MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_018526	AGA	2	6	632262	632267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061281
13003	NC_018526	A	6	6	632267	632272	100 %	0 %	0 %	0 %	403061281
13004	NC_018526	GCGG	2	8	632343	632350	0 %	0 %	75 %	25 %	403061281
13005	NC_018526	CAA	2	6	632406	632411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061281
13006	NC_018526	TG	3	6	632637	632642	0 %	50 %	50 %	0 %	403061282
13007	NC_018526	TCAG	2	8	632686	632693	25 %	25 %	25 %	25 %	403061282
13008	NC_018526	GAC	2	6	632707	632712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061282
13009	NC_018526	AGG	2	6	632817	632822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061282
13010	NC_018526	AAG	2	6	632978	632983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061282
13011	NC_018526	AGGC	2	8	633035	633042	25 %	0 %	50 %	25 %	403061282
13012	NC_018526	TTTG	2	8	633100	633107	0 %	75 %	25 %	0 %	403061282
13013	NC_018526	TCAT	2	8	633162	633169	25 %	50 %	0 %	25 %	403061282
13014	NC_018526	TTG	2	6	633227	633232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061282
13015	NC_018526	GGT	2	6	633319	633324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061282
13016	NC_018526	A	6	6	633339	633344	100 %	0 %	0 %	0 %	403061282
13017	NC_018526	TCTG	2	8	633399	633406	0 %	50 %	25 %	25 %	403061282
13018	NC_018526	CAG	2	6	633432	633437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061282
13019	NC_018526	GAG	2	6	633438	633443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061282
13020	NC_018526	CTAT	2	8	633587	633594	25 %	50 %	0 %	25 %	403061282
13021	NC_018526	GTCA	2	8	633649	633656	25 %	25 %	25 %	25 %	403061282
13022	NC_018526	CTT	2	6	633811	633816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061282
13023	NC_018526	GAAA	2	8	633837	633844	75 %	0 %	25 %	0 %	403061282
13024	NC_018526	TCA	2	6	633885	633890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061282
13025	NC_018526	TGAT	2	8	633981	633988	25 %	50 %	25 %	0 %	403061282
13026	NC_018526	GGCA	2	8	634041	634048	25 %	0 %	50 %	25 %	403061282
13027	NC_018526	TGTCG	2	10	634186	634195	0 %	40 %	40 %	20 %	403061282
13028	NC_018526	A	7	7	634235	634241	100 %	0 %	0 %	0 %	403061282
13029	NC_018526	AAT	2	6	634340	634345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061282
13030	NC_018526	TTG	2	6	634370	634375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061282
13031	NC_018526	AACT	2	8	634378	634385	50 %	25 %	0 %	25 %	403061282
13032	NC_018526	CCTG	2	8	634444	634451	0 %	25 %	25 %	50 %	403061282
13033	NC_018526	CTT	2	6	634491	634496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061282
13034	NC_018526	CTG	2	6	634542	634547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061282
13035	NC_018526	AAC	2	6	634553	634558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061282
13036	NC_018526	GAG	2	6	634684	634689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403061282
13037	NC_018526	TAC	2	6	634778	634783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061283
13038	NC_018526	TGC	2	6	634814	634819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061283
13039	NC_018526	TCAG	2	8	634870	634877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13040	NC_018526	TAA	2	6	634984	634989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_018526	AGG	2	6	635005	635010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_018526	GTT	2	6	635048	635053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061284
13043	NC_018526	GTTG	2	8	635143	635150	0 %	50 %	50 %	0 %	403061284
13044	NC_018526	CTAT	2	8	635204	635211	25 %	50 %	0 %	25 %	403061284
13045	NC_018526	TGA	2	6	635256	635261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061284
13046	NC_018526	TGC	2	6	635305	635310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061284
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13049	NC_018526	TTC	2	6	635406	635411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403061284
13050	NC_018526	GAA	2	6	635429	635434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061284
13051	NC_018526	TTG	2	6	635454	635459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061284
13052	NC_018526	A	6	6	635481	635486	100 %	0 %	0 %	0 %	403061284
13053	NC_018526	TGG	2	6	635496	635501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061284
13054	NC_018526	GAA	2	6	635597	635602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061284
13055	NC_018526	T	7	7	635692	635698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_018526	ATA	2	6	635736	635741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_018526	TG	3	6	635752	635757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_018526	AGG	2	6	635758	635763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_018526	AAT	2	6	635807	635812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061285
13060	NC_018526	CCT	2	6	635827	635832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403061285
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13062	NC_018526	T	6	6	635932	635937	0 %	100 %	0 %	0 %	403061285
13063	NC_018526	CTAT	2	8	635975	635982	25 %	50 %	0 %	25 %	403061285
13064	NC_018526	TGG	2	6	636015	636020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061285
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13067	NC_018526	A	7	7	636195	636201	100 %	0 %	0 %	0 %	403061285
13068	NC_018526	AC	3	6	636207	636212	50 %	0 %	0 %	50 %	403061285
13069	NC_018526	TGG	2	6	636223	636228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403061285
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13071	NC_018526	GAA	2	6	636356	636361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061285
13072	NC_018526	A	6	6	636428	636433	100 %	0 %	0 %	0 %	403061285
13073	NC_018526	ATT	2	6	636444	636449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061285
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13080	NC_018526	TAA	2	6	636636	636641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061286
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13082	NC_018526	TCTT	2	8	636712	636719	0 %	75 %	0 %	25 %	403061286
13083	NC_018526	AAC	2	6	636737	636742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061286
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13088	NC_018526	CTG	2	6	636968	636973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061286
13089	NC_018526	AGAAA	2	10	636978	636987	80 %	0 %	20 %	0 %	403061286
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13093	NC_018526	ATA	2	6	637154	637159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403061286
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13096	NC_018526	AAC	3	9	637337	637345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403061286
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13105	NC_018526	ATT	2	6	637690	637695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403061286
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13107	NC_018526	CAG	2	6	637754	637759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061286
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13109	NC_018526	TGC	2	6	637803	637808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061286
13110	NC_018526	AAG	2	6	637826	637831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061286
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13112	NC_018526	GTTT	2	8	637903	637910	0 %	75 %	25 %	0 %	403061287
13113	NC_018526	T	6	6	637927	637932	0 %	100 %	0 %	0 %	403061287
13114	NC_018526	TA	3	6	638046	638051	50 %	50 %	0 %	0 %	403061287
13115	NC_018526	CAAT	2	8	638132	638139	50 %	25 %	0 %	25 %	403061287
13116	NC_018526	CAT	2	6	638242	638247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403061287
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13121	NC_018526	TTG	2	6	638470	638475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403061287
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13132	NC_018526	GAAT	2	8	638875	638882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13247	NC_018526	A	7	7	643648	643654	100 %	0 %	0 %	0 %	403061293
13248	NC_018526	A	6	6	643710	643715	100 %	0 %	0 %	0 %	403061293
13249	NC_018526	AGCG	2	8	643727	643734	25 %	0 %	50 %	25 %	403061293
13250	NC_018526	GAC	2	6	643760	643765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061293
13251	NC_018526	TAAT	2	8	643783	643790	50 %	50 %	0 %	0 %	403061293
13252	NC_018526	AAAG	2	8	643796	643803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13253	NC_018526	GGC	2	6	643808	643813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13254	NC_018526	AAAT	2	8	643837	643844	75 %	25 %	0 %	0 %	403061294
13255	NC_018526	CGTA	2	8	643854	643861	25 %	25 %	25 %	25 %	403061294
13256	NC_018526	ATCA	2	8	643873	643880	50 %	25 %	0 %	25 %	403061294
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13282	NC_018526	TCCCA	2	10	645162	645171	20 %	20 %	0 %	60 %	403061295
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13320	NC_018526	TA	3	6	646810	646815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13343	NC_018526	GTTGGG	2	12	648255	648266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13350	NC_018526	ATATT	2	10	648738	648747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13351	NC_018526	TCA	2	6	648778	648783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13353	NC_018526	AAG	2	6	648832	648837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_018526	ACA	2	6	648973	648978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13355	NC_018526	CTG	2	6	649043	649048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13368	NC_018526	A	7	7	649791	649797	100 %	0 %	0 %	0 %	403061299
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13370	NC_018526	TTGAT	2	10	649844	649853	20 %	60 %	20 %	0 %	403061299
13371	NC_018526	GCA	2	6	649909	649914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403061299
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13376	NC_018526	GCTG	3	12	650077	650088	0 %	25 %	50 %	25 %	403061299
13377	NC_018526	CTG	2	6	650108	650113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403061299
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13379	NC_018526	TAG	2	6	650354	650359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061299
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13395	NC_018526	T	7	7	651206	651212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13396	NC_018526	AAT	2	6	651218	651223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13398	NC_018526	AT	4	8	651250	651257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13399	NC_018526	AT	3	6	651269	651274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13422	NC_018526	TGA	3	9	652362	652370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061302
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13427	NC_018526	CTAT	2	8	652451	652458	25 %	50 %	0 %	25 %	403061302
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13436	NC_018526	AGT	2	6	652808	652813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061302
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13455	NC_018526	TGA	2	6	653617	653622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403061303
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13467	NC_018526	AGA	2	6	654150	654155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13469	NC_018526	AGA	2	6	654332	654337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403061304
13470	NC_018526	ATCT	2	8	654351	654358	25 %	50 %	0 %	25 %	403061304
13471	NC_018526	ACCT	2	8	654462	654469	25 %	25 %	0 %	50 %	403061304
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13481	NC_018526	GA	3	6	654807	654812	50 %	0 %	50 %	0 %	403061304
13482	NC_018526	A	7	7	654894	654900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13483	NC_018526	TAGAA	2	10	654929	654938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13484	NC_018526	TCA	2	6	655019	655024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13485	NC_018526	A	6	6	655024	655029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13486	NC_018526	GTT	2	6	655092	655097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13487	NC_018526	GCAAA	2	10	655144	655153	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13488	NC_018526	CAG	2	6	655157	655162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13489	NC_018526	G	6	6	655262	655267	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13490	NC_018526	CAA	2	6	655305	655310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13491	NC_018526	TTG	2	6	655325	655330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13493	NC_018526	TGTC	2	8	655469	655476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13494	NC_018526	ATTT	2	8	655533	655540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13499	NC_018526	CAT	2	6	655778	655783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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