MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_018526	GCT	2	6	1548009	1548014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062197
31502	NC_018526	CTC	3	9	1548026	1548034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062197
31503	NC_018526	CGAT	2	8	1548078	1548085	25 %	25 %	25 %	25 %	403062197
31504	NC_018526	CCT	2	6	1548106	1548111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062198
31505	NC_018526	AG	3	6	1548172	1548177	50 %	0 %	50 %	0 %	403062198
31506	NC_018526	GAA	2	6	1548230	1548235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062198
31507	NC_018526	TCT	2	6	1548288	1548293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062198
31508	NC_018526	GCA	3	9	1548315	1548323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31509	NC_018526	GCTG	2	8	1548464	1548471	0 %	25 %	50 %	25 %	403062198
31510	NC_018526	CAT	2	6	1548545	1548550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062198
31511	NC_018526	GCTG	2	8	1548585	1548592	0 %	25 %	50 %	25 %	403062198
31512	NC_018526	CCAA	2	8	1548662	1548669	50 %	0 %	0 %	50 %	403062198
31513	NC_018526	ACG	2	6	1548704	1548709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31514	NC_018526	GAA	2	6	1548755	1548760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062198
31515	NC_018526	AGG	2	6	1548765	1548770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062198
31516	NC_018526	CTG	2	6	1548832	1548837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31517	NC_018526	AGT	2	6	1548847	1548852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062198
31518	NC_018526	AAG	2	6	1548893	1548898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062198
31519	NC_018526	TCA	2	6	1548930	1548935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062198
31520	NC_018526	CCG	2	6	1548979	1548984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062198
31521	NC_018526	CTA	2	6	1549120	1549125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062198
31522	NC_018526	AGA	2	6	1549159	1549164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062198
31523	NC_018526	CCA	2	6	1549186	1549191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062198
31524	NC_018526	CGGA	2	8	1549245	1549252	25 %	0 %	50 %	25 %	403062198
31525	NC_018526	TGG	2	6	1549305	1549310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062198
31526	NC_018526	CTT	2	6	1549333	1549338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062198
31527	NC_018526	TCA	2	6	1549425	1549430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062198
31528	NC_018526	CGA	2	6	1549477	1549482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31529	NC_018526	AAG	2	6	1549620	1549625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062198
31530	NC_018526	TTG	2	6	1549692	1549697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062198
31531	NC_018526	GCTG	2	8	1549770	1549777	0 %	25 %	50 %	25 %	403062198
31532	NC_018526	GTC	2	6	1549845	1549850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31533	NC_018526	CAG	2	6	1549876	1549881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31534	NC_018526	TCT	2	6	1549915	1549920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062198
31535	NC_018526	TCT	2	6	1549938	1549943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062198
31536	NC_018526	CTG	2	6	1549955	1549960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062198
31537	NC_018526	GGCGT	2	10	1549993	1550002	0 %	20 %	60 %	20 %	403062198
31538	NC_018526	TGTC	2	8	1550038	1550045	0 %	50 %	25 %	25 %	403062198
31539	NC_018526	CCAAG	2	10	1550113	1550122	40 %	0 %	20 %	40 %	403062198
31540	NC_018526	CAA	2	6	1550125	1550130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062198
31541	NC_018526	ATT	2	6	1550145	1550150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062198
31542	NC_018526	TCC	2	6	1550156	1550161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062199
31543	NC_018526	CAA	2	6	1550164	1550169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062199
31544	NC_018526	T	6	6	1550209	1550214	0 %	100 %	0 %	0 %	403062199
31545	NC_018526	CTT	2	6	1550373	1550378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062199
31546	NC_018526	CTT	2	6	1550394	1550399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062199
31547	NC_018526	CTGG	2	8	1550475	1550482	0 %	25 %	50 %	25 %	403062199
31548	NC_018526	CTT	2	6	1550541	1550546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062199
31549	NC_018526	ACC	2	6	1550611	1550616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062199
31550	NC_018526	CCAA	2	8	1550658	1550665	50 %	0 %	0 %	50 %	403062199
31551	NC_018526	CCCAG	2	10	1550670	1550679	20 %	0 %	20 %	60 %	403062199
31552	NC_018526	AACGA	2	10	1550719	1550728	60 %	0 %	20 %	20 %	403062199
31553	NC_018526	AGATGG	2	12	1550794	1550805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403062199
31554	NC_018526	TGG	2	6	1550825	1550830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062199
31555	NC_018526	CTG	2	6	1550871	1550876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062199
31556	NC_018526	GAC	2	6	1550877	1550882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062199
31557	NC_018526	AGCA	2	8	1550990	1550997	50 %	0 %	25 %	25 %	403062199
31558	NC_018526	TTG	2	6	1551016	1551021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062199
31559	NC_018526	T	7	7	1551052	1551058	0 %	100 %	0 %	0 %	403062199
31560	NC_018526	CTT	2	6	1551071	1551076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31561	NC_018526	CAA	2	6	1551117	1551122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31562	NC_018526	GCAG	2	8	1551126	1551133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31563	NC_018526	ACG	2	6	1551159	1551164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31564	NC_018526	TAA	2	6	1551165	1551170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31565	NC_018526	AAGT	2	8	1551323	1551330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31566	NC_018526	TA	4	8	1551355	1551362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31567	NC_018526	CTG	2	6	1551484	1551489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062200
31568	NC_018526	TGA	2	6	1551528	1551533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062200
31569	NC_018526	CTGT	2	8	1551622	1551629	0 %	50 %	25 %	25 %	403062200
31570	NC_018526	CCA	2	6	1551673	1551678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062200
31571	NC_018526	TGAT	2	8	1551744	1551751	25 %	50 %	25 %	0 %	403062200
31572	NC_018526	CTTT	2	8	1551777	1551784	0 %	75 %	0 %	25 %	403062200
31573	NC_018526	ATA	2	6	1551785	1551790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062200
31574	NC_018526	TCGG	2	8	1551827	1551834	0 %	25 %	50 %	25 %	403062200
31575	NC_018526	TTA	2	6	1551908	1551913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31576	NC_018526	ATT	2	6	1551969	1551974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31577	NC_018526	TGGCT	2	10	1551982	1551991	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31578	NC_018526	CTT	2	6	1552032	1552037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31579	NC_018526	TAG	2	6	1552150	1552155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062201
31580	NC_018526	TAC	2	6	1552168	1552173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062201
31581	NC_018526	TCT	2	6	1552226	1552231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062201
31582	NC_018526	ATC	2	6	1552342	1552347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062201
31583	NC_018526	ATT	2	6	1552378	1552383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062201
31584	NC_018526	TCA	2	6	1552388	1552393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062201
31585	NC_018526	CAC	2	6	1552470	1552475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062201
31586	NC_018526	CGC	2	6	1552498	1552503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062201
31587	NC_018526	TTG	2	6	1552530	1552535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062201
31588	NC_018526	CG	3	6	1552586	1552591	0 %	0 %	50 %	50 %	403062201
31589	NC_018526	T	7	7	1552594	1552600	0 %	100 %	0 %	0 %	403062201
31590	NC_018526	TTC	2	6	1552696	1552701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062201
31591	NC_018526	TCA	2	6	1552718	1552723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062201
31592	NC_018526	AAT	2	6	1552754	1552759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062201
31593	NC_018526	CAA	3	9	1552806	1552814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062201
31594	NC_018526	TCT	2	6	1552866	1552871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31595	NC_018526	ACG	2	6	1552880	1552885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31596	NC_018526	TTTA	2	8	1552924	1552931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31597	NC_018526	A	6	6	1552987	1552992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31598	NC_018526	CTAT	2	8	1553006	1553013	25 %	50 %	0 %	25 %	403062202
31599	NC_018526	GAT	2	6	1553060	1553065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062202
31600	NC_018526	CAT	2	6	1553098	1553103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062202
31601	NC_018526	TAT	2	6	1553104	1553109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062202
31602	NC_018526	GTAG	2	8	1553113	1553120	25 %	25 %	50 %	0 %	403062202
31603	NC_018526	ACC	2	6	1553147	1553152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062202
31604	NC_018526	GTC	2	6	1553208	1553213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062202
31605	NC_018526	GCC	2	6	1553289	1553294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062202
31606	NC_018526	AGCG	2	8	1553366	1553373	25 %	0 %	50 %	25 %	403062202
31607	NC_018526	GCC	2	6	1553382	1553387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062202
31608	NC_018526	CAA	2	6	1553407	1553412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062202
31609	NC_018526	GCC	2	6	1553436	1553441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062202
31610	NC_018526	ATA	2	6	1553448	1553453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062202
31611	NC_018526	CCA	2	6	1553574	1553579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062202
31612	NC_018526	AACC	2	8	1553628	1553635	50 %	0 %	0 %	50 %	403062202
31613	NC_018526	CAC	2	6	1553792	1553797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062203
31614	NC_018526	CCGTAT	2	12	1553893	1553904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403062203
31615	NC_018526	CTG	2	6	1553966	1553971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062203
31616	NC_018526	TCA	2	6	1553991	1553996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062203
31617	NC_018526	TGA	2	6	1554013	1554018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062203
31618	NC_018526	TTC	2	6	1554032	1554037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062203
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31620	NC_018526	CTT	2	6	1554070	1554075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062203
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31856	NC_018526	GCT	2	6	1565075	1565080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062211
31857	NC_018526	TGC	2	6	1565092	1565097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062211
31858	NC_018526	ATC	2	6	1565240	1565245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062211
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31970	NC_018526	TG	3	6	1571133	1571138	0 %	50 %	50 %	0 %	403062217
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