MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes A20 chromosome

Total Repeats: 39139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018936	ATTT	2	8	91	98	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018936	ACTA	2	8	117	124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018936	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018936	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	410679695
5	NC_018936	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	410679695
6	NC_018936	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679695
7	NC_018936	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	410679695
8	NC_018936	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
9	NC_018936	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
10	NC_018936	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679695
11	NC_018936	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
12	NC_018936	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679695
13	NC_018936	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	410679695
14	NC_018936	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679695
15	NC_018936	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	410679695
16	NC_018936	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679695
17	NC_018936	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	410679695
18	NC_018936	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	410679695
19	NC_018936	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
20	NC_018936	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679695
21	NC_018936	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	410679695
22	NC_018936	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679695
23	NC_018936	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
24	NC_018936	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410679695
25	NC_018936	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	410679695
26	NC_018936	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679695
27	NC_018936	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679695
28	NC_018936	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679695
29	NC_018936	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410679695
30	NC_018936	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679695
31	NC_018936	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	410679695
32	NC_018936	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018936	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018936	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018936	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018936	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018936	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018936	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
39	NC_018936	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679696
40	NC_018936	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	410679696
41	NC_018936	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
42	NC_018936	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	410679696
43	NC_018936	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
44	NC_018936	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679696
45	NC_018936	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679696
46	NC_018936	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679696
47	NC_018936	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
48	NC_018936	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
49	NC_018936	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679696
50	NC_018936	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	410679696
51	NC_018936	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679696
52	NC_018936	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	410679696
53	NC_018936	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679696
54	NC_018936	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679696
55	NC_018936	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679696
56	NC_018936	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679696
57	NC_018936	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679696
58	NC_018936	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	410679696
59	NC_018936	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	410679696
60	NC_018936	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679696
61	NC_018936	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	410679696
62	NC_018936	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	410679696
63	NC_018936	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018936	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018936	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018936	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	410679697
67	NC_018936	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	410679697
68	NC_018936	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679697
69	NC_018936	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	410679697
70	NC_018936	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018936	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018936	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018936	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679698
74	NC_018936	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410679698
75	NC_018936	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018936	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018936	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018936	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018936	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
80	NC_018936	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679699
81	NC_018936	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	410679699
82	NC_018936	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	410679699
83	NC_018936	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	410679699
84	NC_018936	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
85	NC_018936	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	410679699
86	NC_018936	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	410679699
87	NC_018936	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
88	NC_018936	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679699
89	NC_018936	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679699
90	NC_018936	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	410679699
91	NC_018936	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
92	NC_018936	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
93	NC_018936	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
94	NC_018936	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
95	NC_018936	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679699
96	NC_018936	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679699
97	NC_018936	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410679699
98	NC_018936	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679699
99	NC_018936	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679699
100	NC_018936	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
101	NC_018936	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679699
102	NC_018936	TGT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679699
103	NC_018936	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679699
104	NC_018936	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018936	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410679700
106	NC_018936	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	410679700
107	NC_018936	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679700
108	NC_018936	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679700
109	NC_018936	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679700
110	NC_018936	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679700
111	NC_018936	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410679700
112	NC_018936	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679700
113	NC_018936	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410679700
114	NC_018936	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679700
115	NC_018936	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410679700
116	NC_018936	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679700
117	NC_018936	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410679700
118	NC_018936	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	410679700
119	NC_018936	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	410679700
120	NC_018936	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
121	NC_018936	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410679701
122	NC_018936	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
123	NC_018936	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	410679701
124	NC_018936	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
125	NC_018936	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	410679701
126	NC_018936	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
127	NC_018936	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
128	NC_018936	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	410679701
129	NC_018936	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
130	NC_018936	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410679701
131	NC_018936	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
132	NC_018936	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410679701
133	NC_018936	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	410679701
134	NC_018936	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410679701
135	NC_018936	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	410679701
136	NC_018936	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
137	NC_018936	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410679701
138	NC_018936	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	410679701
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