MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018526	TGC	2	6	682468	682473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061331
14002	NC_018526	CAGT	2	8	682497	682504	25 %	25 %	25 %	25 %	403061331
14003	NC_018526	TGA	2	6	682711	682716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061331
14004	NC_018526	GAAA	2	8	682719	682726	75 %	0 %	25 %	0 %	403061331
14005	NC_018526	AGATA	2	10	682765	682774	60 %	20 %	20 %	0 %	403061331
14006	NC_018526	ATC	2	6	682779	682784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061331
14007	NC_018526	CACG	2	8	682835	682842	25 %	0 %	25 %	50 %	403061331
14008	NC_018526	CGA	2	6	682911	682916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061331
14009	NC_018526	TTCT	2	8	682950	682957	0 %	75 %	0 %	25 %	403061331
14010	NC_018526	GAG	2	6	682970	682975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061331
14011	NC_018526	AGC	2	6	683005	683010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061331
14012	NC_018526	GTCGA	2	10	683025	683034	20 %	20 %	40 %	20 %	403061331
14013	NC_018526	A	7	7	683037	683043	100 %	0 %	0 %	0 %	403061331
14014	NC_018526	GAC	2	6	683065	683070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061331
14015	NC_018526	CTG	2	6	683116	683121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061331
14016	NC_018526	GGA	2	6	683155	683160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061331
14017	NC_018526	GAT	2	6	683192	683197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061331
14018	NC_018526	AAG	2	6	683202	683207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061331
14019	NC_018526	GGA	2	6	683236	683241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061331
14020	NC_018526	TCA	2	6	683284	683289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061331
14021	NC_018526	GAAC	2	8	683303	683310	50 %	0 %	25 %	25 %	403061331
14022	NC_018526	ATG	2	6	683337	683342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061331
14023	NC_018526	AG	3	6	683365	683370	50 %	0 %	50 %	0 %	403061331
14024	NC_018526	GGT	2	6	683388	683393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_018526	T	6	6	683401	683406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_018526	A	6	6	683412	683417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_018526	AAAT	2	8	683433	683440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_018526	AT	3	6	683463	683468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_018526	ATGAT	2	10	683487	683496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_018526	TTAC	2	8	683497	683504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14031	NC_018526	GAAA	2	8	683505	683512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_018526	TAA	2	6	683515	683520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_018526	GGA	2	6	683540	683545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_018526	GAAATG	2	12	683550	683561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403061332
14035	NC_018526	TTG	2	6	683563	683568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061332
14036	NC_018526	GATT	2	8	683587	683594	25 %	50 %	25 %	0 %	403061332
14037	NC_018526	GAA	2	6	683655	683660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061332
14038	NC_018526	GAGC	2	8	683661	683668	25 %	0 %	50 %	25 %	403061332
14039	NC_018526	AGA	2	6	683669	683674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061332
14040	NC_018526	GCA	2	6	683694	683699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061332
14041	NC_018526	TTA	2	6	683700	683705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061332
14042	NC_018526	TGG	2	6	683747	683752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061332
14043	NC_018526	TGA	2	6	683800	683805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061332
14044	NC_018526	A	7	7	683861	683867	100 %	0 %	0 %	0 %	403061332
14045	NC_018526	A	7	7	683880	683886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_018526	AGG	2	6	683895	683900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_018526	ACA	2	6	683964	683969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061333
14048	NC_018526	GCA	3	9	683978	683986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061333
14049	NC_018526	TGA	2	6	684115	684120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061333
14050	NC_018526	A	6	6	684176	684181	100 %	0 %	0 %	0 %	403061333
14051	NC_018526	TTC	2	6	684183	684188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061333
14052	NC_018526	A	6	6	684246	684251	100 %	0 %	0 %	0 %	403061334
14053	NC_018526	ATC	2	6	684290	684295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061334
14054	NC_018526	AGT	2	6	684334	684339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061334
14055	NC_018526	GTA	2	6	684342	684347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061334
14056	NC_018526	ATC	2	6	684574	684579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061334
14057	NC_018526	TGG	2	6	684634	684639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061334
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14059	NC_018526	CTAT	2	8	684684	684691	25 %	50 %	0 %	25 %	403061334
14060	NC_018526	CTAT	2	8	684797	684804	25 %	50 %	0 %	25 %	403061334
14061	NC_018526	GGT	2	6	684839	684844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061334
14062	NC_018526	CATT	2	8	684846	684853	25 %	50 %	0 %	25 %	403061334
14063	NC_018526	TTC	2	6	684929	684934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061334
14064	NC_018526	TCCT	2	8	684938	684945	0 %	50 %	0 %	50 %	403061334
14065	NC_018526	TGG	2	6	684947	684952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061334
14066	NC_018526	CAGT	2	8	684968	684975	25 %	25 %	25 %	25 %	403061334
14067	NC_018526	AGC	2	6	685036	685041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061334
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14069	NC_018526	TCAGGT	2	12	685112	685123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403061334
14070	NC_018526	GTC	2	6	685232	685237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061334
14071	NC_018526	TGA	2	6	685254	685259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061334
14072	NC_018526	TGG	2	6	685401	685406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061334
14073	NC_018526	GTT	2	6	685424	685429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061334
14074	NC_018526	ATT	2	6	685436	685441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061334
14075	NC_018526	TTC	2	6	685472	685477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061334
14076	NC_018526	AAGAT	2	10	685485	685494	60 %	20 %	20 %	0 %	403061334
14077	NC_018526	ATG	2	6	685532	685537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_018526	GAAA	2	8	685662	685669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_018526	CTGA	2	8	685737	685744	25 %	25 %	25 %	25 %	403061335
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14081	NC_018526	AAG	2	6	685779	685784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
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14083	NC_018526	AG	3	6	685839	685844	50 %	0 %	50 %	0 %	403061335
14084	NC_018526	GAA	3	9	685911	685919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
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14087	NC_018526	GGGATG	2	12	686023	686034	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	403061335
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14092	NC_018526	CTT	2	6	686162	686167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061335
14093	NC_018526	GAG	2	6	686253	686258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061335
14094	NC_018526	ATC	2	6	686340	686345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061335
14095	NC_018526	ACT	2	6	686435	686440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061335
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14097	NC_018526	TCG	2	6	686641	686646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061335
14098	NC_018526	TAAC	2	8	686653	686660	50 %	25 %	0 %	25 %	403061335
14099	NC_018526	CAA	2	6	686684	686689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061335
14100	NC_018526	CTG	2	6	686719	686724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061335
14101	NC_018526	TGG	2	6	686753	686758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061335
14102	NC_018526	AAG	2	6	686772	686777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
14103	NC_018526	CTTA	2	8	686797	686804	25 %	50 %	0 %	25 %	403061335
14104	NC_018526	AC	3	6	686826	686831	50 %	0 %	0 %	50 %	403061335
14105	NC_018526	ATGA	2	8	686886	686893	50 %	25 %	25 %	0 %	403061335
14106	NC_018526	TGCC	2	8	686926	686933	0 %	25 %	25 %	50 %	403061335
14107	NC_018526	AAC	2	6	686937	686942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061335
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14111	NC_018526	AAG	2	6	687340	687345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
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14114	NC_018526	GAA	2	6	687435	687440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
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14117	NC_018526	GAT	3	9	687552	687560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061335
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14119	NC_018526	TGG	2	6	687650	687655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061335
14120	NC_018526	CAT	2	6	687673	687678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061335
14121	NC_018526	GTT	2	6	687760	687765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061335
14122	NC_018526	ATA	2	6	687775	687780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061335
14123	NC_018526	TTG	2	6	687841	687846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061335
14124	NC_018526	AGA	3	9	687893	687901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061335
14125	NC_018526	CAAA	2	8	687902	687909	75 %	0 %	0 %	25 %	403061335
14126	NC_018526	AATT	2	8	687910	687917	50 %	50 %	0 %	0 %	403061335
14127	NC_018526	TGT	2	6	687971	687976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061335
14128	NC_018526	TTGA	2	8	687990	687997	25 %	50 %	25 %	0 %	403061335
14129	NC_018526	TGATT	2	10	688025	688034	20 %	60 %	20 %	0 %	403061335
14130	NC_018526	TTC	2	6	688059	688064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061335
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14132	NC_018526	ACAT	2	8	688112	688119	50 %	25 %	0 %	25 %	403061335
14133	NC_018526	TTA	3	9	688131	688139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061336
14134	NC_018526	AAG	2	6	688239	688244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061336
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14136	NC_018526	CAT	2	6	688285	688290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061336
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14138	NC_018526	CTG	2	6	688413	688418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061336
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14143	NC_018526	AGC	2	6	688720	688725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061336
14144	NC_018526	CCAT	2	8	688736	688743	25 %	25 %	0 %	50 %	403061336
14145	NC_018526	GAT	2	6	688769	688774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061336
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14147	NC_018526	G	6	6	688829	688834	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14148	NC_018526	ATC	2	6	688879	688884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061337
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14151	NC_018526	ATT	2	6	689094	689099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061337
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14153	NC_018526	TCCA	2	8	689250	689257	25 %	25 %	0 %	50 %	403061337
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14170	NC_018526	TTA	2	6	689870	689875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14171	NC_018526	CTAT	2	8	689888	689895	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14172	NC_018526	AGG	2	6	689903	689908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14199	NC_018526	A	6	6	691106	691111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14221	NC_018526	TTA	2	6	692258	692263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14222	NC_018526	T	6	6	692295	692300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14223	NC_018526	CAA	2	6	692303	692308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14224	NC_018526	AG	3	6	692315	692320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14225	NC_018526	ATT	2	6	692358	692363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061340
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14228	NC_018526	TGT	2	6	692437	692442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061340
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14230	NC_018526	TTA	2	6	692463	692468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061340
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14232	NC_018526	AC	3	6	692499	692504	50 %	0 %	0 %	50 %	403061340
14233	NC_018526	GAA	2	6	692508	692513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061340
14234	NC_018526	A	6	6	692536	692541	100 %	0 %	0 %	0 %	403061340
14235	NC_018526	CG	3	6	692590	692595	0 %	0 %	50 %	50 %	403061340
14236	NC_018526	GGC	2	6	692621	692626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403061340
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14238	NC_018526	TAC	2	6	692664	692669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061340
14239	NC_018526	GTCGT	2	10	692758	692767	0 %	40 %	40 %	20 %	403061340
14240	NC_018526	CAT	2	6	692816	692821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061340
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14242	NC_018526	CTT	2	6	692885	692890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061340
14243	NC_018526	TGA	2	6	692978	692983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061340
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14365	NC_018526	GAT	2	6	698864	698869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061345
14366	NC_018526	TCG	2	6	698889	698894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061345
14367	NC_018526	TCA	2	6	698943	698948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061345
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14369	NC_018526	TGA	2	6	698968	698973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061345
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14395	NC_018526	AGA	2	6	700436	700441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061346
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14400	NC_018526	ATC	2	6	700761	700766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061346
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14402	NC_018526	T	6	6	700801	700806	0 %	100 %	0 %	0 %	403061346
14403	NC_018526	A	6	6	700807	700812	100 %	0 %	0 %	0 %	403061346
14404	NC_018526	T	6	6	700845	700850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14405	NC_018526	AAT	2	6	700893	700898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14428	NC_018526	TTG	2	6	702218	702223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061349
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14431	NC_018526	TCG	2	6	702345	702350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061349
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14470	NC_018526	TTG	2	6	704515	704520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061351
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14473	NC_018526	AAAG	2	8	704618	704625	75 %	0 %	25 %	0 %	403061351
14474	NC_018526	GAA	2	6	704640	704645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061351
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14476	NC_018526	TA	3	6	704858	704863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14477	NC_018526	A	7	7	704907	704913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14478	NC_018526	T	6	6	704932	704937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14479	NC_018526	A	7	7	704975	704981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14480	NC_018526	GTT	2	6	705022	705027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061352
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14485	NC_018526	AAG	2	6	705386	705391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061352
14486	NC_018526	CAG	2	6	705452	705457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061352
14487	NC_018526	GTT	2	6	705502	705507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061352
14488	NC_018526	GTAAAG	2	12	705551	705562	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403061352
14489	NC_018526	AGT	2	6	705564	705569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061352
14490	NC_018526	TGT	2	6	705579	705584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061352
14491	NC_018526	AAG	2	6	705686	705691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061352
14492	NC_018526	TGGTAA	2	12	705696	705707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061352
14493	NC_018526	ATC	2	6	705718	705723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061352
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14497	NC_018526	GTAC	2	8	705949	705956	25 %	25 %	25 %	25 %	403061352
14498	NC_018526	AGC	2	6	705966	705971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061352
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14500	NC_018526	GCT	2	6	706099	706104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061352

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