MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_018526	GCATG	2	10	1724003	1724012	20 %	20 %	40 %	20 %	403062357
35002	NC_018526	TTG	2	6	1724026	1724031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062357
35003	NC_018526	CTTC	2	8	1724084	1724091	0 %	50 %	0 %	50 %	403062357
35004	NC_018526	TAT	2	6	1724102	1724107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062357
35005	NC_018526	TGG	2	6	1724131	1724136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062357
35006	NC_018526	GACCT	2	10	1724208	1724217	20 %	20 %	20 %	40 %	403062357
35007	NC_018526	T	8	8	1724235	1724242	0 %	100 %	0 %	0 %	403062357
35008	NC_018526	CTTG	2	8	1724291	1724298	0 %	50 %	25 %	25 %	403062357
35009	NC_018526	AT	3	6	1724391	1724396	50 %	50 %	0 %	0 %	403062358
35010	NC_018526	TGCT	2	8	1724399	1724406	0 %	50 %	25 %	25 %	403062358
35011	NC_018526	TGA	2	6	1724454	1724459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062358
35012	NC_018526	GCTG	2	8	1724487	1724494	0 %	25 %	50 %	25 %	403062358
35013	NC_018526	CTA	2	6	1724503	1724508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062358
35014	NC_018526	AAG	2	6	1724560	1724565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062358
35015	NC_018526	GCA	2	6	1724631	1724636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062358
35016	NC_018526	A	6	6	1724651	1724656	100 %	0 %	0 %	0 %	403062358
35017	NC_018526	ATC	2	6	1724682	1724687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062358
35018	NC_018526	GGT	2	6	1724733	1724738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062358
35019	NC_018526	GGGGCA	2	12	1724779	1724790	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	403062358
35020	NC_018526	AAT	2	6	1724800	1724805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062358
35021	NC_018526	TTC	2	6	1724809	1724814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062358
35022	NC_018526	T	6	6	1724820	1724825	0 %	100 %	0 %	0 %	403062359
35023	NC_018526	TCTG	2	8	1724865	1724872	0 %	50 %	25 %	25 %	403062359
35024	NC_018526	AGG	2	6	1724902	1724907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062359
35025	NC_018526	CTA	2	6	1725029	1725034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35026	NC_018526	CAA	2	6	1725225	1725230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35027	NC_018526	TTG	2	6	1725245	1725250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35028	NC_018526	TTCT	2	8	1725276	1725283	0 %	75 %	0 %	25 %	403062360
35029	NC_018526	CTT	2	6	1725292	1725297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062360
35030	NC_018526	GTT	2	6	1725300	1725305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062360
35031	NC_018526	GTTGGG	2	12	1725365	1725376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062360
35032	NC_018526	CCG	2	6	1725419	1725424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062360
35033	NC_018526	ATG	2	6	1725515	1725520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062360
35034	NC_018526	AGCC	2	8	1725629	1725636	25 %	0 %	25 %	50 %	403062360
35035	NC_018526	ACCA	2	8	1725646	1725653	50 %	0 %	0 %	50 %	403062360
35036	NC_018526	CTA	2	6	1725656	1725661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062360
35037	NC_018526	AAG	2	6	1725797	1725802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062360
35038	NC_018526	CAT	2	6	1725826	1725831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062360
35039	NC_018526	TCC	2	6	1725902	1725907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062360
35040	NC_018526	AG	3	6	1725927	1725932	50 %	0 %	50 %	0 %	403062360
35041	NC_018526	AAG	2	6	1725962	1725967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062360
35042	NC_018526	CCAA	2	8	1725976	1725983	50 %	0 %	0 %	50 %	403062360
35043	NC_018526	CAAC	2	8	1725991	1725998	50 %	0 %	0 %	50 %	403062360
35044	NC_018526	CTG	2	6	1726035	1726040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062360
35045	NC_018526	CAT	2	6	1726054	1726059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062360
35046	NC_018526	A	6	6	1726082	1726087	100 %	0 %	0 %	0 %	403062360
35047	NC_018526	GAT	2	6	1726093	1726098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062360
35048	NC_018526	CAAG	2	8	1726137	1726144	50 %	0 %	25 %	25 %	403062360
35049	NC_018526	CCG	2	6	1726196	1726201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062360
35050	NC_018526	ATA	2	6	1726286	1726291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062360
35051	NC_018526	CTG	2	6	1726342	1726347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062360
35052	NC_018526	ATC	2	6	1726361	1726366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062360
35053	NC_018526	TGG	2	6	1726407	1726412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062360
35054	NC_018526	TC	3	6	1726530	1726535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35055	NC_018526	GA	3	6	1726573	1726578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35056	NC_018526	TTGA	2	8	1726618	1726625	25 %	50 %	25 %	0 %	403062361
35057	NC_018526	CAT	2	6	1726635	1726640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062361
35058	NC_018526	GAA	2	6	1726675	1726680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062361
35059	NC_018526	ATT	2	6	1726708	1726713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062361
35060	NC_018526	A	6	6	1726721	1726726	100 %	0 %	0 %	0 %	403062361
35061	NC_018526	A	6	6	1726769	1726774	100 %	0 %	0 %	0 %	403062361
35062	NC_018526	CAT	2	6	1726830	1726835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062361
35063	NC_018526	AGGA	2	8	1726865	1726872	50 %	0 %	50 %	0 %	403062361
35064	NC_018526	CT	3	6	1726893	1726898	0 %	50 %	0 %	50 %	403062361
35065	NC_018526	AAG	2	6	1726901	1726906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062361
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35068	NC_018526	ACC	2	6	1727111	1727116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062361
35069	NC_018526	AAG	2	6	1727171	1727176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062361
35070	NC_018526	ACTG	2	8	1727206	1727213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35071	NC_018526	T	6	6	1727230	1727235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35072	NC_018526	A	6	6	1727247	1727252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35073	NC_018526	GATC	2	8	1727264	1727271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35074	NC_018526	AAT	2	6	1727274	1727279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35075	NC_018526	ACG	2	6	1727350	1727355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35076	NC_018526	TAA	2	6	1727356	1727361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35077	NC_018526	CAT	2	6	1727439	1727444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062362
35078	NC_018526	CTGG	2	8	1727594	1727601	0 %	25 %	50 %	25 %	403062362
35079	NC_018526	ATC	2	6	1727616	1727621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062362
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35086	NC_018526	CAG	2	6	1728053	1728058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062362
35087	NC_018526	ATG	3	9	1728061	1728069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062362
35088	NC_018526	AACC	2	8	1728071	1728078	50 %	0 %	0 %	50 %	403062362
35089	NC_018526	CCTC	2	8	1728100	1728107	0 %	25 %	0 %	75 %	403062362
35090	NC_018526	CTT	2	6	1728128	1728133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062362
35091	NC_018526	ATA	2	6	1728169	1728174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062362
35092	NC_018526	CTTTT	2	10	1728182	1728191	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35093	NC_018526	ATC	2	6	1728305	1728310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062363
35094	NC_018526	CTT	2	6	1728448	1728453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062363
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35098	NC_018526	AGA	2	6	1728575	1728580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062363
35099	NC_018526	ATC	2	6	1728671	1728676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062363
35100	NC_018526	TCAT	2	8	1728774	1728781	25 %	50 %	0 %	25 %	403062363
35101	NC_018526	GCA	2	6	1729013	1729018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062364
35102	NC_018526	CTGCT	2	10	1729060	1729069	0 %	40 %	20 %	40 %	403062364
35103	NC_018526	TCG	2	6	1729211	1729216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062364
35104	NC_018526	GGAT	2	8	1729227	1729234	25 %	25 %	50 %	0 %	403062364
35105	NC_018526	CCG	2	6	1729374	1729379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062364
35106	NC_018526	GGT	2	6	1729426	1729431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062364
35107	NC_018526	ATG	2	6	1729445	1729450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062364
35108	NC_018526	GTCG	2	8	1729512	1729519	0 %	25 %	50 %	25 %	403062364
35109	NC_018526	CTA	2	6	1729638	1729643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062364
35110	NC_018526	CTGG	2	8	1729782	1729789	0 %	25 %	50 %	25 %	403062364
35111	NC_018526	CCTG	2	8	1729792	1729799	0 %	25 %	25 %	50 %	403062364
35112	NC_018526	TCT	2	6	1729868	1729873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062364
35113	NC_018526	CATC	2	8	1729890	1729897	25 %	25 %	0 %	50 %	403062364
35114	NC_018526	CTT	2	6	1730082	1730087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062364
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35118	NC_018526	CAT	2	6	1730301	1730306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062365
35119	NC_018526	CCA	2	6	1730546	1730551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062365
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35121	NC_018526	T	6	6	1730669	1730674	0 %	100 %	0 %	0 %	403062365
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35356	NC_018526	GAA	2	6	1743388	1743393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062374
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35360	NC_018526	AGA	2	6	1743615	1743620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062374
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35362	NC_018526	CAA	2	6	1743721	1743726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062375
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35364	NC_018526	ATT	2	6	1743747	1743752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062375
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35384	NC_018526	GGCT	2	8	1744741	1744748	0 %	25 %	50 %	25 %	403062377
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35391	NC_018526	TA	3	6	1745447	1745452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35392	NC_018526	A	6	6	1745452	1745457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35393	NC_018526	CAA	2	6	1745492	1745497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35472	NC_018526	AAT	2	6	1749630	1749635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062380
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