MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018526	AGAT	2	8	146271	146278	50 %	25 %	25 %	0 %	403060847
3002	NC_018526	CCT	2	6	146297	146302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060848
3003	NC_018526	GCCA	2	8	146362	146369	25 %	0 %	25 %	50 %	403060848
3004	NC_018526	GCCA	2	8	146374	146381	25 %	0 %	25 %	50 %	403060848
3005	NC_018526	TGG	2	6	146391	146396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060848
3006	NC_018526	GGT	2	6	146397	146402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060848
3007	NC_018526	GAG	2	6	146452	146457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060848
3008	NC_018526	TTG	2	6	146461	146466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060848
3009	NC_018526	GGCTGT	2	12	146496	146507	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403060848
3010	NC_018526	GCT	2	6	146554	146559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060848
3011	NC_018526	GGC	2	6	146625	146630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060848
3012	NC_018526	GCGG	2	8	146631	146638	0 %	0 %	75 %	25 %	403060848
3013	NC_018526	GGAGTT	2	12	146643	146654	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403060848
3014	NC_018526	GAT	2	6	146746	146751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060848
3015	NC_018526	GGGTC	2	10	146778	146787	0 %	20 %	60 %	20 %	403060848
3016	NC_018526	TTTC	2	8	146894	146901	0 %	75 %	0 %	25 %	403060848
3017	NC_018526	CAG	2	6	146944	146949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060848
3018	NC_018526	AAG	2	6	147028	147033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060848
3019	NC_018526	TGG	2	6	147062	147067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060848
3020	NC_018526	GCGG	2	8	147070	147077	0 %	0 %	75 %	25 %	403060848
3021	NC_018526	GCT	2	6	147112	147117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060848
3022	NC_018526	AGC	2	6	147189	147194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060848
3023	NC_018526	GCTG	2	8	147223	147230	0 %	25 %	50 %	25 %	403060848
3024	NC_018526	TTGG	2	8	147382	147389	0 %	50 %	50 %	0 %	403060849
3025	NC_018526	TTC	2	6	147400	147405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060849
3026	NC_018526	TAG	2	6	147426	147431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
3027	NC_018526	T	6	6	147434	147439	0 %	100 %	0 %	0 %	403060849
3028	NC_018526	GAT	2	6	147472	147477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
3029	NC_018526	TTG	2	6	147481	147486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060849
3030	NC_018526	AGT	2	6	147525	147530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
3031	NC_018526	ATC	2	6	147559	147564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060849
3032	NC_018526	TA	3	6	147616	147621	50 %	50 %	0 %	0 %	403060849
3033	NC_018526	T	6	6	147720	147725	0 %	100 %	0 %	0 %	403060849
3034	NC_018526	GAT	2	6	147726	147731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
3035	NC_018526	TTTCA	2	10	147748	147757	20 %	60 %	0 %	20 %	403060849
3036	NC_018526	GTT	2	6	147804	147809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060849
3037	NC_018526	CCTG	2	8	147821	147828	0 %	25 %	25 %	50 %	403060849
3038	NC_018526	GGT	2	6	147954	147959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060849
3039	NC_018526	GAT	2	6	148003	148008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060849
3040	NC_018526	GTT	2	6	148026	148031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060849
3041	NC_018526	TTA	2	6	148112	148117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060849
3042	NC_018526	A	6	6	148223	148228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_018526	A	6	6	148231	148236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_018526	GTTATA	2	12	148296	148307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_018526	TCG	2	6	148324	148329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_018526	AAAAG	2	10	148341	148350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_018526	TAT	2	6	148354	148359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_018526	GAA	2	6	148363	148368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060850
3049	NC_018526	CTTG	2	8	148387	148394	0 %	50 %	25 %	25 %	403060850
3050	NC_018526	CTG	2	6	148406	148411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060850
3051	NC_018526	AGT	2	6	148457	148462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060850
3052	NC_018526	GGT	2	6	148625	148630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060850
3053	NC_018526	TGAA	2	8	148761	148768	50 %	25 %	25 %	0 %	403060850
3054	NC_018526	ACA	2	6	148773	148778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060850
3055	NC_018526	A	6	6	148838	148843	100 %	0 %	0 %	0 %	403060850
3056	NC_018526	GAT	2	6	148874	148879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060850
3057	NC_018526	AAG	2	6	148902	148907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060850
3058	NC_018526	GAA	2	6	148912	148917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060850
3059	NC_018526	CTA	2	6	148978	148983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060850
3060	NC_018526	TATC	2	8	148990	148997	25 %	50 %	0 %	25 %	403060850
3061	NC_018526	TGG	2	6	149002	149007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060850
3062	NC_018526	TTA	2	6	149013	149018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060850
3063	NC_018526	TGA	2	6	149020	149025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060850
3064	NC_018526	TAC	2	6	149072	149077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060850
3065	NC_018526	A	6	6	149094	149099	100 %	0 %	0 %	0 %	403060850
3066	NC_018526	TGC	2	6	149299	149304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060850
3067	NC_018526	TGC	2	6	149323	149328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060850
3068	NC_018526	CAAA	2	8	149436	149443	75 %	0 %	0 %	25 %	403060850
3069	NC_018526	TGG	2	6	149472	149477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060850
3070	NC_018526	AAC	2	6	149506	149511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060850
3071	NC_018526	GAA	2	6	149576	149581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060850
3072	NC_018526	ATG	2	6	149603	149608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060850
3073	NC_018526	TAGG	2	8	149633	149640	25 %	25 %	50 %	0 %	403060850
3074	NC_018526	TTC	2	6	149658	149663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_018526	CTT	2	6	149671	149676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_018526	GAA	2	6	149685	149690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_018526	A	7	7	149712	149718	100 %	0 %	0 %	0 %	403060851
3078	NC_018526	TGGGGA	2	12	149740	149751	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	403060851
3079	NC_018526	ATT	2	6	149767	149772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060851
3080	NC_018526	ATT	2	6	149791	149796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060851
3081	NC_018526	GTT	2	6	149947	149952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060851
3082	NC_018526	TTGC	2	8	149977	149984	0 %	50 %	25 %	25 %	403060851
3083	NC_018526	T	7	7	150032	150038	0 %	100 %	0 %	0 %	403060851
3084	NC_018526	TGG	2	6	150047	150052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060851
3085	NC_018526	CGT	2	6	150127	150132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060851
3086	NC_018526	ATTTTA	2	12	150229	150240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060851
3087	NC_018526	TGT	2	6	150357	150362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060851
3088	NC_018526	ATG	2	6	150409	150414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060851
3089	NC_018526	AAT	2	6	150472	150477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060851
3090	NC_018526	CCA	2	6	150509	150514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060851
3091	NC_018526	TGT	3	9	150521	150529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060851
3092	NC_018526	ATT	2	6	150535	150540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060851
3093	NC_018526	A	6	6	150574	150579	100 %	0 %	0 %	0 %	403060851
3094	NC_018526	AGG	2	6	150597	150602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060851
3095	NC_018526	CAA	2	6	150630	150635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060852
3096	NC_018526	ATGC	2	8	150641	150648	25 %	25 %	25 %	25 %	403060852
3097	NC_018526	CTT	2	6	150649	150654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060852
3098	NC_018526	TTTG	2	8	150686	150693	0 %	75 %	25 %	0 %	403060852
3099	NC_018526	TAA	2	6	150802	150807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060852
3100	NC_018526	TGA	2	6	150837	150842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060852
3101	NC_018526	TGGTC	2	10	150934	150943	0 %	40 %	40 %	20 %	403060852
3102	NC_018526	ATG	2	6	150953	150958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060852
3103	NC_018526	TGA	2	6	150993	150998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060852
3104	NC_018526	GGA	2	6	151111	151116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060852
3105	NC_018526	CTT	2	6	151153	151158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060852
3106	NC_018526	TTTG	2	8	151216	151223	0 %	75 %	25 %	0 %	403060852
3107	NC_018526	TGG	2	6	151423	151428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060852
3108	NC_018526	AGG	2	6	151437	151442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060852
3109	NC_018526	TTA	2	6	151500	151505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060853
3110	NC_018526	TAT	2	6	151550	151555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060853
3111	NC_018526	CTT	2	6	151578	151583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060853
3112	NC_018526	AGA	2	6	151630	151635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060853
3113	NC_018526	GAG	2	6	151826	151831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060853
3114	NC_018526	ATTT	2	8	151853	151860	25 %	75 %	0 %	0 %	403060853
3115	NC_018526	GTCTT	2	10	151889	151898	0 %	60 %	20 %	20 %	403060853
3116	NC_018526	AAC	2	6	151947	151952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060853
3117	NC_018526	TCTG	2	8	151964	151971	0 %	50 %	25 %	25 %	403060853
3118	NC_018526	TCA	2	6	152080	152085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060853
3119	NC_018526	TAG	2	6	152119	152124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060853
3120	NC_018526	A	6	6	152250	152255	100 %	0 %	0 %	0 %	403060853
3121	NC_018526	ATCC	2	8	152273	152280	25 %	25 %	0 %	50 %	403060853
3122	NC_018526	GTT	2	6	152333	152338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060853
3123	NC_018526	TTTTGA	2	12	152470	152481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403060853
3124	NC_018526	GAT	2	6	152546	152551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060853
3125	NC_018526	GGTT	2	8	152552	152559	0 %	50 %	50 %	0 %	403060853
3126	NC_018526	GA	3	6	152610	152615	50 %	0 %	50 %	0 %	403060853
3127	NC_018526	ATT	2	6	152639	152644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060853
3128	NC_018526	CAT	2	6	152747	152752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060853
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3131	NC_018526	AGC	2	6	152995	153000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060853
3132	NC_018526	GTG	2	6	153033	153038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060853
3133	NC_018526	CTA	2	6	153064	153069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060853
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3136	NC_018526	TTTG	2	8	153268	153275	0 %	75 %	25 %	0 %	403060853
3137	NC_018526	AAG	2	6	153285	153290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060853
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3139	NC_018526	TCG	2	6	153448	153453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060853
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3141	NC_018526	CTT	2	6	153615	153620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060853
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3144	NC_018526	GA	3	6	153877	153882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_018526	TTC	2	6	153887	153892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3146	NC_018526	AATG	2	8	153919	153926	50 %	25 %	25 %	0 %	403060854
3147	NC_018526	TGA	2	6	154051	154056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060854
3148	NC_018526	TG	3	6	154093	154098	0 %	50 %	50 %	0 %	403060854
3149	NC_018526	CAT	2	6	154287	154292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060854
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3153	NC_018526	A	7	7	154488	154494	100 %	0 %	0 %	0 %	403060854
3154	NC_018526	CTG	2	6	154506	154511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060854
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3174	NC_018526	TCAG	2	8	155100	155107	25 %	25 %	25 %	25 %	403060856
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3194	NC_018526	TAGT	2	8	156085	156092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3198	NC_018526	T	6	6	156214	156219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3199	NC_018526	TA	3	6	156275	156280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3230	NC_018526	CTTA	2	8	157843	157850	25 %	50 %	0 %	25 %	403060857
3231	NC_018526	TTG	2	6	157988	157993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060857
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3233	NC_018526	CT	3	6	158063	158068	0 %	50 %	0 %	50 %	403060857
3234	NC_018526	ATC	2	6	158103	158108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060857
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3237	NC_018526	AAGA	2	8	158449	158456	75 %	0 %	25 %	0 %	403060857
3238	NC_018526	GGT	2	6	158545	158550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060857
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3240	NC_018526	TTA	2	6	158576	158581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060857
3241	NC_018526	A	6	6	158656	158661	100 %	0 %	0 %	0 %	403060857
3242	NC_018526	TGA	3	9	158700	158708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060857
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3245	NC_018526	GCT	2	6	158761	158766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060857
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3248	NC_018526	ACG	2	6	158830	158835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060857
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3253	NC_018526	TGA	2	6	159030	159035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060857
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3363	NC_018526	GTA	2	6	163393	163398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060859
3364	NC_018526	GAA	2	6	163437	163442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060859
3365	NC_018526	ACAA	2	8	163538	163545	75 %	0 %	0 %	25 %	403060859
3366	NC_018526	AGAA	2	8	163629	163636	75 %	0 %	25 %	0 %	403060859
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3368	NC_018526	AGACT	2	10	163718	163727	40 %	20 %	20 %	20 %	403060859
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3494	NC_018526	ATT	2	6	169439	169444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060864
3495	NC_018526	TGC	2	6	169478	169483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060864
3496	NC_018526	GAT	2	6	169545	169550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060864
3497	NC_018526	ATT	2	6	169605	169610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060864
3498	NC_018526	TAC	2	6	169665	169670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060864
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