MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_018526	GCAC	2	8	1930585	1930592	25 %	0 %	25 %	50 %	403062541
39002	NC_018526	ATG	2	6	1930614	1930619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062541
39003	NC_018526	TTC	2	6	1930626	1930631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062541
39004	NC_018526	TCA	2	6	1930735	1930740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062541
39005	NC_018526	TTG	2	6	1930789	1930794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062541
39006	NC_018526	CAAG	2	8	1930930	1930937	50 %	0 %	25 %	25 %	403062541
39007	NC_018526	CCG	2	6	1931003	1931008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062541
39008	NC_018526	TCA	2	6	1931317	1931322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062541
39009	NC_018526	GTA	2	6	1931343	1931348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062541
39010	NC_018526	GCT	2	6	1931375	1931380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062541
39011	NC_018526	AC	3	6	1931426	1931431	50 %	0 %	0 %	50 %	403062541
39012	NC_018526	AGT	2	6	1931444	1931449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062541
39013	NC_018526	CG	3	6	1931450	1931455	0 %	0 %	50 %	50 %	403062541
39014	NC_018526	AGT	2	6	1931519	1931524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062541
39015	NC_018526	GTT	2	6	1931562	1931567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062541
39016	NC_018526	ATC	2	6	1931616	1931621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062541
39017	NC_018526	ACG	2	6	1931895	1931900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062541
39018	NC_018526	CCAAC	2	10	1931905	1931914	40 %	0 %	0 %	60 %	403062541
39019	NC_018526	TTC	2	6	1931983	1931988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39020	NC_018526	ATTC	2	8	1932011	1932018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39021	NC_018526	A	6	6	1932057	1932062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39022	NC_018526	ATC	2	6	1932119	1932124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062542
39023	NC_018526	TGAT	2	8	1932161	1932168	25 %	50 %	25 %	0 %	403062542
39024	NC_018526	CTTT	2	8	1932210	1932217	0 %	75 %	0 %	25 %	403062542
39025	NC_018526	CATT	2	8	1932219	1932226	25 %	50 %	0 %	25 %	403062542
39026	NC_018526	TGTAA	2	10	1932227	1932236	40 %	40 %	20 %	0 %	403062542
39027	NC_018526	CAT	2	6	1932251	1932256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062542
39028	NC_018526	TGGCT	2	10	1932282	1932291	0 %	40 %	40 %	20 %	403062542
39029	NC_018526	TGA	2	6	1932292	1932297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062542
39030	NC_018526	TCA	2	6	1932318	1932323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062542
39031	NC_018526	TCA	2	6	1932372	1932377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062542
39032	NC_018526	ACA	2	6	1932444	1932449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062542
39033	NC_018526	GTT	2	6	1932499	1932504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062542
39034	NC_018526	AT	3	6	1932528	1932533	50 %	50 %	0 %	0 %	403062542
39035	NC_018526	TCC	2	6	1932534	1932539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062543
39036	NC_018526	TCTGG	2	10	1932582	1932591	0 %	40 %	40 %	20 %	403062543
39037	NC_018526	ATCA	2	8	1932797	1932804	50 %	25 %	0 %	25 %	403062543
39038	NC_018526	T	7	7	1932832	1932838	0 %	100 %	0 %	0 %	403062543
39039	NC_018526	AAT	2	6	1932847	1932852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062543
39040	NC_018526	CCA	2	6	1932861	1932866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062543
39041	NC_018526	GCA	2	6	1932879	1932884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062543
39042	NC_018526	ATCA	2	8	1932914	1932921	50 %	25 %	0 %	25 %	403062543
39043	NC_018526	TAA	2	6	1932986	1932991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062543
39044	NC_018526	ATG	2	6	1933028	1933033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062543
39045	NC_018526	T	6	6	1933046	1933051	0 %	100 %	0 %	0 %	403062543
39046	NC_018526	GGA	2	6	1933225	1933230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062543
39047	NC_018526	CAC	3	9	1933291	1933299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062543
39048	NC_018526	A	6	6	1933319	1933324	100 %	0 %	0 %	0 %	403062543
39049	NC_018526	TC	4	8	1933372	1933379	0 %	50 %	0 %	50 %	403062543
39050	NC_018526	TCT	2	6	1933454	1933459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39051	NC_018526	TTA	2	6	1933485	1933490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39052	NC_018526	GGTT	2	8	1933594	1933601	0 %	50 %	50 %	0 %	403062544
39053	NC_018526	ATT	2	6	1933646	1933651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062544
39054	NC_018526	TCA	2	6	1933684	1933689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062544
39055	NC_018526	CTG	2	6	1933835	1933840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062544
39056	NC_018526	CAT	3	9	1934045	1934053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39057	NC_018526	T	6	6	1934135	1934140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39058	NC_018526	CT	3	6	1934223	1934228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39059	NC_018526	ACGT	2	8	1934357	1934364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39060	NC_018526	CGT	2	6	1934419	1934424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39061	NC_018526	TAA	2	6	1934425	1934430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39062	NC_018526	TC	3	6	1934537	1934542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39063	NC_018526	A	6	6	1934645	1934650	100 %	0 %	0 %	0 %	403062545
39064	NC_018526	CCA	2	6	1934679	1934684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062545
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39066	NC_018526	TCTGC	2	10	1934775	1934784	0 %	40 %	20 %	40 %	403062545
39067	NC_018526	T	6	6	1934785	1934790	0 %	100 %	0 %	0 %	403062545
39068	NC_018526	AGCC	2	8	1934796	1934803	25 %	0 %	25 %	50 %	403062545
39069	NC_018526	TCT	2	6	1934900	1934905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062545
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39071	NC_018526	TACA	2	8	1935064	1935071	50 %	25 %	0 %	25 %	403062545
39072	NC_018526	TTA	2	6	1935113	1935118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062545
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39074	NC_018526	CTT	2	6	1935234	1935239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062545
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39076	NC_018526	TGACTC	2	12	1935297	1935308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403062545
39077	NC_018526	AG	3	6	1935420	1935425	50 %	0 %	50 %	0 %	403062545
39078	NC_018526	ATAGG	2	10	1935494	1935503	40 %	20 %	40 %	0 %	403062545
39079	NC_018526	GATA	2	8	1935578	1935585	50 %	25 %	25 %	0 %	403062545
39080	NC_018526	GAA	2	6	1935591	1935596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062545
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39084	NC_018526	T	7	7	1935660	1935666	0 %	100 %	0 %	0 %	403062545
39085	NC_018526	ATG	2	6	1935721	1935726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062545
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39090	NC_018526	ATCA	2	8	1936132	1936139	50 %	25 %	0 %	25 %	403062545
39091	NC_018526	GAC	2	6	1936176	1936181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062545
39092	NC_018526	TCA	2	6	1936322	1936327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062545
39093	NC_018526	CT	3	6	1936453	1936458	0 %	50 %	0 %	50 %	403062545
39094	NC_018526	GCC	2	6	1936577	1936582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062545
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39098	NC_018526	CTTG	2	8	1936827	1936834	0 %	50 %	25 %	25 %	403062545
39099	NC_018526	AGAT	2	8	1936863	1936870	50 %	25 %	25 %	0 %	403062545
39100	NC_018526	GCT	2	6	1936928	1936933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062545
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39102	NC_018526	TAA	2	6	1936956	1936961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062545
39103	NC_018526	TCA	2	6	1936974	1936979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062545
39104	NC_018526	TATCA	2	10	1937008	1937017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39105	NC_018526	TTC	2	6	1937042	1937047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39106	NC_018526	A	6	6	1937081	1937086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39107	NC_018526	CTT	2	6	1937123	1937128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39108	NC_018526	AAAATC	2	12	1937139	1937150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39109	NC_018526	TAT	2	6	1937246	1937251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39110	NC_018526	TCA	2	6	1937293	1937298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39111	NC_018526	CAA	2	6	1937307	1937312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39112	NC_018526	TAT	2	6	1937337	1937342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062546
39113	NC_018526	TCA	2	6	1937359	1937364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062546
39114	NC_018526	GCT	2	6	1937409	1937414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062546
39115	NC_018526	GCCCA	2	10	1937421	1937430	20 %	0 %	20 %	60 %	403062546
39116	NC_018526	ATG	2	6	1937443	1937448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062546
39117	NC_018526	GTG	2	6	1937460	1937465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062546
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39355	NC_018526	ATA	2	6	1947985	1947990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062555
39356	NC_018526	ATC	2	6	1947991	1947996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062555
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39462	NC_018526	TTCATG	2	12	1953679	1953690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403062559
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39466	NC_018526	TTC	2	6	1953945	1953950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062559
39467	NC_018526	GCT	2	6	1953976	1953981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062559
39468	NC_018526	CAC	2	6	1954001	1954006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062559
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39470	NC_018526	AAG	2	6	1954228	1954233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062560
39471	NC_018526	GTT	2	6	1954245	1954250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062560
39472	NC_018526	TCA	2	6	1954301	1954306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062560
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39474	NC_018526	GCA	2	6	1954385	1954390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062560
39475	NC_018526	ATC	2	6	1954487	1954492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062560
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39478	NC_018526	GTCC	2	8	1954594	1954601	0 %	25 %	25 %	50 %	403062561
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39480	NC_018526	TGA	2	6	1954755	1954760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062561
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39487	NC_018526	A	6	6	1955066	1955071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39488	NC_018526	CAT	2	6	1955097	1955102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39496	NC_018526	TTTA	2	8	1955494	1955501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39497	NC_018526	CAA	2	6	1955526	1955531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39499	NC_018526	A	7	7	1955587	1955593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39500	NC_018526	GGA	2	6	1955596	1955601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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