MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018526	TGG	2	6	169832	169837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060864
3502	NC_018526	CAA	2	6	169854	169859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060864
3503	NC_018526	GTT	2	6	169884	169889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060864
3504	NC_018526	TGA	2	6	170074	170079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060864
3505	NC_018526	A	6	6	170091	170096	100 %	0 %	0 %	0 %	403060864
3506	NC_018526	ATT	2	6	170099	170104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060864
3507	NC_018526	GATTGA	2	12	170147	170158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060864
3508	NC_018526	TTA	2	6	170163	170168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060864
3509	NC_018526	TTG	2	6	170173	170178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060864
3510	NC_018526	TCA	2	6	170195	170200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060864
3511	NC_018526	TCAA	2	8	170236	170243	50 %	25 %	0 %	25 %	403060864
3512	NC_018526	AGA	2	6	170279	170284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060864
3513	NC_018526	AT	3	6	170393	170398	50 %	50 %	0 %	0 %	403060864
3514	NC_018526	AGA	2	6	170420	170425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060864
3515	NC_018526	AGA	2	6	170480	170485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060864
3516	NC_018526	GAA	3	9	170643	170651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060864
3517	NC_018526	CAA	2	6	170658	170663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060864
3518	NC_018526	ACA	2	6	170693	170698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060864
3519	NC_018526	AGG	2	6	170707	170712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060864
3520	NC_018526	GGT	2	6	170845	170850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060865
3521	NC_018526	TG	3	6	170871	170876	0 %	50 %	50 %	0 %	403060865
3522	NC_018526	TAT	2	6	170940	170945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060865
3523	NC_018526	ATGA	2	8	170950	170957	50 %	25 %	25 %	0 %	403060865
3524	NC_018526	GGTTT	2	10	170995	171004	0 %	60 %	40 %	0 %	403060865
3525	NC_018526	GCA	2	6	171153	171158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060866
3526	NC_018526	G	6	6	171170	171175	0 %	0 %	100 %	0 %	403060866
3527	NC_018526	TTG	2	6	171187	171192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060866
3528	NC_018526	TTG	3	9	171199	171207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060866
3529	NC_018526	ATT	2	6	171222	171227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060866
3530	NC_018526	GTT	2	6	171285	171290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060866
3531	NC_018526	AAT	2	6	171294	171299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060866
3532	NC_018526	AT	3	6	171407	171412	50 %	50 %	0 %	0 %	403060866
3533	NC_018526	CA	3	6	171429	171434	50 %	0 %	0 %	50 %	403060866
3534	NC_018526	TA	3	6	171436	171441	50 %	50 %	0 %	0 %	403060866
3535	NC_018526	TGGG	2	8	171505	171512	0 %	25 %	75 %	0 %	403060866
3536	NC_018526	GTG	2	6	171631	171636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060866
3537	NC_018526	TAG	2	6	171637	171642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060866
3538	NC_018526	TAAGTC	2	12	171659	171670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403060866
3539	NC_018526	TTTG	2	8	171767	171774	0 %	75 %	25 %	0 %	403060866
3540	NC_018526	GTG	2	6	171805	171810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060866
3541	NC_018526	GCA	2	6	171855	171860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060866
3542	NC_018526	TTATC	2	10	171871	171880	20 %	60 %	0 %	20 %	403060866
3543	NC_018526	GTT	2	6	171975	171980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060866
3544	NC_018526	GGT	2	6	172032	172037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060866
3545	NC_018526	ATT	2	6	172050	172055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060866
3546	NC_018526	CTT	2	6	172103	172108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060866
3547	NC_018526	GGT	2	6	172146	172151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060866
3548	NC_018526	GCTA	2	8	172301	172308	25 %	25 %	25 %	25 %	403060866
3549	NC_018526	A	6	6	172383	172388	100 %	0 %	0 %	0 %	403060866
3550	NC_018526	AGAA	2	8	172393	172400	75 %	0 %	25 %	0 %	403060866
3551	NC_018526	ATA	2	6	172403	172408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060866
3552	NC_018526	TGG	2	6	172500	172505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060867
3553	NC_018526	GCT	2	6	172531	172536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060867
3554	NC_018526	TCT	2	6	172576	172581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060867
3555	NC_018526	CTT	2	6	172656	172661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060867
3556	NC_018526	AAG	2	6	172804	172809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060867
3557	NC_018526	CTATAC	2	12	172827	172838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060867
3558	NC_018526	TGAA	2	8	172859	172866	50 %	25 %	25 %	0 %	403060867
3559	NC_018526	AGC	2	6	172881	172886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060867
3560	NC_018526	CAC	2	6	172900	172905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060867
3561	NC_018526	A	6	6	172942	172947	100 %	0 %	0 %	0 %	403060867
3562	NC_018526	TTG	2	6	172991	172996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060867
3563	NC_018526	TTGG	2	8	173012	173019	0 %	50 %	50 %	0 %	403060867
3564	NC_018526	TAT	2	6	173055	173060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060867
3565	NC_018526	AAGT	2	8	173085	173092	50 %	25 %	25 %	0 %	403060867
3566	NC_018526	CTC	2	6	173093	173098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060867
3567	NC_018526	TAC	2	6	173121	173126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060867
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3569	NC_018526	AGA	2	6	173151	173156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060867
3570	NC_018526	GA	3	6	173232	173237	50 %	0 %	50 %	0 %	403060867
3571	NC_018526	GACA	2	8	173257	173264	50 %	0 %	25 %	25 %	403060868
3572	NC_018526	AGC	2	6	173327	173332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060868
3573	NC_018526	CAA	2	6	173366	173371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060868
3574	NC_018526	G	6	6	173387	173392	0 %	0 %	100 %	0 %	403060868
3575	NC_018526	AGC	2	6	173438	173443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060868
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3577	NC_018526	TC	3	6	173527	173532	0 %	50 %	0 %	50 %	403060868
3578	NC_018526	TGG	2	6	173597	173602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060868
3579	NC_018526	GAG	2	6	173619	173624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060868
3580	NC_018526	GGA	2	6	173816	173821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060868
3581	NC_018526	CTTG	2	8	173828	173835	0 %	50 %	25 %	25 %	403060868
3582	NC_018526	TAT	2	6	173843	173848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060868
3583	NC_018526	GGC	2	6	173867	173872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060868
3584	NC_018526	TAT	2	6	173956	173961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060868
3585	NC_018526	TGG	2	6	174002	174007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060868
3586	NC_018526	GTA	2	6	174013	174018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060868
3587	NC_018526	CAA	2	6	174099	174104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060868
3588	NC_018526	CTTA	2	8	174106	174113	25 %	50 %	0 %	25 %	403060868
3589	NC_018526	CAG	2	6	174133	174138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060868
3590	NC_018526	AT	3	6	174140	174145	50 %	50 %	0 %	0 %	403060868
3591	NC_018526	ACA	2	6	174170	174175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060868
3592	NC_018526	CAAAT	2	10	174241	174250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3593	NC_018526	T	6	6	174282	174287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_018526	TTCA	2	8	174294	174301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_018526	TGA	2	6	174325	174330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_018526	A	6	6	174395	174400	100 %	0 %	0 %	0 %	403060869
3597	NC_018526	CTT	2	6	174432	174437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060869
3598	NC_018526	TTTG	2	8	174460	174467	0 %	75 %	25 %	0 %	403060869
3599	NC_018526	CGA	2	6	174533	174538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060869
3600	NC_018526	TGT	2	6	174542	174547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060869
3601	NC_018526	T	6	6	174595	174600	0 %	100 %	0 %	0 %	403060869
3602	NC_018526	CATTGC	2	12	174606	174617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403060869
3603	NC_018526	TGG	2	6	174716	174721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060869
3604	NC_018526	TTC	3	9	174779	174787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060869
3605	NC_018526	TAT	2	6	174814	174819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060869
3606	NC_018526	TAA	2	6	174822	174827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060869
3607	NC_018526	TTGATT	2	12	174886	174897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403060869
3608	NC_018526	TCC	2	6	174899	174904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060869
3609	NC_018526	TTC	2	6	174910	174915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060869
3610	NC_018526	ATTT	2	8	174952	174959	25 %	75 %	0 %	0 %	403060869
3611	NC_018526	TGGT	2	8	175048	175055	0 %	50 %	50 %	0 %	403060869
3612	NC_018526	AGG	2	6	175086	175091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060869
3613	NC_018526	CTT	2	6	175139	175144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060869
3614	NC_018526	CTGG	2	8	175146	175153	0 %	25 %	50 %	25 %	403060869
3615	NC_018526	CTA	2	6	175185	175190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060869
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3617	NC_018526	ATG	2	6	175210	175215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060869
3618	NC_018526	CCT	2	6	175227	175232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060869
3619	NC_018526	AAC	2	6	175241	175246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060869
3620	NC_018526	CCG	2	6	175257	175262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403060869
3621	NC_018526	TCA	2	6	175275	175280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060869
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3623	NC_018526	GATG	2	8	175467	175474	25 %	25 %	50 %	0 %	403060869
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