MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_018526	AG	3	6	242918	242923	50 %	0 %	50 %	0 %	403060924
5002	NC_018526	AGAA	2	8	242962	242969	75 %	0 %	25 %	0 %	403060924
5003	NC_018526	TCA	2	6	242990	242995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060924
5004	NC_018526	CTC	2	6	243037	243042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060925
5005	NC_018526	AAT	2	6	243102	243107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060925
5006	NC_018526	ATC	2	6	243178	243183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060925
5007	NC_018526	GAGAA	2	10	243242	243251	60 %	0 %	40 %	0 %	403060925
5008	NC_018526	CTT	2	6	243307	243312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060925
5009	NC_018526	GGT	2	6	243385	243390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060925
5010	NC_018526	TGGT	2	8	243459	243466	0 %	50 %	50 %	0 %	403060925
5011	NC_018526	A	7	7	243473	243479	100 %	0 %	0 %	0 %	403060925
5012	NC_018526	TGG	2	6	243491	243496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060925
5013	NC_018526	ATA	2	6	243563	243568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060925
5014	NC_018526	TCAA	2	8	243587	243594	50 %	25 %	0 %	25 %	403060925
5015	NC_018526	CAT	2	6	243630	243635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060925
5016	NC_018526	TCCAA	2	10	243678	243687	40 %	20 %	0 %	40 %	403060925
5017	NC_018526	TGG	3	9	243813	243821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060925
5018	NC_018526	GAT	2	6	243853	243858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060925
5019	NC_018526	TTTTCC	2	12	243859	243870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060925
5020	NC_018526	CAG	2	6	243894	243899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060925
5021	NC_018526	ATCAT	2	10	244001	244010	40 %	40 %	0 %	20 %	403060925
5022	NC_018526	TTA	2	6	244104	244109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060926
5023	NC_018526	AT	3	6	244121	244126	50 %	50 %	0 %	0 %	403060926
5024	NC_018526	GAG	2	6	244128	244133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060926
5025	NC_018526	GAA	2	6	244174	244179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060926
5026	NC_018526	TGC	2	6	244197	244202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060926
5027	NC_018526	CAA	2	6	244263	244268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060926
5028	NC_018526	ATG	2	6	244377	244382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060926
5029	NC_018526	CAT	2	6	244395	244400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060926
5030	NC_018526	CAG	2	6	244506	244511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060926
5031	NC_018526	GT	3	6	244522	244527	0 %	50 %	50 %	0 %	403060926
5032	NC_018526	TGT	3	9	244525	244533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060926
5033	NC_018526	CAGG	2	8	244558	244565	25 %	0 %	50 %	25 %	403060926
5034	NC_018526	GTTC	2	8	244595	244602	0 %	50 %	25 %	25 %	403060926
5035	NC_018526	TTC	2	6	244668	244673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_018526	A	6	6	244776	244781	100 %	0 %	0 %	0 %	403060927
5037	NC_018526	TCAA	2	8	244900	244907	50 %	25 %	0 %	25 %	403060927
5038	NC_018526	TGA	2	6	244949	244954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060927
5039	NC_018526	TGG	2	6	244957	244962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060927
5040	NC_018526	AG	3	6	244973	244978	50 %	0 %	50 %	0 %	403060927
5041	NC_018526	GAA	2	6	245031	245036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060927
5042	NC_018526	ACT	2	6	245041	245046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060927
5043	NC_018526	TCA	2	6	245053	245058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060927
5044	NC_018526	AGA	2	6	245066	245071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060927
5045	NC_018526	TTG	2	6	245155	245160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060927
5046	NC_018526	GA	3	6	245255	245260	50 %	0 %	50 %	0 %	403060927
5047	NC_018526	GGC	2	6	245282	245287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403060927
5048	NC_018526	GACT	2	8	245356	245363	25 %	25 %	25 %	25 %	403060927
5049	NC_018526	TCA	2	6	245557	245562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060927
5050	NC_018526	AAC	2	6	245602	245607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060927
5051	NC_018526	CAAT	2	8	245621	245628	50 %	25 %	0 %	25 %	403060927
5052	NC_018526	GCAG	2	8	245630	245637	25 %	0 %	50 %	25 %	403060927
5053	NC_018526	AAC	2	6	245644	245649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060927
5054	NC_018526	CTG	2	6	245671	245676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060927
5055	NC_018526	ATCA	2	8	245733	245740	50 %	25 %	0 %	25 %	403060927
5056	NC_018526	GGA	2	6	245766	245771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060927
5057	NC_018526	ACTCT	2	10	245785	245794	20 %	40 %	0 %	40 %	403060927
5058	NC_018526	TTG	2	6	245835	245840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060927
5059	NC_018526	CAG	2	6	245842	245847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060927
5060	NC_018526	CAGC	2	8	245863	245870	25 %	0 %	25 %	50 %	403060927
5061	NC_018526	TTGG	2	8	245931	245938	0 %	50 %	50 %	0 %	403060927
5062	NC_018526	TGGCA	2	10	246041	246050	20 %	20 %	40 %	20 %	403060927
5063	NC_018526	ACA	2	6	246123	246128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060927
5064	NC_018526	GTG	2	6	246214	246219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060927
5065	NC_018526	AGC	2	6	246305	246310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060927
5066	NC_018526	GTTG	2	8	246323	246330	0 %	50 %	50 %	0 %	403060927
5067	NC_018526	AAT	2	6	246333	246338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060927
5068	NC_018526	AGT	2	6	246339	246344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060927
5069	NC_018526	AAC	2	6	246424	246429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060927
5070	NC_018526	AATT	2	8	246448	246455	50 %	50 %	0 %	0 %	403060927
5071	NC_018526	GTG	2	6	246478	246483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060927
5072	NC_018526	CTCAG	2	10	246546	246555	20 %	20 %	20 %	40 %	403060927
5073	NC_018526	CAA	2	6	246561	246566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060927
5074	NC_018526	GTC	2	6	246573	246578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060927
5075	NC_018526	AGA	2	6	246584	246589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060927
5076	NC_018526	GAT	2	6	246642	246647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060927
5077	NC_018526	AGC	2	6	246818	246823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060927
5078	NC_018526	TTC	2	6	246841	246846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060927
5079	NC_018526	AAT	2	6	246890	246895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060927
5080	NC_018526	TGG	2	6	246937	246942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060927
5081	NC_018526	TAC	2	6	246988	246993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060927
5082	NC_018526	CTT	2	6	247040	247045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060927
5083	NC_018526	TAG	2	6	247121	247126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060927
5084	NC_018526	TCA	2	6	247127	247132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060927
5085	NC_018526	TCT	2	6	247150	247155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060927
5086	NC_018526	TAG	2	6	247156	247161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060927
5087	NC_018526	GAATAA	2	12	247203	247214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403060927
5088	NC_018526	ATTG	2	8	247276	247283	25 %	50 %	25 %	0 %	403060928
5089	NC_018526	TGG	2	6	247290	247295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060928
5090	NC_018526	TAGGGT	2	12	247333	247344	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403060928
5091	NC_018526	TAAG	2	8	247426	247433	50 %	25 %	25 %	0 %	403060928
5092	NC_018526	TC	3	6	247449	247454	0 %	50 %	0 %	50 %	403060928
5093	NC_018526	TAG	2	6	247475	247480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060928
5094	NC_018526	CTA	2	6	247494	247499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060928
5095	NC_018526	T	6	6	247501	247506	0 %	100 %	0 %	0 %	403060928
5096	NC_018526	TGGT	2	8	247517	247524	0 %	50 %	50 %	0 %	403060928
5097	NC_018526	AAG	2	6	247618	247623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060928
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5101	NC_018526	AG	3	6	248017	248022	50 %	0 %	50 %	0 %	403060928
5102	NC_018526	TTG	2	6	248069	248074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060928
5103	NC_018526	GTT	2	6	248101	248106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060928
5104	NC_018526	AGC	2	6	248197	248202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060928
5105	NC_018526	ATA	2	6	248285	248290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060928
5106	NC_018526	AAGC	2	8	248347	248354	50 %	0 %	25 %	25 %	403060929
5107	NC_018526	A	6	6	248382	248387	100 %	0 %	0 %	0 %	403060929
5108	NC_018526	CCA	2	6	248570	248575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060929
5109	NC_018526	CTAG	2	8	248587	248594	25 %	25 %	25 %	25 %	403060929
5110	NC_018526	CGTT	2	8	248658	248665	0 %	50 %	25 %	25 %	403060929
5111	NC_018526	A	6	6	248701	248706	100 %	0 %	0 %	0 %	403060929
5112	NC_018526	GAA	2	6	248772	248777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060929
5113	NC_018526	AGAGA	2	10	248778	248787	60 %	0 %	40 %	0 %	403060929
5114	NC_018526	AGTTG	2	10	248828	248837	20 %	40 %	40 %	0 %	403060929
5115	NC_018526	TTG	2	6	248847	248852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060929
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5117	NC_018526	TTG	2	6	248875	248880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060929
5118	NC_018526	TGT	2	6	248885	248890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060929
5119	NC_018526	CTT	2	6	248909	248914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060929
5120	NC_018526	TTC	2	6	248928	248933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060929
5121	NC_018526	AAG	2	6	248983	248988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060929
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5123	NC_018526	AT	3	6	249049	249054	50 %	50 %	0 %	0 %	403060929
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5244	NC_018526	T	6	6	254268	254273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5374	NC_018526	T	6	6	260728	260733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5498	NC_018526	CTA	2	6	266324	266329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060945
5499	NC_018526	TAGG	2	8	266515	266522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_018526	AGT	2	6	266523	266528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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