MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018682	CGG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018682	GCC	2	6	44	49	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018682	GCA	2	6	113	118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
4	NC_018682	GCA	2	6	156	161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
5	NC_018682	ACGA	2	8	217	224	50 %	0 %	25 %	25 %	407689767
6	NC_018682	CAG	2	6	297	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
7	NC_018682	AAC	2	6	310	315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
8	NC_018682	TCC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689767
9	NC_018682	CGT	2	6	406	411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
10	NC_018682	GGC	2	6	454	459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689767
11	NC_018682	ACC	3	9	469	477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689767
12	NC_018682	CTGGAC	2	12	529	540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407689767
13	NC_018682	TGC	2	6	612	617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
14	NC_018682	ACG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
15	NC_018682	CGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689767
16	NC_018682	TCT	2	6	773	778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689767
17	NC_018682	ACG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689767
18	NC_018682	CCG	2	6	844	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689767
19	NC_018682	CAA	2	6	887	892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689767
20	NC_018682	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407689767
21	NC_018682	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
22	NC_018682	ATG	2	6	1046	1051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689767
23	NC_018682	ATTT	2	8	1085	1092	25 %	75 %	0 %	0 %	407689767
24	NC_018682	TTG	2	6	1105	1110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689767
25	NC_018682	CGAT	2	8	1159	1166	25 %	25 %	25 %	25 %	407689767
26	NC_018682	TCA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689767
27	NC_018682	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689768
28	NC_018682	AGC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
29	NC_018682	CCT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407689768
30	NC_018682	CGAT	2	8	1435	1442	25 %	25 %	25 %	25 %	407689768
31	NC_018682	CCCCT	2	10	1529	1538	0 %	20 %	0 %	80 %	407689768
32	NC_018682	GACAG	2	10	1563	1572	40 %	0 %	40 %	20 %	407689768
33	NC_018682	CGAT	2	8	1590	1597	25 %	25 %	25 %	25 %	407689768
34	NC_018682	GCT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
35	NC_018682	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
36	NC_018682	TCG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689768
37	NC_018682	CG	3	6	1809	1814	0 %	0 %	50 %	50 %	407689768
38	NC_018682	CCGA	2	8	1926	1933	25 %	0 %	25 %	50 %	407689768
39	NC_018682	TAGG	2	8	1966	1973	25 %	25 %	50 %	0 %	407689768
40	NC_018682	GCA	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689768
41	NC_018682	A	6	6	2121	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	407689768
42	NC_018682	GAA	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018682	C	6	6	2368	2373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_018682	CGT	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018682	CT	4	8	2395	2402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018682	TGAAGG	2	12	2491	2502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018682	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
48	NC_018682	GCG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689769
49	NC_018682	CGA	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
50	NC_018682	CGA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
51	NC_018682	GCTTG	2	10	2655	2664	0 %	40 %	40 %	20 %	407689769
52	NC_018682	GCTCA	2	10	2734	2743	20 %	20 %	20 %	40 %	407689769
53	NC_018682	TCG	2	6	2825	2830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
54	NC_018682	GAA	2	6	2950	2955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
55	NC_018682	GCA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
56	NC_018682	TCA	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
57	NC_018682	CCG	2	6	3056	3061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
58	NC_018682	GAA	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689769
59	NC_018682	ACA	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
60	NC_018682	GGA	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
61	NC_018682	ATC	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689769
62	NC_018682	ACA	2	6	3219	3224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689769
63	NC_018682	TGC	2	6	3249	3254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
64	NC_018682	GAT	3	9	3346	3354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
65	NC_018682	CGAA	2	8	3355	3362	50 %	0 %	25 %	25 %	407689769
66	NC_018682	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689769
67	NC_018682	ATG	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689769
68	NC_018682	GTC	3	9	3478	3486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689769
69	NC_018682	AGG	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
70	NC_018682	CGC	2	6	3552	3557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689769
71	NC_018682	GGA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689769
72	NC_018682	CGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689769
73	NC_018682	GGT	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018682	GCG	4	12	3763	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018682	CGG	3	9	3891	3899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018682	AAT	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018682	GCG	2	6	3971	3976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018682	GCG	2	6	3984	3989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018682	CGAT	2	8	4133	4140	25 %	25 %	25 %	25 %	407689770
80	NC_018682	GTTC	2	8	4149	4156	0 %	50 %	25 %	25 %	407689770
81	NC_018682	TGC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689770
82	NC_018682	CAG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689770
83	NC_018682	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689770
84	NC_018682	ACG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018682	CCA	2	6	4378	4383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018682	CTC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018682	CGC	2	6	4558	4563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_018682	AG	4	8	4590	4597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018682	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018682	GAA	2	6	4688	4693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018682	TTC	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018682	GTT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018682	GCC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_018682	CTG	2	6	4832	4837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018682	AAC	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018682	CCG	2	6	4981	4986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018682	ACCA	2	8	5048	5055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018682	GGC	2	6	5076	5081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018682	TCG	4	12	5099	5110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
100	NC_018682	GTC	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
101	NC_018682	AGGGG	2	10	5150	5159	20 %	0 %	80 %	0 %	407689771
102	NC_018682	ACGG	2	8	5184	5191	25 %	0 %	50 %	25 %	407689771
103	NC_018682	TCG	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689771
104	NC_018682	GCC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
105	NC_018682	GCC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
106	NC_018682	TGCT	2	8	5284	5291	0 %	50 %	25 %	25 %	407689771
107	NC_018682	GC	3	6	5336	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	407689771
108	NC_018682	AGG	2	6	5402	5407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689771
109	NC_018682	GCC	3	9	5411	5419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
110	NC_018682	TGCG	2	8	5433	5440	0 %	25 %	50 %	25 %	407689771
111	NC_018682	CAG	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689771
112	NC_018682	GC	3	6	5467	5472	0 %	0 %	50 %	50 %	407689771
113	NC_018682	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689771
114	NC_018682	G	6	6	5532	5537	0 %	0 %	100 %	0 %	407689771
115	NC_018682	ACCT	2	8	5585	5592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018682	CGC	2	6	5619	5624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_018682	GAGGG	2	10	5778	5787	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018682	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018682	AAG	2	6	5936	5941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018682	GCG	2	6	5976	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
121	NC_018682	TCG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
122	NC_018682	CGGA	2	8	6019	6026	25 %	0 %	50 %	25 %	407689772
123	NC_018682	GCC	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
124	NC_018682	GATCGG	2	12	6107	6118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407689772
125	NC_018682	CGC	2	6	6129	6134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
126	NC_018682	TCA	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689772
127	NC_018682	GCG	2	6	6165	6170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689772
128	NC_018682	CGA	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689772
129	NC_018682	TCG	2	6	6358	6363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
130	NC_018682	GTC	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689772
131	NC_018682	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	407689772
132	NC_018682	CGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689772
133	NC_018682	CT	3	6	6500	6505	0 %	50 %	0 %	50 %	407689772
134	NC_018682	ATCG	2	8	6565	6572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018682	GATC	2	8	6580	6587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018682	ATCG	2	8	6654	6661	25 %	25 %	25 %	25 %	407689773
137	NC_018682	ACG	2	6	6671	6676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
138	NC_018682	AGC	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689773
139	NC_018682	GC	3	6	6728	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	407689773
140	NC_018682	CGG	2	6	6774	6779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689773
141	NC_018682	GTC	2	6	6814	6819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689773
142	NC_018682	CG	3	6	7045	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018682	AGC	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018682	GCC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_018682	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018682	TAA	2	6	7433	7438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018682	ACCT	2	8	7498	7505	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018682	TCGG	2	8	7564	7571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018682	CAT	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689774
150	NC_018682	GTT	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689774
151	NC_018682	GAT	2	6	7731	7736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689774
152	NC_018682	TGAT	2	8	7819	7826	25 %	50 %	25 %	0 %	407689774
153	NC_018682	TCG	3	9	7937	7945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
154	NC_018682	TCG	2	6	7982	7987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
155	NC_018682	TTCAA	2	10	8012	8021	40 %	40 %	0 %	20 %	407689774
156	NC_018682	GTC	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689774
157	NC_018682	T	6	6	8159	8164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018682	GCC	2	6	8210	8215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_018682	GAT	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018682	GAT	2	6	8252	8257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018682	GAT	2	6	8288	8293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018682	TGT	2	6	8294	8299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018682	TTCA	2	8	8303	8310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_018682	CGC	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689775
165	NC_018682	CAG	2	6	8509	8514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
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170	NC_018682	AGC	2	6	8786	8791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
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172	NC_018682	TCT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689775
173	NC_018682	TGG	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689775
174	NC_018682	AGC	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689775
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179	NC_018682	TTG	2	6	9254	9259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689776
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258	NC_018682	GGA	2	6	14025	14030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689778
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262	NC_018682	GCC	2	6	14180	14185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689778
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266	NC_018682	T	6	6	14313	14318	0 %	100 %	0 %	0 %	407689778
267	NC_018682	TC	3	6	14373	14378	0 %	50 %	0 %	50 %	407689778
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269	NC_018682	GCT	2	6	14506	14511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689778
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273	NC_018682	GGA	2	6	14718	14723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407689778
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282	NC_018682	TGG	2	6	15270	15275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689778
283	NC_018682	TGCA	2	8	15294	15301	25 %	25 %	25 %	25 %	407689778
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289	NC_018682	CG	3	6	15656	15661	0 %	0 %	50 %	50 %	407689779
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363	NC_018682	AG	3	6	19074	19079	50 %	0 %	50 %	0 %	407689782
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380	NC_018682	GGAG	2	8	19999	20006	25 %	0 %	75 %	0 %	407689783
381	NC_018682	TTGTAG	2	12	20075	20086	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	407689783
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384	NC_018682	A	6	6	20264	20269	100 %	0 %	0 %	0 %	407689783
385	NC_018682	AAG	2	6	20278	20283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689783
386	NC_018682	CCA	2	6	20365	20370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407689784
387	NC_018682	GGCG	2	8	20457	20464	0 %	0 %	75 %	25 %	407689784
388	NC_018682	GCC	2	6	20494	20499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689784
389	NC_018682	ATCG	2	8	20523	20530	25 %	25 %	25 %	25 %	407689784
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391	NC_018682	GAC	2	6	20700	20705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689784
392	NC_018682	CG	3	6	20730	20735	0 %	0 %	50 %	50 %	407689784
393	NC_018682	AC	3	6	20741	20746	50 %	0 %	0 %	50 %	407689784
394	NC_018682	CGA	2	6	20786	20791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689784
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396	NC_018682	GCA	2	6	20978	20983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689784
397	NC_018682	CGC	2	6	20990	20995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689784
398	NC_018682	G	6	6	21020	21025	0 %	0 %	100 %	0 %	407689784
399	NC_018682	CTT	2	6	21072	21077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689784
400	NC_018682	CGG	2	6	21078	21083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689784
401	NC_018682	CAG	2	6	21126	21131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689784
402	NC_018682	TG	3	6	21137	21142	0 %	50 %	50 %	0 %	407689784
403	NC_018682	GGT	2	6	21171	21176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689784
404	NC_018682	GCA	2	6	21185	21190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689784
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423	NC_018682	GCTT	2	8	22129	22136	0 %	50 %	25 %	25 %	407689785
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429	NC_018682	TTC	2	6	22407	22412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689785
430	NC_018682	CGT	2	6	22456	22461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689785
431	NC_018682	CGT	2	6	22738	22743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689785
432	NC_018682	TCT	2	6	22856	22861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689786
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434	NC_018682	GC	3	6	23063	23068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
435	NC_018682	CAT	2	6	23160	23165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689787
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442	NC_018682	GTCGCG	2	12	23807	23818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407689787
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453	NC_018682	GTT	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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