MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018526	T	6	6	47632	47637	0 %	100 %	0 %	0 %	403060741
1002	NC_018526	ACA	2	6	47649	47654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060741
1003	NC_018526	CAC	2	6	47659	47664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060741
1004	NC_018526	TGT	2	6	47684	47689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060741
1005	NC_018526	GTA	2	6	47745	47750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060741
1006	NC_018526	GCTT	2	8	47867	47874	0 %	50 %	25 %	25 %	403060742
1007	NC_018526	CCTA	2	8	47953	47960	25 %	25 %	0 %	50 %	403060742
1008	NC_018526	TAT	2	6	47966	47971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060742
1009	NC_018526	GAAGT	2	10	48048	48057	40 %	20 %	40 %	0 %	403060742
1010	NC_018526	TGA	2	6	48125	48130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060742
1011	NC_018526	TAT	2	6	48146	48151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060742
1012	NC_018526	GAA	2	6	48162	48167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060742
1013	NC_018526	TTATC	2	10	48179	48188	20 %	60 %	0 %	20 %	403060742
1014	NC_018526	GCTA	2	8	48221	48228	25 %	25 %	25 %	25 %	403060742
1015	NC_018526	TC	3	6	48240	48245	0 %	50 %	0 %	50 %	403060742
1016	NC_018526	TTG	2	6	48258	48263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060742
1017	NC_018526	ATT	2	6	48271	48276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060742
1018	NC_018526	TAATC	2	10	48287	48296	40 %	40 %	0 %	20 %	403060742
1019	NC_018526	GGA	2	6	48363	48368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060742
1020	NC_018526	ATG	2	6	48422	48427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060743
1021	NC_018526	TAT	2	6	48438	48443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060743
1022	NC_018526	TC	3	6	48496	48501	0 %	50 %	0 %	50 %	403060743
1023	NC_018526	TTG	3	9	48515	48523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060743
1024	NC_018526	TCAAT	2	10	48546	48555	40 %	40 %	0 %	20 %	403060743
1025	NC_018526	CAG	2	6	48597	48602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060743
1026	NC_018526	CAA	2	6	48612	48617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060743
1027	NC_018526	GAT	2	6	48704	48709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060743
1028	NC_018526	TTG	2	6	48762	48767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060743
1029	NC_018526	TAT	2	6	48776	48781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060743
1030	NC_018526	TTATT	2	10	48799	48808	20 %	80 %	0 %	0 %	403060743
1031	NC_018526	CAG	2	6	48809	48814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060743
1032	NC_018526	AAGA	2	8	48824	48831	75 %	0 %	25 %	0 %	403060743
1033	NC_018526	ATCA	2	8	48855	48862	50 %	25 %	0 %	25 %	403060744
1034	NC_018526	TTG	2	6	48937	48942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060744
1035	NC_018526	A	6	6	48953	48958	100 %	0 %	0 %	0 %	403060744
1036	NC_018526	TGAT	2	8	49084	49091	25 %	50 %	25 %	0 %	403060744
1037	NC_018526	A	6	6	49155	49160	100 %	0 %	0 %	0 %	403060744
1038	NC_018526	AAC	2	6	49252	49257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060744
1039	NC_018526	ATTG	2	8	49349	49356	25 %	50 %	25 %	0 %	403060744
1040	NC_018526	GT	3	6	49639	49644	0 %	50 %	50 %	0 %	403060744
1041	NC_018526	ATTG	2	8	49658	49665	25 %	50 %	25 %	0 %	403060744
1042	NC_018526	GAAA	2	8	49694	49701	75 %	0 %	25 %	0 %	403060744
1043	NC_018526	TTTA	2	8	49808	49815	25 %	75 %	0 %	0 %	403060745
1044	NC_018526	TTG	2	6	49887	49892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060745
1045	NC_018526	ATG	2	6	49904	49909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060745
1046	NC_018526	CAG	2	6	49917	49922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060745
1047	NC_018526	TTC	2	6	49932	49937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060745
1048	NC_018526	AAG	2	6	49980	49985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060745
1049	NC_018526	CAA	2	6	50064	50069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060745
1050	NC_018526	TCT	2	6	50088	50093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060745
1051	NC_018526	AG	3	6	50176	50181	50 %	0 %	50 %	0 %	403060745
1052	NC_018526	TTTG	2	8	50253	50260	0 %	75 %	25 %	0 %	403060745
1053	NC_018526	GAT	3	9	50311	50319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060745
1054	NC_018526	TTG	2	6	50328	50333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060745
1055	NC_018526	GCGA	2	8	50378	50385	25 %	0 %	50 %	25 %	403060745
1056	NC_018526	GCTT	2	8	50404	50411	0 %	50 %	25 %	25 %	403060745
1057	NC_018526	ATT	2	6	50435	50440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060745
1058	NC_018526	TGC	2	6	50464	50469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060745
1059	NC_018526	A	6	6	50471	50476	100 %	0 %	0 %	0 %	403060745
1060	NC_018526	TCG	2	6	50513	50518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060746
1061	NC_018526	GTT	2	6	50523	50528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060746
1062	NC_018526	ATT	2	6	50726	50731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060746
1063	NC_018526	GTA	2	6	50747	50752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1064	NC_018526	CAA	2	6	50770	50775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060746
1065	NC_018526	TTG	2	6	50791	50796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060746
1066	NC_018526	GTT	2	6	50869	50874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060746
1067	NC_018526	TCA	2	6	50882	50887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060746
1068	NC_018526	TTC	2	6	50894	50899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060746
1069	NC_018526	TGA	2	6	50909	50914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1070	NC_018526	ATTT	2	8	50938	50945	25 %	75 %	0 %	0 %	403060746
1071	NC_018526	TCT	2	6	50984	50989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060746
1072	NC_018526	TGT	2	6	50999	51004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060746
1073	NC_018526	TAC	2	6	51043	51048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060746
1074	NC_018526	TAG	2	6	51081	51086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1075	NC_018526	TGA	2	6	51116	51121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1076	NC_018526	GA	3	6	51152	51157	50 %	0 %	50 %	0 %	403060746
1077	NC_018526	TAG	2	6	51234	51239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1078	NC_018526	TAT	2	6	51255	51260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060746
1079	NC_018526	TGA	2	6	51302	51307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1080	NC_018526	ATG	2	6	51340	51345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1081	NC_018526	TGAT	2	8	51350	51357	25 %	50 %	25 %	0 %	403060746
1082	NC_018526	TGC	2	6	51372	51377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060746
1083	NC_018526	GAA	2	6	51448	51453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060746
1084	NC_018526	GTTG	2	8	51468	51475	0 %	50 %	50 %	0 %	403060746
1085	NC_018526	TGC	2	6	51477	51482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060746
1086	NC_018526	TTG	2	6	51578	51583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060746
1087	NC_018526	TGA	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1088	NC_018526	CAA	2	6	51667	51672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060746
1089	NC_018526	GATT	2	8	51707	51714	25 %	50 %	25 %	0 %	403060746
1090	NC_018526	CT	3	6	51737	51742	0 %	50 %	0 %	50 %	403060746
1091	NC_018526	TAG	2	6	51842	51847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060746
1092	NC_018526	AAC	2	6	51914	51919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060746
1093	NC_018526	ATTT	2	8	51958	51965	25 %	75 %	0 %	0 %	403060746
1094	NC_018526	TCA	2	6	52140	52145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060746
1095	NC_018526	CAG	2	6	52147	52152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060746
1096	NC_018526	GA	3	6	52159	52164	50 %	0 %	50 %	0 %	403060746
1097	NC_018526	ATC	2	6	52166	52171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060746
1098	NC_018526	GACC	2	8	52229	52236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_018526	AGTCTA	2	12	52237	52248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1100	NC_018526	TAA	3	9	52257	52265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018526	TGA	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018526	ATAG	2	8	52297	52304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018526	GAGAA	2	10	52305	52314	60 %	0 %	40 %	0 %	403060747
1104	NC_018526	AAAC	2	8	52317	52324	75 %	0 %	0 %	25 %	403060747
1105	NC_018526	GGA	2	6	52344	52349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060747
1106	NC_018526	AG	3	6	52356	52361	50 %	0 %	50 %	0 %	403060747
1107	NC_018526	GAA	2	6	52383	52388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060747
1108	NC_018526	AT	3	6	52400	52405	50 %	50 %	0 %	0 %	403060747
1109	NC_018526	GAA	2	6	52439	52444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060747
1110	NC_018526	GAG	2	6	52479	52484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060747
1111	NC_018526	GAAT	2	8	52537	52544	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018526	TA	3	6	52715	52720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018526	TGA	2	6	52928	52933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060748
1114	NC_018526	ACC	2	6	52980	52985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060748
1115	NC_018526	TGG	2	6	53065	53070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060748
1116	NC_018526	GAG	2	6	53142	53147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060748
1117	NC_018526	CAT	2	6	53183	53188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060748
1118	NC_018526	GCC	2	6	53231	53236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403060748
1119	NC_018526	CGG	2	6	53362	53367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060748
1120	NC_018526	GCT	2	6	53397	53402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060748
1121	NC_018526	TCG	2	6	53414	53419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060748
1122	NC_018526	AGA	2	6	53572	53577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060748
1123	NC_018526	GAG	2	6	53649	53654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060748
1124	NC_018526	GGA	2	6	53666	53671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060748
1125	NC_018526	CAG	2	6	53694	53699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060748
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1127	NC_018526	GCAGA	2	10	53786	53795	40 %	0 %	40 %	20 %	403060749
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1253	NC_018526	ATA	2	6	60875	60880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_018526	GGA	2	6	61237	61242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060755
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1260	NC_018526	AGTC	2	8	61324	61331	25 %	25 %	25 %	25 %	403060755
1261	NC_018526	TATT	2	8	61370	61377	25 %	75 %	0 %	0 %	403060755
1262	NC_018526	GT	3	6	61439	61444	0 %	50 %	50 %	0 %	403060755
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1265	NC_018526	ATT	2	6	61623	61628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
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1270	NC_018526	TTTC	2	8	61835	61842	0 %	75 %	0 %	25 %	403060755
1271	NC_018526	TAT	2	6	61877	61882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060755
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1273	NC_018526	TTC	2	6	61946	61951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060755
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1283	NC_018526	CTG	2	6	62222	62227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060755
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1323	NC_018526	TCAA	2	8	64240	64247	50 %	25 %	0 %	25 %	403060757
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