MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 33384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018683	AGC	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018683	AAC	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690005
3	NC_018683	C	6	6	90	95	0 %	0 %	0 %	100 %	407690005
4	NC_018683	CG	3	6	99	104	0 %	0 %	50 %	50 %	407690005
5	NC_018683	CTG	2	6	145	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690005
6	NC_018683	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690005
7	NC_018683	CGGC	2	8	219	226	0 %	0 %	50 %	50 %	407690005
8	NC_018683	GAA	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690005
9	NC_018683	CCG	2	6	303	308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690005
10	NC_018683	GGC	2	6	355	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690005
11	NC_018683	TC	3	6	451	456	0 %	50 %	0 %	50 %	407690005
12	NC_018683	CGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690005
13	NC_018683	TCCCG	2	10	534	543	0 %	20 %	20 %	60 %	407690005
14	NC_018683	CAT	2	6	552	557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690005
15	NC_018683	GCG	2	6	642	647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690005
16	NC_018683	CAG	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690005
17	NC_018683	TCG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690005
18	NC_018683	CCG	2	6	770	775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690005
19	NC_018683	TCA	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690005
20	NC_018683	CCG	2	6	884	889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690005
21	NC_018683	ATC	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690005
22	NC_018683	TGA	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690005
23	NC_018683	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690005
24	NC_018683	TCA	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690005
25	NC_018683	TGC	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690005
26	NC_018683	GA	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	407690005
27	NC_018683	TCT	2	6	1271	1276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690006
28	NC_018683	CGTC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	25 %	50 %	407690006
29	NC_018683	TGG	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690006
30	NC_018683	TCG	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690006
31	NC_018683	GATC	2	8	1361	1368	25 %	25 %	25 %	25 %	407690006
32	NC_018683	GCCGGC	2	12	1531	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	407690006
33	NC_018683	CTC	2	6	1557	1562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690006
34	NC_018683	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690006
35	NC_018683	AGG	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690006
36	NC_018683	CGC	2	6	1704	1709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690006
37	NC_018683	GCA	2	6	1773	1778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690006
38	NC_018683	CG	3	6	1783	1788	0 %	0 %	50 %	50 %	407690006
39	NC_018683	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690006
40	NC_018683	GATCT	2	10	2004	2013	20 %	40 %	20 %	20 %	407690006
41	NC_018683	CAA	2	6	2072	2077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690006
42	NC_018683	GCT	2	6	2296	2301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018683	GAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690007
44	NC_018683	GCG	2	6	2362	2367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690007
45	NC_018683	GTCG	2	8	2428	2435	0 %	25 %	50 %	25 %	407690007
46	NC_018683	TCGC	2	8	2452	2459	0 %	25 %	25 %	50 %	407690007
47	NC_018683	GA	3	6	2553	2558	50 %	0 %	50 %	0 %	407690007
48	NC_018683	GTC	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690007
49	NC_018683	GCC	2	6	2642	2647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690007
50	NC_018683	TCG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690007
51	NC_018683	TCGC	2	8	2667	2674	0 %	25 %	25 %	50 %	407690007
52	NC_018683	TCGC	2	8	2747	2754	0 %	25 %	25 %	50 %	407690007
53	NC_018683	GATCG	2	10	2810	2819	20 %	20 %	40 %	20 %	407690007
54	NC_018683	GTG	2	6	2882	2887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690007
55	NC_018683	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690007
56	NC_018683	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407690007
57	NC_018683	GGCCA	2	10	3158	3167	20 %	0 %	40 %	40 %	407690007
58	NC_018683	CGGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	60 %	20 %	407690007
59	NC_018683	AGG	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407690007
60	NC_018683	AGGGC	2	10	3398	3407	20 %	0 %	60 %	20 %	407690007
61	NC_018683	CTG	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690007
62	NC_018683	G	6	6	3522	3527	0 %	0 %	100 %	0 %	407690007
63	NC_018683	TGT	2	6	3528	3533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690007
64	NC_018683	TCG	2	6	3668	3673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018683	CCT	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018683	CGG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018683	CGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_018683	AC	3	6	3788	3793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018683	GTC	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018683	TGA	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690008
71	NC_018683	AGA	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690008
72	NC_018683	CGA	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690008
73	NC_018683	CGC	2	6	3942	3947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690008
74	NC_018683	AGC	2	6	3978	3983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690008
75	NC_018683	CGC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690008
76	NC_018683	GGC	2	6	4106	4111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690008
77	NC_018683	T	6	6	4112	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	407690008
78	NC_018683	AGG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018683	GTT	2	6	4319	4324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407690009
80	NC_018683	GGCC	2	8	4372	4379	0 %	0 %	50 %	50 %	407690009
81	NC_018683	TGC	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690009
82	NC_018683	GCC	2	6	4420	4425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018683	CGG	2	6	4547	4552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690010
84	NC_018683	CGG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690010
85	NC_018683	GCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690010
86	NC_018683	CGG	2	6	4757	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690010
87	NC_018683	AAT	2	6	4784	4789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407690010
88	NC_018683	GCT	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690010
89	NC_018683	GCCT	2	8	4927	4934	0 %	25 %	25 %	50 %	407690010
90	NC_018683	GT	3	6	4957	4962	0 %	50 %	50 %	0 %	407690010
91	NC_018683	AGA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690010
92	NC_018683	CCG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690010
93	NC_018683	GCCG	2	8	5132	5139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018683	TTA	2	6	5206	5211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018683	CT	3	6	5244	5249	0 %	50 %	0 %	50 %	407690011
96	NC_018683	CT	3	6	5253	5258	0 %	50 %	0 %	50 %	407690011
97	NC_018683	G	6	6	5276	5281	0 %	0 %	100 %	0 %	407690011
98	NC_018683	GAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690011
99	NC_018683	TCC	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690011
100	NC_018683	GC	3	6	5515	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	407690011
101	NC_018683	GAA	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690011
102	NC_018683	GCGG	2	8	5617	5624	0 %	0 %	75 %	25 %	407690011
103	NC_018683	AGC	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690011
104	NC_018683	CGG	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
105	NC_018683	TCC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690011
106	NC_018683	CGA	2	6	5713	5718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690011
107	NC_018683	CGA	2	6	5721	5726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690011
108	NC_018683	CTT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690011
109	NC_018683	GAA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690011
110	NC_018683	TCGG	2	8	5852	5859	0 %	25 %	50 %	25 %	407690011
111	NC_018683	CGG	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
112	NC_018683	GGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
113	NC_018683	GCG	2	6	5921	5926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
114	NC_018683	CAA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407690011
115	NC_018683	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690011
116	NC_018683	CCG	2	6	5955	5960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690011
117	NC_018683	GAA	2	6	6086	6091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407690011
118	NC_018683	GC	3	6	6127	6132	0 %	0 %	50 %	50 %	407690011
119	NC_018683	TGC	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690011
120	NC_018683	GCCG	2	8	6221	6228	0 %	0 %	50 %	50 %	407690011
121	NC_018683	CGG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
122	NC_018683	CCCG	2	8	6269	6276	0 %	0 %	25 %	75 %	407690011
123	NC_018683	GGGC	2	8	6345	6352	0 %	0 %	75 %	25 %	407690011
124	NC_018683	TCT	2	6	6361	6366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690011
125	NC_018683	TC	3	6	6426	6431	0 %	50 %	0 %	50 %	407690011
126	NC_018683	GCG	2	6	6462	6467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
127	NC_018683	GGC	2	6	6526	6531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
128	NC_018683	CG	3	6	6551	6556	0 %	0 %	50 %	50 %	407690011
129	NC_018683	GCG	2	6	6588	6593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
130	NC_018683	TGC	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690011
131	NC_018683	GC	3	6	6604	6609	0 %	0 %	50 %	50 %	407690011
132	NC_018683	CGG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690011
133	NC_018683	GCT	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690011
134	NC_018683	CGA	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690011
135	NC_018683	ACCA	2	8	6671	6678	50 %	0 %	0 %	50 %	407690011
136	NC_018683	GCT	2	6	6715	6720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690011
137	NC_018683	TCG	3	9	6738	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690011
138	NC_018683	ACG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690011
139	NC_018683	TGA	2	6	6885	6890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690012
140	NC_018683	CAC	2	6	6966	6971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018683	GCC	2	6	7010	7015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018683	GGT	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690013
143	NC_018683	CGG	2	6	7102	7107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407690013
144	NC_018683	GCT	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690013
145	NC_018683	CG	3	6	7201	7206	0 %	0 %	50 %	50 %	407690013
146	NC_018683	CCG	2	6	7284	7289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690013
147	NC_018683	CAG	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690013
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149	NC_018683	ACG	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690013
150	NC_018683	TCG	2	6	7416	7421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690013
151	NC_018683	CAG	3	9	7544	7552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690013
152	NC_018683	GCCG	2	8	7562	7569	0 %	0 %	50 %	50 %	407690013
153	NC_018683	CAT	2	6	7646	7651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407690013
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155	NC_018683	GAGG	2	8	7697	7704	25 %	0 %	75 %	0 %	407690013
156	NC_018683	CGA	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690013
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159	NC_018683	AT	3	6	8014	8019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018683	T	6	6	8022	8027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018683	ACT	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_018683	T	6	6	8055	8060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018683	CCA	2	6	8124	8129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690014
164	NC_018683	ACG	3	9	8241	8249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690014
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167	NC_018683	GCC	2	6	8283	8288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690014
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169	NC_018683	GCTTG	2	10	8340	8349	0 %	40 %	40 %	20 %	407690014
170	NC_018683	GCA	2	6	8410	8415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407690014
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173	NC_018683	AAT	2	6	8647	8652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018683	GTGCG	2	10	8794	8803	0 %	20 %	60 %	20 %	407690015
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178	NC_018683	GCGATC	2	12	8909	8920	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407690015
179	NC_018683	CTT	2	6	8922	8927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690015
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182	NC_018683	CCT	2	6	9201	9206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407690015
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189	NC_018683	GA	3	6	9533	9538	50 %	0 %	50 %	0 %	407690015
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201	NC_018683	TGA	2	6	10182	10187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_018683	TGA	2	6	11421	11426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407690018
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247	NC_018683	GC	3	6	12219	12224	0 %	0 %	50 %	50 %	407690018
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255	NC_018683	TC	3	6	12718	12723	0 %	50 %	0 %	50 %	407690018
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262	NC_018683	CAC	2	6	12964	12969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407690018
263	NC_018683	TGG	2	6	13002	13007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407690018
264	NC_018683	GCT	2	6	13018	13023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407690018
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266	NC_018683	GGCG	2	8	13078	13085	0 %	0 %	75 %	25 %	407690018
267	NC_018683	ACGA	2	8	13127	13134	50 %	0 %	25 %	25 %	407690018
268	NC_018683	CTT	2	6	13135	13140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407690018
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296	NC_018683	CGG	2	6	14746	14751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_018683	CG	3	6	14769	14774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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396	NC_018683	GCGA	2	8	18888	18895	25 %	0 %	50 %	25 %	407690023
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432	NC_018683	CCG	2	6	20079	20084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407690024
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500	NC_018683	AGC	2	6	22908	22913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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