MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis S735 chromosome

Total Repeats: 40056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018526	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060704
2	NC_018526	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	403060704
3	NC_018526	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	403060704
4	NC_018526	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	403060704
5	NC_018526	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060704
6	NC_018526	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
7	NC_018526	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060704
8	NC_018526	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060704
9	NC_018526	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060704
10	NC_018526	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060704
11	NC_018526	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060704
12	NC_018526	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	403060704
13	NC_018526	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	403060704
14	NC_018526	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060704
15	NC_018526	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	403060704
16	NC_018526	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060704
17	NC_018526	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060704
18	NC_018526	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
19	NC_018526	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	403060704
20	NC_018526	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060704
21	NC_018526	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	403060704
22	NC_018526	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	403060704
23	NC_018526	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060704
24	NC_018526	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	403060704
25	NC_018526	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	403060704
26	NC_018526	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	403060704
27	NC_018526	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	403060704
28	NC_018526	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	403060704
29	NC_018526	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060704
30	NC_018526	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060704
31	NC_018526	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	403060704
32	NC_018526	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018526	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018526	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018526	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018526	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018526	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018526	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
39	NC_018526	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	403060705
40	NC_018526	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	403060705
41	NC_018526	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060705
42	NC_018526	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060705
43	NC_018526	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	403060705
44	NC_018526	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060705
45	NC_018526	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060705
46	NC_018526	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060705
47	NC_018526	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	403060705
48	NC_018526	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060705
49	NC_018526	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
50	NC_018526	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
51	NC_018526	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060705
52	NC_018526	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	403060705
53	NC_018526	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	403060705
54	NC_018526	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060705
55	NC_018526	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
56	NC_018526	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
57	NC_018526	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060705
58	NC_018526	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	403060705
59	NC_018526	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060705
60	NC_018526	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	403060705
61	NC_018526	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060705
62	NC_018526	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018526	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018526	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018526	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	403060706
66	NC_018526	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060706
67	NC_018526	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	403060706
68	NC_018526	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	403060706
69	NC_018526	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	403060706
70	NC_018526	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060706
71	NC_018526	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
72	NC_018526	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	403060706
73	NC_018526	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	403060706
74	NC_018526	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	403060706
75	NC_018526	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	403060706
76	NC_018526	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
77	NC_018526	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060706
78	NC_018526	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	403060706
79	NC_018526	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060706
80	NC_018526	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	403060706
81	NC_018526	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
82	NC_018526	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403060706
83	NC_018526	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060706
84	NC_018526	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	403060706
85	NC_018526	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	403060706
86	NC_018526	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060706
87	NC_018526	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060707
88	NC_018526	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403060707
89	NC_018526	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060707
90	NC_018526	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018526	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018526	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018526	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060708
94	NC_018526	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060708
95	NC_018526	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	403060708
96	NC_018526	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060708
97	NC_018526	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403060708
98	NC_018526	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060708
99	NC_018526	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060708
100	NC_018526	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018526	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
102	NC_018526	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060709
103	NC_018526	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060709
104	NC_018526	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	403060709
105	NC_018526	AG	3	6	4821	4826	50 %	0 %	50 %	0 %	403060709
106	NC_018526	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403060709
107	NC_018526	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	403060709
108	NC_018526	A	6	6	4910	4915	100 %	0 %	0 %	0 %	403060709
109	NC_018526	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
110	NC_018526	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
111	NC_018526	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	403060709
112	NC_018526	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060709
113	NC_018526	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
114	NC_018526	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060709
115	NC_018526	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
116	NC_018526	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
117	NC_018526	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	403060709
118	NC_018526	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060709
119	NC_018526	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403060709
120	NC_018526	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403060709
121	NC_018526	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060709
122	NC_018526	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
123	NC_018526	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403060709
124	NC_018526	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403060709
125	NC_018526	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018526	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018526	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018526	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018526	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	403060710
130	NC_018526	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	403060710
131	NC_018526	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	403060710
132	NC_018526	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403060710
133	NC_018526	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	403060710
134	NC_018526	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	403060710
135	NC_018526	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060710
136	NC_018526	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060710
137	NC_018526	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403060710
138	NC_018526	TGG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403060710
139	NC_018526	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	403060710
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143	NC_018526	AATC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	403060711
144	NC_018526	TTA	3	9	6319	6327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403060711
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200	NC_018526	GTA	2	6	9430	9435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060711
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269	NC_018526	T	6	6	12116	12121	0 %	100 %	0 %	0 %	403060716
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271	NC_018526	CCA	2	6	12166	12171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403060716
272	NC_018526	GAT	2	6	12176	12181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403060716
273	NC_018526	GATT	2	8	12204	12211	25 %	50 %	25 %	0 %	403060716
274	NC_018526	GGCG	2	8	12215	12222	0 %	0 %	75 %	25 %	403060716
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387	NC_018526	A	6	6	16775	16780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_018526	GGA	2	6	17685	17690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_018526	CT	3	6	17710	17715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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403	NC_018526	GGT	2	6	18023	18028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_018526	GTC	2	6	18037	18042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_018526	TCGTG	2	10	18046	18055	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
406	NC_018526	CAT	2	6	18105	18110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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412	NC_018526	AC	3	6	18369	18374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
413	NC_018526	CAC	2	6	18384	18389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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427	NC_018526	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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452	NC_018526	ACA	2	6	20329	20334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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