MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018526	GTG	2	6	23983	23988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060720
502	NC_018526	TGG	2	6	24017	24022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060720
503	NC_018526	CGG	2	6	24058	24063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060720
504	NC_018526	ATG	2	6	24157	24162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060720
505	NC_018526	TGA	2	6	24203	24208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060720
506	NC_018526	TGT	2	6	24227	24232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060720
507	NC_018526	CAAA	2	8	24381	24388	75 %	0 %	0 %	25 %	403060720
508	NC_018526	TTTAT	2	10	24433	24442	20 %	80 %	0 %	0 %	403060721
509	NC_018526	GGTC	2	8	24479	24486	0 %	25 %	50 %	25 %	403060721
510	NC_018526	ATT	2	6	24489	24494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060721
511	NC_018526	T	6	6	24530	24535	0 %	100 %	0 %	0 %	403060721
512	NC_018526	ATT	2	6	24564	24569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060721
513	NC_018526	CTA	2	6	24629	24634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060721
514	NC_018526	TCT	2	6	24668	24673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060721
515	NC_018526	TAG	2	6	24719	24724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060721
516	NC_018526	TTA	2	6	24743	24748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060721
517	NC_018526	TAA	2	6	24807	24812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060721
518	NC_018526	ATT	2	6	24864	24869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060721
519	NC_018526	AACA	2	8	24888	24895	75 %	0 %	0 %	25 %	403060721
520	NC_018526	TAA	2	6	24909	24914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018526	T	7	7	24936	24942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018526	GA	3	6	24951	24956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018526	GAG	2	6	24970	24975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018526	GAA	2	6	24990	24995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060722
525	NC_018526	A	7	7	24994	25000	100 %	0 %	0 %	0 %	403060722
526	NC_018526	TCTA	2	8	25032	25039	25 %	50 %	0 %	25 %	403060722
527	NC_018526	ATG	2	6	25070	25075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060722
528	NC_018526	CAA	2	6	25091	25096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
529	NC_018526	A	6	6	25095	25100	100 %	0 %	0 %	0 %	403060722
530	NC_018526	CAA	2	6	25126	25131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
531	NC_018526	CAA	3	9	25141	25149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
532	NC_018526	AGA	2	6	25206	25211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060722
533	NC_018526	GGC	2	6	25245	25250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060722
534	NC_018526	ATCA	2	8	25371	25378	50 %	25 %	0 %	25 %	403060722
535	NC_018526	AATGC	2	10	25399	25408	40 %	20 %	20 %	20 %	403060722
536	NC_018526	ATT	2	6	25414	25419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060722
537	NC_018526	TAA	2	6	25425	25430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060722
538	NC_018526	AAC	2	6	25442	25447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
539	NC_018526	TTG	2	6	25469	25474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060722
540	NC_018526	ACT	2	6	25504	25509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060722
541	NC_018526	GCT	2	6	25579	25584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060722
542	NC_018526	CTG	2	6	25613	25618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060722
543	NC_018526	TTG	2	6	25636	25641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060722
544	NC_018526	AGA	2	6	25659	25664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060722
545	NC_018526	AGC	2	6	25665	25670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060722
546	NC_018526	CAA	2	6	25729	25734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
547	NC_018526	TAG	2	6	25769	25774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060722
548	NC_018526	CAT	2	6	25859	25864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060722
549	NC_018526	GCA	2	6	25885	25890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060722
550	NC_018526	AAT	2	6	25891	25896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060722
551	NC_018526	GGT	2	6	26071	26076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060722
552	NC_018526	TAT	2	6	26077	26082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060722
553	NC_018526	GTT	2	6	26095	26100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060722
554	NC_018526	CAA	2	6	26117	26122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
555	NC_018526	GTT	2	6	26131	26136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060722
556	NC_018526	GTC	2	6	26153	26158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060722
557	NC_018526	GTG	2	6	26177	26182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060722
558	NC_018526	CAA	2	6	26195	26200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060722
559	NC_018526	TAC	2	6	26221	26226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060722
560	NC_018526	TTTG	2	8	26283	26290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018526	AT	3	6	26330	26335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018526	AGG	2	6	26336	26341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018526	A	7	7	26413	26419	100 %	0 %	0 %	0 %	403060723
564	NC_018526	TTC	2	6	26516	26521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060723
565	NC_018526	CTG	2	6	26594	26599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060723
566	NC_018526	GTA	2	6	26611	26616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060723
567	NC_018526	TTA	2	6	26622	26627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
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569	NC_018526	TTG	2	6	26722	26727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060723
570	NC_018526	TGC	2	6	26742	26747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060723
571	NC_018526	TTC	2	6	26761	26766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060723
572	NC_018526	ATTG	2	8	26799	26806	25 %	50 %	25 %	0 %	403060723
573	NC_018526	ATT	2	6	26810	26815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
574	NC_018526	CGT	2	6	26821	26826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060723
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576	NC_018526	TGG	2	6	26868	26873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060723
577	NC_018526	TAT	2	6	26922	26927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
578	NC_018526	TGA	2	6	26969	26974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060723
579	NC_018526	ATT	2	6	26977	26982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
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581	NC_018526	TGAT	2	8	27023	27030	25 %	50 %	25 %	0 %	403060723
582	NC_018526	GTT	2	6	27166	27171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060723
583	NC_018526	AGA	2	6	27192	27197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060723
584	NC_018526	ATT	2	6	27237	27242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
585	NC_018526	ATT	2	6	27253	27258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060723
586	NC_018526	TTTG	2	8	27288	27295	0 %	75 %	25 %	0 %	403060723
587	NC_018526	CTT	2	6	27338	27343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018526	T	6	6	27342	27347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018526	ATTT	2	8	27350	27357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018526	TAT	2	6	27366	27371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018526	TAA	2	6	27422	27427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060724
592	NC_018526	GAT	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060724
593	NC_018526	AGC	2	6	27551	27556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060724
594	NC_018526	GCT	2	6	27561	27566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060724
595	NC_018526	TTA	2	6	27584	27589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060724
596	NC_018526	CT	3	6	27684	27689	0 %	50 %	0 %	50 %	403060724
597	NC_018526	TTC	2	6	27754	27759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060724
598	NC_018526	TGCC	2	8	27760	27767	0 %	25 %	25 %	50 %	403060724
599	NC_018526	TGG	2	6	27802	27807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060724
600	NC_018526	ACG	2	6	27831	27836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060724
601	NC_018526	ATT	2	6	27879	27884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060724
602	NC_018526	CAT	2	6	28163	28168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060724
603	NC_018526	GCGG	2	8	28277	28284	0 %	0 %	75 %	25 %	403060724
604	NC_018526	CAT	2	6	28307	28312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060724
605	NC_018526	CTT	2	6	28412	28417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060724
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607	NC_018526	GCA	2	6	28506	28511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060724
608	NC_018526	AGA	2	6	28559	28564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060724
609	NC_018526	TA	3	6	28598	28603	50 %	50 %	0 %	0 %	403060725
610	NC_018526	ATG	3	9	28751	28759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060725
611	NC_018526	TCA	2	6	28782	28787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060725
612	NC_018526	CTTGGC	2	12	28848	28859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060725
613	NC_018526	CT	3	6	28895	28900	0 %	50 %	0 %	50 %	403060725
614	NC_018526	T	6	6	28905	28910	0 %	100 %	0 %	0 %	403060725
615	NC_018526	CAA	2	6	29098	29103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060725
616	NC_018526	TGA	2	6	29172	29177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060725
617	NC_018526	T	6	6	29224	29229	0 %	100 %	0 %	0 %	403060725
618	NC_018526	GAT	2	6	29287	29292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060725
619	NC_018526	TCT	2	6	29296	29301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060725
620	NC_018526	TGGG	2	8	29371	29378	0 %	25 %	75 %	0 %	403060726
621	NC_018526	TCAA	2	8	29410	29417	50 %	25 %	0 %	25 %	403060726
622	NC_018526	TGA	2	6	29459	29464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060726
623	NC_018526	ACG	2	6	29517	29522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060726
624	NC_018526	GAT	2	6	29538	29543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060726
625	NC_018526	TCG	2	6	29561	29566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060726
626	NC_018526	GAA	2	6	29567	29572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060726
627	NC_018526	GGC	2	6	29660	29665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060726
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629	NC_018526	CTA	2	6	29728	29733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060726
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