MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_018526	CCA	2	6	1978836	1978841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062584
40002	NC_018526	TGT	2	6	1978870	1978875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062584
40003	NC_018526	TTA	2	6	1978881	1978886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40004	NC_018526	CAA	2	6	1978903	1978908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062584
40005	NC_018526	ATC	2	6	1978939	1978944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062584
40006	NC_018526	A	6	6	1978988	1978993	100 %	0 %	0 %	0 %	403062584
40007	NC_018526	TTA	2	6	1979031	1979036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40008	NC_018526	A	6	6	1979076	1979081	100 %	0 %	0 %	0 %	403062584
40009	NC_018526	TTG	2	6	1979094	1979099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062584
40010	NC_018526	CAG	2	6	1979139	1979144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062584
40011	NC_018526	CTG	2	6	1979154	1979159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062584
40012	NC_018526	TAT	2	6	1979260	1979265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40013	NC_018526	ACAA	2	8	1979308	1979315	75 %	0 %	0 %	25 %	403062584
40014	NC_018526	ATG	2	6	1979487	1979492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062584
40015	NC_018526	TAT	2	6	1979500	1979505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40016	NC_018526	A	6	6	1979517	1979522	100 %	0 %	0 %	0 %	403062584
40017	NC_018526	GAC	2	6	1979569	1979574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062584
40018	NC_018526	GTA	2	6	1979633	1979638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062584
40019	NC_018526	TTA	2	6	1979694	1979699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40020	NC_018526	CT	3	6	1979748	1979753	0 %	50 %	0 %	50 %	403062584
40021	NC_018526	TTA	2	6	1979788	1979793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062584
40022	NC_018526	AAT	2	6	1979798	1979803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062584
40023	NC_018526	AAAC	2	8	1979807	1979814	75 %	0 %	0 %	25 %	403062584
40024	NC_018526	AGA	2	6	1979842	1979847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062584
40025	NC_018526	AAT	2	6	1979856	1979861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062584
40026	NC_018526	T	8	8	1979897	1979904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40027	NC_018526	AT	3	6	1979917	1979922	50 %	50 %	0 %	0 %	403062585
40028	NC_018526	GAA	2	6	1979924	1979929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40029	NC_018526	ATCC	2	8	1979954	1979961	25 %	25 %	0 %	50 %	403062585
40030	NC_018526	TGA	2	6	1979989	1979994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062585
40031	NC_018526	GCTC	2	8	1980010	1980017	0 %	25 %	25 %	50 %	403062585
40032	NC_018526	ATT	2	6	1980050	1980055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062585
40033	NC_018526	TCT	2	6	1980065	1980070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062585
40034	NC_018526	ATT	2	6	1980085	1980090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062585
40035	NC_018526	AAG	2	6	1980100	1980105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40036	NC_018526	GACT	2	8	1980129	1980136	25 %	25 %	25 %	25 %	403062585
40037	NC_018526	CAG	2	6	1980144	1980149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062585
40038	NC_018526	ACTG	2	8	1980160	1980167	25 %	25 %	25 %	25 %	403062585
40039	NC_018526	ATG	2	6	1980168	1980173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062585
40040	NC_018526	AGA	2	6	1980229	1980234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40041	NC_018526	AGC	2	6	1980235	1980240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062585
40042	NC_018526	TAG	2	6	1980259	1980264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062585
40043	NC_018526	ATG	2	6	1980276	1980281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062585
40044	NC_018526	AT	3	6	1980313	1980318	50 %	50 %	0 %	0 %	403062585
40045	NC_018526	CTA	2	6	1980335	1980340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062585
40046	NC_018526	ATC	2	6	1980346	1980351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062585
40047	NC_018526	AGA	2	6	1980370	1980375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40048	NC_018526	CG	3	6	1980397	1980402	0 %	0 %	50 %	50 %	403062585
40049	NC_018526	AGA	2	6	1980421	1980426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40050	NC_018526	AAGC	2	8	1980428	1980435	50 %	0 %	25 %	25 %	403062585
40051	NC_018526	A	6	6	1980509	1980514	100 %	0 %	0 %	0 %	403062585
40052	NC_018526	AAC	2	6	1980528	1980533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062585
40053	NC_018526	AAG	2	6	1980602	1980607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062585
40054	NC_018526	CAA	2	6	1980670	1980675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062585
40055	NC_018526	ATTT	2	8	1980697	1980704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40056	NC_018526	T	6	6	1980839	1980844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.