MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pRM41A

Total Repeats: 4942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018682	CGT	2	6	52580	52585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1002	NC_018682	ACG	2	6	52687	52692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1003	NC_018682	GCCG	2	8	52701	52708	0 %	0 %	50 %	50 %	407689818
1004	NC_018682	CGC	2	6	52723	52728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689818
1005	NC_018682	CTCA	2	8	52740	52747	25 %	25 %	0 %	50 %	407689818
1006	NC_018682	GAT	2	6	52749	52754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689818
1007	NC_018682	AAGC	2	8	52791	52798	50 %	0 %	25 %	25 %	407689818
1008	NC_018682	GAC	3	9	52818	52826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1009	NC_018682	TCT	2	6	52850	52855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689818
1010	NC_018682	CGA	2	6	52886	52891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1011	NC_018682	GC	3	6	52938	52943	0 %	0 %	50 %	50 %	407689818
1012	NC_018682	AGT	2	6	53048	53053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689818
1013	NC_018682	CGC	2	6	53096	53101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689818
1014	NC_018682	GCC	2	6	53118	53123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689818
1015	NC_018682	CGA	2	6	53129	53134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1016	NC_018682	GCCG	2	8	53178	53185	0 %	0 %	50 %	50 %	407689818
1017	NC_018682	CCGC	2	8	53190	53197	0 %	0 %	25 %	75 %	407689818
1018	NC_018682	CAG	2	6	53247	53252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689818
1019	NC_018682	GCCG	2	8	53256	53263	0 %	0 %	50 %	50 %	407689818
1020	NC_018682	AAGC	2	8	53313	53320	50 %	0 %	25 %	25 %	407689818
1021	NC_018682	TCC	2	6	53335	53340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_018682	A	6	6	53385	53390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018682	CTT	2	6	53404	53409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_018682	CTC	2	6	53424	53429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_018682	TCG	2	6	53436	53441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_018682	TGT	2	6	53460	53465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018682	AAC	2	6	53486	53491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_018682	AAAT	2	8	53572	53579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018682	GAG	2	6	53600	53605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018682	TGC	2	6	53611	53616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018682	CGC	2	6	53716	53721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_018682	GGC	2	6	53726	53731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_018682	CTT	2	6	53777	53782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689819
1034	NC_018682	CAG	2	6	53837	53842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1035	NC_018682	TCA	2	6	53847	53852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689819
1036	NC_018682	ATG	2	6	53910	53915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689819
1037	NC_018682	GCA	2	6	53928	53933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1038	NC_018682	GCG	2	6	53939	53944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689819
1039	NC_018682	GAA	2	6	53945	53950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689819
1040	NC_018682	GCC	2	6	53992	53997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689819
1041	NC_018682	GAAG	2	8	54115	54122	50 %	0 %	50 %	0 %	407689819
1042	NC_018682	GAC	2	6	54136	54141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1043	NC_018682	CGA	2	6	54157	54162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1044	NC_018682	TCG	2	6	54174	54179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1045	NC_018682	AGC	2	6	54188	54193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1046	NC_018682	GGCAAG	2	12	54242	54253	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	407689819
1047	NC_018682	AAG	2	6	54314	54319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689819
1048	NC_018682	GAA	2	6	54484	54489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689819
1049	NC_018682	TCG	2	6	54516	54521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1050	NC_018682	GAC	2	6	54527	54532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689819
1051	NC_018682	TCA	2	6	54684	54689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689819
1052	NC_018682	GC	3	6	54735	54740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018682	CGC	2	6	54754	54759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_018682	CGT	2	6	54808	54813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1055	NC_018682	ATC	2	6	54866	54871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689820
1056	NC_018682	TGA	2	6	54900	54905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689820
1057	NC_018682	TCT	2	6	54909	54914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689820
1058	NC_018682	CGAC	2	8	54926	54933	25 %	0 %	25 %	50 %	407689820
1059	NC_018682	ACG	2	6	54954	54959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1060	NC_018682	CAG	2	6	54973	54978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1061	NC_018682	CAT	2	6	55060	55065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689820
1062	NC_018682	TCA	2	6	55095	55100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689820
1063	NC_018682	GAA	2	6	55105	55110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689820
1064	NC_018682	CGA	2	6	55147	55152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1065	NC_018682	GCA	3	9	55195	55203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1066	NC_018682	GCG	2	6	55226	55231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689820
1067	NC_018682	CCG	2	6	55266	55271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689820
1068	NC_018682	CG	3	6	55281	55286	0 %	0 %	50 %	50 %	407689820
1069	NC_018682	GAC	3	9	55438	55446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1070	NC_018682	CGT	2	6	55531	55536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1071	NC_018682	TCG	2	6	55626	55631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1072	NC_018682	GCCG	2	8	55634	55641	0 %	0 %	50 %	50 %	407689820
1073	NC_018682	GAA	2	6	55769	55774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689820
1074	NC_018682	CGG	2	6	55846	55851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689820
1075	NC_018682	TGC	2	6	55854	55859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1076	NC_018682	GGC	2	6	55958	55963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689820
1077	NC_018682	ATC	2	6	55979	55984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689820
1078	NC_018682	GCG	2	6	56080	56085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689820
1079	NC_018682	AAGG	2	8	56096	56103	50 %	0 %	50 %	0 %	407689820
1080	NC_018682	TCG	2	6	56163	56168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1081	NC_018682	GCA	2	6	56204	56209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689820
1082	NC_018682	TCG	2	6	56366	56371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1083	NC_018682	TGG	2	6	56387	56392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689821
1084	NC_018682	ACA	2	6	56429	56434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407689821
1085	NC_018682	CGT	2	6	56439	56444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1086	NC_018682	CG	3	6	56445	56450	0 %	0 %	50 %	50 %	407689821
1087	NC_018682	GGC	2	6	56454	56459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689821
1088	NC_018682	TCG	2	6	56462	56467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1089	NC_018682	TCG	2	6	56501	56506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1090	NC_018682	TCGG	2	8	56521	56528	0 %	25 %	50 %	25 %	407689821
1091	NC_018682	GGC	3	9	56529	56537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689821
1092	NC_018682	TCG	2	6	56552	56557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1093	NC_018682	CTG	3	9	56563	56571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1094	NC_018682	CTT	2	6	56649	56654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689821
1095	NC_018682	TCA	2	6	56729	56734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689821
1096	NC_018682	CGGT	2	8	56891	56898	0 %	25 %	50 %	25 %	407689821
1097	NC_018682	CG	3	6	56932	56937	0 %	0 %	50 %	50 %	407689821
1098	NC_018682	GGCT	2	8	57043	57050	0 %	25 %	50 %	25 %	407689821
1099	NC_018682	CGG	2	6	57078	57083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689821
1100	NC_018682	GCG	2	6	57095	57100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689821
1101	NC_018682	ATC	2	6	57112	57117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689821
1102	NC_018682	CTT	2	6	57169	57174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689821
1103	NC_018682	TCG	2	6	57203	57208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689821
1104	NC_018682	GCG	2	6	57209	57214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689821
1105	NC_018682	CCG	3	9	57246	57254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689821
1106	NC_018682	GTT	2	6	57272	57277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407689822
1107	NC_018682	AG	3	6	57338	57343	50 %	0 %	50 %	0 %	407689822
1108	NC_018682	GTG	2	6	57351	57356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689822
1109	NC_018682	GAT	2	6	57369	57374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689822
1110	NC_018682	AAGG	2	8	57405	57412	50 %	0 %	50 %	0 %	407689822
1111	NC_018682	GGC	3	9	57476	57484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689822
1112	NC_018682	TG	3	6	57534	57539	0 %	50 %	50 %	0 %	407689822
1113	NC_018682	GC	3	6	57578	57583	0 %	0 %	50 %	50 %	407689822
1114	NC_018682	TCG	2	6	57586	57591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689822
1115	NC_018682	ATC	2	6	57627	57632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689822
1116	NC_018682	GCA	4	12	57734	57745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689822
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1118	NC_018682	TGGG	2	8	57772	57779	0 %	25 %	75 %	0 %	407689822
1119	NC_018682	CTG	2	6	58014	58019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689822
1120	NC_018682	GAAG	2	8	58022	58029	50 %	0 %	50 %	0 %	407689822
1121	NC_018682	CGT	2	6	58036	58041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689822
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1123	NC_018682	CGG	2	6	58184	58189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689822
1124	NC_018682	ACT	2	6	58226	58231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689822
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1126	NC_018682	GACG	2	8	58250	58257	25 %	0 %	50 %	25 %	407689822
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1249	NC_018682	GCG	3	9	64478	64486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
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1252	NC_018682	GTC	2	6	64589	64594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689829
1253	NC_018682	CGA	2	6	64600	64605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689829
1254	NC_018682	GGC	2	6	64663	64668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
1255	NC_018682	TTC	2	6	64724	64729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689829
1256	NC_018682	CG	3	6	64742	64747	0 %	0 %	50 %	50 %	407689829
1257	NC_018682	GCTG	2	8	64839	64846	0 %	25 %	50 %	25 %	407689829
1258	NC_018682	GCG	2	6	64850	64855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
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1260	NC_018682	GCAT	2	8	64867	64874	25 %	25 %	25 %	25 %	407689829
1261	NC_018682	CCGT	2	8	64883	64890	0 %	25 %	25 %	50 %	407689829
1262	NC_018682	CGG	2	6	64941	64946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
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1264	NC_018682	CGC	2	6	65038	65043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689829
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1266	NC_018682	GCG	2	6	65071	65076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689829
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1272	NC_018682	AGGAG	2	10	65284	65293	40 %	0 %	60 %	0 %	407689829
1273	NC_018682	TGG	2	6	65316	65321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689829
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1277	NC_018682	GCG	2	6	65412	65417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1278	NC_018682	AGGG	2	8	65420	65427	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_018682	CAAT	2	8	65487	65494	50 %	25 %	0 %	25 %	407689830
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1282	NC_018682	TCG	2	6	65537	65542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689830
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1291	NC_018682	GCC	2	6	65957	65962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689830
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1293	NC_018682	GCA	2	6	66021	66026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689830
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1310	NC_018682	CCACCG	2	12	66866	66877	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	407689831
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1316	NC_018682	GGT	2	6	67318	67323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1317	NC_018682	CA	3	6	67389	67394	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1318	NC_018682	G	6	6	67421	67426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1319	NC_018682	AGG	2	6	67446	67451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1320	NC_018682	GGC	2	6	67458	67463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689832
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1322	NC_018682	TCA	2	6	67541	67546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689832
1323	NC_018682	CTGT	2	8	67585	67592	0 %	50 %	25 %	25 %	407689832
1324	NC_018682	CGG	2	6	67671	67676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689832
1325	NC_018682	GATC	2	8	67677	67684	25 %	25 %	25 %	25 %	407689832
1326	NC_018682	GAT	2	6	67713	67718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689832
1327	NC_018682	TGG	2	6	67742	67747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407689832
1328	NC_018682	GCT	2	6	67779	67784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689832
1329	NC_018682	GCT	2	6	67815	67820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689832
1330	NC_018682	GAT	2	6	67863	67868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689832
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1334	NC_018682	CGG	2	6	67962	67967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689832
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1340	NC_018682	TGTCG	2	10	68130	68139	0 %	40 %	40 %	20 %	407689832
1341	NC_018682	GCTT	2	8	68141	68148	0 %	50 %	25 %	25 %	407689832
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1351	NC_018682	GCGCGG	2	12	68449	68460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1352	NC_018682	AGGG	2	8	68503	68510	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1353	NC_018682	CAGGA	2	10	68524	68533	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1354	NC_018682	CCA	2	6	68536	68541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1355	NC_018682	AAC	2	6	68542	68547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1356	NC_018682	GGA	2	6	68550	68555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1357	NC_018682	ACT	2	6	68576	68581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689833
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1360	NC_018682	CTT	2	6	68675	68680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407689833
1361	NC_018682	GTC	3	9	68736	68744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407689833
1362	NC_018682	GAA	2	6	68750	68755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407689833
1363	NC_018682	GTCA	2	8	68772	68779	25 %	25 %	25 %	25 %	407689833
1364	NC_018682	TGA	2	6	68791	68796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407689833
1365	NC_018682	GCC	5	15	68835	68849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407689833
1366	NC_018682	GC	3	6	68914	68919	0 %	0 %	50 %	50 %	407689833
1367	NC_018682	CAT	2	6	68978	68983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689833
1368	NC_018682	ATC	2	6	69015	69020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689833
1369	NC_018682	ACG	2	6	69036	69041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689833
1370	NC_018682	GC	3	6	69071	69076	0 %	0 %	50 %	50 %	407689833
1371	NC_018682	CGA	2	6	69080	69085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689833
1372	NC_018682	CAG	2	6	69111	69116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407689833
1373	NC_018682	CGG	2	6	69133	69138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689833
1374	NC_018682	ATC	2	6	69192	69197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689833
1375	NC_018682	ATC	2	6	69270	69275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407689833
1376	NC_018682	GGC	2	6	69276	69281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407689833
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