MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_018526	GCT	2	6	1422411	1422416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062061
29003	NC_018526	ACA	2	6	1422447	1422452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062061
29004	NC_018526	AATC	2	8	1422562	1422569	50 %	25 %	0 %	25 %	403062061
29005	NC_018526	ACC	2	6	1422590	1422595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062061
29006	NC_018526	CAA	2	6	1422604	1422609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062061
29007	NC_018526	AGG	2	6	1422630	1422635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062061
29008	NC_018526	TAG	2	6	1422648	1422653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062061
29009	NC_018526	ATA	2	6	1422765	1422770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062061
29010	NC_018526	AAT	2	6	1422836	1422841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062061
29011	NC_018526	CAA	2	6	1422856	1422861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062061
29012	NC_018526	T	6	6	1422867	1422872	0 %	100 %	0 %	0 %	403062061
29013	NC_018526	CAC	2	6	1422874	1422879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062061
29014	NC_018526	CCA	2	6	1422909	1422914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062061
29015	NC_018526	TA	3	6	1423010	1423015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29016	NC_018526	TA	3	6	1423058	1423063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29017	NC_018526	TC	3	6	1423075	1423080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29018	NC_018526	TCA	2	6	1423082	1423087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062062
29019	NC_018526	TC	3	6	1423146	1423151	0 %	50 %	0 %	50 %	403062062
29020	NC_018526	AGA	2	6	1423174	1423179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062062
29021	NC_018526	AAT	2	6	1423323	1423328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062062
29022	NC_018526	TCA	2	6	1423338	1423343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062062
29023	NC_018526	ATA	2	6	1423398	1423403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062062
29024	NC_018526	CATTC	2	10	1423409	1423418	20 %	40 %	0 %	40 %	403062062
29025	NC_018526	AT	3	6	1423432	1423437	50 %	50 %	0 %	0 %	403062062
29026	NC_018526	CTG	2	6	1423486	1423491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062062
29027	NC_018526	TCT	2	6	1423542	1423547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062062
29028	NC_018526	CTTT	2	8	1423656	1423663	0 %	75 %	0 %	25 %	403062062
29029	NC_018526	AGAC	2	8	1423678	1423685	50 %	0 %	25 %	25 %	403062062
29030	NC_018526	ATA	2	6	1423861	1423866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062063
29031	NC_018526	GCT	2	6	1423900	1423905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062063
29032	NC_018526	GCTT	2	8	1423910	1423917	0 %	50 %	25 %	25 %	403062063
29033	NC_018526	CGA	2	6	1424024	1424029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062063
29034	NC_018526	T	6	6	1424032	1424037	0 %	100 %	0 %	0 %	403062063
29035	NC_018526	CCG	2	6	1424104	1424109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403062063
29036	NC_018526	ACC	2	6	1424124	1424129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062063
29037	NC_018526	AGT	2	6	1424216	1424221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062063
29038	NC_018526	ACG	2	6	1424445	1424450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062063
29039	NC_018526	TC	3	6	1424750	1424755	0 %	50 %	0 %	50 %	403062063
29040	NC_018526	AAC	2	6	1424902	1424907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062063
29041	NC_018526	AT	3	6	1424945	1424950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29042	NC_018526	GAA	2	6	1425096	1425101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29043	NC_018526	GTA	2	6	1425117	1425122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29044	NC_018526	TAA	2	6	1425222	1425227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29045	NC_018526	GTT	2	6	1425287	1425292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29046	NC_018526	ACC	2	6	1425354	1425359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062064
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29048	NC_018526	CGCTC	2	10	1425537	1425546	0 %	20 %	20 %	60 %	403062064
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29051	NC_018526	TTG	2	6	1425778	1425783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062064
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29053	NC_018526	CTGTG	2	10	1425839	1425848	0 %	40 %	40 %	20 %	403062065
29054	NC_018526	CAA	2	6	1425856	1425861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062065
29055	NC_018526	GAC	2	6	1425895	1425900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062065
29056	NC_018526	ATTA	2	8	1425938	1425945	50 %	50 %	0 %	0 %	403062065
29057	NC_018526	CCA	2	6	1426030	1426035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062065
29058	NC_018526	CTTG	2	8	1426061	1426068	0 %	50 %	25 %	25 %	403062065
29059	NC_018526	CCAA	2	8	1426075	1426082	50 %	0 %	0 %	50 %	403062065
29060	NC_018526	A	6	6	1426129	1426134	100 %	0 %	0 %	0 %	403062065
29061	NC_018526	CTTC	2	8	1426321	1426328	0 %	50 %	0 %	50 %	403062065
29062	NC_018526	CTTTG	2	10	1426427	1426436	0 %	60 %	20 %	20 %	403062065
29063	NC_018526	A	6	6	1426524	1426529	100 %	0 %	0 %	0 %	403062065
29064	NC_018526	TCAT	2	8	1426536	1426543	25 %	50 %	0 %	25 %	403062065
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29068	NC_018526	GAC	2	6	1427042	1427047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062066
29069	NC_018526	ACG	2	6	1427071	1427076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062066
29070	NC_018526	TCC	2	6	1427316	1427321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062066
29071	NC_018526	GT	3	6	1427378	1427383	0 %	50 %	50 %	0 %	403062066
29072	NC_018526	ACC	2	6	1427445	1427450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062066
29073	NC_018526	ATA	2	6	1427509	1427514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062066
29074	NC_018526	CGT	2	6	1427517	1427522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062066
29075	NC_018526	CCT	2	6	1427585	1427590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29076	NC_018526	TAT	2	6	1427601	1427606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29077	NC_018526	T	7	7	1427623	1427629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29078	NC_018526	AT	3	6	1427662	1427667	50 %	50 %	0 %	0 %	403062067
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29081	NC_018526	GGT	2	6	1428019	1428024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062067
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29088	NC_018526	CAAC	2	8	1428342	1428349	50 %	0 %	0 %	50 %	403062067
29089	NC_018526	CTT	2	6	1428372	1428377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062067
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29092	NC_018526	CTT	2	6	1428569	1428574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062067
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29095	NC_018526	A	7	7	1428729	1428735	100 %	0 %	0 %	0 %	403062068
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29100	NC_018526	GCA	2	6	1429229	1429234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062069
29101	NC_018526	CTGG	2	8	1429236	1429243	0 %	25 %	50 %	25 %	403062069
29102	NC_018526	AACC	2	8	1429245	1429252	50 %	0 %	0 %	50 %	403062069
29103	NC_018526	CTT	2	6	1429396	1429401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062069
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29107	NC_018526	GGACT	2	10	1429607	1429616	20 %	20 %	40 %	20 %	403062069
29108	NC_018526	A	6	6	1429692	1429697	100 %	0 %	0 %	0 %	403062069
29109	NC_018526	TGT	2	6	1429699	1429704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062069
29110	NC_018526	TC	3	6	1429745	1429750	0 %	50 %	0 %	50 %	403062069
29111	NC_018526	ATAG	2	8	1429961	1429968	50 %	25 %	25 %	0 %	403062069
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29114	NC_018526	CGT	2	6	1430149	1430154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062069
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29117	NC_018526	TTG	2	6	1430324	1430329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062069
29118	NC_018526	TCAATC	2	12	1430339	1430350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062069
29119	NC_018526	ACC	2	6	1430549	1430554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062069
29120	NC_018526	CCA	2	6	1430562	1430567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062069
29121	NC_018526	TA	3	6	1430598	1430603	50 %	50 %	0 %	0 %	403062069
29122	NC_018526	TCT	2	6	1430654	1430659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062070
29123	NC_018526	AG	3	6	1430666	1430671	50 %	0 %	50 %	0 %	403062070
29124	NC_018526	TCGCA	2	10	1430798	1430807	20 %	20 %	20 %	40 %	403062070
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29126	NC_018526	CAT	2	6	1430951	1430956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062070
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29130	NC_018526	T	6	6	1431095	1431100	0 %	100 %	0 %	0 %	403062070
29131	NC_018526	ATCA	2	8	1431208	1431215	50 %	25 %	0 %	25 %	403062071
29132	NC_018526	CCA	2	6	1431302	1431307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062071
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29134	NC_018526	T	6	6	1431353	1431358	0 %	100 %	0 %	0 %	403062071
29135	NC_018526	CCATA	2	10	1431375	1431384	40 %	20 %	0 %	40 %	403062071
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29138	NC_018526	TCC	2	6	1431452	1431457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29139	NC_018526	TCT	2	6	1431472	1431477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29140	NC_018526	CAA	2	6	1431715	1431720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062072
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29142	NC_018526	TTGA	2	8	1431764	1431771	25 %	50 %	25 %	0 %	403062072
29143	NC_018526	T	7	7	1431779	1431785	0 %	100 %	0 %	0 %	403062072
29144	NC_018526	TTC	2	6	1431796	1431801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062072
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29147	NC_018526	TTC	2	6	1431904	1431909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062072
29148	NC_018526	ATATG	2	10	1432041	1432050	40 %	40 %	20 %	0 %	403062072
29149	NC_018526	CT	3	6	1432085	1432090	0 %	50 %	0 %	50 %	403062073
29150	NC_018526	TTGG	2	8	1432176	1432183	0 %	50 %	50 %	0 %	403062073
29151	NC_018526	CAC	2	6	1432211	1432216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062073
29152	NC_018526	TC	3	6	1432269	1432274	0 %	50 %	0 %	50 %	403062073
29153	NC_018526	GCG	2	6	1432280	1432285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403062073
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29156	NC_018526	TCT	2	6	1432411	1432416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062073
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29159	NC_018526	ATC	2	6	1432494	1432499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062073
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29180	NC_018526	AGCG	2	8	1433489	1433496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29181	NC_018526	ATG	2	6	1433509	1433514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29183	NC_018526	GAA	2	6	1433622	1433627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062075
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29193	NC_018526	A	7	7	1434160	1434166	100 %	0 %	0 %	0 %	403062076
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29209	NC_018526	CTGGG	2	10	1434916	1434925	0 %	20 %	60 %	20 %	403062077
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29221	NC_018526	GTGTT	2	10	1435470	1435479	0 %	60 %	40 %	0 %	403062077
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29232	NC_018526	AC	3	6	1435872	1435877	50 %	0 %	0 %	50 %	403062077
29233	NC_018526	TGA	2	6	1435987	1435992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062077
29234	NC_018526	CTG	2	6	1436019	1436024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062077
29235	NC_018526	T	6	6	1436026	1436031	0 %	100 %	0 %	0 %	403062077
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29237	NC_018526	TGT	2	6	1436183	1436188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062077
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29242	NC_018526	TGA	2	6	1436448	1436453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062078
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29246	NC_018526	T	9	9	1436557	1436565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29247	NC_018526	GAAAA	2	10	1436566	1436575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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