0 %	25 %	410594189
11502	NC_019048	AT	5	10	519377	519386	50 %	50 %	0 %	0 %	410594189
11503	NC_019048	TAGAA	2	10	519421	519430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_019048	GA	3	6	519444	519449	50 %	0 %	50 %	0 %	410594190
11505	NC_019048	TTA	2	6	519590	519595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594190
11506	NC_019048	CCACT	2	10	519689	519698	20 %	20 %	0 %	60 %	410594190
11507	NC_019048	AGT	2	6	519862	519867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_019048	ATTT	2	8	519917	519924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_019048	T	6	6	519966	519971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_019048	ATT	2	6	519980	519985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_019048	TAAT	2	8	520000	520007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_019048	T	7	7	520019	520025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_019048	GTC	2	6	520079	520084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_019048	GAAA	2	8	520090	520097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_019048	GA	3	6	520161	520166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_019048	AGG	2	6	520171	520176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_019048	A	6	6	520199	520204	100 %	0 %	0 %	0 %	410594191
11518	NC_019048	AC	3	6	520215	520220	50 %	0 %	0 %	50 %	410594191
11519	NC_019048	AAG	2	6	520227	520232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11520	NC_019048	TCT	2	6	520253	520258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594191
11521	NC_019048	A	6	6	520285	520290	100 %	0 %	0 %	0 %	410594191
11522	NC_019048	GAA	2	6	520322	520327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11523	NC_019048	A	6	6	520331	520336	100 %	0 %	0 %	0 %	410594191
11524	NC_019048	T	6	6	520355	520360	0 %	100 %	0 %	0 %	410594191
11525	NC_019048	ATT	2	6	520382	520387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11526	NC_019048	TGC	2	6	520399	520404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594191
11527	NC_019048	CT	3	6	520409	520414	0 %	50 %	0 %	50 %	410594191
11528	NC_019048	TTA	2	6	520416	520421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11529	NC_019048	GTT	2	6	520466	520471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594191
11530	NC_019048	AGC	2	6	520516	520521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594191
11531	NC_019048	TCG	2	6	520564	520569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594191
11532	NC_019048	TGT	2	6	520642	520647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594191
11533	NC_019048	GAA	2	6	520691	520696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11534	NC_019048	AGT	2	6	520744	520749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11535	NC_019048	GTT	2	6	520829	520834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594191
11536	NC_019048	TGA	2	6	520891	520896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11537	NC_019048	ATT	2	6	520939	520944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11538	NC_019048	ACTT	2	8	520946	520953	25 %	50 %	0 %	25 %	410594191
11539	NC_019048	ATT	2	6	520961	520966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11540	NC_019048	TTA	2	6	520971	520976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11541	NC_019048	AAG	2	6	521004	521009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11542	NC_019048	TGA	2	6	521025	521030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11543	NC_019048	TCGT	2	8	521133	521140	0 %	50 %	25 %	25 %	410594191
11544	NC_019048	ATC	2	6	521257	521262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594191
11545	NC_019048	GAA	2	6	521267	521272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11546	NC_019048	ATA	2	6	521283	521288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594191
11547	NC_019048	TAT	2	6	521299	521304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11548	NC_019048	AATT	2	8	521343	521350	50 %	50 %	0 %	0 %	410594191
11549	NC_019048	ATT	2	6	521536	521541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11550	NC_019048	TGA	2	6	521655	521660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11551	NC_019048	TTG	2	6	521706	521711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594191
11552	NC_019048	AAG	2	6	521793	521798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11553	NC_019048	TAT	2	6	521869	521874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11554	NC_019048	AGA	2	6	521890	521895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594191
11555	NC_019048	ATG	2	6	522063	522068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11556	NC_019048	CAG	2	6	522084	522089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594191
11557	NC_019048	ATTGGT	2	12	522092	522103	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	410594191
11558	NC_019048	TGA	2	6	522157	522162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594191
11559	NC_019048	TAT	2	6	522175	522180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11560	NC_019048	AGGA	2	8	522192	522199	50 %	0 %	50 %	0 %	410594191
11561	NC_019048	TCT	2	6	522207	522212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594191
11562	NC_019048	TCT	2	6	522238	522243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594191
11563	NC_019048	GGATG	2	10	522293	522302	20 %	20 %	60 %	0 %	410594191
11564	NC_019048	CTT	2	6	522320	522325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594191
11565	NC_019048	CTT	2	6	522427	522432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594191
11566	NC_019048	TGG	2	6	522436	522441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594191
11567	NC_019048	TAT	2	6	522454	522459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594191
11568	NC_019048	CAAT	2	8	522629	522636	50 %	25 %	0 %	25 %	410594191
11569	NC_019048	TTG	2	6	522714	522719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594191
11570	NC_019048	TAA	2	6	522730	522735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594191
11571	NC_019048	TTTAG	2	10	522864	522873	20 %	60 %	20 %	0 %	410594191
11572	NC_019048	T	7	7	522918	522924	0 %	100 %	0 %	0 %	410594192
11573	NC_019048	AT	3	6	523048	523053	50 %	50 %	0 %	0 %	410594192
11574	NC_019048	AGT	2	6	523074	523079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594192
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11576	NC_019048	TGATA	2	10	523136	523145	40 %	40 %	20 %	0 %	410594192
11577	NC_019048	A	6	6	523180	523185	100 %	0 %	0 %	0 %	410594192
11578	NC_019048	GA	3	6	523196	523201	50 %	0 %	50 %	0 %	410594192
11579	NC_019048	AAT	2	6	523251	523256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594192
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11581	NC_019048	CAT	2	6	523325	523330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410594192
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11583	NC_019048	TAT	2	6	523400	523405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594192
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11586	NC_019048	TTTCTG	2	12	523490	523501	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	410594192
11587	NC_019048	T	6	6	523552	523557	0 %	100 %	0 %	0 %	410594192
11588	NC_019048	AT	3	6	523601	523606	50 %	50 %	0 %	0 %	410594192
11589	NC_019048	T	6	6	523631	523636	0 %	100 %	0 %	0 %	410594192
11590	NC_019048	ATTA	2	8	523650	523657	50 %	50 %	0 %	0 %	410594192
11591	NC_019048	GT	3	6	523838	523843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_019048	AGG	3	9	523872	523880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_019048	GAAA	2	8	523908	523915	75 %	0 %	25 %	0 %	410594193
11594	NC_019048	AGA	2	6	523929	523934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594193
11595	NC_019048	TTA	2	6	523997	524002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
11596	NC_019048	ATG	2	6	524021	524026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594193
11597	NC_019048	ATT	2	6	524073	524078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
11598	NC_019048	GAT	2	6	524119	524124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594193
11599	NC_019048	TTA	2	6	524139	524144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
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11601	NC_019048	TAT	2	6	524370	524375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
11602	NC_019048	ATT	2	6	524382	524387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
11603	NC_019048	AGA	2	6	524403	524408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594193
11604	NC_019048	TGT	2	6	524463	524468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410594193
11605	NC_019048	GGTA	2	8	524488	524495	25 %	25 %	50 %	0 %	410594193
11606	NC_019048	ATG	2	6	524558	524563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594193
11607	NC_019048	AGC	2	6	524577	524582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410594193
11608	NC_019048	TGC	2	6	524622	524627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410594193
11609	NC_019048	TAA	2	6	524634	524639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410594193
11610	NC_019048	CTT	2	6	524720	524725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410594193
11611	NC_019048	ACA	2	6	524790	524795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594193
11612	NC_019048	ATTG	2	8	524832	524839	25 %	50 %	25 %	0 %	410594193
11613	NC_019048	TTA	2	6	524876	524881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410594193
11614	NC_019048	TAG	2	6	524949	524954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594193
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11617	NC_019048	TGA	2	6	525017	525022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594193
11618	NC_019048	GTAT	2	8	525083	525090	25 %	50 %	25 %	0 %	410594193
11619	NC_019048	TGG	2	6	525183	525188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410594193
11620	NC_019048	ATTT	2	8	525203	525210	25 %	75 %	0 %	0 %	410594193
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11990	NC_019048	GAT	2	6	544443	544448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410594211
11991	NC_019048	A	6	6	544494	544499	100 %	0 %	0 %	0 %	410594211
11992	NC_019048	AAC	2	6	544502	544507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410594211
11993	NC_019048	TTAC	2	8	544530	544537	25 %	50 %	0 %	25 %	410594211
11994	NC_019048	GAA	3	9	544548	544556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410594211
11995	NC_019048	CATGAA	2	12	544566	544577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	410594211
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