MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_018526	ACG	2	6	1523965	1523970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062170
31003	NC_018526	ACC	2	6	1523995	1524000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062170
31004	NC_018526	ATG	2	6	1524086	1524091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062170
31005	NC_018526	TTGC	2	8	1524161	1524168	0 %	50 %	25 %	25 %	403062170
31006	NC_018526	AAC	2	6	1524169	1524174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062170
31007	NC_018526	TCT	2	6	1524176	1524181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062170
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31009	NC_018526	ACA	2	6	1524272	1524277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062170
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31011	NC_018526	TAT	2	6	1524327	1524332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_018526	CTT	2	6	1524444	1524449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062171
31013	NC_018526	T	6	6	1524448	1524453	0 %	100 %	0 %	0 %	403062171
31014	NC_018526	TTG	2	6	1524466	1524471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062171
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31017	NC_018526	TCA	2	6	1524590	1524595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062171
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31019	NC_018526	TCA	2	6	1524635	1524640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062171
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31097	NC_018526	A	7	7	1528433	1528439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31098	NC_018526	CTG	2	6	1528448	1528453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31102	NC_018526	T	6	6	1528636	1528641	0 %	100 %	0 %	0 %	403062176
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31118	NC_018526	C	6	6	1529303	1529308	0 %	0 %	0 %	100 %	403062176
31119	NC_018526	TTG	2	6	1529310	1529315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062176
31120	NC_018526	TGT	2	6	1529336	1529341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062176
31121	NC_018526	TAA	2	6	1529394	1529399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062176
31122	NC_018526	GTTATT	2	12	1529478	1529489	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403062177
31123	NC_018526	ACT	2	6	1529535	1529540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062177
31124	NC_018526	AT	3	6	1529590	1529595	50 %	50 %	0 %	0 %	403062177
31125	NC_018526	ATTT	2	8	1529641	1529648	25 %	75 %	0 %	0 %	403062177
31126	NC_018526	GTTG	2	8	1529665	1529672	0 %	50 %	50 %	0 %	403062177
31127	NC_018526	T	6	6	1529705	1529710	0 %	100 %	0 %	0 %	403062177
31128	NC_018526	CTT	2	6	1529887	1529892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062177
31129	NC_018526	CAG	2	6	1529983	1529988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31130	NC_018526	CTA	2	6	1529998	1530003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062177
31131	NC_018526	CCG	2	6	1530058	1530063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062177
31132	NC_018526	TCG	2	6	1530183	1530188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31133	NC_018526	CTT	3	9	1530217	1530225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062177
31134	NC_018526	GAA	2	6	1530228	1530233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062177
31135	NC_018526	CTGTAT	2	12	1530241	1530252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403062177
31136	NC_018526	ATA	2	6	1530291	1530296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062177
31137	NC_018526	TGC	2	6	1530498	1530503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31138	NC_018526	ATT	2	6	1530623	1530628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062177
31139	NC_018526	TTG	2	6	1530694	1530699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062177
31140	NC_018526	CTT	2	6	1530748	1530753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062177
31141	NC_018526	CTT	2	6	1530763	1530768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062177
31142	NC_018526	GTC	2	6	1530798	1530803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31143	NC_018526	A	6	6	1530869	1530874	100 %	0 %	0 %	0 %	403062177
31144	NC_018526	CCAG	2	8	1531026	1531033	25 %	0 %	25 %	50 %	403062177
31145	NC_018526	ATA	2	6	1531046	1531051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062177
31146	NC_018526	GCC	2	6	1531194	1531199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062177
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31148	NC_018526	GAC	2	6	1531218	1531223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31149	NC_018526	TTCAG	2	10	1531272	1531281	20 %	40 %	20 %	20 %	403062177
31150	NC_018526	GCT	2	6	1531291	1531296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062177
31151	NC_018526	CATAA	2	10	1531298	1531307	60 %	20 %	0 %	20 %	403062177
31152	NC_018526	T	6	6	1531382	1531387	0 %	100 %	0 %	0 %	403062177
31153	NC_018526	ATG	2	6	1531413	1531418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062177
31154	NC_018526	CT	4	8	1531528	1531535	0 %	50 %	0 %	50 %	403062177
31155	NC_018526	ATA	2	6	1531569	1531574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062177
31156	NC_018526	A	6	6	1531598	1531603	100 %	0 %	0 %	0 %	403062177
31157	NC_018526	AAG	2	6	1531619	1531624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062177
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31160	NC_018526	T	6	6	1531670	1531675	0 %	100 %	0 %	0 %	403062177
31161	NC_018526	TAT	2	6	1531696	1531701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062177
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31165	NC_018526	GCTT	2	8	1531808	1531815	0 %	50 %	25 %	25 %	403062178
31166	NC_018526	TTGA	2	8	1531852	1531859	25 %	50 %	25 %	0 %	403062178
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31168	NC_018526	CT	3	6	1532041	1532046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31169	NC_018526	GC	3	6	1532089	1532094	0 %	0 %	50 %	50 %	403062179
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31172	NC_018526	CTT	2	6	1532215	1532220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062179
31173	NC_018526	GTT	2	6	1532227	1532232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062179
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31177	NC_018526	CTG	2	6	1532306	1532311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062179
31178	NC_018526	CTG	2	6	1532323	1532328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062179
31179	NC_018526	CTT	3	9	1532390	1532398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062179
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31184	NC_018526	CTGATC	2	12	1532825	1532836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403062179
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31187	NC_018526	TG	3	6	1532975	1532980	0 %	50 %	50 %	0 %	403062179
31188	NC_018526	TAAAA	2	10	1533022	1533031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31189	NC_018526	GTT	2	6	1533033	1533038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31190	NC_018526	A	7	7	1533052	1533058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31191	NC_018526	TA	3	6	1533093	1533098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31192	NC_018526	T	7	7	1533155	1533161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31193	NC_018526	ACA	2	6	1533186	1533191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31194	NC_018526	AGG	2	6	1533259	1533264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31195	NC_018526	ACA	2	6	1533369	1533374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062180
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31197	NC_018526	TCAA	2	8	1533493	1533500	50 %	25 %	0 %	25 %	403062181
31198	NC_018526	CTT	2	6	1533627	1533632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062181
31199	NC_018526	ATC	2	6	1533690	1533695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062181
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31201	NC_018526	AGT	2	6	1533801	1533806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062181
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31204	NC_018526	CTA	2	6	1533906	1533911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062181
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31206	NC_018526	TAC	2	6	1533951	1533956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062181
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31208	NC_018526	CAAA	2	8	1533991	1533998	75 %	0 %	0 %	25 %	403062181
31209	NC_018526	GAA	2	6	1534005	1534010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31210	NC_018526	CTT	2	6	1534171	1534176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062182
31211	NC_018526	GTTC	2	8	1534201	1534208	0 %	50 %	25 %	25 %	403062182
31212	NC_018526	GCT	2	6	1534220	1534225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31213	NC_018526	A	6	6	1534230	1534235	100 %	0 %	0 %	0 %	403062183
31214	NC_018526	AAG	2	6	1534306	1534311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062183
31215	NC_018526	TCC	2	6	1534452	1534457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062183
31216	NC_018526	GTAT	2	8	1534459	1534466	25 %	50 %	25 %	0 %	403062183
31217	NC_018526	AGC	2	6	1534537	1534542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062183
31218	NC_018526	TGT	2	6	1534601	1534606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062183
31219	NC_018526	TGGA	2	8	1534617	1534624	25 %	25 %	50 %	0 %	403062183
31220	NC_018526	ACC	2	6	1534642	1534647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062183
31221	NC_018526	GGT	2	6	1534683	1534688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062183
31222	NC_018526	AGA	2	6	1534775	1534780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062183
31223	NC_018526	CGG	2	6	1534868	1534873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403062183
31224	NC_018526	CTA	2	6	1534886	1534891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062183
31225	NC_018526	CTA	2	6	1534964	1534969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062183
31226	NC_018526	CTT	2	6	1534985	1534990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062183
31227	NC_018526	TAT	2	6	1534994	1534999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062183
31228	NC_018526	GGA	2	6	1535057	1535062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062183
31229	NC_018526	CTC	2	6	1535211	1535216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062183
31230	NC_018526	GGT	2	6	1535220	1535225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062183
31231	NC_018526	ATG	2	6	1535226	1535231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062183
31232	NC_018526	A	6	6	1535301	1535306	100 %	0 %	0 %	0 %	403062183
31233	NC_018526	CAAA	2	8	1535342	1535349	75 %	0 %	0 %	25 %	403062184
31234	NC_018526	T	6	6	1535358	1535363	0 %	100 %	0 %	0 %	403062184
31235	NC_018526	TTC	2	6	1535391	1535396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062184
31236	NC_018526	AGA	3	9	1535483	1535491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062184
31237	NC_018526	TGACCT	2	12	1535536	1535547	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403062184
31238	NC_018526	TCCT	2	8	1535593	1535600	0 %	50 %	0 %	50 %	403062184
31239	NC_018526	TC	3	6	1535697	1535702	0 %	50 %	0 %	50 %	403062185
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31260	NC_018526	TAA	2	6	1536721	1536726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31353	NC_018526	ATG	2	6	1540966	1540971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062191
31354	NC_018526	AGA	2	6	1541055	1541060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062191
31355	NC_018526	AGA	2	6	1541146	1541151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062191
31356	NC_018526	AGTAG	2	10	1541170	1541179	40 %	20 %	40 %	0 %	403062191
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31358	NC_018526	CAT	2	6	1541281	1541286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062191
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31360	NC_018526	TGC	2	6	1541324	1541329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062191
31361	NC_018526	AAT	2	6	1541330	1541335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062191
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31365	NC_018526	TAGG	2	8	1541562	1541569	25 %	25 %	50 %	0 %	403062191
31366	NC_018526	GAC	2	6	1541575	1541580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062191
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31384	NC_018526	T	6	6	1542492	1542497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31385	NC_018526	TTA	2	6	1542536	1542541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403062192
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31407	NC_018526	TCTT	2	8	1543254	1543261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31446	NC_018526	ATGA	2	8	1545658	1545665	50 %	25 %	25 %	0 %	403062195
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31472	NC_018526	AGC	2	6	1546848	1546853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062195
31473	NC_018526	CAT	2	6	1546860	1546865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062195
31474	NC_018526	CCG	3	9	1546895	1546903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062195
31475	NC_018526	CGC	2	6	1546911	1546916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062195
31476	NC_018526	CAT	2	6	1546929	1546934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062195
31477	NC_018526	CAT	2	6	1546953	1546958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062195
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31479	NC_018526	AGAAA	2	10	1546994	1547003	80 %	0 %	20 %	0 %	403062195
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31482	NC_018526	ACT	2	6	1547176	1547181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062196
31483	NC_018526	AAT	2	6	1547304	1547309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062196
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31487	NC_018526	CTA	2	6	1547463	1547468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31491	NC_018526	T	6	6	1547576	1547581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31492	NC_018526	AAC	2	6	1547644	1547649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31493	NC_018526	A	7	7	1547794	1547800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31494	NC_018526	TAT	2	6	1547828	1547833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31499	NC_018526	CGG	2	6	1547976	1547981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403062197
31500	NC_018526	CTC	2	6	1547996	1548001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062197

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