MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_018526	ATC	2	6	1324770	1324775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061954
27002	NC_018526	AAC	2	6	1324839	1324844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061954
27003	NC_018526	TCA	2	6	1325011	1325016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061954
27004	NC_018526	TTG	2	6	1325039	1325044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061954
27005	NC_018526	T	8	8	1325126	1325133	0 %	100 %	0 %	0 %	403061954
27006	NC_018526	CAT	2	6	1325144	1325149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061954
27007	NC_018526	GA	3	6	1325186	1325191	50 %	0 %	50 %	0 %	403061954
27008	NC_018526	T	6	6	1325197	1325202	0 %	100 %	0 %	0 %	403061954
27009	NC_018526	TCA	2	6	1325254	1325259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061954
27010	NC_018526	AAAT	2	8	1325279	1325286	75 %	25 %	0 %	0 %	403061954
27011	NC_018526	AAT	2	6	1325292	1325297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061954
27012	NC_018526	GCA	2	6	1325308	1325313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061954
27013	NC_018526	GCT	2	6	1325338	1325343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061954
27014	NC_018526	TAAA	2	8	1325350	1325357	75 %	25 %	0 %	0 %	403061954
27015	NC_018526	GA	3	6	1325373	1325378	50 %	0 %	50 %	0 %	403061954
27016	NC_018526	CAA	2	6	1325417	1325422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061954
27017	NC_018526	ACC	3	9	1325436	1325444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061954
27018	NC_018526	TGC	2	6	1325451	1325456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061954
27019	NC_018526	T	6	6	1325466	1325471	0 %	100 %	0 %	0 %	403061954
27020	NC_018526	TTTGT	2	10	1325549	1325558	0 %	80 %	20 %	0 %	403061954
27021	NC_018526	AACC	2	8	1325749	1325756	50 %	0 %	0 %	50 %	403061954
27022	NC_018526	CAA	2	6	1325801	1325806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061954
27023	NC_018526	CAA	2	6	1325822	1325827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061954
27024	NC_018526	ATA	2	6	1325944	1325949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061954
27025	NC_018526	TGA	2	6	1325964	1325969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061954
27026	NC_018526	TAGC	2	8	1325974	1325981	25 %	25 %	25 %	25 %	403061954
27027	NC_018526	A	6	6	1326001	1326006	100 %	0 %	0 %	0 %	403061954
27028	NC_018526	A	7	7	1326121	1326127	100 %	0 %	0 %	0 %	403061954
27029	NC_018526	A	6	6	1326156	1326161	100 %	0 %	0 %	0 %	403061954
27030	NC_018526	ATTG	2	8	1326175	1326182	25 %	50 %	25 %	0 %	403061954
27031	NC_018526	CCA	2	6	1326244	1326249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061954
27032	NC_018526	GTG	2	6	1326266	1326271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061954
27033	NC_018526	T	6	6	1326318	1326323	0 %	100 %	0 %	0 %	403061954
27034	NC_018526	GAATCA	2	12	1326337	1326348	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403061954
27035	NC_018526	CAT	2	6	1326389	1326394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061954
27036	NC_018526	GAT	2	6	1326402	1326407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061954
27037	NC_018526	T	8	8	1326421	1326428	0 %	100 %	0 %	0 %	403061954
27038	NC_018526	GAA	2	6	1326530	1326535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061954
27039	NC_018526	TCC	2	6	1326546	1326551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403061954
27040	NC_018526	ATA	2	6	1326592	1326597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061954
27041	NC_018526	T	6	6	1326614	1326619	0 %	100 %	0 %	0 %	403061955
27042	NC_018526	CT	3	6	1326724	1326729	0 %	50 %	0 %	50 %	403061955
27043	NC_018526	CTT	2	6	1326736	1326741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061955
27044	NC_018526	CAT	2	6	1326765	1326770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061955
27045	NC_018526	TCA	2	6	1326773	1326778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061955
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27048	NC_018526	TG	3	6	1326824	1326829	0 %	50 %	50 %	0 %	403061955
27049	NC_018526	GTA	2	6	1326838	1326843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061955
27050	NC_018526	TTGA	2	8	1326856	1326863	25 %	50 %	25 %	0 %	403061955
27051	NC_018526	AAT	2	6	1326873	1326878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061955
27052	NC_018526	AAT	2	6	1326886	1326891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061955
27053	NC_018526	GCT	2	6	1326983	1326988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061955
27054	NC_018526	TCA	2	6	1326989	1326994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061955
27055	NC_018526	T	7	7	1327018	1327024	0 %	100 %	0 %	0 %	403061955
27056	NC_018526	ATG	2	6	1327025	1327030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061955
27057	NC_018526	T	6	6	1327039	1327044	0 %	100 %	0 %	0 %	403061955
27058	NC_018526	CTC	2	6	1327057	1327062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403061955
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27061	NC_018526	TCA	2	6	1327172	1327177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061955
27062	NC_018526	TAT	2	6	1327210	1327215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061955
27063	NC_018526	A	6	6	1327298	1327303	100 %	0 %	0 %	0 %	403061955
27064	NC_018526	T	6	6	1327305	1327310	0 %	100 %	0 %	0 %	403061955
27065	NC_018526	GAA	2	6	1327316	1327321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061955
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27068	NC_018526	TTA	2	6	1327391	1327396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061955
27069	NC_018526	TAAAA	2	10	1327461	1327470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27070	NC_018526	AT	3	6	1327494	1327499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27071	NC_018526	ATT	2	6	1327561	1327566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27072	NC_018526	A	6	6	1327585	1327590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27073	NC_018526	TAA	2	6	1327593	1327598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27074	NC_018526	AAT	2	6	1327643	1327648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27075	NC_018526	CTT	2	6	1327668	1327673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27076	NC_018526	T	8	8	1327764	1327771	0 %	100 %	0 %	0 %	403061956
27077	NC_018526	GCA	2	6	1327867	1327872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061956
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27079	NC_018526	GAG	2	6	1328013	1328018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061956
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27084	NC_018526	A	6	6	1328324	1328329	100 %	0 %	0 %	0 %	403061956
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27087	NC_018526	AGCCT	2	10	1328440	1328449	20 %	20 %	20 %	40 %	403061956
27088	NC_018526	GACA	2	8	1328450	1328457	50 %	0 %	25 %	25 %	403061956
27089	NC_018526	TGC	2	6	1328465	1328470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061956
27090	NC_018526	CTG	2	6	1328526	1328531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061956
27091	NC_018526	CTA	2	6	1328537	1328542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061956
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27093	NC_018526	AGCAGG	2	12	1328641	1328652	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403061956
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27099	NC_018526	TTGA	2	8	1328880	1328887	25 %	50 %	25 %	0 %	403061956
27100	NC_018526	ATTG	2	8	1328978	1328985	25 %	50 %	25 %	0 %	403061956
27101	NC_018526	CAT	2	6	1329071	1329076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061956
27102	NC_018526	A	6	6	1329086	1329091	100 %	0 %	0 %	0 %	403061956
27103	NC_018526	ATG	2	6	1329103	1329108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061956
27104	NC_018526	A	6	6	1329129	1329134	100 %	0 %	0 %	0 %	403061956
27105	NC_018526	TCA	2	6	1329181	1329186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061956
27106	NC_018526	AGAC	2	8	1329217	1329224	50 %	0 %	25 %	25 %	403061956
27107	NC_018526	A	6	6	1329297	1329302	100 %	0 %	0 %	0 %	403061956
27108	NC_018526	AGA	2	6	1329352	1329357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061956
27109	NC_018526	ATAAA	2	10	1329382	1329391	80 %	20 %	0 %	0 %	403061956
27110	NC_018526	TCT	2	6	1329452	1329457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061957
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27112	NC_018526	ATC	2	6	1329598	1329603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061957
27113	NC_018526	AGCC	2	8	1329624	1329631	25 %	0 %	25 %	50 %	403061957
27114	NC_018526	CAA	2	6	1329669	1329674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061957
27115	NC_018526	GAC	2	6	1329711	1329716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061957
27116	NC_018526	TTTGAT	2	12	1329790	1329801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403061957
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27118	NC_018526	CAG	2	6	1329936	1329941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061957
27119	NC_018526	TCCA	2	8	1329994	1330001	25 %	25 %	0 %	50 %	403061957
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27212	NC_018526	ATC	2	6	1334823	1334828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061963
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27220	NC_018526	GAT	2	6	1335334	1335339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27230	NC_018526	TGA	2	6	1336005	1336010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061965
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27233	NC_018526	ATG	2	6	1336157	1336162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061965
27234	NC_018526	CAG	2	6	1336185	1336190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061965
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27236	NC_018526	ACC	2	6	1336252	1336257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061965
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27238	NC_018526	CTT	2	6	1336341	1336346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061965
27239	NC_018526	TGAA	2	8	1336347	1336354	50 %	25 %	25 %	0 %	403061965
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27241	NC_018526	ACC	2	6	1336414	1336419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061965
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27248	NC_018526	GTT	2	6	1336654	1336659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061965
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27254	NC_018526	GAAA	2	8	1336962	1336969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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