MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes A20 chromosome

Total Repeats: 39139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018936	GGT	2	6	21404	21409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018936	TCG	2	6	21519	21524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_018936	CGT	2	6	21599	21604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_018936	AGGGA	2	10	21737	21746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018936	C	6	6	21775	21780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
506	NC_018936	GA	3	6	21823	21828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018936	AGTGTA	2	12	21850	21861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018936	ACTAAT	2	12	21878	21889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
509	NC_018936	CAG	2	6	22040	22045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018936	GCTTA	2	10	22103	22112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
511	NC_018936	AC	3	6	22116	22121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_018936	AGT	2	6	22297	22302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018936	T	6	6	22307	22312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018936	CGT	2	6	22637	22642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018936	GAG	2	6	22651	22656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018936	T	6	6	22745	22750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018936	CTC	2	6	22816	22821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_018936	AGA	2	6	22913	22918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018936	AAAT	2	8	22990	22997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018936	AG	3	6	23041	23046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018936	GGC	2	6	23073	23078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_018936	ACCT	2	8	23164	23171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
523	NC_018936	AG	3	6	23216	23221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018936	CGA	2	6	23318	23323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_018936	GCA	2	6	23392	23397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018936	CGC	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_018936	GTGA	2	8	23445	23452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018936	TGT	2	6	23478	23483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018936	AGA	2	6	23487	23492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018936	ATG	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018936	CCA	2	6	23514	23519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_018936	TAAC	2	8	23528	23535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_018936	CAG	2	6	23561	23566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018936	AGCG	2	8	23616	23623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_018936	T	6	6	23631	23636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018936	AT	3	6	23745	23750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018936	GGA	2	6	23751	23756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018936	CT	3	6	23776	23781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_018936	GAA	2	6	24015	24020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018936	GGT	2	6	24089	24094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018936	GTC	2	6	24103	24108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018936	TCGTG	2	10	24112	24121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
543	NC_018936	CAT	2	6	24171	24176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018936	TAA	2	6	24206	24211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018936	GGA	2	6	24215	24220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018936	ATC	2	6	24239	24244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018936	AC	3	6	24266	24271	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_018936	TGGT	2	8	24281	24288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018936	CGC	2	6	24405	24410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_018936	AC	3	6	24435	24440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_018936	CAC	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_018936	AGCC	2	8	24498	24505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
553	NC_018936	GAT	2	6	24521	24526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018936	CCT	2	6	24577	24582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_018936	AGG	2	6	24676	24681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018936	CTA	2	6	24722	24727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_018936	TG	3	6	24790	24795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018936	AGCG	2	8	24844	24851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_018936	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018936	TAA	2	6	24970	24975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018936	A	7	7	24988	24994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018936	TAA	2	6	25001	25006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018936	GTTAA	2	10	25008	25017	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018936	GAA	2	6	25054	25059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018936	ACG	2	6	25071	25076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018936	GTAA	2	8	25094	25101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018936	ACTA	2	8	25136	25143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_018936	GAAG	2	8	25176	25183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018936	TAG	2	6	25242	25247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018936	GCGA	2	8	25250	25257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
571	NC_018936	AGG	2	6	25264	25269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018936	AGA	2	6	25330	25335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018936	AG	3	6	25358	25363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018936	GGA	2	6	25446	25451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018936	CT	3	6	25472	25477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_018936	GGGAG	2	10	25527	25536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018936	ACA	2	6	25564	25569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_018936	ATG	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018936	TGT	2	6	25701	25706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018936	GGA	2	6	25764	25769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018936	TC	3	6	25850	25855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_018936	ATC	2	6	25971	25976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018936	ACC	2	6	26029	26034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_018936	AGC	2	6	26109	26114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018936	ATTC	2	8	26116	26123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_018936	TG	3	6	26240	26245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018936	AAG	2	6	26246	26251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018936	GAG	2	6	26261	26266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018936	GA	3	6	26391	26396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018936	TA	3	6	26445	26450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018936	CTAA	2	8	26472	26479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
592	NC_018936	TAG	2	6	26574	26579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018936	GA	3	6	26687	26692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018936	CT	3	6	26802	26807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_018936	GAT	2	6	26820	26825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018936	AGG	2	6	26865	26870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_018936	GA	3	6	27009	27014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018936	TAGG	2	8	27127	27134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018936	GTT	2	6	27171	27176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018936	TAC	2	6	27181	27186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_018936	CCT	2	6	27269	27274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_018936	TTGG	2	8	27310	27317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018936	AATC	2	8	27319	27326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_018936	GGT	2	6	27405	27410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018936	TCG	2	6	27520	27525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018936	CGT	2	6	27600	27605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018936	AGGGA	2	10	27738	27747	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018936	C	6	6	27776	27781	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
610	NC_018936	GA	3	6	27824	27829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018936	AGTGTA	2	12	27851	27862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018936	ACTAAT	2	12	27879	27890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_018936	CAG	2	6	28041	28046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_018936	GCTTA	2	10	28104	28113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
615	NC_018936	AC	3	6	28117	28122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_018936	AGT	2	6	28298	28303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018936	T	6	6	28308	28313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018936	CGT	2	6	28638	28643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_018936	GAG	2	6	28652	28657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018936	T	6	6	28746	28751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018936	CTC	2	6	28817	28822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_018936	CGC	2	6	28983	28988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_018936	TAT	2	6	28989	28994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018936	ATT	2	6	29099	29104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018936	GGA	2	6	29107	29112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018936	GCGT	2	8	29166	29173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_018936	TCC	2	6	29190	29195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_018936	TCG	2	6	29230	29235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_018936	GTT	2	6	29294	29299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018936	CGG	2	6	29347	29352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018936	TGT	2	6	29424	29429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018936	GGT	2	6	29504	29509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018936	GGT	2	6	29539	29544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018936	AT	4	8	29563	29570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018936	TAAA	2	8	29689	29696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018936	AGA	2	6	29703	29708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018936	T	7	7	29720	29726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018936	ATT	2	6	29768	29773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018936	ACT	2	6	29801	29806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018936	GTT	2	6	29846	29851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_018936	AGT	2	6	29875	29880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018936	TTCTT	2	10	29907	29916	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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