MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 43315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018594	AGG	2	6	244155	244160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760140
5002	NC_018594	TGG	2	6	244173	244178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760140
5003	NC_018594	ATC	2	6	244202	244207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760140
5004	NC_018594	TGA	2	6	244243	244248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760140
5005	NC_018594	TG	3	6	244276	244281	0 %	50 %	50 %	0 %	405760140
5006	NC_018594	A	6	6	244282	244287	100 %	0 %	0 %	0 %	405760140
5007	NC_018594	GGT	2	6	244326	244331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760141
5008	NC_018594	AGA	2	6	244334	244339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760141
5009	NC_018594	TCA	2	6	244345	244350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760141
5010	NC_018594	ATC	2	6	244366	244371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760141
5011	NC_018594	GGCAAA	2	12	244429	244440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	405760141
5012	NC_018594	GGA	3	9	244496	244504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760141
5013	NC_018594	AAG	2	6	244540	244545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760141
5014	NC_018594	T	6	6	244550	244555	0 %	100 %	0 %	0 %	405760141
5015	NC_018594	GA	3	6	244570	244575	50 %	0 %	50 %	0 %	405760141
5016	NC_018594	TCTT	2	8	244611	244618	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_018594	T	6	6	244634	244639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_018594	TAG	2	6	244683	244688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_018594	ATA	2	6	244695	244700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_018594	A	6	6	244820	244825	100 %	0 %	0 %	0 %	405760142
5021	NC_018594	TGA	2	6	244845	244850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760142
5022	NC_018594	ACC	2	6	244943	244948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	405760142
5023	NC_018594	GCA	2	6	245034	245039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760142
5024	NC_018594	TAC	2	6	245095	245100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760142
5025	NC_018594	ACG	2	6	245104	245109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760142
5026	NC_018594	TTGA	2	8	245125	245132	25 %	50 %	25 %	0 %	405760142
5027	NC_018594	ATG	2	6	245164	245169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760142
5028	NC_018594	AGAA	2	8	245171	245178	75 %	0 %	25 %	0 %	405760142
5029	NC_018594	CAGCC	2	10	245195	245204	20 %	0 %	20 %	60 %	405760142
5030	NC_018594	CTT	3	9	245373	245381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760142
5031	NC_018594	CAGG	2	8	245494	245501	25 %	0 %	50 %	25 %	405760142
5032	NC_018594	CTA	2	6	245623	245628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_018594	CG	4	8	245660	245667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_018594	A	6	6	245681	245686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_018594	ACGA	2	8	245763	245770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_018594	A	6	6	245770	245775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018594	GTA	2	6	245816	245821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_018594	CATC	2	8	245896	245903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_018594	TTG	2	6	245930	245935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_018594	GGTCGC	2	12	246140	246151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_018594	TACCCA	2	12	246313	246324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5042	NC_018594	A	6	6	246437	246442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_018594	A	7	7	246449	246455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_018594	GCA	2	6	246510	246515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_018594	CAT	2	6	246699	246704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_018594	ATC	2	6	246735	246740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_018594	A	6	6	246784	246789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_018594	TGG	2	6	246908	246913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_018594	GTTG	2	8	246953	246960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_018594	TGG	2	6	247004	247009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_018594	TGA	2	6	247013	247018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_018594	AAG	2	6	247039	247044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_018594	AGA	2	6	247116	247121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760143
5054	NC_018594	CGGA	2	8	247171	247178	25 %	0 %	50 %	25 %	405760143
5055	NC_018594	TTG	2	6	247190	247195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760143
5056	NC_018594	GCTC	2	8	247208	247215	0 %	25 %	25 %	50 %	405760143
5057	NC_018594	GAA	2	6	247225	247230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760143
5058	NC_018594	GAA	2	6	247276	247281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760143
5059	NC_018594	GAT	2	6	247339	247344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760143
5060	NC_018594	CT	3	6	247361	247366	0 %	50 %	0 %	50 %	405760143
5061	NC_018594	CTCAGG	2	12	247388	247399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	405760143
5062	NC_018594	TCAG	2	8	247544	247551	25 %	25 %	25 %	25 %	405760143
5063	NC_018594	T	6	6	247650	247655	0 %	100 %	0 %	0 %	405760143
5064	NC_018594	A	6	6	247660	247665	100 %	0 %	0 %	0 %	405760143
5065	NC_018594	AT	3	6	247683	247688	50 %	50 %	0 %	0 %	405760143
5066	NC_018594	AGG	2	6	247750	247755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760143
5067	NC_018594	TAT	2	6	247779	247784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760144
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5069	NC_018594	GGA	2	6	247861	247866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405760144
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5071	NC_018594	AAG	2	6	247974	247979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760144
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5073	NC_018594	AGACA	2	10	248050	248059	60 %	0 %	20 %	20 %	405760144
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5078	NC_018594	ATT	2	6	248469	248474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760144
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5080	NC_018594	TTGT	2	8	248618	248625	0 %	75 %	25 %	0 %	405760144
5081	NC_018594	TCT	2	6	248667	248672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760144
5082	NC_018594	TGA	2	6	248674	248679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760144
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5084	NC_018594	CTT	2	6	248732	248737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760144
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5089	NC_018594	GAA	2	6	248999	249004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760144
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5091	NC_018594	AATCA	2	10	249056	249065	60 %	20 %	0 %	20 %	405760145
5092	NC_018594	GAT	2	6	249120	249125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760145
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5094	NC_018594	GCCT	2	8	249262	249269	0 %	25 %	25 %	50 %	405760145
5095	NC_018594	ACCA	2	8	249450	249457	50 %	0 %	0 %	50 %	405760145
5096	NC_018594	CCAGA	2	10	249609	249618	40 %	0 %	20 %	40 %	405760145
5097	NC_018594	GAT	2	6	249705	249710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760145
5098	NC_018594	AGA	2	6	249716	249721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760145
5099	NC_018594	GTCAT	2	10	249736	249745	20 %	40 %	20 %	20 %	405760145
5100	NC_018594	CAC	2	6	249753	249758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	405760145
5101	NC_018594	GCTT	2	8	249760	249767	0 %	50 %	25 %	25 %	405760145
5102	NC_018594	AGTCC	2	10	249777	249786	20 %	20 %	20 %	40 %	405760145
5103	NC_018594	TAT	2	6	249794	249799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760145
5104	NC_018594	ATG	4	12	249843	249854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760145
5105	NC_018594	TGG	2	6	249871	249876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760145
5106	NC_018594	GA	3	6	249883	249888	50 %	0 %	50 %	0 %	405760145
5107	NC_018594	T	6	6	249968	249973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_018594	TGTT	2	8	249984	249991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_018594	T	7	7	249990	249996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_018594	TAA	2	6	250011	250016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_018594	GTA	2	6	250063	250068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_018594	GTAT	2	8	250079	250086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_018594	AT	3	6	250085	250090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_018594	ACC	2	6	250147	250152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_018594	T	6	6	250182	250187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_018594	GAAAT	2	10	250211	250220	60 %	20 %	20 %	0 %	405760146
5117	NC_018594	AAG	3	9	250222	250230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760146
5118	NC_018594	TAA	2	6	250264	250269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405760146
5119	NC_018594	ACTA	2	8	250279	250286	50 %	25 %	0 %	25 %	405760146
5120	NC_018594	ATC	2	6	250324	250329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405760146
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5122	NC_018594	GGT	2	6	250511	250516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760146
5123	NC_018594	TATC	2	8	250519	250526	25 %	50 %	0 %	25 %	405760146
5124	NC_018594	TAT	2	6	250573	250578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760146
5125	NC_018594	A	6	6	250599	250604	100 %	0 %	0 %	0 %	405760146
5126	NC_018594	GTG	2	6	250752	250757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760146
5127	NC_018594	AGGC	2	8	250797	250804	25 %	0 %	50 %	25 %	405760146
5128	NC_018594	CTT	2	6	250828	250833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760146
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5132	NC_018594	GAAG	2	8	251097	251104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5158	NC_018594	ATA	2	6	252445	252450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5159	NC_018594	AAGG	2	8	252469	252476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5233	NC_018594	TCGCC	2	10	256019	256028	0 %	20 %	20 %	60 %	405760152
5234	NC_018594	GGT	2	6	256064	256069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405760152
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5237	NC_018594	TCTTT	2	10	256199	256208	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5239	NC_018594	TTA	2	6	256234	256239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_018594	GAG	2	6	256247	256252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_018594	CTGA	2	8	256694	256701	25 %	25 %	25 %	25 %	405760153
5247	NC_018594	AGA	2	6	256768	256773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760153
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5249	NC_018594	TCT	2	6	257006	257011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405760153
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5376	NC_018594	TGA	2	6	263423	263428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405760161
5377	NC_018594	TTA	2	6	263447	263452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405760161
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5379	NC_018594	GAA	2	6	263546	263551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760161
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5382	NC_018594	TATT	2	8	263733	263740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_018594	A	7	7	263752	263758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_018594	CGA	2	6	263834	263839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5386	NC_018594	T	6	6	263928	263933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5387	NC_018594	T	6	6	263937	263942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_018594	A	7	7	263986	263992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_018594	CAG	2	6	264100	264105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5393	NC_018594	ATC	2	6	264293	264298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5396	NC_018594	TTGA	2	8	264383	264390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5397	NC_018594	TTG	2	6	264495	264500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405760162
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5497	NC_018594	GAA	2	6	269962	269967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405760163
5498	NC_018594	CA	3	6	269969	269974	50 %	0 %	0 %	50 %	405760163
5499	NC_018594	CGT	2	6	270004	270009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405760163
5500	NC_018594	GAC	2	6	270022	270027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405760163

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