MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018299	CGC	2	6	187166	187171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995502
4002	NC_018299	GC	3	6	187218	187223	0 %	0 %	50 %	50 %	399995502
4003	NC_018299	A	6	6	187323	187328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018299	TTC	2	6	187367	187372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_018299	CG	3	6	187396	187401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4006	NC_018299	GTC	2	6	187503	187508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995503
4007	NC_018299	CGA	2	6	187529	187534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995504
4008	NC_018299	GC	3	6	187648	187653	0 %	0 %	50 %	50 %	399995504
4009	NC_018299	GGC	2	6	187668	187673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
4010	NC_018299	CGG	2	6	187715	187720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
4011	NC_018299	CAC	2	6	187733	187738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995504
4012	NC_018299	GGT	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995504
4013	NC_018299	TCTTT	2	10	187772	187781	0 %	80 %	0 %	20 %	399995504
4014	NC_018299	TCG	2	6	187825	187830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
4015	NC_018299	GAG	2	6	187866	187871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995504
4016	NC_018299	GGC	2	6	187884	187889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
4017	NC_018299	CGT	2	6	187898	187903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
4018	NC_018299	GGC	2	6	187952	187957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
4019	NC_018299	CCG	2	6	187988	187993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995504
4020	NC_018299	GGC	2	6	187996	188001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995504
4021	NC_018299	TGC	2	6	188065	188070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995504
4022	NC_018299	GTCG	2	8	188097	188104	0 %	25 %	50 %	25 %	399995504
4023	NC_018299	GC	3	6	188106	188111	0 %	0 %	50 %	50 %	399995504
4024	NC_018299	TGGC	2	8	188112	188119	0 %	25 %	50 %	25 %	399995504
4025	NC_018299	GAGG	2	8	188145	188152	25 %	0 %	75 %	0 %	399995504
4026	NC_018299	TCA	2	6	188158	188163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995504
4027	NC_018299	TCTT	2	8	188195	188202	0 %	75 %	0 %	25 %	399995504
4028	NC_018299	CCGA	2	8	188212	188219	25 %	0 %	25 %	50 %	399995504
4029	NC_018299	CGC	2	6	188258	188263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4030	NC_018299	TGG	2	6	188264	188269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995505
4031	NC_018299	CGC	2	6	188301	188306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4032	NC_018299	GCCG	2	8	188349	188356	0 %	0 %	50 %	50 %	399995505
4033	NC_018299	TGA	2	6	188387	188392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995505
4034	NC_018299	CGG	2	6	188405	188410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4035	NC_018299	CGT	2	6	188466	188471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
4036	NC_018299	TCC	2	6	188481	188486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995505
4037	NC_018299	ATC	2	6	188494	188499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
4038	NC_018299	ATC	2	6	188519	188524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
4039	NC_018299	GCG	2	6	188596	188601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4040	NC_018299	GCG	2	6	188620	188625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4041	NC_018299	CAC	2	6	188640	188645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995505
4042	NC_018299	CTC	2	6	188709	188714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995505
4043	NC_018299	CGG	2	6	188726	188731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4044	NC_018299	CGC	2	6	188781	188786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4045	NC_018299	GCCGA	2	10	188863	188872	20 %	0 %	40 %	40 %	399995505
4046	NC_018299	CGATC	2	10	188874	188883	20 %	20 %	20 %	40 %	399995505
4047	NC_018299	TCG	2	6	188897	188902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
4048	NC_018299	GCCGA	2	10	188920	188929	20 %	0 %	40 %	40 %	399995505
4049	NC_018299	GCC	2	6	188963	188968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4050	NC_018299	GCG	2	6	189015	189020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4051	NC_018299	ACA	2	6	189047	189052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995505
4052	NC_018299	CGT	2	6	189215	189220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
4053	NC_018299	GAA	2	6	189229	189234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995505
4054	NC_018299	CGC	2	6	189251	189256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4055	NC_018299	CGG	2	6	189279	189284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4056	NC_018299	CGG	3	9	189356	189364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4057	NC_018299	GCC	2	6	189399	189404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995505
4058	NC_018299	GCG	3	9	189489	189497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995505
4059	NC_018299	GC	3	6	189504	189509	0 %	0 %	50 %	50 %	399995505
4060	NC_018299	GTG	2	6	189537	189542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995505
4061	NC_018299	ACT	2	6	189575	189580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995505
4062	NC_018299	TCG	2	6	189581	189586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995505
4063	NC_018299	GAT	2	6	189592	189597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995505
4064	NC_018299	CAC	2	6	189713	189718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995506
4065	NC_018299	TCC	2	6	189730	189735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995506
4066	NC_018299	GCG	2	6	189736	189741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995506
4067	NC_018299	CGG	2	6	189748	189753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995506
4068	NC_018299	GGCA	2	8	189821	189828	25 %	0 %	50 %	25 %	399995506
4069	NC_018299	CG	4	8	189850	189857	0 %	0 %	50 %	50 %	399995506
4070	NC_018299	CCGA	2	8	189924	189931	25 %	0 %	25 %	50 %	399995506
4071	NC_018299	GTGC	2	8	189998	190005	0 %	25 %	50 %	25 %	399995506
4072	NC_018299	GAC	2	6	190014	190019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
4073	NC_018299	GAC	2	6	190071	190076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4075	NC_018299	GCC	3	9	190147	190155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995506
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4080	NC_018299	CGA	2	6	190304	190309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4082	NC_018299	GGA	2	6	190358	190363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995506
4083	NC_018299	TCG	2	6	190417	190422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995506
4084	NC_018299	GAG	2	6	190467	190472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995506
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4087	NC_018299	TCT	2	6	190636	190641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995506
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4089	NC_018299	CAGGG	2	10	190680	190689	20 %	0 %	60 %	20 %	399995506
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4092	NC_018299	TCGA	2	8	190734	190741	25 %	25 %	25 %	25 %	399995506
4093	NC_018299	CGA	2	6	190790	190795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4095	NC_018299	GAG	2	6	190836	190841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995506
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4099	NC_018299	CTGGTC	2	12	190991	191002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4102	NC_018299	CAG	2	6	191085	191090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
4103	NC_018299	GC	3	6	191098	191103	0 %	0 %	50 %	50 %	399995506
4104	NC_018299	CGG	2	6	191126	191131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995506
4105	NC_018299	ATC	2	6	191158	191163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995506
4106	NC_018299	ATG	2	6	191241	191246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995506
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4108	NC_018299	GAT	2	6	191372	191377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995506
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4113	NC_018299	GAT	2	6	191861	191866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995506
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4118	NC_018299	GCAG	2	8	192051	192058	25 %	0 %	50 %	25 %	399995506
4119	NC_018299	GC	3	6	192120	192125	0 %	0 %	50 %	50 %	399995506
4120	NC_018299	TCG	3	9	192127	192135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4122	NC_018299	CGA	2	6	192164	192169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4126	NC_018299	CGA	2	6	192290	192295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995506
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4143	NC_018299	GTC	2	6	192976	192981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4245	NC_018299	CTC	2	6	198412	198417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995514
4246	NC_018299	GATG	2	8	198450	198457	25 %	25 %	50 %	0 %	399995514
4247	NC_018299	CGC	2	6	198525	198530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995514
4248	NC_018299	TGA	2	6	198533	198538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995514
4249	NC_018299	TCG	2	6	198620	198625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995514
4250	NC_018299	TCG	2	6	198683	198688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995514
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4258	NC_018299	CATC	2	8	199247	199254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_018299	ATC	2	6	199333	199338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_018299	CCCAT	2	10	199348	199357	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4261	NC_018299	ATCCG	2	10	199460	199469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4262	NC_018299	CAT	2	6	199554	199559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4264	NC_018299	GTG	3	9	199684	199692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_018299	ACC	2	6	199706	199711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4266	NC_018299	CAT	2	6	199771	199776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4268	NC_018299	TTG	2	6	199792	199797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_018299	GCA	2	6	199809	199814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4270	NC_018299	TCG	2	6	199840	199845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4273	NC_018299	GCT	2	6	199920	199925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4320	NC_018299	TTGG	2	8	202346	202353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4348	NC_018299	GA	3	6	203391	203396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4349	NC_018299	CGTCC	2	10	203401	203410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4350	NC_018299	CTCAC	2	10	203481	203490	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4354	NC_018299	CAT	2	6	203682	203687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995519
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4360	NC_018299	GCC	2	6	204014	204019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4362	NC_018299	GA	3	6	204034	204039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_018299	GGC	2	6	204053	204058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4364	NC_018299	CGGG	2	8	204081	204088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4365	NC_018299	CGC	2	6	204140	204145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995520
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4491	NC_018299	GCG	2	6	208828	208833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995521
4492	NC_018299	CGT	2	6	208857	208862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995521
4493	NC_018299	CCG	2	6	208889	208894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995521
4494	NC_018299	G	6	6	209149	209154	0 %	0 %	100 %	0 %	399995521
4495	NC_018299	CGC	2	6	209183	209188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995521
4496	NC_018299	GC	3	6	209187	209192	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
4497	NC_018299	CGG	2	6	209194	209199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995521
4498	NC_018299	GCT	2	6	209200	209205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995521
4499	NC_018299	TCGC	2	8	209288	209295	0 %	25 %	25 %	50 %	399995521
4500	NC_018299	TGCCGA	2	12	209392	209403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995521

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