MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_018526	TCACAA	2	12	1396833	1396844	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403062030
28502	NC_018526	AAT	2	6	1396915	1396920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062030
28503	NC_018526	AAT	2	6	1396930	1396935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062030
28504	NC_018526	CAA	2	6	1397018	1397023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062030
28505	NC_018526	CAA	2	6	1397026	1397031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062030
28506	NC_018526	AAG	2	6	1397043	1397048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062030
28507	NC_018526	CAAA	2	8	1397091	1397098	75 %	0 %	0 %	25 %	403062030
28508	NC_018526	T	6	6	1397180	1397185	0 %	100 %	0 %	0 %	403062030
28509	NC_018526	A	7	7	1397221	1397227	100 %	0 %	0 %	0 %	403062030
28510	NC_018526	CTG	2	6	1397232	1397237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062030
28511	NC_018526	A	6	6	1397314	1397319	100 %	0 %	0 %	0 %	403062030
28512	NC_018526	TCA	2	6	1397348	1397353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062030
28513	NC_018526	CT	3	6	1397508	1397513	0 %	50 %	0 %	50 %	403062031
28514	NC_018526	GAT	2	6	1397556	1397561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062031
28515	NC_018526	AG	3	6	1397608	1397613	50 %	0 %	50 %	0 %	403062031
28516	NC_018526	CTGA	2	8	1397693	1397700	25 %	25 %	25 %	25 %	403062031
28517	NC_018526	TTTC	2	8	1397746	1397753	0 %	75 %	0 %	25 %	403062031
28518	NC_018526	CTC	2	6	1397761	1397766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062032
28519	NC_018526	ATC	2	6	1397767	1397772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062032
28520	NC_018526	A	6	6	1397776	1397781	100 %	0 %	0 %	0 %	403062032
28521	NC_018526	TCT	2	6	1397901	1397906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062032
28522	NC_018526	CCTA	2	8	1397925	1397932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28523	NC_018526	ATAAAA	2	12	1397955	1397966	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28524	NC_018526	TCT	2	6	1397980	1397985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28525	NC_018526	GTTT	2	8	1397993	1398000	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28526	NC_018526	A	8	8	1398073	1398080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28527	NC_018526	ACC	2	6	1398086	1398091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28528	NC_018526	GGT	2	6	1398101	1398106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28529	NC_018526	CCAG	2	8	1398134	1398141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28530	NC_018526	TAC	2	6	1398220	1398225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062033
28531	NC_018526	TA	3	6	1398306	1398311	50 %	50 %	0 %	0 %	403062033
28532	NC_018526	ATA	2	6	1398351	1398356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062033
28533	NC_018526	CAT	2	6	1398417	1398422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062033
28534	NC_018526	GGA	2	6	1398475	1398480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062033
28535	NC_018526	ACT	2	6	1398576	1398581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062033
28536	NC_018526	GAT	2	6	1398597	1398602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062033
28537	NC_018526	T	7	7	1398745	1398751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28538	NC_018526	TCG	2	6	1398762	1398767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28539	NC_018526	GGT	2	6	1398783	1398788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28540	NC_018526	AAT	2	6	1398867	1398872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062034
28541	NC_018526	AGG	2	6	1398916	1398921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062034
28542	NC_018526	CCA	2	6	1398928	1398933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062034
28543	NC_018526	TAGG	2	8	1399046	1399053	25 %	25 %	50 %	0 %	403062034
28544	NC_018526	TTGC	2	8	1399071	1399078	0 %	50 %	25 %	25 %	403062034
28545	NC_018526	GTCTG	2	10	1399088	1399097	0 %	40 %	40 %	20 %	403062034
28546	NC_018526	CAC	2	6	1399185	1399190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062034
28547	NC_018526	A	7	7	1399198	1399204	100 %	0 %	0 %	0 %	403062034
28548	NC_018526	GAA	2	6	1399227	1399232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
28549	NC_018526	GAA	2	6	1399251	1399256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
28550	NC_018526	CGCAT	2	10	1399261	1399270	20 %	20 %	20 %	40 %	403062034
28551	NC_018526	CGTT	2	8	1399295	1399302	0 %	50 %	25 %	25 %	403062034
28552	NC_018526	AT	3	6	1399313	1399318	50 %	50 %	0 %	0 %	403062034
28553	NC_018526	AAG	2	6	1399354	1399359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
28554	NC_018526	CCT	2	6	1399361	1399366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062034
28555	NC_018526	TTC	3	9	1399380	1399388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062034
28556	NC_018526	ATA	2	6	1399413	1399418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062034
28557	NC_018526	AAC	2	6	1399458	1399463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062034
28558	NC_018526	TACT	2	8	1399474	1399481	25 %	50 %	0 %	25 %	403062034
28559	NC_018526	TCA	2	6	1399561	1399566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062034
28560	NC_018526	T	6	6	1399655	1399660	0 %	100 %	0 %	0 %	403062034
28561	NC_018526	ATCC	2	8	1399710	1399717	25 %	25 %	0 %	50 %	403062034
28562	NC_018526	TCT	2	6	1399822	1399827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062034
28563	NC_018526	CTC	2	6	1399845	1399850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062034
28564	NC_018526	TCC	2	6	1399962	1399967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062034
28565	NC_018526	GAAAT	2	10	1400059	1400068	60 %	20 %	20 %	0 %	403062034
28566	NC_018526	TAA	2	6	1400080	1400085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403062034
28567	NC_018526	TGA	2	6	1400120	1400125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062034
28568	NC_018526	AGGT	2	8	1400143	1400150	25 %	25 %	50 %	0 %	403062034
28569	NC_018526	AGA	2	6	1400164	1400169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
28570	NC_018526	ATAAG	2	10	1400243	1400252	60 %	20 %	20 %	0 %	403062034
28571	NC_018526	CTT	2	6	1400301	1400306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062034
28572	NC_018526	TGAG	2	8	1400321	1400328	25 %	25 %	50 %	0 %	403062034
28573	NC_018526	AGAT	2	8	1400386	1400393	50 %	25 %	25 %	0 %	403062034
28574	NC_018526	AGA	2	6	1400474	1400479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
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28577	NC_018526	T	6	6	1400571	1400576	0 %	100 %	0 %	0 %	403062034
28578	NC_018526	GCT	2	6	1400618	1400623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062034
28579	NC_018526	AGA	2	6	1400645	1400650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062034
28580	NC_018526	ATG	2	6	1400653	1400658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062034
28581	NC_018526	TGACC	2	10	1400723	1400732	20 %	20 %	20 %	40 %	403062034
28582	NC_018526	TCA	2	6	1400792	1400797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062034
28583	NC_018526	TAC	2	6	1400870	1400875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062034
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28585	NC_018526	TGA	2	6	1400979	1400984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062035
28586	NC_018526	GCT	2	6	1401008	1401013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062035
28587	NC_018526	T	6	6	1401060	1401065	0 %	100 %	0 %	0 %	403062035
28588	NC_018526	AGA	2	6	1401077	1401082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403062035
28589	NC_018526	CTGG	2	8	1401138	1401145	0 %	25 %	50 %	25 %	403062035
28590	NC_018526	TGA	2	6	1401147	1401152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062035
28591	NC_018526	GCT	3	9	1401174	1401182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062035
28592	NC_018526	ACC	2	6	1401184	1401189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403062035
28593	NC_018526	TCTTG	2	10	1401207	1401216	0 %	60 %	20 %	20 %	403062035
28594	NC_018526	TCATC	2	10	1401264	1401273	20 %	40 %	0 %	40 %	403062035
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28597	NC_018526	AG	3	6	1401582	1401587	50 %	0 %	50 %	0 %	403062035
28598	NC_018526	CTTTT	2	10	1401641	1401650	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28599	NC_018526	A	6	6	1401731	1401736	100 %	0 %	0 %	0 %	403062036
28600	NC_018526	CTT	2	6	1401746	1401751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403062036
28601	NC_018526	GCA	2	6	1401820	1401825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062036
28602	NC_018526	GA	3	6	1401835	1401840	50 %	0 %	50 %	0 %	403062036
28603	NC_018526	CT	3	6	1401922	1401927	0 %	50 %	0 %	50 %	403062036
28604	NC_018526	ATC	2	6	1401960	1401965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062036
28605	NC_018526	CAGC	2	8	1402044	1402051	25 %	0 %	25 %	50 %	403062036
28606	NC_018526	TGAA	2	8	1402108	1402115	50 %	25 %	25 %	0 %	403062036
28607	NC_018526	ATC	2	6	1402182	1402187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062036
28608	NC_018526	AGACC	2	10	1402217	1402226	40 %	0 %	20 %	40 %	403062036
28609	NC_018526	TGA	2	6	1402264	1402269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062036
28610	NC_018526	GGACT	2	10	1402271	1402280	20 %	20 %	40 %	20 %	403062036
28611	NC_018526	TGG	2	6	1402333	1402338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403062036
28612	NC_018526	GTA	2	6	1402350	1402355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062036
28613	NC_018526	TCTG	2	8	1402366	1402373	0 %	50 %	25 %	25 %	403062036
28614	NC_018526	CAA	2	6	1402437	1402442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062036
28615	NC_018526	AGT	2	6	1402461	1402466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403062036
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28617	NC_018526	GAG	2	6	1402533	1402538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062036
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28619	NC_018526	GAG	3	9	1402551	1402559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403062036
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28852	NC_018526	A	6	6	1414633	1414638	100 %	0 %	0 %	0 %	403062050
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28855	NC_018526	TA	3	6	1414804	1414809	50 %	50 %	0 %	0 %	403062051
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28977	NC_018526	T	7	7	1421268	1421274	0 %	100 %	0 %	0 %	403062060
28978	NC_018526	CAAAG	2	10	1421321	1421330	60 %	0 %	20 %	20 %	403062060
28979	NC_018526	ATC	2	6	1421338	1421343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403062060
28980	NC_018526	TCC	2	6	1421431	1421436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403062060
28981	NC_018526	AGCA	2	8	1421543	1421550	50 %	0 %	25 %	25 %	403062060
28982	NC_018526	T	6	6	1421627	1421632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28983	NC_018526	AGT	2	6	1421654	1421659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28984	NC_018526	CT	3	6	1421671	1421676	0 %	50 %	0 %	50 %	403062061
28985	NC_018526	TCAA	2	8	1421682	1421689	50 %	25 %	0 %	25 %	403062061
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28988	NC_018526	CAGT	2	8	1421848	1421855	25 %	25 %	25 %	25 %	403062061
28989	NC_018526	GTT	2	6	1421882	1421887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403062061
28990	NC_018526	CAA	2	6	1421959	1421964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403062061
28991	NC_018526	TGC	2	6	1422009	1422014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403062061
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28995	NC_018526	CAG	3	9	1422196	1422204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403062061
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