MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018526	GCA	2	6	729249	729254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15002	NC_018526	ATA	2	6	729346	729351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061375
15003	NC_018526	CAA	2	6	729427	729432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15004	NC_018526	CTG	2	6	729433	729438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15005	NC_018526	TAA	2	6	729542	729547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061375
15006	NC_018526	ATG	3	9	729622	729630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15007	NC_018526	CAA	2	6	729637	729642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15008	NC_018526	TCT	2	6	729750	729755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061375
15009	NC_018526	CAACTA	2	12	729787	729798	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403061375
15010	NC_018526	TAT	2	6	729921	729926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061375
15011	NC_018526	CCTA	2	8	729933	729940	25 %	25 %	0 %	50 %	403061375
15012	NC_018526	CAA	2	6	730006	730011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15013	NC_018526	TA	3	6	730028	730033	50 %	50 %	0 %	0 %	403061375
15014	NC_018526	TA	3	6	730181	730186	50 %	50 %	0 %	0 %	403061375
15015	NC_018526	GAC	2	6	730217	730222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15016	NC_018526	TGA	2	6	730262	730267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15017	NC_018526	TAA	2	6	730286	730291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061375
15018	NC_018526	ACT	2	6	730359	730364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061375
15019	NC_018526	AAAG	2	8	730374	730381	75 %	0 %	25 %	0 %	403061375
15020	NC_018526	TTG	2	6	730402	730407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061375
15021	NC_018526	TAC	2	6	730410	730415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061375
15022	NC_018526	CCAG	2	8	730506	730513	25 %	0 %	25 %	50 %	403061375
15023	NC_018526	TGC	2	6	730520	730525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15024	NC_018526	AAG	2	6	730549	730554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061375
15025	NC_018526	AGT	2	6	730586	730591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15026	NC_018526	CTG	2	6	730789	730794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15027	NC_018526	TTGA	2	8	730833	730840	25 %	50 %	25 %	0 %	403061375
15028	NC_018526	TAA	2	6	730847	730852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061375
15029	NC_018526	CAA	2	6	730873	730878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15030	NC_018526	AAG	2	6	730906	730911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061375
15031	NC_018526	TAC	2	6	731030	731035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061375
15032	NC_018526	ATC	2	6	731058	731063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061375
15033	NC_018526	ACC	2	6	731396	731401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061375
15034	NC_018526	A	6	6	731451	731456	100 %	0 %	0 %	0 %	403061375
15035	NC_018526	TAAC	2	8	731461	731468	50 %	25 %	0 %	25 %	403061375
15036	NC_018526	TGA	2	6	731474	731479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15037	NC_018526	AAG	2	6	731503	731508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061375
15038	NC_018526	CAAA	2	8	731521	731528	75 %	0 %	0 %	25 %	403061375
15039	NC_018526	GTT	3	9	731628	731636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061375
15040	NC_018526	AGA	2	6	731648	731653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061375
15041	NC_018526	ACA	2	6	731725	731730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15042	NC_018526	TAAC	2	8	731869	731876	50 %	25 %	0 %	25 %	403061375
15043	NC_018526	TGA	2	6	731882	731887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15044	NC_018526	AAG	2	6	731911	731916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061375
15045	NC_018526	CAAA	2	8	731929	731936	75 %	0 %	0 %	25 %	403061375
15046	NC_018526	TGA	2	6	732044	732049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15047	NC_018526	ACA	2	6	732084	732089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15048	NC_018526	TGA	2	6	732134	732139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061375
15049	NC_018526	TAA	2	6	732176	732181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061375
15050	NC_018526	CAA	2	6	732184	732189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061375
15051	NC_018526	CGT	3	9	732336	732344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061375
15052	NC_018526	A	6	6	732436	732441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_018526	ACT	2	6	732507	732512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_018526	TG	3	6	732527	732532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_018526	T	7	7	732551	732557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_018526	TTCT	2	8	732569	732576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_018526	T	7	7	732585	732591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_018526	ACAGA	2	10	732695	732704	60 %	0 %	20 %	20 %	403061376
15059	NC_018526	T	6	6	732735	732740	0 %	100 %	0 %	0 %	403061376
15060	NC_018526	CT	3	6	732754	732759	0 %	50 %	0 %	50 %	403061376
15061	NC_018526	CCTG	2	8	732793	732800	0 %	25 %	25 %	50 %	403061376
15062	NC_018526	TGA	2	6	732855	732860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061376
15063	NC_018526	AAG	2	6	732870	732875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
15064	NC_018526	GAT	2	6	732890	732895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061376
15065	NC_018526	TTTC	2	8	732913	732920	0 %	75 %	0 %	25 %	403061376
15066	NC_018526	ACAG	2	8	732970	732977	50 %	0 %	25 %	25 %	403061376
15067	NC_018526	AAG	2	6	733125	733130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
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15069	NC_018526	TGG	2	6	733215	733220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061376
15070	NC_018526	AGA	3	9	733246	733254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
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15074	NC_018526	GTT	2	6	733544	733549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061376
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15081	NC_018526	TCA	2	6	733953	733958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061376
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15089	NC_018526	GCCA	2	8	734276	734283	25 %	0 %	25 %	50 %	403061376
15090	NC_018526	GTCA	2	8	734382	734389	25 %	25 %	25 %	25 %	403061376
15091	NC_018526	AGA	3	9	734428	734436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
15092	NC_018526	GA	3	6	734493	734498	50 %	0 %	50 %	0 %	403061376
15093	NC_018526	AAG	2	6	734504	734509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
15094	NC_018526	TGC	2	6	734515	734520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061376
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15098	NC_018526	AT	3	6	734608	734613	50 %	50 %	0 %	0 %	403061376
15099	NC_018526	A	6	6	734625	734630	100 %	0 %	0 %	0 %	403061376
15100	NC_018526	GAA	2	6	734645	734650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
15101	NC_018526	TTGA	2	8	734714	734721	25 %	50 %	25 %	0 %	403061376
15102	NC_018526	GAA	3	9	734797	734805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
15103	NC_018526	AAC	2	6	734859	734864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061376
15104	NC_018526	GCT	2	6	734882	734887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061376
15105	NC_018526	TTC	2	6	734976	734981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061376
15106	NC_018526	ATCC	3	12	734998	735009	25 %	25 %	0 %	50 %	403061376
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15108	NC_018526	GGA	2	6	735175	735180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061376
15109	NC_018526	ATCA	2	8	735353	735360	50 %	25 %	0 %	25 %	403061376
15110	NC_018526	ATTTGC	2	12	735510	735521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403061376
15111	NC_018526	GAA	2	6	735550	735555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061376
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15113	NC_018526	ACAA	2	8	735714	735721	75 %	0 %	0 %	25 %	403061376
15114	NC_018526	CTGG	2	8	735737	735744	0 %	25 %	50 %	25 %	403061376
15115	NC_018526	AGC	2	6	735795	735800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061376
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15118	NC_018526	AGG	2	6	735898	735903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061376
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15121	NC_018526	GGC	2	6	736158	736163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403061377
15122	NC_018526	GAC	2	6	736215	736220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061377
15123	NC_018526	ACC	2	6	736315	736320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403061377
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15131	NC_018526	TTC	2	6	736814	736819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061377
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15239	NC_018526	GT	3	6	742321	742326	0 %	50 %	50 %	0 %	403061379
15240	NC_018526	AG	3	6	742397	742402	50 %	0 %	50 %	0 %	403061379
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15487	NC_018526	GTACAG	2	12	755356	755367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403061394
15488	NC_018526	TGC	2	6	755412	755417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061394
15489	NC_018526	GAA	2	6	755431	755436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061394
15490	NC_018526	GGT	2	6	755497	755502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061394
15491	NC_018526	A	6	6	755602	755607	100 %	0 %	0 %	0 %	403061394
15492	NC_018526	TGG	2	6	755640	755645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061394
15493	NC_018526	GAA	2	6	755686	755691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061394
15494	NC_018526	TGA	2	6	755720	755725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061394
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