MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae gamPNI0373 chromosome

Total Repeats: 42066

< Previous12...73747576777879808182838485Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42001	NC_018630	A	6	6	2061325	2061330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42002	NC_018630	TAT	2	6	2061354	2061359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42003	NC_018630	CAG	2	6	2061368	2061373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42004	NC_018630	ATT	2	6	2061443	2061448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42005	NC_018630	CTG	2	6	2061500	2061505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477574
42006	NC_018630	CAA	2	6	2061532	2061537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477574
42007	NC_018630	T	6	6	2061603	2061608	0 %	100 %	0 %	0 %	410477574
42008	NC_018630	GAT	2	6	2061612	2061617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477574
42009	NC_018630	AAT	2	6	2061638	2061643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410477574
42010	NC_018630	TCT	2	6	2061678	2061683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477574
42011	NC_018630	TTC	2	6	2061698	2061703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410477574
42012	NC_018630	GAA	2	6	2061707	2061712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477574
42013	NC_018630	T	6	6	2061832	2061837	0 %	100 %	0 %	0 %	410477574
42014	NC_018630	TTTC	2	8	2061919	2061926	0 %	75 %	0 %	25 %	410477574
42015	NC_018630	T	6	6	2061983	2061988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42016	NC_018630	A	6	6	2062008	2062013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42017	NC_018630	A	6	6	2062165	2062170	100 %	0 %	0 %	0 %	410477575
42018	NC_018630	ATT	2	6	2062179	2062184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477575
42019	NC_018630	T	6	6	2062204	2062209	0 %	100 %	0 %	0 %	410477575
42020	NC_018630	AACT	2	8	2062241	2062248	50 %	25 %	0 %	25 %	410477575
42021	NC_018630	A	6	6	2062250	2062255	100 %	0 %	0 %	0 %	410477575
42022	NC_018630	AAC	2	6	2062264	2062269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477575
42023	NC_018630	AAC	2	6	2062273	2062278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477575
42024	NC_018630	CAA	2	6	2062319	2062324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477575
42025	NC_018630	TGT	2	6	2062353	2062358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477575
42026	NC_018630	TTA	2	6	2062364	2062369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477575
42027	NC_018630	ATG	2	6	2062406	2062411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477575
42028	NC_018630	TTAT	2	8	2062457	2062464	25 %	75 %	0 %	0 %	410477575
42029	NC_018630	AAG	2	6	2062478	2062483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477575
42030	NC_018630	CAA	2	6	2062497	2062502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477575
42031	NC_018630	GTC	2	6	2062603	2062608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410477575
42032	NC_018630	ACA	2	6	2062630	2062635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477575
42033	NC_018630	GTATC	2	10	2062736	2062745	20 %	40 %	20 %	20 %	410477575
42034	NC_018630	GGC	2	6	2062843	2062848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410477575
42035	NC_018630	GGA	2	6	2062909	2062914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410477575
42036	NC_018630	ATG	2	6	2062952	2062957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477575
42037	NC_018630	ATT	2	6	2062966	2062971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477575
42038	NC_018630	A	7	7	2062982	2062988	100 %	0 %	0 %	0 %	410477575
42039	NC_018630	AGA	2	6	2063059	2063064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477575
42040	NC_018630	GTTC	2	8	2063101	2063108	0 %	50 %	25 %	25 %	410477575
42041	NC_018630	TGCC	2	8	2063123	2063130	0 %	25 %	25 %	50 %	410477575
42042	NC_018630	TCA	2	6	2063188	2063193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477575
42043	NC_018630	CTA	2	6	2063250	2063255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477575
42044	NC_018630	AGA	2	6	2063268	2063273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477575
42045	NC_018630	AAAG	2	8	2063336	2063343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42046	NC_018630	A	7	7	2063417	2063423	100 %	0 %	0 %	0 %	410477576
42047	NC_018630	ATT	2	6	2063509	2063514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477576
42048	NC_018630	GA	4	8	2063555	2063562	50 %	0 %	50 %	0 %	410477576
42049	NC_018630	TGT	2	6	2063607	2063612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410477576
42050	NC_018630	GAT	2	6	2063634	2063639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477576
42051	NC_018630	GTCCA	2	10	2063641	2063650	20 %	20 %	20 %	40 %	410477576
42052	NC_018630	AG	3	6	2063666	2063671	50 %	0 %	50 %	0 %	410477576
42053	NC_018630	AGA	2	6	2063688	2063693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477576
42054	NC_018630	TC	3	6	2063710	2063715	0 %	50 %	0 %	50 %	410477576
42055	NC_018630	AT	3	6	2063772	2063777	50 %	50 %	0 %	0 %	410477576
42056	NC_018630	AAC	2	6	2063885	2063890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410477576
42057	NC_018630	TTTC	2	8	2063898	2063905	0 %	75 %	0 %	25 %	410477576
42058	NC_018630	AGA	3	9	2063916	2063924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477576
42059	NC_018630	A	6	6	2063962	2063967	100 %	0 %	0 %	0 %	410477576
42060	NC_018630	A	6	6	2063981	2063986	100 %	0 %	0 %	0 %	410477576
42061	NC_018630	GAA	2	6	2064007	2064012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477576
42062	NC_018630	ACT	2	6	2064027	2064032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410477576
42063	NC_018630	A	6	6	2064061	2064066	100 %	0 %	0 %	0 %	410477576
42064	NC_018630	ATT	2	6	2064082	2064087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410477576
42065	NC_018630	AAG	2	6	2064101	2064106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410477576
42066	NC_018630	TAG	2	6	2064111	2064116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410477576

< Previous12...73747576777879808182838485Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.