MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA

Total Repeats: 33384

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_018683	CATC	2	8	1360201	1360208	25 %	25 %	0 %	50 %	407691388
29003	NC_018683	CGA	2	6	1360234	1360239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691388
29004	NC_018683	AGC	2	6	1360259	1360264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691388
29005	NC_018683	AAGC	2	8	1360385	1360392	50 %	0 %	25 %	25 %	407691388
29006	NC_018683	GGC	2	6	1360409	1360414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691388
29007	NC_018683	AAG	2	6	1360415	1360420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691388
29008	NC_018683	ATC	2	6	1360421	1360426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691388
29009	NC_018683	CGGC	2	8	1360457	1360464	0 %	0 %	50 %	50 %	407691388
29010	NC_018683	GT	3	6	1360596	1360601	0 %	50 %	50 %	0 %	407691389
29011	NC_018683	GCAA	2	8	1360694	1360701	50 %	0 %	25 %	25 %	407691389
29012	NC_018683	TGC	2	6	1360727	1360732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691389
29013	NC_018683	CAC	2	6	1360762	1360767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691389
29014	NC_018683	CAA	2	6	1360801	1360806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691389
29015	NC_018683	GTG	2	6	1360833	1360838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691389
29016	NC_018683	TCG	2	6	1360949	1360954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691389
29017	NC_018683	AGG	2	6	1360955	1360960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407691389
29018	NC_018683	GC	3	6	1360970	1360975	0 %	0 %	50 %	50 %	407691389
29019	NC_018683	CAG	2	6	1360989	1360994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691389
29020	NC_018683	AT	3	6	1361155	1361160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29021	NC_018683	ACC	2	6	1361218	1361223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691390
29022	NC_018683	GCC	3	9	1361239	1361247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691390
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29024	NC_018683	CGC	2	6	1361271	1361276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691390
29025	NC_018683	CTGG	2	8	1361345	1361352	0 %	25 %	50 %	25 %	407691390
29026	NC_018683	CTCG	2	8	1361418	1361425	0 %	25 %	25 %	50 %	407691390
29027	NC_018683	GAC	2	6	1361428	1361433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691390
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29029	NC_018683	TCG	2	6	1361483	1361488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691390
29030	NC_018683	TCA	2	6	1361510	1361515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691390
29031	NC_018683	CT	3	6	1361564	1361569	0 %	50 %	0 %	50 %	407691390
29032	NC_018683	ACG	2	6	1361587	1361592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691390
29033	NC_018683	GCC	2	6	1361959	1361964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691390
29034	NC_018683	CGAG	2	8	1362067	1362074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29035	NC_018683	ACC	2	6	1362132	1362137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29036	NC_018683	AATT	2	8	1362157	1362164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29037	NC_018683	GGA	2	6	1362168	1362173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29038	NC_018683	ATG	2	6	1362196	1362201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691391
29039	NC_018683	GCG	2	6	1362268	1362273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691391
29040	NC_018683	GTT	2	6	1362291	1362296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691391
29041	NC_018683	GC	3	6	1362300	1362305	0 %	0 %	50 %	50 %	407691391
29042	NC_018683	CGA	2	6	1362459	1362464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691391
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29045	NC_018683	TCG	2	6	1362650	1362655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691391
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29047	NC_018683	CT	3	6	1362748	1362753	0 %	50 %	0 %	50 %	407691391
29048	NC_018683	ATA	2	6	1362754	1362759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691391
29049	NC_018683	ATG	2	6	1362774	1362779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691391
29050	NC_018683	GCT	2	6	1362863	1362868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691391
29051	NC_018683	ATC	2	6	1363120	1363125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691391
29052	NC_018683	ATC	2	6	1363129	1363134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691391
29053	NC_018683	G	6	6	1363178	1363183	0 %	0 %	100 %	0 %	407691391
29054	NC_018683	TCC	2	6	1363243	1363248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407691391
29055	NC_018683	CCGTC	2	10	1363267	1363276	0 %	20 %	20 %	60 %	407691391
29056	NC_018683	CT	3	6	1363365	1363370	0 %	50 %	0 %	50 %	407691391
29057	NC_018683	ACTC	2	8	1363408	1363415	25 %	25 %	0 %	50 %	407691391
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29060	NC_018683	GGT	2	6	1363622	1363627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691391
29061	NC_018683	TTC	2	6	1363676	1363681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691391
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29065	NC_018683	GAG	2	6	1363822	1363827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29066	NC_018683	CTG	2	6	1363837	1363842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29067	NC_018683	GC	3	6	1363925	1363930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29068	NC_018683	GTC	2	6	1364064	1364069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29069	NC_018683	CGG	2	6	1364075	1364080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29070	NC_018683	TCAG	2	8	1364179	1364186	25 %	25 %	25 %	25 %	407691392
29071	NC_018683	GCAC	2	8	1364200	1364207	25 %	0 %	25 %	50 %	407691392
29072	NC_018683	CGG	2	6	1364229	1364234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691392
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29089	NC_018683	GCG	2	6	1364965	1364970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691392
29090	NC_018683	CGA	2	6	1364999	1365004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691392
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29092	NC_018683	CTT	2	6	1365211	1365216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691393
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29097	NC_018683	ATCG	2	8	1365433	1365440	25 %	25 %	25 %	25 %	407691393
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29100	NC_018683	ATC	2	6	1365511	1365516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691393
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29102	NC_018683	CGGG	2	8	1365605	1365612	0 %	0 %	75 %	25 %	407691393
29103	NC_018683	CGGC	2	8	1365656	1365663	0 %	0 %	50 %	50 %	407691393
29104	NC_018683	TGA	2	6	1365671	1365676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691393
29105	NC_018683	GC	3	6	1365715	1365720	0 %	0 %	50 %	50 %	407691393
29106	NC_018683	GAG	2	6	1365733	1365738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407691393
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29108	NC_018683	AGC	3	9	1365794	1365802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691393
29109	NC_018683	CCGGG	2	10	1365836	1365845	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29110	NC_018683	TCG	2	6	1365861	1365866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29111	NC_018683	CCG	2	6	1365875	1365880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29112	NC_018683	GAA	2	6	1365889	1365894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29113	NC_018683	CGA	3	9	1365895	1365903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29114	NC_018683	TTC	2	6	1365971	1365976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29115	NC_018683	GCG	2	6	1366022	1366027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29116	NC_018683	TGG	2	6	1366052	1366057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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29118	NC_018683	TGC	2	6	1366166	1366171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691394
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29237	NC_018683	T	6	6	1371642	1371647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29238	NC_018683	CAT	2	6	1371669	1371674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29475	NC_018683	GCT	2	6	1382628	1382633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29476	NC_018683	GAA	2	6	1382634	1382639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691411
29477	NC_018683	CTG	2	6	1382641	1382646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29478	NC_018683	CTT	2	6	1382686	1382691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691411
29479	NC_018683	GAT	2	6	1382728	1382733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691411
29480	NC_018683	CGC	2	6	1382734	1382739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691411
29481	NC_018683	CGC	2	6	1382842	1382847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691411
29482	NC_018683	CGAC	2	8	1382874	1382881	25 %	0 %	25 %	50 %	407691411
29483	NC_018683	CGT	2	6	1382904	1382909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29484	NC_018683	GCA	2	6	1382923	1382928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691411
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29486	NC_018683	AGC	2	6	1383032	1383037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29487	NC_018683	CG	3	6	1383038	1383043	0 %	0 %	50 %	50 %	407691411
29488	NC_018683	CCG	2	6	1383065	1383070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691411
29489	NC_018683	GCCG	3	12	1383067	1383078	0 %	0 %	50 %	50 %	407691411
29490	NC_018683	TCC	2	6	1383227	1383232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407691411
29491	NC_018683	GCC	2	6	1383283	1383288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691411
29492	NC_018683	TTG	2	6	1383302	1383307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691411
29493	NC_018683	GCG	2	6	1383315	1383320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691411
29494	NC_018683	AGC	2	6	1383329	1383334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29495	NC_018683	TGA	2	6	1383369	1383374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691411
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29497	NC_018683	CAT	2	6	1383523	1383528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691411
29498	NC_018683	GCCGA	2	10	1383530	1383539	20 %	0 %	40 %	40 %	407691411
29499	NC_018683	GTC	2	6	1383599	1383604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691411
29500	NC_018683	GGT	2	6	1383669	1383674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691412

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