MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Secondary endosymbiont of Ctenarytaina eucalypti chromosome

Total Repeats: 31043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018419	AGC	2	6	1438582	1438587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	400405896
31002	NC_018419	CAT	2	6	1438641	1438646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	400405896
31003	NC_018419	GC	3	6	1438826	1438831	0 %	0 %	50 %	50 %	400405896
31004	NC_018419	AGA	2	6	1438944	1438949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_018419	CAA	2	6	1438952	1438957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31006	NC_018419	TTG	2	6	1439003	1439008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31007	NC_018419	AGAT	2	8	1439027	1439034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31008	NC_018419	AGT	2	6	1439102	1439107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31009	NC_018419	GAC	2	6	1439113	1439118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31010	NC_018419	GCT	2	6	1439199	1439204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31011	NC_018419	ATG	2	6	1439275	1439280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31012	NC_018419	ATA	2	6	1439411	1439416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31013	NC_018419	TAT	2	6	1439426	1439431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31014	NC_018419	AATC	2	8	1439490	1439497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31015	NC_018419	ATT	2	6	1439505	1439510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_018419	GAG	2	6	1439517	1439522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_018419	TAATT	2	10	1439685	1439694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31018	NC_018419	CTA	2	6	1439865	1439870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31019	NC_018419	AT	3	6	1439912	1439917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31020	NC_018419	CAG	2	6	1440030	1440035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_018419	CAA	2	6	1440057	1440062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31022	NC_018419	ATGAA	2	10	1440113	1440122	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31023	NC_018419	ATT	2	6	1440123	1440128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31024	NC_018419	TAG	2	6	1440141	1440146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31025	NC_018419	ATAG	2	8	1440237	1440244	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31026	NC_018419	CTA	2	6	1440309	1440314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31027	NC_018419	AGC	2	6	1440344	1440349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31028	NC_018419	GCTA	2	8	1440350	1440357	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31029	NC_018419	CATG	2	8	1440390	1440397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31030	NC_018419	TGCA	2	8	1440453	1440460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31031	NC_018419	ATG	2	6	1440621	1440626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31032	NC_018419	AAT	2	6	1440652	1440657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31033	NC_018419	CAT	2	6	1440699	1440704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31034	NC_018419	TAT	2	6	1440708	1440713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31035	NC_018419	TAA	2	6	1440715	1440720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31036	NC_018419	TTA	2	6	1440741	1440746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31037	NC_018419	T	6	6	1440773	1440778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31038	NC_018419	CATA	2	8	1440837	1440844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31039	NC_018419	TCG	2	6	1440848	1440853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31040	NC_018419	AGA	2	6	1440947	1440952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31041	NC_018419	GGA	2	6	1440953	1440958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31042	NC_018419	GTTTT	2	10	1441103	1441112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_018419	T	7	7	1441109	1441115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.